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au:ROMANO, JOAO V.
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1.
Multidisciplinary Scientific Cruises for Environmental Characterization in the Santos Basin – Methods and Sampling Design
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Moreira, Daniel L.
; Dalto, Adriana G.
; Figueiredo JR, Alberto G.
; Valerio, Aline M.
; Detoni, Amalia M. S.
; Bonecker, Ana C. T.
; Signori, Camila N.
; Namiki, Cláudia
; Sasaki, Dalton K.
; Pupo, Daniel V.
; Silva, Danilo A.
; Kutner, Deborah S.
; Duque-Castaño, Diana C.
; Marcon, Eduardo H.
; Gallotta, Fabiana D. C.
; Paula, Fabiana S.
; Gallucci, Fabiane
; Roque, Gabriela C. F.
; Campos, Giulia S.
; Fonseca, Gustavo
; Mattos, Gustavo
; Lavrado, Helena P.
; Silveira, Ilson C. A. da
; Costa, Jessica O.
; Santos Filho, João R. dos
; Carneiro, Juliane C.
; Moreira, Julio C.F.
; Rozo, Laura
; Araujo, Leandro F.M.
; Lazzari, Letícia
; Silva, Letícia O. da
; Michelazzo, Luan S.
; Fernandes, Luciano F.
; Dottori, Marcelo
; Araújo Jr., Marcus A. G. de
; Chuqui, Mateus G.
; Ceccopieri, Milena
; Borges-Silva, Milton
; Kampel, Milton
; Bergo, Natascha M.
; Silva, Paulo V. M.
; Tura, Pedro M.
; Moura, Rafael B. de
; Romano, Renato G.
; Martins, Renato P.
; Carreira, Renato S.
; Toledo, Rodrigo G.A.
; Bonecker, Sérgio L.C.
; Disaró, Sibelle T.
; Rodrigues, Silvana V.
; Corbisier, Thais N.
; Vicente, Thaisa M.
; Paiva, Vitor G. de
; Pellizari, Vivian H.
; Belo, Wellington C.
; Brandini, Frederico P.
; Sousa, Silvia H.M
.
Abstract The Santos Basin (SB) is the main petroliferous basin in the Brazilian continental margin and one of the most studied marine areas in Brazil. However, historical data suggest that new efforts should be carried out to acquire quantitative biological data, especially in the deep sea, to establish the baseline of essential ocean variables in different ecosystems for future monitoring programs. The Brazilian energy company Petrobras planned and executed 24 oceanographic cruises over a period of 2 years to assess the benthic (SANSED cruise) and pelagic (SANAGU cruise) systems of the SB (356 days at sea in 2019 and 2021/2022). These efforts were part of the Santos Project, which comprised a comprehensive environmental study aimed at investigating benthic and pelagic variables to characterize ecology, biogeochemistry, thermohaline properties of water masses, and ocean circulation patterns, geomorphology, and sedimentology, as well as organic and inorganic chemistry. Here we present the detailed sampling designs and the field methods employed on board, during the SB scientific cruises. All sampling protocols were based on standardized approaches. For the benthos analyses, triplicate sediment samples were performed using a GOMEX-type box corer (0.25 m²) or a large modified Van Veen grab (0.75 m²) at 100 stations ranging from 25 to 2400 m depth. At each station, 25 geochemical and physico-chemical parameters were analyzed in addition to micro-, meio-, and macrofauna and living foraminifera samples. For the pelagic system, 60 stations were selected to investigate the plankton community, ranging in size from pico- to macroplankton, through vertical, horizontal, and oblique net hauls (20, 200, and 500 μm mesh size), as well as 25 biogeochemical parameters collected with an aid of a CTD-rosette sampler. Part of this scientific information also serves the Regional Environmental Characterization Project (PCR-BS) in support of Petrobras’ Santos Basin drilling licensing process led by the Brazilian Environmental Agency – IBAMA. This project contributes to the sustainable development of the SB, in line with the guidelines of the United Nations Decade of Ocean Science for Sustainable Development.
2.
[SciELO Preprints] - Guideline of the Brazilian Society of Cardiology on Diagnosis and Treatment of Patients with Chagas Disease Cardiomyopathy
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Marin-Neto, José Antonio
Rassi Jr., Anis
Moraes Oliveira, Gláucia M.
