Este é o histórico dos estudos sobre a biodiversidade do fitoplâncton da Baía da Guanabara, Brasil, com base em 57 publicações relativas a amostras coletadas no período entre 1913 e 2004. Estão aqui incluídas apenas as investigações que identificaram espécies por microscopia. Apesar de 80% dos estudos serem de cunho ecológico, os quais tendem a citar apenas as espécies mais abundantes, 24 publicações incluem listas completas dos táxons identificados em nível específico, especialmente daqueles > 20 μm. Atualmente, o inventário de espécies inclui 308 táxons dentre 199 diatomáceas, 90 dinoflagelados, 9 cianobactérias, 5 euglenofíceas, 1 clorofícea, 1 prasinofícea, 1 silicoflagelado e 2 ebriideos. As duas espécies que mais se destacaram foram o dinoflagelado Scrippsiella trochoidea e diatomáceas do complexo Skeletonema costatum. A primeira foi o tema de publicação pioneira sobre o fitoplâncton da Baía (Faria 1914), que relatou sua floração associada à mortandade de peixes, e continua sendo detectada em altas concentrações (10(6) cell.L-1) em áreas mais protegidas. A segunda foi considerada por muitos anos na literatura como uma espécie cosmopolita e oportunista, até a descoberta recente de espécies crípticas dentro do gênero, indicando que as populações da Baía da Guanabara requerem revisão taxonômica. Além destas duas espécies, apenas 25 apresentaram alta freqüência de ocorrência e ampla distribuição, algumas relatadas como causadoras de florações nocivas em outros locais. A biodiversidade de dinoflagelados, especialmente dentre os Gymnodiniales, assim como a de outros grupos de flagelados ainda não identificados (Haptophyceae, Cryptophyceae, Prasinophyceae, Raphidophyceae), está subestimada devido ao uso de fixadores que destorcem ou destroem caracteres diagnósticos. Se considerarmos o inventário de espécies mais antigo, uma lista de 124 táxons publicada em 1917, e o incremento no número de espécies desde então, é possível ter a falsa impressão de que a biodiversidade do fitoplâncton da Baía de Guanabara aumentou apesar da crescente eutrofização local. Há dois motivos possíveis: 1) trata-se apenas do reflexo do aprimoramento da capacidade técnica de detectar e identificar as espécies e 2) os efeitos potenciais da eutrofização podem ser melhor percebidos através da análise da estrutura da comunidade, ou seja, quando as tendências espaciais e temporais na abundância das populações (e não apenas no número de espécies) são levadas em consideração.

This is a historical account of the biodiversity of phytoplankton in Guanabara Bay, Brazil. It is based on 57 publications that refer to sampling carried out between 1913 and 2004. The publications included are those with direct microscopic identification. Although 80% of the studies focus on ecological issues that tend to mention only the most abundant species, 24 publications provide comprehensive check-lists at the species level, especially of taxa > 20 μm. The inventory of species includes, to date, 308 taxa among 199 diatoms, 90 dinoflagellates, 9 cyanobacteria, 5 euglenophyceans, 1 chlorophycean, 1 prasinophycean, 1 silicoflagellate, and 2 ebriids. The most conspicuous species were the dinoflagellate Scrippsiella trochoidea and diatoms from the Skeletonema costatum complex. The first was the theme of the very first publication in the area (Faria 1914) that reported on its bloom associated with the mass mortality of fish due to oxygen depletion; it is still often found in high abundances (10(6) cell.L-1) in more protected areas. The second was long considered in the literature as a cosmopolitan and opportunistic species, until the recent discovery of cryptic species within the genus; taxonomic re-evaluation of local populations is, therefore, needed. Besides these two species, only other 25 species stood out in terms of frequency of occurrence and widespread distribution in the Bay, some known to be implicated in harmful blooms elsewhere. The biodiversity of dinoflagellates, especially within the Gymnodiniales, and that of other unidentified flagellates (Haptophyceae, Cryptophyceae, Prasinophyceae, Raphidophyceae) is largely underestimated because of the use of fixatives that distort/destroy diagnostic characters. From the initial inventory of 124 taxa published in 1917 and the subsequent additions in species numbers, one can have a false perception that the phytoplankton biodiversity has increased throughout the years, despite the overall increase in eutrophication observed in Guanabara Bay. The reason for this may be twofold: 1) it is an artifact caused by our progressively improving technical capability to detect and identify species and 2) the possible effects of eutrophication could be better perceived when the community structure is evaluated, that is, when space-time variations in the abundances of the populations (rather than just number of species) are also taken into account.

