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Abstract Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) was the responsible for the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. Because of its high transmissibility, allied to the emergence of some variants of concern (VOC), like Alpha, Beta, Gamma, Delta, and Omicron, the detection of these strains must be rapid and efficient. Among the tests available, the reverse-transcriptase polymerase-chain reaction (RT-PCR) is considered the gold standard test for COVID-19 detection, and the use of specific primers and probes can discriminate the different COVID-19 variants. In this study, we screened 317 individuals tested positive for COVID-19 from the municipality of Ponta Grossa (Paraná State, Brazil), from April/2021 to February/2022, aiming to identify the Gamma, Delta, and Omicron variants, by RT-PCR, using specific probes. The Gamma variant was detected from April/2021 to September/2021. The Delta variant was subsequently detected from August/2021 to November/2021. The Omicron variant was the unique strain detected from December/2021 to February/2022 and, because of its high rate of transmissibility, it caused a considerable increase in the number of COVID-19 infections. Mass testing is considered an important strategy for COVID-19 control and, the correct detection of new strains, could improve the knowledge about the virus´ behavior, permitting the development of drugs and optimized vaccines.

https://doi.org/10.1590/1678-4324-2023220591

Guidelines on COVID-19 vaccination in patients with immune-mediated rheumatic diseases: a Brazilian Society of Rheumatology task force
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Tavares, Anna Carolina Faria Moreira Gomes

; Melo, Ana Karla Guedes de

; Cruz, Vítor Alves

; Souza, Viviane Angelina de

; Carvalho, Joana Starling de

; Machado, Ketty Lysie Libardi Lira

; Valadares, Lilian David de Azevedo

; Reis Neto, Edgard Torres dos

; Rezende, Rodrigo Poubel Vieira de

; Guimarães, Maria Fernanda Brandão de Resende

; Ferreira, Gilda Aparecida

; Braz, Alessandra de Sousa

; Vieira, Rejane Maria Rodrigues de Abreu

; Pinheiro, Marcelo de Medeiros

; Ribeiro, Sandra Lúcia Euzébio

; Bica, Blanca Elena Gomes Rios

; Baptista, Kátia Lino

; Costa, Izaias Pereira da

; Marques, Claudia Diniz Lopes

; Lopes, Maria Lúcia Lemos

; Martinez, José Eduardo

; Giorgi, Rina Dalva Neubarth

; Mota, Lícia Maria Henrique da

; Loures, Marcos Antônio Araújo da Rocha

; Paiva, Eduardo dos Santos

; Monticielo, Odirlei André

; Xavier, Ricardo Machado

; Kakehasi, Adriana Maria

; Pileggi, Gecilmara Cristina Salviato

Advances in Rheumatology

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2022, Volume 62 elocation 3

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

Abstract Objective: To provide guidelines on the coronavirus disease 2019 (COVID-19) vaccination in patients with immune-mediated rheumatic diseases (IMRD) to rheumatologists considering specific scenarios of the daily practice based on the shared-making decision (SMD) process. Methods: A task force was constituted by 24 rheumatologists (panel members), with clinical and research expertise in immunizations and infectious diseases in immunocompromised patients, endorsed by the Brazilian Society of Rheumatology (BSR), to develop guidelines for COVID-19 vaccination in patients with IMRD. A consensus was built through the Delphi method and involved four rounds of anonymous voting, where five options were used to determine the level of agreement (LOA), based on the Likert Scale: (1) strongly disagree; (2) disagree, (3) neither agree nor disagree (neutral); (4) agree; and (5) strongly agree. Nineteen questions were addressed and discussed via teleconference to formulate the answers. In order to identify the relevant data on COVID-19 vaccines, a search with standardized descriptors and synonyms was performed on September 10th, 2021, of the MEDLINE, EMBASE, Cochrane Central Register of Controlled Trials, ClinicalTrials.gov, and LILACS to identify studies of interest. We used the Newcastle–Ottawa Scale to assess the quality of nonrandomized studies. Results: All the nineteen questions-answers (Q&A) were approved by the BSR Task Force with more than 80% of panelists voting options 4—agree—and 5—strongly agree—, and a consensus was reached. These Guidelines were focused in SMD on the most appropriate timing for IMRD patients to get vaccinated to reach the adequate covid-19 vaccination response. Conclusion: These guidelines were developed by a BSR Task Force with a high LOA among panelists, based on the literature review of published studies and expert opinion for COVID-19 vaccination in IMRD patients. Noteworthy, in the pandemic period, up to the time of the review and the consensus process for this document, high-quality evidence was scarce. Thus, it is not a substitute for clinical judgment.

https://doi.org/10.1186/s42358-022-00234-7

COVID-19: The question of genetic diversity and therapeutic intervention approaches
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Figueiredo, David Livingstone Alves