Lemos Correia, Luís Claudio
Novaes Ramos Jr., Alberto
Hasslocher-Moreno, Alejandro Marcel
Luquetti Ostermayer, Alejandro
Sousa, Andréa Silvestre de
Amato Vincenzo de Paola, Angelo
Sobral de Sousa, Antonio Carlos
Pinho Ribeiro, Antonio Luiz
Correia Filho, Dalmo
Moraes de Souza, Dilma do Socorro
Cunha-Neto, Edecio
J. A. Ramires, Felix
Bacal, Fernando
Pereira Nunes, Maria do Carmo
Martinelli Filho, Martino
Ibrahim Scanavacca, Maurício
Magalhães Saraiva, Roberto
Alves de Oliveira Júnior, Wilson
M. Lorga-Filho, Adalberto
de Jesus Benevides de Almeida Guimarães, Adriana
Lopes Latado Braga, Adriana
Sarmento de Oliveira, Adriana
V. L. Sarabanda, Alvaro
Yecê das Neves Pinto, Ana
Assis Lopes do Carmo, André
Schmidt, André
Costa, Andréa Rodrigues da
Ianni, Barbara Maria
Markman Filho, Brivaldo
Eduardo Rochitte, Carlos
Thé Macedo, Carolina
Mady, Charles
Chevillard, Christophe
Bittencourt das Virgens, Cláudio Marcelo
Nery de Castro, Cleudson
De Paoli de Carvalho Britto, Constança Felícia
Pisani, Cristiano
do Carmo Rassi, Daniela
C. Sobral Filho, Dario
Rodrigues Almeida, Dirceu
A. Bocchi, Edimar
T. Mesquita, Evandro
de Souza Nogueira Sardinha Mendes, Fernanda
Pereira, Francisca Tatiana
Sperandio da Silva, Gilberto Marcelo
de Lima Peixoto, Giselle
Glotz de Lima, Gustavo
H. Veloso, Henrique
Turin Moreira, Henrique
Bellotti Lopes, Hugo
Masciarelli Francisco Pinto, Ibraim
Pinto Dias, João Carlos
Bemfica, João Marcos
Silva-Nunes, João Paulo
Soares Barreto-Filho, José Augusto
Kerr Saraiva, José Francisco
Lannes-Vieira, Joseli
Menezes Oliveira, Joselina Luzia
V. Armaganijan, Luciana
Martins, Luiz Cláudio
C. Sangenis, Luiz Henrique
Barbosa, Marco Paulo
Almeida-Santos, Marcos Antônio
Simões, Marcos Vinicius
Shikanai-Yasuda, Maria Aparecida
Vieira Moreira, Maria da Consolação
Higuchi, Maria de Lourdes
Costa Monteiro, Maria Rita de Cássia
Felix Mediano, Mauro Felippe
Maia Lima, Mayara
T. Oliveira, Maykon
Moreira Dias Romano , Minna
Nitz, Nadjar
de Tarso Jorge Medeiros, Paulo
Vieira Alves, Renato
Alkmim Teixeira, Ricardo
Coury Pedrosa, Roberto
Aras, Roque
Morais Torres, Rosália
dos Santos Povoa, Rui Manoel
Rassi, Sérgio Gabriel
Salles Xavier, Sérgio
Marinho Martins Alves , Silvia
B. N. Tavares, Suelene
Lima Palmeira, Swamy
da Silva Junior, Telêmaco Luiz
da Rocha Rodrigues, Thiago
Madrini Junior, Vagner
Maia da Costa , Veruska
Dutra, Walderez
This guideline aimed to update the concepts and formulate the standards of conduct and scientific evidence that support them, regarding the diagnosis and treatment of the Cardiomyopathy of Chagas disease, with special emphasis on the rationality base that supported it.nbsp;
Chagas disease in the 21st century maintains an epidemiological pattern of endemicity in 21 Latin American countries. Researchers and managers from endemic and non-endemic countries point to the need to adopt comprehensive public health policies to effectively control the interhuman transmission of T. cruzi infection, and to obtain an optimized level of care for already infected individuals, focusing on diagnostic and therapeutic opportunistic opportunities.
