As Ilhas Japonesas são cobertas de rochas e solos vulcânicos intemperizados. Terraços de campos de arroz estão comumente localizados em áreas de tufos verdes, as quais são férteis, mas estão geralmente sujeitas a trágicos deslizamentos de terra associados a grandes terremotos. As análises dos solos por difração e fluorescência de raios-X em áreas de deslizamento identificam a predominância de esmectitas, cujos componentes principais são Mg, Al, Si, K, Ca, Ti, Mn, e Fe como principais componentes. A palha de arroz mostrou que S, Cl, K, e Ca têm importantes papéis para a nutrição dos solos dessa área. Sistemas de tubos de deslizamento foram instalados nestas áreas detufos verdes de forma a reduzir os riscos de deslizamentos. Nas saídas dos tubos de descarga se formou uma esteira de algas microbianas marrom avermelhadas habitadas por bactérias e diatomácea. Os materiais microbianos são ricos em Fe e PO4(3-). As bactérias das águas subterrâneas são ricas em Fe e têm uma alta taxa metabólicasugerindo que os materiais intemperizados foram produzidos não somente por influência física e química, mas também por micro organismos. Muitos dos microorganismos se prendem às superfícies minerais e apresentam um grande impacto na química mineral da água nas áreas de deslizamento. As bactérias nas áreas de tufos verdes desempenham um importante papel na agricultura sustentável incluindo a nutrição do arroz.

Japanese Islands are covered with weathered volcanic rocks and soils. Terraced rice field are located in green-tuff areas which are very fertile but where landslides occur associated to strong earthquakes. The Xray diffraction and X-ray fluorescence analyses of the soils in landslide area identified predominant smectite and Mg, Al, Si, K, Ti, Mn and Fe are main components. The rice leaf showed that S, Cl, K and Ca play important roles for nutrients in the area. Drainpipe systems have set up in the green- tuff areas to reduce the risks of landslides. Reddish brown microbial mats inhabited bacteria and diatom in the drainpipe outlets. The microbial mats are rich in Fe and PO4(3-). The iron bacteria in the ground water have a high metabolic rate suggesting that the weathering materials were produced by not only physical and chemical influence but also by microorganism. Many microorganisms attach to mineral surfaces and show their high impact in the water mineral chemistry in the landslide area. Bacteria in the green-tuff over landslide area play important roles for sustainable agriculture including rice nutrition.

The micromorphological structure of microbial mats (biomats) from the hot springs of the Vilyuchinskaya hydrothermal system, Kamchatka Peninsula, Russia, were investigated. The Vilyuchinskie hot springs had a discharge temperature of 55-56°C and Na-Ca-HCO3-type waters rich in silicic and boric acids. Water and biomats had high concentrations of Fe, Mn, Sr, and As. Enumeration of total bacterial abundance (TBA) demonstrated a low density of bacterial populations. However, the fractions of metabolically active bacteria and respiring iron-oxidizing bacteria in the hot-spring water were high, comprising 68 and 21% of TBA, respectively. Scanning electron microscopy equipped with an energy dispersive X-ray spectrometer (SEM-EDX) showed that unicellular rod-shaped bacteria about 5-µm long predominated in the brown biomats. The mineral capsules of these bacteria contained large amounts of Fe and Si. Extracellular and intracellular particles were observed by transmission electron microscopy. Fe-oxidizing bacteria were isolated from the biomats on agar plates with selective medium. Therefore, it can be concluded that microorganisms inhabiting the biomats of the Vilyuchinskie hot springs are essential for the deposition of Fe-minerals at neutral pH.

O estudo descreve a estrutura micromorfológica dos tapetes microbianos (biomats) das fontes termais do sistema hidrotermal de Vilyunchinskaya, na península de Kamchatcka (Rússia). As fontes hidrotermais tinham uma temperatura de descarga de 55-56ºC e suas águas eram do tipo Na-Ca-HCO3, ricas em ácidos sílicico e bórico. A água e os tapetes microbianos apresentavam uma alta concentração de Fe, Mn, Sr e As. A enumeração da abundância total das bactérias (ATB) mostrou uma baixa densidade das populações bacterianas. Sem dúvida, na água das fontes termais as frações das bactérias metabolicamente ativas e das respiradoras oxidadoras de Fe eram elevadas, compreendendo 68 e 21% de ATB, respectivamente. O estudo feito com microscópio eletrônico de varredura equipado com um espectrofotômetro de raios X dispersores de energía (SEM-EDX) mostrou que nos tapetes microbianos marrons predominavam bactérias unicelulares em forma de bacilo de uns 5 µm. As cápsulas minerais destas bactérias continham grande quantidade de Fe e Si. A observação com microscopia eletrônica de transmissão revelou a presença de partículas extra e intracelulares. Através do uso de placas de ágar com meio seletivo foram isoladas bactérias oxidadoras de Fe dos tapetes microbianos. Conclui-se que os microrganismos dos tapetes microbianos das fontes termais de Vilyuchinskie são essenciais para o depósito de minerais de ferro em pH neutro.

Se describe el estudio de la estructura micromorfológica de los tapetes microbianos (biomats) de las fuentes termales del sistema hidrotermal de Vilyunchinskaya, en la península de Kamchatka (Rusia). Las fuentes hidrotermales de Vilyichinskie tenían una temperatura de descarga de 55-56ºC y sus aguas son del tipo Na-Ca-HCO3, ricas en ácidos silícico y bórico. El agua y los tapetes microbianos tenían una alta concentración de Fe, Mn, Sr y As. La enumeración de la abundancia total de bacterias (ATB) mostró una baja densidad de poblaciones bacterianas. Sin embargo, en el agua de las fuentes termales las fracciones de bacterias metabólicamente activas y de bacterias respiradoras oxidadoras de Fe eran elevadas, del 68 y el 21% de ATB, respectivamente. El estudio mediante el microscopio electrónico de barrido equipado con un espectrofotómetro de rayos X dispersor de energía (SEM-EDX) mostró que en los tapetes microbianos marrones predominaban las bacterias unicelulares en forma de bacilo de unos 5 µm. Las cápsulas minerales de estas bacterias contenían gran cantidad de Fe y Si. La observación con microscopía electrónica de transmisión reveló la presencia de partículas extracelulares e intracelulares. De los tapetes microbianos se aislaron bacterias oxidadoras de Fe mediante placas de agar con medio selectivo. Por tanto, se puede concluir que los microorganismos de los tapetes microbianos de las fuentes termales de Vilyuchinskie son esenciales para el depósito de minerales de hierro a pH neutro.