O objetivo deste estudo é compilar o inventário de quase 100 anos de pesquisa sobre a composição de espécies do fitoplâncton do litoral do Estado de São Paulo, Brasil. O retrato atualizado da biodiversidade local é necessário para establecer um dignóstico para comparações futuras. Este tipo de informação encontra-se dispersa em antigas publicações e em material considerado como "literatura cinza" e requer atualização nomenclatural. Vinte e seis publicações foram consideradas neste estudo. O registro mais antigo é de 1913 (?) e o mais recente de 2002. Esta lista de espécies, compilada a partir de dados pretéritos, foi complementada com dados primários coletados entre agosto de 2004 e julho de 2006 nas zonas de arrebentação de 20 praias paulistas e em área de maricultura da praia da Cocanha em Caraguatatuba. A lista de espécies completa inclui 572 táxons: a maioria de diatomáceas (82%), seguidas por dinoflagelados (16%), com uma pequena contribuição de silicoflagelados, cocolitoforídeos, ebriideas e cianobactérias. As áreas mais estudadas foram: Ubatuba, São Sebastião, Santos e Cananéia. O levantamento atual tem uma cobertura espacial mais abrangente. Ao longo dos anos, os objetivos dos estudos pretéritos variaram desde puramente taxonômicos até investigações de aspectos funcionais do ecossistema. Desta forma, os inventários mais longos e a maioria dos primeiros registros foram publicados antes de 1980 e as publicações mais recentes fazem menção apenas a espécies mais abundantes/freqüentes. Microscopia eletrônica foi empregada pela primeira vez no levantamento atual e novos registros incluem 38 diatomáceas, 42 dinoflagelados, 1 silicoflagelado, 1 ebriidea e 2 cianobactérias. O uso e interpretação deste inventário exige cautela. Se por um lado, não é viável questionar a identificação feita por outros pesquisadores, por outro lado, a capacidade de amostrar, analisar e identificar espécies evoluiu ao longo do tempo. Algumas considerações sobre esta questão são apresentadas.

The objective of this study is to compile the inventory of nearly 100 years of research about the phytoplankton species cited for the coast of the state of São Paulo, Brazil. A state-of-the-art study on the local biodiversity has long been needed to provide a baseline for future comparisons. This type of data is scattered in old scientific journals and in the so-called "grey literature", and are in need of nomenclature updating. Twenty-six publications are considered. The earliest sampling record is from 1913 (?) and the most recent from 2002. This checklist compiled from the literature was complemented with primary data collected between August 2004 and July 2006, recent surveys of the surf-zone of 20 beaches located along the coast and of a mariculture farm at the Cocanha Beach, Caraguatatuba. The complete species list includes 572 taxa: most are diatoms (82%), seconded by dinoflagellates (16%), with a minor contribution of silicoflagellates, coccolithophorids, ebriideans and cyanobacteria. The most investigated areas were: Ubatuba, São Sebastião, Santos and Cananéia. The recent surveys have a broader spatial coverage. The objectives of the studies have changed over the years from purely taxonomic to process-oriented investigations. Therefore, the longest species lists and most first records for the area were published before the 1980's and later publications, even those in which cell counts were performed, mention only the most abundant/frequent species. Electron microscopy was used for the first time in the present surveys, and new records include 38 diatoms, 42 dinoflagellates, 1 silicoflagellate, 1 ebriidean and 2 cyanobacteria. The use and interpretation of this species list require the perception of some constraints. It is not our role to question the identification made by other researchers. On the other hand, the ability to sample, analyze and identify species has evolved over the years and some considerations in this regard are presented.

Variações do nanoplâncton (2-20µm) e bactérias filamentosas (diâmetro: 0.5-2.0 µm) da Baía de Guanabara (RJ, Brasil) são apresentadas, considerando densidade celular e biomassa de autótrofos e heterótrofos. A meta deste trabalho é contribuir para uma futura modelagem da dinâmica trófica neste sistema. Amostras subsuperficiais de água foram coletadas semanalmente durante um ano em dois pontos: Urca (próximo à entrada, mais salino, eutrófico) e Ramos (no interior, menos salino, hipertrófico). Foi feita análise por microscopia de epifluorescência, com densidade celular convertida para biomassa através do biovolume celular. A concentração do nanoplâncton total foi alta (10(8)cel.l-1) na maioria das amostras (>57%) e das bactérias filamentosas variou de 10(5) a 10(8)fil.l-1. A densidade de autótrofos em Ramos foi uma ordem de grandeza superior tanto para o nanoplâncton (Md: 10(8)cel.l-1 em Ramos e 10(7)cel.l-1 na Urca) quanto para as bactérias filamentosas (Md: 10(6)fil.l-1 em Ramos e 10(5)fil.l-1 na Urca). A biomassa autotrófica do nanoplâncton (Md: 10³µgC.l-1 em Ramos e 10¹µgC.l-1 na Urca) e das bactérias filamentosas (Md: 28µgC.l-1 em Ramos e 1,4µgC.l-1 na Urca) seguiu o mesmo padrão. A contribuição relativa de autótrofos aumentou após a conversão para biomassa. Uma tendência temporal foi evidenciada para as bactérias filamentosas em ambos os pontos e, para o nanoplâncton autotrófico, em Ramos, com valores máximos no período chuvoso (primavera-verão).

