This study investigated biological characteristics of recovered stressed M. tuberculosis isolates that failed to grow in differential culture media for phenotypic identification and in culture media containing anti-tuberculosis drugs for drug-susceptibility testing, despite of having grown in primary culture. It represents an improvement in the diagnosis of MDR tuberculosis and tuberculosis control.

OBJETIVOS: Verificar evidências da formação de aerossóis durante a manipulação de cepas de micobactérias para teste de sensibilidade às drogas (ANT) e identificação (TIP) e o efeito da descontaminação com solução de álcool 70% e luz ultravioleta (UV) na cabine de segurança biológica (CSB), após os procedimentos laboratoriais. MÉTODOS: Uma placa foi exposta na CSB durante os procedimentos de ANT e TIP. Ao término, a CSB foi limpa e descontaminada com álcool 70% e exposta à luz UV por 15 minutos. Após esse tempo outra placa foi exposta por duas horas, somente com a ventilação da CSB ligada. As placas foram incubadas a 37°C e observadas por 30 dias. Os esfregaços das colônias isoladas foram corados pelas técnicas de Ziehl Neelsen e Gram, e as colônias de bacilo álcool-ácido-resistente (BAAR) foram identificadas pelos métodos tradicionais. RESULTADOS: Nas 38 placas expostas durante o ANT, cresceram micobactérias em 10 placas (26,3%), fungos em uma (2,6%) e outros bacilos em duas (5,3%). Das placas com micobactérias, oito (80%) foram identificadas como M. tuberculosis e duas (20%) tiveram identificação inconclusiva. Mesmo após a descontaminação com álcool 70% e uso de UV, cresceram fungos em duas placas (5,3%) e cocos em outras duas (5,3%). Nas 30 placas colocadas nas CSB durante a TIP, cresceram micobactérias em 10 placas (33,3%), fungos em duas (6,6%), cocos em uma (3,4%) e uma mistura de micobactérias e outro bacilo em uma (3,4%). Não houve crescimento nas placas expostas após descontaminação das CSB com álcool a 70% e uso de UV ao término da TIP. CONCLUSÃO: Durante os procedimentos houve formação de aerossóis contendo micobactérias, fato que ficou comprovado pelo crescimento de colônias de micobactérias nas placas expostas. Técnicas laboratoriais adequadas devem ser respeitadas para minimizar a formação de aerossóis como também observar a experiência dos profissionais, a manutenção de um programa de capacitação e a manutenção periódica da CSB.

OBJECTIVES: To verify the evidence of aerosol formation during the manipulation of mycobacteria strains for susceptibility (ST) and identification tests (IT) as well as the decontamination effect of alcohol solution 70% and ultraviolet (UV) radiation in biological safety cabinets (BSC) after laboratory procedures. METHODS: One plate was exposed in a BSC during ST and IT procedures. Afterwards, the BSC was cleaned and decontaminated with alcohol solution 70% and exposed to UV radiation for 15 minutes. After that, another plate was exposed for two hours, only with the BSC ventilation on. Both plates were incubated at 37°C and observed for 30 days. The smears from the isolated colonies were stained with Ziehl Neelsen and Gram techniques, and acid fast bacilli (AFB) were identified by conventional methods. RESULTS: In 38 plates exposed during ST, there was mycobacteria growth in 10 plates (26.3%), fungi in one (2.6%) and bacilli in two (5.3%). Among those plates that presented mycobacteria growth, eight (80%) were identified as M. tuberculosis and two (20%) had inconclusive identification. Even after decontamination with alcohol solution 70% and UV radiation, two plates presented fungi growth (5.3%) and other two presented cocci growth (5.3%). Among 30 plates exposed during IT procedures, there was mycobacteria growth in 10 of them (33.3%), fungi in two (6.6%), cocci in one (3.4%) and one (3.4%) mixed mycobacteria and another bacillus. No growth was observed when alcohol solution 70% and UV radiation were used for decontamination after IT procedures. CONCLUSION: During the procedures there was aerosol formation with mycobacteria, which was proved by mycobacteria growth on the exposed plates. Not only should adequate laboratory techniques be respected to minimize aerosol formation, but professional expertise, the continuity of capacity programs and periodic BSC maintenance should also be observed.

O gênero Mycobacterium é constituído por espécies do complexo M. tuberculosis e outras denominadas micobactérias não-tuberculosas (MNT). Até o momento, mais de cem MNT foram descritas. Os objetivos deste estudo foram avaliar a diversidade das espécies de MNT identificadas no estado de São Paulo, no período de 1991 a 1997, que antecedeu a expansão da terapia anti-retroviral, e determinar a freqüência dos casos que atenderam alguns critérios bacteriológicos para o diagnóstico das infecções causadas pelas MNT. MATERIAL E MÉTODOS: Foram analisadas 1.892 cepas isoladas de sítios estéreis e não-estéreis de 1.248 pacientes atendidos no estado de São Paulo. RESULTADOS: Do total de pacientes, 1.199 (96,1%) tiveram suas cepas identificadas e 3,9% apresentaram resultados não-conclusivos. As dez espécies encontradas foram o complexo M. avium (MAC), M. kansasii, M. chelonae, M. fortuitum, M. szulgai, M. xenopi, M. marinum, M. gordonae, M. terrae e M. nonchromogenicum. Quarenta e sete (7,8%) casos pulmonares tiveram diagnóstico confirmado pelo isolamento da mesma espécie em três ou mais amostras e 67 (34%) pacientes tiveram o diagnóstico bacteriológico confirmado por isolamento em sítios estéreis. CONCLUSÕES: As espécies de MNT mais freqüentemente isoladas no estado de São Paulo foram MAC e M. kansasii. Uma publicação nacional com recomendações para diagnóstico e tratamento dessas infecções seria fundamental para a conduta correta no diagnóstico e no tratamento de micobacterioses.