; Ximenez, João Paulo Bianchi

; Seiva, Fábio Rodrigues Ferreira

; Panis, Carolina

; Bezerra, Rafael dos Santos

; Ferrasa, Adriano

; Cecchini, Alessandra Lourenço

; Medeiros, Alexandra Ivo de

; Almeida, Ana Marisa Fusco

; Ramão, Anelisa

; Boldt, Angelica Beate Winter

; Moya, Carla Fredrichsen

; Chin, Chung Man

; Paula, Daniel de

; Rech, Daniel

; Gradia, Daniela Fiori

; Malheiros, Danielle

; Venturini, Danielle

; Tavares, Eliandro Reis

; Carraro, Emerson

; Ribeiro, Enilze Maria de Souza Fonseca

; Pereira, Evani Marques

; Tuon, Felipe Francisco

; Follador, Franciele Aní Caovilla

; Fernandes, Glaura Scantamburlo Alves

; Volpato, Hélito

; Cólus, Ilce Mara de Syllos

; Oliveira, Jaqueline Carvalho de

; Rodrigues, Jean Henrique da Silva

; Santos, Jean Leandro dos

; Visentainer, Jeane Eliete Laguila

; Brandi, Juliana Cristina

; Serpeloni, Juliana Mara

; Bonini, Juliana Sartori

; Oliveira, Karen Brajão de

; Fiorentin, Karine

; Lucio, Léia Carolina

; Faccin-Galhardi, Ligia Carla

; Ferreto, Lirane Elize Defante

; Lioni, Lucy Megumi Yamauchi

; Consolaro, Marcia Edilaine Lopes

; Vicari, Marcelo Ricardo

; Arbex, Marcos Abdo

; Pileggi, Marcos

; Watanabe, Maria Angelica Ehara

; Costa, Maria Antônia Ramos

; Giannini, Maria José S. Mendes

; Amarante, Marla Karine

; Khalil, Najeh Maissar

; Lima Neto, Quirino Alves de

; Herai, Roberto H.

; Guembarovski, Roberta Losi

; Shinsato, Rogério N.

; Mainardes, Rubiana Mara

; Giuliatti, Silvana

; Yamada-Ogatta, Sueli Fumie

; Gerber, Viviane Knuppel de Quadros

; Pavanelli, Wander Rogério

; Silva, Weber Claudio da

; Petzl-Erler, Maria Luiza

; Valente, Valeria

; Soares, Christiane Pienna

; Cavalli, Luciane Regina

; Silva Jr, Wilson Araujo

Genetics and Molecular Biology

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2021, Volume 44 Nº 1 elocation e20200452

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

Abstract Coronavirus disease 2019 (COVID-19), caused by the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus type 2 (SARS-CoV-2), is the largest pandemic in modern history with very high infection rates and considerable mortality. The disease, which emerged in China’s Wuhan province, had its first reported case on December 29, 2019, and spread rapidly worldwide. On March 11, 2020, the World Health Organization (WHO) declared the COVID-19 outbreak a pandemic and global health emergency. Since the outbreak, efforts to develop COVID-19 vaccines, engineer new drugs, and evaluate existing ones for drug repurposing have been intensively undertaken to find ways to control this pandemic. COVID-19 therapeutic strategies aim to impair molecular pathways involved in the virus entrance and replication or interfere in the patients’ overreaction and immunopathology. Moreover, nanotechnology could be an approach to boost the activity of new drugs. Several COVID-19 vaccine candidates have received emergency-use or full authorization in one or more countries, and others are being developed and tested. This review assesses the different strategies currently proposed to control COVID-19 and the issues or limitations imposed on some approaches by the human and viral genetic variability.

https://doi.org/10.1590/1678-4685-gmb-2020-0452

Epidemiologia e desfecho dos pacientes de alto risco cirúrgico admitidos em unidades de terapia intensiva no Brasil
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Silva Júnior, João Manoel

