Abstract Most mining decisions are based on models estimated/simulated given the information obtained from samples. During the exploration stage, samples are commonly taken using diamond drill holes which are accurate and precise. These samples are considered hard data. In the production stage, new samples are added. These last are cheaper and more abundant than the drill hole samples, but imprecise and are here named as soft data. Usually hard and soft data are not sampled at the same locations, they form a heterotopic dataset. This article proposes a framework for geostatistical simulation with completely heterotopic soft data. The simulation proceeds in two steps. First, the variable of interest at the locations where soft data are available is simulated. The local conditional distributions built at these locations consider both hard and soft data and are obtained using simple cokriging with the intrinsic coregionalization model. Second, the variable of interest in the entire simulation grid using the original and previously simulated values at soft data locations is simulated. The results show that the information from soft data improved both the accuracy and precision of the simulated models. The proposed framework is illustrated by a case study with data obtained from an underground copper mine.

RESUMO Introdução: As infecções sexualmente transmissíveis (ISTs) ainda são um importante problema de saúde pública, e a vigilância é essencial para sua prevenção e seu controle. Objetivo: Avaliar a prevalência das ISTs em uma unidade de referência ginecológica no Rio de Janeiro, Brasil. Materiais e métodos: Trata-se de um estudo transversal realizado entre agosto de 2016 e junho de 2017. Foram coletados sangue total e células cervicais de 62 mulheres e realizados testes para detecção de papiloma vírus humano (HPV), vírus da imunodeficiência humana (HIV), sífilis, clamídia, gonorreia e vírus do herpes simples 1 e 2 (HSV-1/2). As lesões cervicais foram diagnosticadas por citopatologia, e em algumas pacientes, por colposcopia (79%). Outras ISTs foram avaliadas durante o exame clínico. Resultados: Foram encontradas lesões cervicais pelo exame citopatológico em 46,8% das pacientes; aquelas com história de quatro parceiros sexuais tiveram mais risco de desenvolvê-las. Houve concordância moderada entre os resultados da citopatologia e colposcopia (Kappa = 0,69). A prevalência de HSV (96,7%), sífilis (6,4%) e HIV (3,2%) foi maior que a descrita na literatura, enquanto a prevalência de clamídia (6,4%) e gonorreia (1,6%) foi similar. O HPV foi detectado em 53,2% das mulheres, sendo 32,3% delas infectadas pelo HPV 16. No contexto das coinfecções, 38 mulheres (61,3%) tinham mais de uma IST. Conclusão: Visto que a maioria das mulheres analisadas era acometida por mais de uma IST, nossos resultados sugerem que uma triagem rotineira dessas infecções nas unidades de saúde poderia auxiliar na detecção precoce, bem como no tratamento e na prevenção. Essas medidas também impactariam no controle do câncer cervical das pacientes.

ABSTRACT Introduction: Sexually transmitted infections (STI) remain a major public health problem and surveillance is crucial for prevention and control strategies. Objective: Our aim was to assess the prevalence of STI in a reference center for gynecology in Rio de Janeiro, Brazil. Materials and methods: It is a cross-sectional study conducted between August 2016 and June 2017. Whole blood and cervical cells were collected from 62 women and tested for human papillomavirus (HPV), human immunodeficiency virus (HIV), syphilis, chlamydia, gonorrhea and herpes simples virus 1 and 2 (HSV-1/2). Cervical lesions were diagnosed by cytopathology and in some patients by colposcopy (79%). Other STI were evaluated during clinical examination. Results: Cervical lesions were detected by cytopathology examinations in 46.8% of patients; those with a history of four sexual partners were at higher risk of developing them. There was moderate agreement between the cytopathology e colposcopy results (Kappa = 0.69). The prevalence of HSV (96.7%), syphilis (6.4%) and HIV (3.2%) were higher than that described in the literature, while the prevalence of chlamydia (6.4%) and gonorrhea (1.6%) were similar. HPV was detected in 53.2% of women, 32.3% of which were infected by HPV 16. In the context of co-infections, 38 women (61.3%) presented more than one STI. Conclusion: Since most of the women analyzed were affected by more than one STI, our results suggest that routine screening for these infections at health centers would help in early detection, treatment and prevention of these infections. These measures would also impact on patients’ cervical cancer control.