nbsp;
Pathogenic and pathophysiological mechanisms of the Cardiomyopathy of Chagas disease were revisited after in-depth updating and the notion that necrosis and fibrosis are stimulated by tissue parasitic persistence and adverse immune reaction, as fundamental mechanisms, assisted by autonomic and microvascular disorders, was well established. Some of them have recently formed potential targets of therapies.nbsp;
The natural history of the acute and chronic phases was reviewed, with enhancement for oral transmission, indeterminate form and chronic syndromes. Recent meta-analyses of observational studies have estimated the risk of evolution from acute and indeterminate forms and mortality after chronic cardiomyopathy. Therapeutic approaches applicable to individuals with Indeterminate form of Chagas disease were specifically addressed. All methods to detect structural and/or functional alterations with various cardiac imaging techniques were also reviewed, with recommendations for use in various clinical scenarios. Mortality risk stratification based on the Rassi score, with recent studies of its application, was complemented by methods that detect myocardial fibrosis.nbsp;
The current methodology for etiological diagnosis and the consequent implications of trypanonomic treatment deserved a comprehensive and in-depth approach. Also the treatment of patients at risk or with heart failure, arrhythmias and thromboembolic events, based on pharmacological and complementary resources, received special attention. Additional chapters supported the conducts applicable to several special contexts, including t. cruzi/HIV co-infection, risk during surgeries, in pregnant women, in the reactivation of infection after heart transplantation, and others.nbsp; nbsp;nbsp;
Finally, two chapters of great social significance, addressing the structuring of specialized services to care for individuals with the Cardiomyopathy of Chagas disease, and reviewing the concepts of severe heart disease and its medical-labor implications completed this guideline.
Esta diretriz teve como objetivo principal atualizar os conceitos e formular as normas de conduta e evidências científicas que as suportam, quanto ao diagnóstico e tratamento da CDC, com especial ênfase na base de racionalidade que a embasou.
A DC no século XXI mantém padrão epidemiológico de endemicidade em 21 países da América Latina. Investigadores e gestores de países endêmicos e não endêmicos indigitam a necessidade de se adotarem políticas abrangentes, de saúde pública, para controle eficaz da transmissão inter-humanos da infecção pelo T. cruzi, e obter-se nível otimizado de atendimento aos indivíduos já infectados, com foco em oportunização diagnóstica e terapêutica.
Mecanismos patogênicos e fisiopatológicos da CDC foram revisitados após atualização aprofundada e ficou bem consolidada a noção de que necrose e fibrose sejam estimuladas pela persistência parasitária tissular e reação imune adversa, como mecanismos fundamentais, coadjuvados por distúrbios autonômicos e microvasculares. Alguns deles recentemente constituíram alvos potenciais de terapêuticas.
A história natural das fases aguda e crônica foi revista, com realce para a transmissão oral, a forma indeterminada e as síndromes crônicas. Metanálises recentes de estudos observacionais estimaram o risco de evolução a partir das formas aguda e indeterminada e de mortalidade após instalação da cardiomiopatia crônica. Condutas terapêuticas aplicáveis aos indivíduos com a FIDC foram abordadas especificamente. Todos os métodos para detectar alterações estruturais e/ou funcionais com variadas técnicas de imageamento cardíaco também foram revisados, com recomendações de uso nos vários cenários clínicos. Estratificação de risco de mortalidade fundamentada no escore de Rassi, com estudos recentes de sua aplicação, foi complementada por métodos que detectam fibrose miocárdica.
A metodologia atual para diagnóstico etiológico e as consequentes implicações do tratamento tripanossomicida mereceram enfoque abrangente e aprofundado. Também o tratamento de pacientes em risco ou com insuficiência cardíaca, arritmias e eventos tromboembólicos, baseado em recursos farmacológicos e complementares, recebeu especial atenção. Capítulos suplementares subsidiaram as condutas aplicáveis a diversos contextos especiais, entre eles o da co-infecção por T. cruzi/HIV, risco durante cirurgias, em grávidas, na reativação da infecção após transplante cardíacos, e outros.nbsp;nbsp;nbsp;
Por fim, dois capítulos de grande significado social, abordando a estruturação de serviços especializados para atendimento aos indivíduos com a CDC, e revisando os conceitos de cardiopatia grave e suas implicações médico-trabalhistas completaram esta diretriz.nbsp;
3.
Evaluation of tear production in juvenile opossum using three different methods
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Oria, Arianne P.
; Raposo, Ana C.
; Araujo, Nayone L.L.C.
; Romano, João V.