; Chaves, Renato Carneiro de Freitas

; Corrêa, Thiago Domingos

; Assunção, Murillo Santucci Cesar de

; Katayama, Henrique Tadashi

; Bosso, Fabio Eduardo

; Amendola, Cristina Prata

; Serpa Neto, Ary

; Malbouisson, Luiz Marcelo Sá

; Oliveira, Neymar Elias de

; Veiga, Viviane Cordeiro

; Rojas, Salomón Soriano Ordinola

; Postalli, Natalia Fioravante

; Alvarisa, Thais Kawagoe

; Lucena, Bruno Melo Nobrega de

; Oliveira, Raphael Augusto Gomes de

; Sanches, Luciana Coelho

; Silva, Ulysses Vasconcellos de Andrade e

; Nassar Junior, Antonio Paulo

; Réa-Neto, Álvaro

; Amaral, Alexandre

; Teles, José Mário

; Freitas, Flávio Geraldo Rezende de

; Bafi, Antônio Tonete

; Pacheco, Eduardo Souza

; Ramos, Fernando José

; Vieira Júnior, José Mauro

; Pereira, Maria Augusta Santos Rahe

; Schwerz, Fábio Sartori

; Menezes, Giovanna Padoa de

; Magalhães, Danielle Dourado

; Castro, Cristine Pilati Pileggi

; Henrich, Sabrina Frighetto

; Toledo, Diogo Oliveira

; Parra, Bruna Fernanda Camargo Silva

; Dias, Fernando Suparregui

; Zerman, Luiza

; Formolo, Fernanda

; Nobrega, Marciano de Sousa

; Piras, Claudio

; Piras, Stéphanie de Barros

; Conti, Rodrigo

; Bittencourt, Paulo Lisboa

; D’Oliveira, Ricardo Azevedo Cruz

; Estrela, André Ricardo de Oliveira

; Oliveira, Mirella Cristine de

; Reese, Fernanda Baeumle

; Motta Júnior, Jarbas da Silva

; Câmara, Bruna Martins Dzivielevski da

; David-João, Paula Geraldes

; Tannous, Luana Alves

; Chaiben, Viviane Bernardes de Oliveira

; Miranda, Lorena Macedo Araújo

; Brasil, José Arthur dos Santos

; Deucher, Rafael Alexandre de Oliveira

; Ferreira, Marcos Henrique Borges

; Vilela, Denner Luiz

; Almeida, Guilherme Cincinato de

; Nedel, Wagner Luis

; Passos, Matheus Golenia dos

; Marin, Luiz Gustavo

; Oliveira Filho, Wilson de

; Coutinho, Raoni Machado

; Oliveira, Michele Cristina Lima de

; Friedman, Gilberto

; Meregalli, André

; Höher, Jorge Amilton

; Soares, Afonso José Celente

; Lobo, Suzana Margareth Ajeje

Revista Brasileira de Terapia Intensiva

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Mar 2020, Volume 32 Nº 1 Páginas 17 - 27

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO Objetivo: Definir o perfil epidemiológico e os principais determinantes de morbimortalidade dos pacientes cirúrgicos não cardíacos de alto risco no Brasil. Métodos: Estudo prospectivo, observacional e multicêntrico. Todos os pacientes cirúrgicos não cardíacos admitidos nas unidades de terapia intensiva, ou seja, considerados de alto risco, no período de 1 mês, foram avaliados e acompanhados diariamente por, no máximo, 7 dias na unidade de terapia intensiva, para determinação de complicações. As taxas de mortalidade em 28 dias de pós-operatório, na unidade de terapia intensiva e hospitalar foram avaliadas. Resultados: Participaram 29 unidades de terapia intensiva onde foram realizadas cirurgias em 25.500 pacientes, dos quais 904 (3,5%) de alto risco (intervalo de confiança de 95% - IC95% 3,3% - 3,8%), tendo sido incluídos no estudo. Dos pacientes envolvidos, 48,3% eram de unidades de terapia intensiva privadas e 51,7% de públicas. O tempo de internação na unidade de terapia intensiva foi de 2,0 (1,0 - 4,0) dias e hospitalar de 9,5 (5,4 - 18,6) dias. As taxas de complicações foram 29,9% (IC95% 26,4 - 33,7) e mortalidade em 28 dias pós-cirurgia 9,6% (IC95% 7,4 - 12,1). Os fatores independentes de risco para complicações foram Simplified Acute Physiology Score 3 (SAPS 3; razão de chance − RC = 1,02; IC95% 1,01 - 1,03) e Sequential Organ Failure Assessment Score (SOFA) da admissão na unidade de terapia intensiva (RC =1,17; IC95% 1,09 - 1,25), tempo de cirurgia (RC = 1,001; IC95% 1,000 - 1,002) e cirurgias de emergências (RC = 1,93; IC95% 1,10 - 3,38). Em adição, foram associados com mortalidade em 28 dias idade (RC = 1,032; IC95% 1,011 - 1,052) SAPS 3 (RC = 1,041; IC95% 1,107 - 1,279), SOFA (RC = 1,175; IC95% 1,069 - 1,292) e cirurgias emergenciais (RC = 2,509; IC95% 1,040 - 6,051). Conclusão: Pacientes com escores prognósticos mais elevados, idosos, tempo cirúrgico e cirurgias emergenciais estiveram fortemente associados a maior mortalidade em 28 dias e mais complicações durante permanência em unidade de terapia intensiva.

ABSTRACT Objective: To define the epidemiological profile and the main determinants of morbidity and mortality in noncardiac high surgical risk patients in Brazil. Methods: This was a prospective, observational and multicenter study. All noncardiac surgical patients admitted to intensive care units, i.e., those considered high risk, within a 1-month period were evaluated and monitored daily for a maximum of 7 days in the intensive care unit to determine complications. The 28-day postoperative, intensive care unit and hospital mortality rates were evaluated. Results: Twenty-nine intensive care units participated in the study. Surgeries were performed in 25,500 patients, of whom 904 (3.5%) were high-risk (95% confidence interval - 95%CI 3.3% - 3.8%) and were included in the study. Of the participating patients, 48.3% were from private intensive care units, and 51.7% were from public intensive care units. The length of stay in the intensive care unit was 2.0 (1.0 - 4.0) days, and the length of hospital stay was 9.5 (5.4 - 18.6) days. The complication rate was 29.9% (95%CI 26.4 - 33.7), and the 28-day postoperative mortality rate was 9.6% (95%CI 7.4 - 12.1). The independent risk factors for complications were the Simplified Acute Physiology Score 3 (SAPS 3; odds ratio - OR = 1.02; 95%CI 1.01 - 1.03) and Sequential Organ Failure Assessment Score (SOFA) on admission to the intensive care unit (OR = 1.17; 95%CI 1.09 - 1.25), surgical time (OR = 1.001, 95%CI 1.000 - 1.002) and emergency surgeries (OR = 1.93, 95%CI, 1.10 - 3.38). In addition, there were associations with 28-day mortality (OR = 1.032; 95%CI 1.011 - 1.052), SAPS 3 (OR = 1.041; 95%CI 1.107 - 1.279), SOFA (OR = 1.175, 95%CI 1.069 - 1.292) and emergency surgeries (OR = 2.509; 95%CI 1.040 - 6.051). Conclusion: Higher prognostic scores, elderly patients, longer surgical times and emergency surgeries were strongly associated with higher 28-day mortality and more complications during the intensive care unit stay.

