Resumo O uso e as mudanças na cobertura da terra estão afetando o meio ambiente global e os ecossistemas das diferentes biosferas. O monitoramento, relatório e verificação (MRV) dessas mudanças são de extrema importância, pois muitas vezes resultam em várias consequências ambientais globais, como degradação da terra, erosão em massa, deterioração do hábitat, bem como micro e macroclima das regiões. As tecnologias avançadas, como sensoriamento remoto (RS) e sistema de informações geográficas (SIG), são úteis para determinar / identificar essas mudanças. Na área de estudo atual, as mudanças nos estoques de carbono, principalmente em áreas florestais, estão resultando em uma dinâmica considerável dos estoques de carbono como resultado das mudanças climáticas e do sequestro de carbono. Este estudo foi realizado no distrito de Diamer de Gilgit Baltistan (GB), Paquistão, para investigar a mudança na mudança de cobertura / mudança de uso da terra (particularmente uso de terras florestais), bem como o potencial de sequestro de carbono das florestas no distrito durante quase os últimos 25 anos. A cobertura da terra, os dados temporais do Landsat (nível 1, LIT), foram baixados do USGS EROS (2016), para 1979-1989, 1990-2000 e 2001-2012. Mudanças nos usos da terra, particularmente na cobertura florestal, foram investigadas usando técnicas de SIG. O inventário florestal foi realizado por meio de técnicas de amostragem aleatória. Um lote padrão de 0,1 ha (n = 80) foi estabelecido para determinar a densidade das árvores, volume, biomassa e estoques de C. A simulação dos estoques de C foi realizada pela aplicação do modelo CO2FIX com a entrada de dados do inventário. Os resultados mostraram uma diminuição na cobertura florestal e de neve na região de 1979 a 2012. Da mesma forma, diminuição foi observada no volume da árvore, biomassa das árvores, dinâmica dos estoques de C e diminuição na densidade das árvores, respectivamente. É recomendado que precisemos de mais projetos como o BTAP (Billion Tree Afforestation Project) e o projeto Green Pakistan para aumentar a cobertura florestal, controlar as mudanças no uso da terra, proteger o ecossistema florestal e proteger a cobertura de neve.

Abstract Land use and land cover change are affecting the global environment and ecosystems of the different biospheres. Monitoring, reporting and verification (MRV) of these changes is of utmost importance as they often results in several global environmental consequences such as land degradation, mass erosion, habitat deterioration as well as micro and macro climate of the regions. The advance technologies like remote sensing (RS) and geographical information system (GIS) are helpful in determining/ identifying these changes. In the current study area, changes in carbon stocks, notably in forest areas, are resulting in considerable dynamics of carbon stocks as a result of climate change and carbon sequestration. This study was carried out in the Diamer district of the Gilgit Baltistan (GB) Pakistan to investigate the change in cover change/land use change (particularly Forest Land use) as well as carbon sequestration potential of the forests in the district during almost last 25years. The land cover, temporal Landsat data (level 1, LIT) were downloaded from the USGS EROS (2016), for 1979-1989, 1990-2000 and 2001-2012. Change in land uses, particularly forest cover was investigated using GIS techniques. Forest inventory was carried out using random sampling techniques. A standard plot of size 0.1 ha (n=80) was laid out to determine the tree density, volume, biomass and C stocks. Simulation of C stocks was accomplished by application of the CO2FIX model with the data input from inventory. Results showed a decrease in both forest and snow cover in the region from 1979-2012. Similarly decrease was seen in tree volume, tree Biomass, dynamics of C Stocks and decrease was in occur tree density respectively. It is recommended we need further more like project such as BTAP (Billion Tree Afforestation Project) and green Pakistan project to increase the forest cover, to control on land use change, protect forest ecosystem and to protect snow cover.

Resumo No presente estudo, diferentes níveis de alimentação da dieta formulada com Moringa oleifera foram comparados para analisar o desempenho de crescimento, taxa de conversão alimentar, eficiência de conversão alimentar e microbiologia intestinal de Oreochromis niloticus. O estudo foi composto por quatro grupos de tratamento, incluindo 4%, 8% e 12% de Moringa oleifera e um grupo de controle sem folhas de Moringa. O ensaio experimental foi realizado no laboratório de Zoologia do Instituto de Ciências Aplicadas e Sociais do Paquistão (PIASS), Kasur. Os parâmetros físico-químicos da água como temperatura, oxigênio dissolvido, pH, sólidos totais dissolvidos e salinidade em todos os aquários foram encontrados não significativamente diferentes entre si. Na condição controle T1, o ganho médio de peso foi de 14,89±16,90a gramas, enquanto o ganho médio de comprimento foi de 11,52±7,444a cm. No entanto, a contagem total viável em azul de metileno de eosina foi de 7,4×107, 5,8×107 em ágar de soja Tryptic e 5,8×107 em ágar Nutriente. Em T2, o ganho médio de peso foi de 16,22±16,09b gramas e o ganho médio de comprimento foi de 12,97±7,79b cm. A contagem total viável em azul de metileno de eosina foi 7×107, 5,5×107 em ágar de soja Tryptic e 5,8×107 em ágar Nutriente. Em T3, o ganho médio de peso foi de 37,88±27,43c gramas, enquanto o ganho médio de comprimento foi registrado como 16,48±12,56c cm. No entanto, a contagem total viável para o tratamento 3 foi de 6,4×10 em azul de metileno de eosina, 4,8×107 em ágar soja Tryptic e 5,2×107 em ágar Nutriente. Em T4, o ganho médio de peso foi de 44,22±31,67d gramas, enquanto o ganho médio de comprimento foi de 15,25±10,49d cm. A contagem total viável foi de 4,3×107 em Eosin metileno blue, 3,1×107 em Tryptic soy agar e 3,8×107 em Nutrient agar. O efeito da Moringa oleifera no crescimento de Oreochromis niloticus foi significativo e o extrato de Moringa a 12% apresentou ganho máximo de comprimento e peso e conversão alimentar mínima com a menor contagem microbiana no intestino dos peixes.