Variations of nanoplankton (2-20 µm) and filamentous bacteria (diameter: 0.5-2.0 µm) of Guanabara Bay (RJ, Brazil) are presented, considering cell density and carbon content of auto- and heterotrophs. Our goal is to contribute to future modeling of local trophic dynamics. Subsurface water samples were taken weekly during the year 2000 at two sites: Urca (close to the entrance, more saline, eutrophic) and Ramos (inner area, less saline, hypertrophic). Microscopic analysis was done by epifluorescence and cell density was converted to biomass through cell biovolume. Total nanoplankton was about 10(8) cells.l-1 in most samples (>57%), and total filamentous bacteria densities varied from 10(5) to 10(8) fil.l-1. Autotroph density was one order of magnitude higher at Ramos, both for nanoplankton (Md: 10(8)cells.l-1 at Ramos and 10(7)cells.l-1 at Urca) and for filamentous bacteria (Md: 10(6) fil.l-1 at Ramos and 10(5) fil.l-1 at Urca). The same was observed for autotrophic biomass (Md: 10³µgC.l-1 at Ramos and 10¹µgC.l-1 at Urca for nanoplankton; Md: 28µgC.l-1 at Ramos and 1.4µgC.l-1 at Urca for filamentous bacteria). The relative contribution of autotrophs increased after conversion to biomass. Seasonal variation was conspicuous for filamentous bacteria at both sites and for nanoplankton only at Ramos, with maximum autotrophic abundances during the rainy period (spring-summer).

Muito tem sido investido para entender a dinâmica do plâncton da Baía de Guanabara (Brasil), estuário tropical com sérios problemas ambientais, mas pouco se sabe sobre o protozooplâncton. Preenchendo esta lacuna, a composição e abundância do protozooplâncton (ciliados, flagelados heterotróficos) foram investigadas em 2000, por meio de amostragens subsuperficiais, quinzenais, em dois locais com qualidade distinta de água (Urca - entrada da baía, águas mais salinas e limpas; Ramos - região mais interna, águas hipereutróficas e menos salinas). A densidade na Urca (10³-10(5) cel.L-1) foi inferior à de Ramos (10(4)-10(5) cel.L-1), com sazonalidade para o nanoplâncton e protozooplâncton mais evidente, menores valores durante o período mais frio (abril a agosto). Pequenos dinoflagelados (20-30 mm) dominaram mais de 50% das amostras. A abundância e composição refletiram o distinto estado trófico na baía (análise fatorial de correspondência: 56%). Ciliados não oligotríqueos (Vorticellidae, Dysteriidae, Didiniidae) e Gymnodiniaceae foram representativos de Ramos na estação quente-úmida (outubro - março), enquanto tintinídeos (Codonellopsidae, Metacyclididae, Tintinnidae, Undellidae) e dinoflagelados (Oxyphysaceae, Ebriidae, Protoperidiniaceae, Noctilucaceae) representativos da Urca, principalmente na estação fria-seca (abril - setembro). Este primeiro estudo descritivo, fundamental para o entendimento das relações na teia alimentar microbiana, revelou o protozooplâncton como bom indicador das condições da qualidade da água da baía.

Much time and resources have been invested in understanding plankton dynamics in Guanabara Bay (Brazil), but no attention has been devoted to the protozooplankton. To fulfill this lacuna, abundance and composition of protozooplankton were investigated from January to December - 2000 in fortnightly surface water samplings at two distinct water quality sites (Urca - closer to the bay entrance, more saline and cleaner waters; Ramos - inner reaches, hypereutrophic waters). The density at Urca (10³ - 10(5) cell.l-1) was one to three orders of magnitude lower than at Ramos (10(4) - 10(5) cell.l-1). A seasonal trend for nanoplankton and protozooplankton was more evident at Urca, but both sites had lower densities during the colder period. Small heterotrophic dinoflagellates (20-30 mm) were dominant in over 50% of the samples. The protozooplankton abundance and composition reflected the distinct trophic conditions states found at the bay. During the wet-warm season, non-oligotrich ciliates were representative of Ramos site with Gymnodiniaceae dinoflagellates, while tintinnids and heterotrophic dinoflagellates were predominantly found at Urca mainly during the dry-cold season. This first descriptive study towards the understanding of the intricate relationships among the microbial food web components reveals that protozooplankton can be a good indicator of water quality conditions at the bay.