https://doi.org/10.5935/0103-507x.20200005 1048 downloads

Brazilian recommendations on the safety and effectiveness of the yellow fever vaccination in patients with chronic immune-mediated inflammatory diseases
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Pileggi, Gecilmara Salviato

; Mota, Licia Maria Henrique Da

; Kakehasi, Adriana Maria

; Souza, Alexandre Wagner De

; Rocha, Aline

; Melo, Ana Karla Guedes de

; Fonte, Caroline Araujo M. da

; Bortoletto, Cecilia

; Brenol, Claiton Viegas

; Marques, Claudia Diniz Lopes

; Zaltman, Cyrla

; Borba, Eduardo Ferreira

; Reis, Enio Ribeiro

; Freire, Eutilia Andrade Medeiros

; Klumb, Evandro Mendes

; Christopoulos, Georges Basile

; Laurindo, Ieda Maria M.

; Ballalai, Isabella

; Costa, Izaias Pereira Da

; Michelin, Lessandra

; Valadares, Lilian David de Azevêdo

; Chebli, Liliana Andrade

; Lacerda, Marcus

; Toscano, Maria Amazile Ferreira

; Yazbek, Michel Alexandre

; Vieira, Rejane Maria R. De Abreu

; Magalhães, Renata

; Kfouri, Renato

; Richtmann, Rosana

; Merenlender, Selma Da Costa Silva

; Valim, Valeria

; Assis, Marcos Renato De

; Kowalski, Sergio Candido

; Trevisani, Virginia Fernandes Moça

Advances in Rheumatology

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2019, Volume 59 elocation 17

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

Abstract Background: In Brazil, we are facing an alarming epidemic scenario of Yellow fever (YF), which is reaching the most populous areas of the country in unvaccinated people. Vaccination is the only effective tool to prevent YF. In special situations, such as patients with chronic immune-mediated inflammatory diseases (CIMID), undergoing immunosuppressive therapy, as a higher risk of severe adverse events may occur, assessment of the risk-benefit ratio of the yellow fever vaccine (YFV) should be performed on an individual level. Main body of the abstract: Faced with the scarcity of specific orientation on YFV for this special group of patients, the Brazilian Rheumatology Society (BRS) endorsed a project aiming the development of individualized YFV recommendations for patients with CIMID, guided by questions addressed by both medical professionals and patients, followed an internationally validated methodology (GIN-McMaster Guideline Development). Firstly, a systematic review was carried out and an expert panel formed to take part of the decision process, comprising BRS clinical practitioners, as well as individuals from the Brazilian Dermatology Society (BDS), Brazilian Inflammatory Bowel Diseases Study Group (GEDIIB), and specialists on infectious diseases and vaccination (from Tropical Medicine, Infectious Diseases and Immunizations National Societies); in addition, two representatives of patient groups were included as members of the panel. When the quality of the evidence was low or there was a lack of evidence to determine the recommendations, the decisions were based on the expert opinion panel and a Delphi approach was performed. A recommendation was accepted upon achieving ≥80% agreement among the panel, including the patient representatives. As a result, eight recommendations were developed regarding the safety of YFV in patients with CIMID, considering the immunosuppression degree conferred by the treatment used. It was not possible to establish recommendations on the effectiveness of YFV in these patients as there is no consistent evidence to support these recommendations. Conclusion: This paper approaches a real need, assessed by clinicians and patient care groups, to address specific questions on the management of YFV in patients with CIMID living or traveling to YF endemic areas, involving specialists from many areas together with patients, and might have global applicability, contributing to and supporting vaccination practices. We recommended a shared decision-making approach on taking or not the YFV.

https://doi.org/10.1186/s42358-019-0056-x 1111 downloads

Rapid PCR-based assay for Sclerotinia sclerotiorum detection on soybean seeds
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Grabicoski, Edilaine Mauricia Gelinski

; Jaccoud Filho, David de Souza

; Pileggi, Marcos

; Henneberg, Luciane

; Pierre, Marcelo Luiz Cunha

; Vrisman, Cláudio Mauricio

; Dabul, Audrei Nisio Gebieluca

Scientia Agricola

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Fev 2015, Volume 72 Nº 1 Páginas 69 - 74

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

Caused by Sclerotinia sclerotiorum, white mold is an important seed-transmitted disease of soybean (Glycine max). Incubation-based methods available for the detection and quantification of seed-borne inoculum such as the blotter test, paper roll and Neon-S assay are time-consuming, laborious, and not always sensitive. In this study, we developed and evaluated a molecular assay for the detection of S. sclerotiorum in soybean seeds using a species-specific PCR (polymerase chain reaction) primer set and seed soaking (without DNA extraction) for up to 72 h. The PCR products were amplified in all the samples infected with the pathogen, but not in the other samples of plant material or the other seed-borne fungi DNA. The minimum amount of DNA detected was 10 pg, or one artificially infested seed in a 400-seed sample (0.25 % fungal incidence) and one naturally infected seed in a 300-seed sample (0.33 % incidence). The PCR-based assay was rapid (< 9 h), did not require DNA extraction and was very sensitive.