Abstract INTRODUCTION: Understanding the diversity of sand flies is important for the epidemiology and control of leishmaniasis. This study aimed to understand the frequency, diversity, and seasonality of medically important sand flies in the municipality of Sinop, State of Mato Grosso, Brazil. METHODS: The study was conducted in an urban area, including four ecotypes with different levels of urbanization. The sand flies were collected using light traps for three nights per month, from May 2014 to April 2015. RESULTS: A total of 62,745 sand flies was collected, 52.34% of which were female. The frequency and diversity of sand flies was the highest in areas of permanent preservation (APPs) (96.85%), and was lower in more urbanized areas. Lutzomyia dasypodogeton was the most frequent species in the APPs. Lutzomyia antunesi was the most frequent in neighborhoods with forest fragments and neighborhoods around APPs, and L. aragaoi was the most frequent in completely urbanized neighborhoods. A higher frequency and diversity of sand flies was observed in the rainy season (87.92%) than in the dry season (12.08%). Eight medically important species were captured, and Lutzomyia antunesi, which is associated with American cutaneous leishmaniasis and visceral leishmaniasis, was observed in all ecotypes throughout the year. CONCLUSIONS: We observed a high frequency and diversity of sand flies in all urban areas, and some species collected were major vectors of leishmaniasis. These results support the need for further studies of the natural rates of infection of these insects and the circulation of the disease in hosts and vectors.

A simulação sequencial gera um conjunto de imagens equiprováveis com a mesma variabilidade espacial dos valores experimentais. O objetivo deste estudo foi analisar a dependência espacial dos atributos diagnósticos do solo e aplicar a simulação sequencial para caracterizar a distribuição de probabilidade local dos atributos e verificar as zonas de incerteza. A área de estudo, com 1.200,32 ha, compreende a fazenda experimental Edgardia da Faculdade de Ciências Agronômicas da Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP. Os atributos do solo foram obtidos a partir de uma grade de amostragem de 90 pontos. A partir do modelo de dependência espacial foi realizada a simulação sequencial direta e a simulação sequencial indicativa. Os atributos do solo apresentaram dependência espacial com diferentes direções para menor e maior alcance. A simulação sequencial direta e a simulação sequencial indicativa possibilitaram a avaliação da incerteza da distribuição espacial das variáveis categóricas e contínuas do solo a qual pode ser utilizada para definir, com mais confiança, as classes de solo e para integrar estudos de planejamento amostral em locais em que a variabilidade é mais acentuada.

The sequential simulation generates a set of equiprobable images with the same spatial variability of the experimental values. The aim of this study was to determine the spatial dependence of the diagnostic attributes of soil and use the sequential simulation to characterize the probability distribution of the location attribute and verify areas of uncertainty. The study area, with 1200.32 ha, was the experimental farm Edgardia belonging to the Faculdade de Ciências Agronômicas da Universidade Estadual Paulista, Botucatu, SP. The soil properties were obtained from a sampling grid of 90 points. From the spatial dependency model the direct sequential simulation and sequential indicative simulation was performed. Soil attributes show spatial dependence with different directions to lesser and greater range. The direct sequential simulation and sequential indicative simulation allowed the evaluation of the spatial distribution of the uncertainty of continuous and categorical variables and soil, which can be used to define, with more confidence, soil classes and to integrate studies of sample planning in places where the variability is most pronounced.

Conduziu-se este trabalho, com o objetivo de conhecer a composição florística do estrato arbóreo de uma área de cerradão, domínio do Cerrado, na Floresta Nacional de Paraopeba - FLONA, município de Paraopeba, estado de Minas Gerais, Brasil (19º16'19"S e 44º24' 06"W). Foram instaladas 30 parcelas de 10 x 10 m, em transectos de 10 x 100 m, totalizando 3.000 m². A distribuição dos transectos foi feita sistematicamente ao longo da trilha, distanciadas 20 m entre si. Foram encontrados 1172 indivíduos/ha, com um total de 61 espécies, pertencentes a 53 gêneros, representados em 30 famílias. As famílias com maior riqueza de espécies foram Fabaceae (Leguminosae) (10) e Vochysiaceae (5), seguidas por Rubiaceae, Sapindaceae, Myrtaceae e Bignoniaceae (4). Das 61 espécies identificadas, pode-se afirmar que 44 (72%) são acessórias e apenas 17 (28%) peculiares de Cerrado, o que evidencia que as espécies de formações florestais encontradas no cerradão parecem ocorrer em seu limite de distribuição, caracterizando o cerradão como uma vegetação de transição entre as florestas e o Cerrado, uma vez que o Cerrado sensu lato comporta-se como um mosaico de espécies peculiares e acessórias, que se sobrepõem ao longo de todo o seu domínio.