; Martins-Filho, Emanoel F.
; Gomes Junior, Deusdete
; Galera, Paula D.
.
RESUMO: O estabelecimento do parâmetro de produção lacrimal nas diferentes espécies é importante para o entendimento da saúde do olho e é um dos componentes da semiotécnica oftálmica. Particularidades derivadas da anatomofisiologia das espécies não domésticas induzem a busca de metodologias que sejam mais fidedignas aos parâmetros. Objetivou-se com este estudo avaliar e comparar a produção lacrimal de gambás-de-orelha-branca (Didelphis albiventris) e gambás-de-orelha-preta (Didelphis aurita) por três diferentes métodos. Quinze indivíduos de cada espécie, juvenis, hígidos, de ambos os sexos, com 60 a 90 dias de vida, foram contidos fisicamente para realização do teste lacrimal do vermelho de fenol (TLVF), da ponta de papel absorvente estéril e do teste lacrimal de Schirmer modificado (TLSm). O TLVF foi o mais difícil de ser executado devido à maleabilidade do fio, enquanto a TEPA se mostrou mais exequível para ambas as espécies. A mediana ± intervalo semi-interquartil para o TLVF foi de 19,79±2,61mm/15” e 5,22±2,92mm/15”, para a TEPA foram de 16,25±1,82mm/min e 10,93±3,04mm/min, e para o TLSm foram de 0±1,63mm/min e 0±1,63mm/min, para gambás-de-orelha-branca e gambás-de-orelha-preta, respectivamente. Não houve diferença entre o olho direito e esquerdo e nem quanto ao sexo. Obteve-se diferença significativa para um mesmo teste entre as espécies. Não foi encontrada correlação significativa entre os testes para ambas as espécies. A quantificação da porção aquosa da lágrima poderá auxiliar no diagnóstico precoce de doenças oculares nas espécies estudadas.
ABSTRACT: The establishment of parameters for tear production in different species is important for better understanding eye´s health and is one of the components of the ophthalmic semiological technique. Particularities derived from the anatomophysiology of non-domestic species induce the search for more reliable methodologies. The aim was to evaluate and compare tear production of white-eared opossum (Didelphis albiventris) and Brazilian common opossum (Didelphis aurita) by three different methods. Fifteen individuals of each species, juveniles, healthy, of both sexes, with 60 to 90 days of life, were physically restrained. Phenol red thread test (PRTT), endodontic absorbent paper point tear test (EAPPTT) and modified -Schirmer tear test (mSTT) were performed. PRTT was the most difficult to perform because of the wire malleability, while EAPPTT was more feasible for both species. The median ± semi-quartile range for PRTT were 19.79±2.61mm/15 “and 5.22±2.92mm/15”, for EAPPTT were 16.25±1.82mm/min and 10.9±3.04mm/min, and for STTm were 0±1.63mm/min and 0±1.63mm/min for white-eared opossum and Brazilian common opossum respectively. There was no difference between the right and left eye neither sex. A significant difference was obtained for the same test to different species. No significant correlation was found between the tests for both species. The description of tear production parameters for juvenile white-eared opossum and Brazilian common opossum may be used as a tool, which will allow the early diagnosis of ocular diseases.
https://doi.org/10.1590/1678-5150-pvb-5735
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4.
Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource
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Vieira, Luiz Gonzaga Esteves
; Andrade, Alan Carvalho
; Colombo, Carlos Augusto
; Moraes, Ana Heloneida de Araújo
; Metha, Ângela
; Oliveira, Angélica Carvalho de
; Labate, Carlos Alberto
; Marino, Celso Luis
; Monteiro-Vitorello, Claúdia de Barros
; Monte, Damares de Castro
; Giglioti, Éder
; Kimura, Edna Teruko
; Romano, Eduardo
; Kuramae, Eiko Eurya
; Lemos, Eliana Gertrudes Macedo
; Almeida, Elionor Rita Pereira de
; Jorge, Érika C.
; Albuquerque, Érika V. S.
; Silva, Felipe Rodrigues da
; Vinecky, Felipe
; Sawazaki, Haiko Enok
; Dorry, Hamza Fahmi A.
; Carrer, Helaine
; Abreu, Ilka Nacif
; Batista, João A. N.