https://doi.org/10.1590/0103-9016-2013-0395 3652 downloads

Prática de vacinação em crianças com doenças reumáticas
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Silva, Clovis Artur A

; Terreri, Maria Teresa R. A

; Aikawa, Nadia E

; Carvalho, Jozélio F

; Pileggi, Gecilmara C.S

; Ferriani, Virginia P.L

; Barbosa, Cássia Maria P.L

; Hilário, Maria Odete E

; Jesus, Adriana A

; Sallum, Adriana M. E

; Lotito, Ana Paola N

; Liphaus, Bernadete L

; Magalhães, Claudia S

; Len, Cláudio A

; Okuda, Eunice M

; Campos, Lucia Maria M

; Carvalho, Luciana M

; Ronchezel, Marcos Vinícius

; Santos, Maria Carolina dos

; Romanelli, Paulo Roberto S

; Marini, Roberto

; Pereira, Rosa Maria R

; Sacchetti, Silvana B

; Lotufo, Simone

; Bastos, Wanda A

Revista Brasileira de Reumatologia

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Ago 2010, Volume 50 Nº 4 Páginas 351 - 355

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

INTRODUÇÃO/OBJETIVOS: Avaliar a prática clínica com relação à verificação do cartão vacinal e à indicação de vacinas específicas em pacientes com doenças reumáticas pediátricas em uso de diferentes drogas, e evidenciar a possível associação entre frequência de vacinação e tempo de prática clínica dos reumatologistas pediátricos do estado de São Paulo. MATERIAL E MÉTODOS: Um questionário foi enviado para os reumatologistas pediátricos do Departamento de Reumatologia da Sociedade de Pediatra de São Paulo. Esse instrumento incluiu questões sobre tempo de prática em Reumatologia Pediátrica, vacinação de pacientes com Lúpus Eritematoso Sistêmico Juvenil (LESJ), artrite idiopática juvenil (AIJ), dermatomiosite juvenil (DMJ) e imunização de acordo com os tratamentos utilizados. RESULTADOS: Cartão de vacinação foi visto por 100% dos profissionais na primeira consulta e por 36% anualmente. Vacinas de agentes vivos não foram recomendadas para pacientes com LESJ, AIJ e DMJ em 44%, 64% e 48%, respectivamente. Os profissionais foram divididos em dois grupos: A (< 15 anos de prática, n = 12) e B (> 16 anos, n = 13). Nenhuma diferença estatística foi observada no uso de vacinas de agentes vivos e vacinas de agentes inativos ou componentes proteicos em relação ao tratamento nos dois grupos (P > 0,05). Além disso, os grupos foram similares em relação à opinião sobre a gravidade de imunossupressão em pacientes com LESJ, AIJ e DMJ com ou sem atividade e a terapêutica utilizada (P > 0,05). CONCLUSÕES: A frequência de vacinação por reumatologistas pediátricos de São Paulo é baixa, especialmente após a primeira consulta, e não é influenciada pelo tempo de prática profissional.

INTRODUCTION/OBJECTIVES: Evaluate clinical practice through assessment of vaccination card and recommendation of specific vaccines in pediatric patients with rheumatic diseases in use of different drugs and reveal the possible association between vaccination frequency and time of the clinical practice of pediatric rheumatologists in the state of São Paulo. MATERIAL AND METHODS: A questionnaire was sent to pediatric rheumatologists of the Departamento de Reumatologia da Sociedade de Pediatria de São Paulo. This instrument included questions about practice time on Pediatric Rheumatology, vaccination of patients with juvenile systemic lupus erythematosus (JSLE), juvenile idiopathic arthritis (JIA), juvenile dermatomyositis (JDM), and immunization according to the treatments used. RESULTS: Vaccination card was seen by 100% of the professionals at the first visit and by 36% annually. Vaccines of live agents were not recommended for patients with JSLE, JIA, and JDM in 44%, 64%, and 48%, respectively. The professionals were divided into two groups: Group A (< 15 years of practice, n = 12) and B (> 16 years, n = 13). No statistical difference was observed in the use of live agent vaccine and vaccines with inactivated agents or protein components in the two treatment groups (P > 0.05). Moreover, the groups had similar opinion regarding severity of immunosuppression in patients with JSLE, JIA, and JDM (with or without activity) and treatment used (P > 0.05). CONCLUSIONS: The frequency of immunization by pediatric rheumatologists in São Paulo is low, especially after the first visit, and not influenced by time of professional practice.

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Selective agent and A. tumefaciens overgrowth-control antibiotics in Eucalyptus camaldulensis Cotiledonary culture
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Quisen, Regina

; Oliveira, Yohana de

; Pileggi, Marcos

; Cuquel, Francine

; Quoirin, Marguerite

Brazilian Archives of Biology and Technology

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Dez 2009, Volume 52 Nº 6 Páginas 1485 - 1492

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

O presente trabalho teve como objetivos determinar o tipo e a concentração de antibióticos adequados para a eliminação de Agrobacterium tumefaciens de explantes inoculados e estabelecer a dose letal mínima do agente seletivo canamicina (Km), sem interferir com o potencial regenerativo do explante cotiledonar de E. camaldulensis. Para a avaliação da eficiência dos antibióticos, cotilédones infectados com A. tumefaciens foram cultivados em meio MS N/2 com BAP, ANA, canamicina e cefotaxima ou AugmentinaÒ . Foi observada a maior média de brotos regenerados por explante (5,4) na presença de 300 mg.L-1 de AugmentinaÒ /15 dias, seguido por 150 mg.L-1/30 dias, e 100 mg.L-1/30 dias. Explantes cotiledonares não transformados foram cultivados em meio de cultura suplementado com antibiótico canamicina onde a concentração adequada para a seleção de células transformadas foi de 9 mg.L-1.

