Espécies de fungos da classe Trichomycete (Zygomycota) estão associados com o trato digestivo dos Arthropoda. A relação entre esses fungos e seus hospedeiros ainda é pouco conhecida, podendo ser comensal, benéfica ou deletéria. Conhecimentos da estrutura de comunidades parasitas/ patógenos e os habitats de larvas de Culicidae podem ser importantes em estudos que utilizam medidas combinadas para o controle populacional. Larvas de Culicidae e os fungos Trichomycetes associados foram coletados no município de Manaus, AM; amostras de criadouros incluindo plantas (habitat natural) e reservatórios antrópicos (habitat artificial). O total de 1518 larvas foi coletado, 913 em criadouros naturais e 605 em criadouros artificiais, distribuídas em 12 espécies de sete gêneros. O total de 661 indivíduos (4° estádio) foi dissecado para verificar a presença de fungos Trichomycetes no intestino médio e posterior. Infecção de fungos Trichomycetes no intestino posterior foram observados em 15% de Culex urichii Coquillett, 13% de Culex (Culex) sp1, 9% of Limatus spp., 49% de Aedes aegypti Linnaeus e 1% de Ochlerotatus argyrothorax Bonne-Wepster & Bonne. Somente em Ae. aegypti foram observados fungos Trichomycetes na matriz peritrófica, no intestino médio; porém este fato é provavelmente, um resultado de um desenvolvimento anormal deste fungo.

Fungal species of the class Trichomycete fungi (Zygomycota) are associated with the digestive tracts of Arthropoda. The relationships between these fungi and their hosts are still little understood: they may be commensal, beneficial or deleterious. Knowledge of the community structure of parasites/ pathogens and of the habitats of each species of Culicidae larvae can be important in studies that intend to use combined approaches to population control. Larvae of Culicidae and their associated trichomycete fungi were collected in Manaus County, AM, Brazil; sampling habitats included plants (natural habitat) and anthropic containers (artificial habitats). The total of 1,518 larvae were collected, 913 of which were in natural habitats and 605 were in artificial habitats, distributed in 12 species of seven genera. The total of 661 individuals (4th instar) were dissected to verify the presence of trichomycete fungi in the mid and hindgut. Infection of trichomycete fungi in the hindgut was observed in 15% of Culex urichii Coquillett, 13% of Culex (Culex) sp1, 9% of Limatus spp., 49% of Aedes aegypti Linnaeus and 1% of Ochlerotatus argyrothorax Bonne-Wepster & Bonne. Only in Ae. aegypti were trichomycete fungi observed in the peritrophic matrix, in the midgut; however, this fact is probably, a result of abnormal development of the fungi.