; Teixeira, João Batista
; Kitajima, João Paulo
; Xavier, Karem Guimarães
; Lima, Liziane Maria de
; Camargo, Luis Eduardo Aranha de
; Pereira, Luiz Filipe Protasio
; Coutinho, Luiz Lehmann
; Lemos, Manoel Victor Franco
; Romano, Marcelo Ribeiro
; Machado, Marcos Antonio
; Costa, Marcos Mota do Carmo
; Sá, Maria Fátima Grossi de
; Goldman, Maria Helena S.
; Ferro, Maria Inês T.
; Tinoco, Maria Laine Penha
; Oliveira, Mariana C.
; Van Sluys, Marie-Anne
; Shimizu, Milton Massao
; Maluf, Mirian Perez
; Eira, Mirian Therezinha Souza da
; Guerreiro Filho, Oliveiro
; Arruda, Paulo
; Mazzafera, Paulo
; Mariani, Pilar Drummond Sampaio Correa
; Oliveira, Regina L.B.C. de
; Harakava, Ricardo
; Balbao, Silvia Filippi
; Tsai, Siu Mui
; Mauro, Sonia Marli Zingaretti di
; Santos, Suzana Neiva
; Siqueira, Walter José
; Costa, Gustavo Gilson Lacerda
; Formighieri, Eduardo Fernandes
; Carazzolle, Marcelo Falsarella
; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães
.
O café é um dos principais produtos agrícolas, sendo considerado o segundo item em importância do comércio internacional de "commodities". O gênero Coffea pertence à família Rubiaceae que também inclui outras plantas importantes. Este gênero contém aproximadamente 100 espécies, mas a produção comercial é baseada somente em duas espécies, Coffea arabica e Coffea canephora, que representam aproximadamente 70 % e 30 % do mercado total de café, respectivamente. O Projeto Genoma Café Brasileiro foi desenvolvido com o objetivo de disponibilizar os modernos recursos da genômica à comunidade científica e aos diferentes segmentos da cadeia produtiva do café. Para isso, foram seqüenciados 214.964 clones escolhidos aleatoriamente de 37 bibliotecas de cDNA de C. arabica, C. canephora e C. racemosa representando estádios específicos do desenvolvimento de células e de tecidos do cafeeiro, resultando em 130.792, 12.381 e 10.566 seqüências de cada espécie, respectivamente, após processo de trimagem. Os ESTs foram agrupados em 17.982 contigs e em 32.155 singletons. A comparação destas seqüências pelo programa BLAST revelou que 22 % não tiveram nenhuma similaridade significativa às seqüências no banco de dados do National Center for Biotechnology Information (de função conhecida ou desconhecida). A base de dados de ESTs do cafeeiro resultou na identificação de cerca de 33.000 unigenes diferentes. Os resultados de anotação das seqüências foram armazenados em base de dados "online" em <A HREF="http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe">http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe</A>. Os recursos desenvolvidos por este projeto disponibilizam ferramentas genéticas e genômicas que podem ser decisivas para a sustentabilidade, a competitividade e a futura viabilidade da agroindústria cafeeira nos mercados interno e externo.
Coffee is one of the most valuable agricultural commodities and ranks second on international trade exchanges. The genus Coffea belongs to the Rubiaceae family which includes other important plants. The genus contains about 100 species but commercial production is based only on two species, Coffea arabica and Coffea canephora that represent about 70 % and 30 % of the total coffee market, respectively. The Brazilian Coffee Genome Project was designed with the objective of making modern genomics resources available to the coffee scientific community, working on different aspects of the coffee production chain. We have single-pass sequenced a total of 214,964 randomly picked clones from 37 cDNA libraries of C. arabica, C. canephora and C. racemosa, representing specific stages of cells and plant development that after trimming resulted in 130,792, 12,381 and 10,566 sequences for each species, respectively. The ESTs clustered into 17,982 clusters and 32,155 singletons. Blast analysis of these sequences revealed that 22 % had no significant matches to sequences in the National Center for Biotechnology Information database (of known or unknown function). The generated coffee EST database resulted in the identification of close to 33,000 different unigenes. Annotated sequencing results have been stored in an online database at <A HREF="http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe">http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe</A>. Resources developed in this project provide genetic and genomic tools that may hold the key to the sustainability, competitiveness and future viability of the coffee industry in local and international markets.
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journal_title | journal full title (e.g. Cadernos de Saúde Pública) |
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