The objectives of the present work were to establish the minimal lethal dose of the selective agent to determine the type and concentration of appropriate antibiotics for the elimination of Agrobacterium tumefaciens inoculated explants, without interfering with the regenerative potential of the E. camaldulensis cotyledonary explants. Non-transformed explants were cultivated in medium supplemented with kanamycin. The results showed that the antibiotic was suitable for the selection of transformed cells in the concentration of 9 mg L-1 as it inhibited the growth of non-transformed cells. Cotyledons infected with A. tumefaciens were cultivated in MS N/2 medium supplemented with BAP, ANA, Km and cefotaxime or AugmentinÒ . The highest average of regenerated shoots by explant (5,4) was observed in the presence of 300 mg L-1 of AugmentinÒ /15 days, followed by 150 mg L-1/15 days and 100 mg L-1/30 days.

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Selection of endophytic fungi from comfrey (Symphytum officinale L.) for in vitro biological control of the phytopathogen Sclerotinia sclerotiorum (Lib.)
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Rocha, Rafaeli

; Luz, Daniela Eleutério da

; Engels, Cibelle

; Pileggi, Sônia Alvim Veiga

; Jaccoud Filho, David de Souza

; Matiello, Rodrigo Rodrigues

; Pileggi, Marcos

Brazilian Journal of Microbiology

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Mar 2009, Volume 40 Nº 1 Páginas 73 - 78

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

O controle biológico consiste no uso de organismos que atacam outros que causam danos a culturas de plantas. Esta é uma estratégia muito utilizada no Controle Integrado de Pragas (CIP). O mofo branco, causado por Sclerotiniasclerotiorum (Lib.), causa danos em culturas de feijão. Este fungo é encontrado no solo e seus sintomas são caracterizados por lesões úmidas cobertas por micélios algodonosos, crescidos a partir do solo e/ou da planta hospedeira. Há relatos de pesquisas buscando agentes potenciais de controle biológico isolados de plantas para controlar fungos fitopatogênicos. Entre estes agentes encontram-se os microrganismos endofíticos, habitantes de espaços intercelulares de tecidos vegetais, muitas vezes responsáveis pela produção de substâncias antimicrobianas. Este trabalho teve por objetivo selecionar linhagens endofíticas isoladas de folhas de confrei (Symphytumofficinale L.), com potencial de antagonismo in vitro contra a linhagem fitopatogênica S. sclerotiorum. Doze linhagens de fungos endofíticos foram utilizadas na técnica de desafio em placa contra um isolado patogênico de S. sclerotiorum. Com o auxílio desta técnica, quatro linhagens com melhor atividade antagonística contra S. sclerotiorum foram selecionadas. Zonas de inibição no crescimento da linhagem patogênica foram consideradas como indicativo de antibiose. Foram efetuadas análises da porcentagem de elongação micelial com e sem antagonismo, mostrando resultados de 46,7% a 50,0% de redução no crescimento micelial do fitopatógeno. Estas análises consistiram de avaliações das medidas do crescimento em mm/dia das linhagens endofíticas/patogênica em testes de antagonismo.

Biological control consists of using one organism to attack another that may cause economic damage to crops. Integrated Pest Management (IPM) is a very common strategy. The white mold produced by Sclerotiniasclerotiorum (Lib.) causes considerable damage to bean crops. This fungus is a soil inhabitant, the symptoms of which are characterized by water-soaked lesions covered by a white cottony fungal growth on the soil surface and/or the host plant. Possible biological control agents taken from plants are being investigated as phytopathogen inhibitors. These are endophytic microorganisms that inhabit the intercellular spaces of vegetal tissues and are often responsible for antimicrobial production. The objective of the present study was to select endophytic fungi isolated from comfrey (Symphytumofficinale L.) leaves with in vitro antagonist potential against the phytopathogenic fungus S. sclerotiorum. Twelve isolates of endophytic fungi and a pathogenic strain of S. sclerotiorum were used in the challenge method. With the aid of this method, four endophytes with the best antagonistic activity against S. sclerotiorum were selected. Pathogen growth inhibition zones were considered indicative of antibiosis. The percentages of pathogenic mycelia growth were measured both with and without the antagonist, resulting in growth reductions of 46.7% to 50.0% for S. sclerotiorum. These analyses were performed by evaluating the endophytic/pathogenic mycelia growth in mm/day over an eight-day period of antagonistic tests.

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10.

Degradation of 2,4-D herbicide by microorganisms isolated from Brazilian contaminated soil
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Silva, Tatiane M.

; Stets, Maria I.

; Mazzetto, André M.

; Andrade, Fabiana D.

; Pileggi, Sônia A. V.

; Fávero, Paulo R.

; Cantú, Marcelo D.

; Carrilho, Emanuel

; Carneiro, Paulo I.B.