INTRODUCTION: Mycobacterium genus includes species of M. tuberculosis complex and others called non-tuberculous mycobacteria (NTM). So far, more than 100 species of NTM have been described. The objectives of this study were to estimate the NTM species diversity among strains isolated in São Paulo State from 1991 to 1997, before the expansion of antiretroviral therapy, and to evaluate the rate of cases that fall under diagnostic criteria for bacteriological diagnosis of NTM infections. MATERIAL AND METHODS: 1,892 strains were isolated from sterile and non-sterile sites of 1,248 patients. RESULTS: 1,199 (96%) were identified as M. avium complex (MAC), M. kansasii, M. chelonae, M. fortuitum, M. szulgai, M. xenopi, M. marinum, M. gordonae, M. terrae or M. nonchromogenicum whereas 49 (3.9%) couldn't be identified up to species. Forty-seven (7,8%) cases from pulmonary sites were confirmed based on strains isolated from three or more samples from the same patient and 67 (34%) patients had NTM isolated from sterile sites, which confirmed the bacteriological diagnosis. CONCLUSIONS: MAC and M. kansasii were the most frequently especies isolated in São Paulo state. National recomendations for the diagnosis and treatment of NTM infections would be useful for correct management of NTM infections.

Mycobacterium kansasii is the most common cause of pulmonary nontuberculous mycobacteria infection and classical identification of this pathogen needs a time consuming phenotypic tests. Polymerase chain reaction-restriction fragment lenght polymorphism analysis (PRA) of the gene enconding for the 65kDa heat shock (hsp65) protein offers an easy, rapid, and inexpensive procedure to identify and subtype M. kansasii isolates. In the present study, we performed a retrospective analysis of patients who had mycobacteria identified on the basis of phenotypic tests by means of a review of database at Mycobacteria Laboratory of the Instituto Adolfo Lutz in the period 1995-1998. A total of 9381 clinical isolates were analyzed of which 7777 (82.9%) were identified as M. tuberculosis complex and 1604 (17.1%) as nontuberculous mycobacteria. Of the 296 M. kansasii isolates, 189 (63.8%) isolates obtained from 119 patients were viable and were analyzed by PRA-hsp65. Hundred eight two (98.9%) were classified as M. kansasii type I. Two isolates were classified as type II and III and five isolates were characterized as other Mycobacterium species. Clinical isolates of M. kansasii in the state of São Paulo was almost exclusively subtype I regardless of HIV status.

O resultado da identificação convencional do complexo Mycobacterium tuberculosis (MT) é demorado. O objetivo deste estudo foi avaliar um teste de triagem para identificação presuntiva de MT e agilização da informação preliminar do resultado, baseado na análise da morfologia da colônia e da visualização de corda no exame microscópico do esfregaço feito da cultura. De janeiro de 1998 a dezembro de 1999 foram analisadas 3056 culturas no Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brasil. As culturas classificadas como micobactérias não tuberculosas foram submetidas ao teste de identificação por método convencional (testes de crescimento em cultura e bioquímicos) e as MT foram submetidas ao teste de sensibilidade às drogas. Os resultados de sensibilidade, especificidade, valores preditivos positivo e negativo, obtidos com a comparação da identificação presuntiva de MT com o teste de triagem proposto e a identificação final com o método convencional, foram respectivamente 98,9, 86,9, 97,8 e 93,0%. Concluiu-se que a análise da morfologia da colônia e da presença de corda no exame microscópico possibilitou a identificação presuntiva de MT. Este teste pode ser usado pelo laboratório para informação preliminar do resultado presuntivo e para direcionar de maneira prática e com baixo custo, os testes adicionais de sensibilidade às drogas ou de identificação de espécie que serão necessários.

The identification of Mycobacterium tuberculosis complex (MT), using non-molecular methods, is time-consuming. The objective of this study was to evaluate a screening test for the presumptive identification of MT, which could potentially decrease laboratory turn-around time for reporting preliminary results. From January 1998 to December 1999, 3056 cultures were analysed at the Mycobacterial Laboratory, Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brasil. The screening test consisted of observation of colony morphology on Löwenstein Jensen medium and evaluation of cord formation on smear microscopy from those positive cultures. After the screening test, the cultures identified as non-tuberculous mycobacteria were identified to species by conventional methods (growth on culture and biochemical tests). Those identified as MT were submitted to drug susceptibility tests. The presumptive identification of MT using the proposed screening test, when compared with conventional tests, presented 98.9, 86.9, 97.8 and 93.0% of sensitivity, specificity, positive and negative predictive values, respectively. The conclusion is that it is possible to make a presumptive identification of MT using visual analysis of colony morphology and cord formation on microscopy examination. This method could be used to report the presumptive identification of MT and to guide laboratory decisions regarding susceptibility and identification tests with little cost and in a very practical way.