RESUMO Considerando a hipótese de que a dificuldade de controle observada pelos produtores com a espécie do gênero Rottboellia pode ser pela existência de biótipos nas populações, objetivouse estudar a variabilidade genética entre três populações de R. cochinchinensis em regiões de cana-de-açúcar do Estado de São Paulo, utilizando-se da técnica Amplified Fragment Lenght Polimorfism (AFLP). Para a caracterização molecular, seis iniciadores foram utilizados para obtenção dos dados. Os géis de AFLP foram analisados com base na presença (1) e na ausência (0) de marcas. Utilizando-se o software NTSYs, foi calculada a similaridade genética pelo coeficiente de Jaccard e, a partir dele, construído o dendrograma pelo método UPGMA, além da determinação das marcas isopolimórficas. As semelhanças genéticas médias observadas nas regiões foram 0,742 para Igarapava, 0,793 para Mococa, 0,808 para Piracicaba, e entre as regiões foram 0,730 para (Igarapava x Mococa), 0,735 para (Mococa x Piracicaba), e 0,694 para (Igarapava x Piracicaba). Em consonância com o dendrograma, podemos observar a formação de três grupos, um formado por quatro indivíduos, sendo dois do local de Igarapava e de Mococa e outro pelo local Piracicaba e os demais indivíduos, com exceção do indivíduo um, de Piracicaba. Podemos concluir que a similaridade genética entre as populações de capim-camalote coletadas no Estado de São Paulo foi elevada (78%), o que evidência que o manejo realizado entre as populações estudadas devem ser similar. No entanto, não se podem descartar a presença de biótipos nas populações, como é sugerido pela presença de marcas polimórficas, detectadas pelo marcador AFLP, gerando 22% de variabilidade genética média.
ABSTRACT The hypothesis assumed was the existence of biotypes within populations, which has been the cause of difficulties in itchgrass control by farmers. For that, the genetic variability of three populations of Rottboellia cochinchinensis in sugarcane fields in the state of São Paulo was investigated by using the Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique. Six primers were used to obtain molecular characterization data. AFLP gels were analyzed based on marker presence (1) and absence (0). Using NTSYs (Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System) software, the genetic similarity was calculated by the Jaccard coefficient and, from that, a dendrogram was built through the UPGMA (Unweighted Pair Group Method Arithmetic averages) method, besides determining the isopolymorphic marks. The average genetic similarities seen in the region was 0.742 for Igarapava, 0.793 for Mococa and 0.808 for Piracicaba. Between regions it was 0.730 (Igarapava vs Mococa), 0.735 (Mococa vs Piracicaba) and 0.694 (Igarapava vs Piracicaba). In line with the dendrogram, it is possible to detect the formation of two groups, one with 8 plants from Igarapava and Mococa and the other with 21 plants from Igarapava, Mococa and Piracicaba, as well as the presence of 1 discriminant individual from Piracicaba. It can be concluded that the genetic similarity among itchgrass populations from the state of São Paulo was high (72%), which denotes that the difficulties in chemical management are not only due to different biotypes but also due to other characteristics linked to tolerance of the species to herbicides. However, biotype existence cannot be discarded because of the polymorphic marks generating 22% average genetic variability.