; Pileggi, Marcos

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Set 2007, Volume 38 Nº 3 Páginas 522 - 525

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O objetivo deste trabalho foi isolar microrganismos de solo brasileiro contaminado com o herbicida 2,4-D, e analisar a eficiência da degradação por cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC). Serratia marcescens e Penicillium sp jamais haviam sido relatadas como degradadoras de 2,4-D. As linhagens isoladas representam um grande potencial em biorremediação.

The aim of this work was to isolate microorganisms from Brazilian soil contaminated with 2,4-D herbicide, and analyze the efficiency for 2,4D degradation, using high-performance liquid chromatography (HPLC). Serratia marcescens and Penicillium sp had never been reported as able to degrade 2,4-D. The isolated strains represent a great potential for bioremediation.

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11.

Selection of microorganisms degrading S-Metolachlor herbicide
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Martins, Paula Fabiane

; Martinez, Camila Ortiz

; Carvalho, Giselle de

; Carneiro, Paulo Irajara Borba

; Azevedo, Ricardo Antunes

; Pileggi, Sônia Alvim Veiga

; Melo, Itamar Soares de

; Pileggi, Marcos

Brazilian Archives of Biology and Technology

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Jan 2007, Volume 50 Nº 1 Páginas 153 - 159

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Os herbicidas representam 65% do consumo geral, sendo que o S-Metolachlor é um dos mais utilizados e está trazendo preocupações ambientais. Objetivamos detectar a degradação do S-Metolachlor por microorganismos de solos sob plantio. Foram identificadas as espécies bacterianas: Klebsiella pneumoniae pneumoniae GC s.B linhagem 1, Pseudomonas alcaligenes, Enterobacter aerogenes GC s.A e Klebsiella pneumoniae pneumoniae GC s.B linhagem 2. Resultados da curva de crescimento por espectrofotometria não permitiram definir diferentes fases, levando a pensar em uma fase Lag longa. Frascos de cultura demonstraram a formação de biofilme, provocando mudança na cor do herbicida, interferindo na leitura do crescimento. É possível a existência de fase Log, mas não detectável pelo método. Após 5 dias de incubação a 35ºC, a diferença média de concentração do S-Metolachlor foi de 14.42%, e em 10 dias, 35.01%. Observou-se o aparecimento de um halo em volta das colônias, o que corrobora a hipótese de degradação microbiana do herbicida.

The aim of this work was to study herbicide degradation through selected microorganisms from humus and soil subjected to different plantation systems. The following bacterial species were identified: Klebsiella pneumoniae pneumoniae GC s.B strain 1, Pseudomonas alcaligenes, Enterobacter aerogenes GC s.A and Klebsiella pneumoniae pneumoniae GC s.B strain 2. Growth studies yet suggested the possibility of a very long lag phase. Although, culture with the herbicide presented biofilm formation and there were color changes in the herbicide that could have interfered with the espectrophotometry readings. After 5 days of incubation at 35ºC, the difference in the concentration of herbicide was 14.42% on average and after 10 days, 35.01%.

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12.

Heurísticas para os problemas de geração e sequenciamento de padrões de corte bidimensionais
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; Morabito, Reinaldo

; Arenales, Marcos Nereu

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2007, Volume 27 Nº 3 Páginas 549 - 568

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Neste artigo é tratado o clássico problema de corte de estoque bidimensional, cuja solução consiste em um conjunto de padrões de corte que otimiza uma função objetivo, por exemplo, a perda de material. Porém, os padrões de corte podem ser seqüenciados de modo que um outro objetivo também seja otimizado, como, por exemplo, o número máximo de pilhas abertas de itens (uma pilha é aberta quando um tipo de item é cortado pela primeira vez e fechada quando todos os itens deste tipo foram cortados). Uma boa solução para o problema de geração de padrões de corte freqüentemente não resulta numa boa solução para o problema de sequenciamento de padrões de corte, e vice-versa. Em geral, esses dois problemas são abordados, tanto na prática como na literatura, de forma independente e sucessiva. Pileggi et al. (2005) propuseram abordagens heurísticas para resolver esses dois problemas de forma integrada, considerando o trade-off entre os objetivos envolvidos, e analisaram o caso de corte unidimensional (p.e., corte de barras). No presente trabalho estas abordagens são estendidas e aplicadas para analisar o caso de corte bidimensional guilhotinado (p.e., corte de chapas). Resultados computacionais são apresentados para exemplos gerados aleatoriamente e para um exemplo real de uma fábrica de móveis.

This paper is concerned with the classical two-dimensional cutting stock problem, whose solution consists of a set of cutting patterns that optimize an objective function, for example, the waste of material. Nevertheless, the cutting patterns have to be sequenced so that another criterion is also optimized, for example, the maximum number of open stacks of the items (a stack is opened when a type of item is cut for the first time and closed when all items of this type were cut). A good solution for the problem of generating cutting patterns often does not result in a good solution for the problem of sequencing cutting patterns, and vice-versa. In general, these two problems are treated, either in practice or in the literature, in an independent and successive way. Pileggi et al. (2005) proposed heuristic approaches to solve these two problems in an integrated way, considering the trade-off between the objectives involved, and they analyzed the one-dimensional cutting case (e.g., cut of bars). In the present study these approaches are extended and applied to analyze the two-dimensional guillotine cutting case (e.g., cut of plates). Computational results are presented for randomly generated examples and for an actual instance of a furniture company.