This research studied the floristic composition of an area of Cerradão, domain Savanna, in the National Forest of Paraopeba -FLONA, municipal district of Paraopeba-MG, Brazil (19º16'19"S e 44º24' 06"W). A total of 30 plots of 10 x 10 m in transects of 10 x 100 m, totaling 3,000 m² were installed. The distribution of transects were systematically along the track, spaced 20 m apart. 1172 individuals/ha were sampled, totaling 61 species, belonging to 53 genera represented by 30 families. The families with greater species richness were Fabaceae (Leguminosae) (10) and Vochysiaceae (5), followed by Rubiaceae, Sapindaceae, Myrtaceae and Bignoniaceae (4). Out of 61 species identified, 44 (72%) are considered accessory and only 17 (28%) peculiar of Savanna, evidencing that the species of forest formations found in the cerradão seem to occur out of their distribution limit, characterizing the cerradão as a transitional vegetation between the forests and the Cerrado, once the Cerrado stricto sensu behaves as a mosaic of peculiar and accessory species, which are superimposed, along all its domain.

Os objetivos deste trabalho foram determinar a composição florística de um fragmento de Floresta e analisar a sua similaridade com outras áreas de Floresta Estacional Semidecidual e Floresta Ombrófila Densa, com o intuito de classificar a tipologia florestal da área de estudo. O levantamento foi realizado em uma trilha interpretativa na Pousada Serra D'Água (20º41'24"S e 42º29'47"W, 1.100 m de altitude), região de entorno do Parque Estadual da Serra do Brigadeiro (PESB), Município de Araponga, MG. A listagem florística foi obtida a partir do levantamento fitossociológico, no qual foram demarcados 150 pontos quadrantes. Foram relacionadas 147 espécies, 98 gêneros e 50 famílias. As famílias com maior número de espécies foram: Melastomataceae (14), Leguminosae (11), Myrtaceae (10), Rubiaceae (8), Annonaceae (7), Flacourtiaceae (7), Lauraceae (7) e Meliaceae (6). Os resultados da análise de agrupamento revelaram que os aspectos de proximidade geográfica e altitude são os principais responsáveis pela similaridade florística de muitas áreas. A vegetação da área de estudo pode ser classificada como Floresta Estacional Semidecidual Montana, pelo fato de a sua composição florística mostrar alta similaridade com outras áreas dessa mesma tipologia.

The objective of this work was to determine the floristic composition of a forest fragment and to analyze its similarity with other areas of the Semideciduous Seasonal Forest and Dense Ombrophylous Forest, in order to classify the forest typology of this area. The survey was carried out in an interpretative trail at the Pousada Serra D'Água (20º41'24"S and 42º29'47"W, 1100 m altitude), in the region around the Serra do Brigadeiro State Park (PESB), municipality of Araponga, MG. The floristic list was obtained from the phytosociological survey in which 150 quarter-centered-points were established. A total of 147 species, 98 genera and 50 families were found. The families with the greatest number of species were: Melastomataceae (14), Leguminosae (11), Myrtaceae (10), Rubiaceae (8), Annonaceae (7), Flacourtiaceae (7), Lauraceae (7) and Meliaceae (6). The results of the cluster analysis showed that the aspects of geographic proximity and altitude are the main factors responsible for the floristic similarity of many areas. The vegetation of the studied area can be classified as Montane Semideciduous Seasonal Forest, since its floristic composition shows a great similarity with other areas of the same typology.

Diferentes subtipos do virus da imunodeficiência humana do tipo 1 (HIV-1) podem ter propriedades biológicas, imunológicas e patogênicas distintas. A eficiência da transmissão materno-infantil (TMI) pode estar entre estas propriedades, porém resultados escassos e controversos foram descritos até o momento. Neste estudo, 102 crianças nascidas de mães infectadas pelo HIV-1 entre 1998 e 2004 na cidade do Rio Grande, Brasil, foram analisadas para fatores de risco potenciais associados à TMI. Aquela região geográfica é caracterizada por uma alta proporção de indivíduos infectados pelo subtipo C do HIV-1, permitindo a comparação entre os subtipos B e C e sua influência na transmissão vertical do vírus. A análise também incluiu parâmetros clínicos, obstétricos e imunológicos. Análises de regressão multivariada foram conduzidas para avaliar a influência daqueles parâmetros na TMI, e as razões de prevalência (RP) e intervalos de confiança de 95% (IC95) foram também calculados. Um prevalência surpreendentemente alta do subtipo C acima dos 70% foi encontrada. Somente a carga viral do HIV e o uso de protocolo ACGT 076 maternos forma preditivos de TMI. O subtipo do HIV-1 e a contagem de células T CD4+ não foram associados a um risco aumentado de transmissão. Embora uma clara expansão do subtipo C seja evidente no sul do Brasil, esta não parece estar correlacionada com risco aumentado de transmissão vertical.

