ABSTRACT Visceral leishmaniasis (VL) is a neglected tropical disease caused by the Leishmania infantum parasite. The protozoan is able to infect several domestic and wild mammals. Since the first report on Leishmania spp. infection in horses in South America, leishmaniasis in equids has been highlighted in Brazil. A molecular epidemiological survey was carried out to verify the occurrence of Leishmania spp. DNA in horses and donkeys, in leishmaniases endemic areas in Sao Paulo State, Brazil. To this end, blood samples were obtained from 107 horses and 36 donkeys and subjected to DNA extraction followed by PCR targeting the ITS-1 region. Among the horses and donkeys, 1.87% (2/107) and 8.33% (3/36) were positive by PCR, respectively. The DNA sequencing of the ITS-1 amplification products confirmed L. infantum DNA in these animals. Our results suggest that horses and donkeys from non-VL and VL endemic areas of São Paulo State may be infected by the parasite.

RESUMO: Leishmania infantum é agente etiológico da leishmaniose canina. Por meio de análises parasitológicas e moleculares, a presença do parasita foi investigada em órgãos reprodutivos de cães machos e fêmeas. Amostras de tecidos dos órgãos reprodutivos de 8 cães machos e 16 fêmeas diagnosticados com leishmaniose foram avaliadas por histoquímica, imunohistoquímica e PCR. Apesar de não terem sido observadas lesões macroscópicas ou microscópicas nos órgãos reprodutivos desses cães, formas amastigotas de L. infantum foram observadas em amostras teciduais do testículo e útero. A PCR e o sequenciamento do DNA extraído desses tecidos revelaram sequências 100% idênticas a L. infantum depositadas no GenBank. Nossos resultados sugerem que os testículos e o útero podem abrigar o parasita, sem associação com lesões macroscópicas ou microscópicas, o que pode ter uma grande importância na transmissão venérea e vertical da leishmaniose entre cães.

ABSTRACT: Leishmania infantum causes canine leishmaniasis. Using parasitological and molecular analyses, we identified L. infantum in the reproductive organs of male and female dogs. Using histochemistry, immunohistochemistry, and PCR, we examined tissue samples from the reproductive organs of 8 male dogs and 16 female dogs diagnosed with leishmaniasis. Despite the absence of macroscopic or microscopic lesions in these organs, we observed L. infantum amastigotes in tissue samples from the testis and the uterus. PCR and sequencing of these tissues revealed sequences that matched 100% with L. infantum DNA available at GenBank. The presence of L. infantum amastigotes and DNA in testicular and uterine tissue samples suggested that these organs can harbor the parasite without associated macroscopic or microscopic lesions, and this can be especially important in the vertical and venereal transmission of leishmaniasis in dogs.

Resumo O objetivo deste estudo foi comparar testes moleculares usados para diagnosticar Leishmania spp., em cães apresentando diferentes estágios de infecção. Amostras de sangue e suabe conjuntival (SC) de cães classificados em quatro estágios clínicos foram submetidas a diferentes PCRs (primers 13A/13B, MC1/MC2, LITSR/L5.8S e LEISH-1/LEISH-2). Para o estudo, 22,3% (48/215) dos cães foram classificados como sem sinais clínicos, 67,5% (145/215) estágio I (doença leve), 7,0% (15/215) estágio II (doença moderada) e 3,2% (7/215) estágio III (doença grave). Os resultados mostraram que, em amostras de sangue, 13A/13B detectou número significativamente maior de cães positivos no estágio I (25/145) e no total (42/215) (p≤0,05). No entanto, quando as amostras de SC foram testadas, nenhuma diferença foi observada (p>0,05). Por outro lado, no sangue, MC1/MC2 detectou significativamente menos cães positivos sem sinais clínicos (0/48), em estágio I (0/145) e no total (1/215) (p≤0,05). Da mesma forma, em amostras de SC, MC1/MC2 também apresentou menor detecção (1/215) (p≤0,05). Assim, a PCR em amostras de sangue com 13A/13B tem maior capacidade de detectar cães positivos, principalmente no início da doença do que outros primers, e o par de primers MC1/MC2 não é uma boa escolha para detectar infecção por Leishmania infantum em cães.

Abstract The aim of this study was to compare molecular tests used to diagnose Leishmania spp. in dogs with different stages of infection. Blood and conjunctival swab (CS) samples from dogs classified in four clinical stages were subjected to different PCR protocols (13A/13B, MC1/MC2, LITSR/L5.8S and LEISH-1/LEISH-2 primers). To the study, 22.3% (48/215) of dogs were classified as without clinical signs, 67.5% (145/215) stage I (mild disease), 7.0% (15/215) stage II (moderate disease) and 3.2% (7/215) stage III (severe disease). The results showed that in blood samples, 13A/13B detected a significant higher number of positive dogs in stage I (25/145) and in total (42/215) (p≤0.05). However, when CS samples were tested, no difference was observed (p>0.05). On the other hand, in blood samples, MC1/MC2 detected significantly fewer positive dogs classified as without clinical signs (0/48), in stage I (0/145) and in total (1/215) (p≤0.05). Likewise, in CS samples, this primers showed also lower detection (1/215) (p≤0.05). So than, we can conclude that PCR on blood samples with 13A/13B primers has greater capacity to detect positive dogs, mainly at the initial of clinical disease than do other primers and MC1/MC2 are not a good choice to detect Leishmania infantum infection in dogs.