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13.

Abordagens para otimização integrada dos problemas de geração e seqüenciamento de padrões de corte: caso unidimensional
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Pileggi, Gisele C. F

; Morabito, Reinaldo

; Arenales, Marcos Nereu

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Dez 2005, Volume 25 Nº 3 Páginas 417 - 447

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O problema de geração de padrões de corte (ou problema de corte de estoque) consiste em determinar o conjunto de padrões em que unidades demandadas (itens) são cortadas de unidades maiores (objetos) tal que, por exemplo, o custo ou a perda de material é minimizado. O problema de seqüenciamento de padrões de corte consiste em determinar a seqüência em que os padrões são cortados tal que, por exemplo, o número máximo de pilhas abertas (pilhas de itens com demanda apenas parcialmente produzida, que ainda serão cortados de um ou mais padrões seguintes nessa seqüência) é minimizado. Em geral, uma boa solução para o problema de geração de padrões não corresponde a uma boa solução para o problema de seqüenciamento de padrões e vice-versa. Esses dois problemas são freqüentemente resolvidos, tanto na prática como na literatura, de forma independente e sucessiva. Este trabalho apresenta três abordagens heurísticas para resolver de forma integrada os problemas de geração e seqüenciamento de padrões, considerando o trade-off entre os objetivos envolvidos. Embora essas abordagens possam ser aplicadas para problemas de corte e empacotamento de qualquer dimensão, neste trabalho elas são analisadas e comparadas apenas para o caso de corte unidimensional.

The cutting pattern generating problem (or cutting stock problem) consists in determining the set of patterns in which ordered units (items) are cut from larger units (objects) so that, for example, the cost or waste of material is minimized. The cutting pattern sequencing problem consists in determining the sequence in which the patterns are cut so that, for example, the maximum number of open stacks (stacks of items with demand only partially produced and that will be cut in the next cutting patterns of the sequence) is minimized. In general a good solution for the pattern generating problem does not correspond to a good solution for the pattern sequencing problem and vice-versa. These problems are frequently solved, both in practice and in the literature, in an independent and successive way. This work presents three heuristic approaches to deal with the integrated pattern generating and sequencing problem, considering the trade-off between the objectives involved. Although the approaches can be applied to cutting and packing problems of any dimension, in this work they are analyzed and compared only for the one-dimensional cutting case.

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14.

An improved method for transformation of lettuce by Agrobacterium tumefaciens with a gene that confers freezing resistance
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Pileggi, Marcos

; Pereira, Albanin Aparecida Mielniczki

; Silva, Joandrei dos Santos

; Pileggi, Sônia Alvim Veiga

; Verma, Desh Pal S.

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Jun 2001, Volume 44 Nº 2 Páginas 191 - 196

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Um método eficiente de obtenção de cultivares de alface por meio de transformação com Agrobacterium tumefaciens foi descrito por Torres et al., 1993. Neste trabalho foi desenvolvido um procedimento melhorado a partir do trabalho descrito acima foi aplicado para transformação da cultivar de alface Grand Rapids com o gene mutado P5CS. As principais modificações nos protocolos de transformação e regeneração, com o objetivo de torná-los mais práticos. Também foi procurado o melhoramento das etapas de transformação no sentido de se aumentar a superfície de infecção, além do aumento no tempo de co-cultivo com Agrobacterium (em uma alta concentração celular). Maior pressão seletiva foi utilizada contra plantas não transformadas e bactérias. Neste trabalho também se trabalhou na produção de sementes das gerações T1 e T2, para que se pudesse fazer os ensaios fisiológicos e genéticos. Este gene codifica para delta¹-pirrolina-5-carboxilato sintetase, uma enzima bifuncional que catalisa dois passos na biossíntese de prolina em plantas (Zhang et al., 1995; Peng et al., 1996), só que neste caso se tornou insensível para inibição por retroalimentação por prolina. O potencial deste gene é conferir resistência ao estresse hídrico (seca, alta concentração salina, frio) devido ao aumento na concentração de prolina intracelular, que funciona como um osmoprotetor. Neste trabalho foram obtidas e analisadas linhagens de alface transgênicas resistentes ao congelamento.

An efficient method for constructing transgenic lettuce cultivars by Agrobacterium tumefaciens was described by Torres et al., 1993. In the present work, an improvement of the above procedure is described and applied to transform the cultivar Grand Rapids with a mutated P5CS gene. The major modifications were concerned with turning more practical the transformation and regeneration protocols. Also we tried to improve transformation steps by increasing injured area in explants and prolonging co-cultivation with Agrobacteria (in larger concentration). A more significant selective pressure was used against non-transformed plants and bacteria. In these work we were concerned to obtain T1 and T2 seeds. The P5CS gene codes for a delta¹-pyrroline-5-carboxylate synthetase, a bifunctional enzyme that catalyzes two steps of proline biosynthesis in plants (Zhang et al., 1995; Peng et al., 1996), while the mutated gene is insensitive to feedback inhibition by proline. The potential benefit of this gene is to confer water stress resistance (drought, salt, cold) due to increased intracellular levels of proline that works like an osmoprotectant. In this work could obtain and characterize transgenic lettuce lineages which are resistant to freezing temperature.

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