Different human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) subtypes may have distinct biological, immunological and pathogenic properties. Efficiency of mother-to-child transmission (MTCT) may be among those properties, but few and controversial results have been described so far. In this study, 102 children born from HIV-1-infected mothers between 1998 and 2004 in the city of Rio Grande, Brazil were analyzed for potential risk factors associated with MTCT. That geographic region is characterized by a high proportion of subtype C-infected subjects, and it allowed comparison between subtypes B and C and their influence on MTCT. The analysis also included clinical, obstetric and immunological parameters. Multivariate regression analyses were conducted to evaluate the influence of the parameters on MTCT, and prevalence ratios (PR) and 95% confidence intervals (CI95) were also calculated. A surprisingly high prevalence of subtype C of over 70% was found. Only the HIV viral load and the use of ACTG 076 protocol were predictive of MTCT. HIV subtype and CD4 T-cell counts were not associated with increased risk of transmission. Although a clear expansion of subtype C is evident in southern Brazil, it does not seem to correlate with increased risk of vertical transmission.

Embora os protocolos de prevenção da transmissão materno-infantil do HIV tenham diminuído a infecção pediátrica pelo HIV nos países desenvolvidos, um grande número de crianças ainda se infectam nas nações em desenvolvimento. Dados disponíveis de infecção pediátrica são entretanto ainda escassos. Neste trabalho, nós conduzimos um levantamento clínico, laboratorial e genotípico de um grande coorte de crianças infectadas pelo HIV em acompanhamento em dois grandes centros de atendimento de HIV/AIDS pediátrica do Rio de Janeiro. Crianças em tratamento anti-retroviral, bem como crianças recentemente diagnosticadas e ainda virgens de tratamento foram analisadas. A prevalência de mutações de resistência às drogas, beem como as respostas imunológicas e virológicas ao tratamento foram avaliadas. Além disso, as frequências dos subtipos do HIV-1 e a sua distrbuição ao longo da epidemia de HIV/AIDS no Brasil foram estudadas. Nós observamos uma alta prevalência de mutações de resistência em vírus de crianças em tratamento, ao passo que o grupo virgem de tratamento não possuía mutações. Apesar dos altos níveis de mutações nas crianças tratadas, uma significativa melhora de sua condição imunológica foi observada. A distribuição de subtipos do HIV-1 seguiu as tendências da população adulta, com o aparecimento de subtipos não-B e de formas recombinantes após 1990. Dentro do nosso conhecimento, este é o maior coorte pediátrico de HIV/AIDS já analisado no Brasil, e os resultados obtidos são de suma importância para um melhor entendimento da evolução do HIV/AIDS em um contexto pediátrico.

Although mother-to-child HIV transmission prevention has slowed down pediatric HIV infection in developed countries, large numbers of infants still become infected in developing nations. Data on pediatric HIV infection is however largely scarce. In this study, we have overviewed clinical, laboratory and genotypic data from a large cohort of HIV-infected infants regularly followed at two pediatric HIV outpatient clinics in Rio de Janeiro, Brazil. Children on antiretroviral therapy, as well as drug-naïve, newly diagnosed infants were analyzed. Prevalence of drug resistance mutations, as well as immunological and virological responses to therapy were evaluated. Additionally, HIV-1 subtype frequencies and their distribution over the course of the epidemic were studied. We have found a high prevalence of mutations among ARV-experienced children, whereas mutations were absent in the drug-naïve group. Despite the high levels of resistance among treated infants, an important improvement of their immunological status was observed. HIV-1 subtype distribution followed the trends of the adult population, with the appearance of non-B subtypes and recombinant forms after 1990. To our knowledge, this is the largest pediatric cohort ever analyzed in Brazil, and the data provided is of paramount importance to a better understanding of HIV/AIDS evolution in pediatric settings.