Resumo Leishmania spp. são agentes causadores das leishmanioses em humanos e em animais, gerando grande impacto à saúde pública. Este estudo objetivou detectar a circulação de Leishmania spp. em área não endêmica para leishmaniose visceral de São Paulo, Brasil. Foram extraídas amostras de DNA de 100 novilhas da cidade de Pirassununga. Estas amostras foram amplificadas com os iniciadores específicos para tripanosomatídeos Internal Transcriber Spacer 1 (ITS1). Os ensaios revelaram uma amostra com bandas entre 300 e 350 pares de base (pb). A amostra demonstrou 100% de identidade com Leishmania infantum (314 pb). Os resultados sugerem que o gado pode ser infectado por L. infantum no Brasil.

Abstract Leishmania spp. are important agents of human and animal leishmaniases that have an important impact on public health. In this study, we aimed to detect the circulation of Leishmania spp. in cattle from a visceral leishmaniasis non-endemic area of the state of São Paulo, Brazil. DNA was extracted from blood samples from 100 heifers in the municipality of Pirassununga and was amplified using primers specific for the first internal transcriber spacer (ITS1), to assess the presence of trypanosomatids. The assays revealed that one sample presented bands of between 300 and 350 base pairs. In GenBank, this sample matched 100% with Leishmania infantum (314 base pairs). The results suggest that cattle can be infected by Leishmania infantum in Brazil.

Resumo A espécie Giardia duodenalis é dividida em oito grupos (nomeados de A a H). Isolados do grupo A são divididos em quatro subgrupos (AI, AII, AIII and AIV). Enquanto isolados do subgrupo AII são detectados quase exclusivamente em hospedeiros humanos, isolados do subgrupo B são encontrados em uma grande variedade de hospedeiros entre animais e humanos. Neste trabalho, foi constatado que, dentre diversos cistos individualizados de G. duodenalis provenientes de fezes de origem humana, um cisto continha os alelos AII e B e um número inesperado de variantes de alelos codificadores de beta giardina e GLORF-C4. Ainda, um dos alelos beta giardina desse cisto possuía fragmentos AII intercalando um fragmento B, indicando que esse alelo pode ser um recombinante entre alelos AII e B. Os resultados aqui apresentados são inéditos e colocam em dúvida o conceito atual de que os diferentes grupos de G. duodenalis representam espécies distintas com diferentes graus de especificidade por hospedeiros.

Abstract Giardia duodenalis is divided into eight assemblages (named A to H). Isolates of assemblage A are divided into four sub-assemblages (AI, AII, AIII and AIV). While isolates of sub-assemblage AII are almost exclusively detected in human hosts, isolates of assemblage B are encountered in a multitude of animal hosts and humans. Here, we isolated single cysts of G. duodenalis from a human stool sample and found that one of them had overlaps of assemblage AII and B alleles and an unexpectedly high number of variants of the beta-giardin (Bg) and GLORF-C4 (OrfC4) alleles. In addition, one of the Bg alleles of that cyst had a fragment of sub-assemblage AII interspersed with fragments of assemblage B, thus indicating that this allele may be a recombinant between sequences A and B. Our results are unprecedented and put a check on the statement that different assemblages of G. duodenalis represent species with different host specificities.

Abstract: INTRODUCTION: Conjunctival swab PCR was evaluated as a tool to diagnose visceral leishmaniasis in dogs. METHODS: Conjunctival swab PCR was compared to indirect immunofluorescence antibody test and blood PCR. RESULTS: Indirect immunofluorescence was significantly correlated with conjunctival swab PCR (p < 0.05), but not with blood PCR (p > 0.05). In addition, conjunctival swab PCR was significantly associated with presence of clinical symptoms (p < 0.05), whereas blood PCR was associated with absence of clinical symptoms (p < 0.05). CONCLUSIONS: Results indicate that conjunctival swab PCR is useful in epidemiological surveys of canine visceral leishmaniasis.

Neste artigo apresenta-se uma metodologia para a filtragem de séries temporais, com aplicação em séries de alta freqüência. Esta metodologia tem como objetivo detectar e substituir as irregularidades da série temporal que podem comprometer a etapa de modelagem. São detalhados o modelo linear dinâmico utilizado para detectar os valores outliers e o emprego do Fator de Bayes. Na interpolação de valores faltantes utiliza-se o Spline Cúbico Suavizado. O desempenho da metodologia proposta é avaliado a través de vários testes onde as irregularidade foram simuladas.

In this article a methodology for filtering a time series is presented, with application to high frequency series such as the minute-by-minute electric load series. The goal of this approach is to detect and substitute the irregularities of the time series that can produce distortions on the modelling stage. Outlier values are detected through a dynamic linear model and the Bayes factor tool; missing values are then interpolated with a Smoothing Cubic Spline. The performance of the proposed approach is illustrated using real data and evaluated through a series of tests where the irregularities have been simulated.