Abstract In current study, different feeding levels of Moringa oleifera formulated diet was compared to analyze the growth performance, feed conversion ratio, feed conversion efficiency and gut microbiology of Oreochromis niloticus. The study was comprised of four treatment groups including 4%, 8% and 12% Moringa oleifera and one control group which was devoid of Moringa leaves. The experimental trial was conducted at the Zoology laboratory of Pakistan Institute of Applied and Social Sciences, (PIASS) Kasur. The physicochemical parameters of water such as temperature, dissolve oxygen, pH, total dissolved solids and salinity in all aquaria were found non-significantly different from each other. In control condition T1, the average weight gain was 14.89±16.90a grams, while average length gain was 11.52±7.444a cm. However, the total viable count on Eosin methylene blue was 7.4×107, 5.8×107 on Tryptic soy agar and 5.8×107on Nutrient agar. In T2, the average weight gain was 16.22±16.09b grams and average length gain was 12.97±7.79b cm. The total viable count on Eosin methylene blue was 7×107, 5.5×107 on Tryptic soy agar and 5.8×107on Nutrient agar. In T3, the average weight gain was 37.88±27.43c grams, while the average length gain was recorded as 16.48±12.56c cm. However, the total viable count for treatment 3 was 6.4×10 on Eosin methylene blue, 4.8×107 on Tryptic soy agar and 5.2×107on Nutrient agar. In T4, the average weight gain was 44.22±31.67d grams, while the average length gain was 15.25±10.49d cm. The total viable count was 4.3×107on Eosin methylene blue, 3.1×107 on Tryptic soy agar and 3.8×107 on Nutrient agar. The effect of Moringa oleifera on the growth of Oreochromis niloticus was found to be significant and 12% Moringa extract showed maximum length and weight gain and minimum feed conversion ratio with the least microbial count in fish intestine.

Resumo Usando dados de inventário, este estudo avaliou a composição de espécies, volume de estoque crescente (GSV) e carbono de biomassa (BMC) das cinco principais espécies madeireiras nas regiões subtropicais e temperadas/subalpinas do Paquistão. Constatou-se que a densidade do caule variou entre 50 e 221 árvores ha-1, com média de 142 árvores ha-1 (13,68 milhões de árvores para toda a área florestal). Entre as espécies, Pinus wallichiana apresentou alta composição de espécies (27,80%), seguida de Picea smithiana (24,64%). O GSV foi encontrado na faixa de 67,81 a 425,94 m3 ha-1, com um valor total de 20,68 milhões de m3 para toda a região. Da mesma forma, o BMC variou de 27,04 a 169,86 mg ha-1, com valor médio de 86,80 mg ha-1. A quantidade total de carbono armazenado foi de 8,69 milhões de toneladas para um total de 95.842 ha de floresta manejada comercialmente. Além disso, a análise de correlação entre área basal (BA), GSV e BMC mostrou que BA é o melhor preditor de GSV e BMC. As descobertas fornecem insights para os formuladores de políticas e gestores florestais sobre o manejo florestal comercial sustentável, bem como o manejo florestal de carbono no recente gerenciamento global de carbono para a mitigação das mudanças climáticas.

Abstract Using inventory data, this study evaluates the species composition, growing stock volume (GSV), and biomass carbon (BMC) of the five major timber species in the sub-tropical, and temperate/sub-alpine regions of Pakistan. It was found that the stem density varies between 50 and 221 trees ha -1, with a mean of 142 trees ha-1 (13.68 million trees for entire forest area). Among the species, Pinus wallichiana showed a high species composition (27.80%) followed by Picea smithiana (24.64%). The GSV was found in the range of 67.81 to 425.94 m3 ha-1, with a total GSV value of 20.68 million m3 for the entire region. Similarly, The BMC ranged from 27.04 to 169.86 Mg ha-1, with a mean BMC value of 86.80 Mg ha-1. The total amount of stored carbon was found at 8.69 million tons for a total of 95842 ha of commercially managed forest. Furthermore, the correlation analysis between the basal area (BA) and GSV and BMC showed that BA is the best predictor of GSV and BMC. The findings provide insights to the policy makers and forest managers regarding the sustainable commercial forest management as well as forest carbon management in the recent global carbon management for climate change mitigation.

Resumo Helicobacter pylori (HP) é um elemento vital na etiologia de úlceras pépticas e câncer gástrico. Esta pesquisa teve como objetivo determinar a frequência, distribuição e determinantes da infecção por HP em adultos e adolescentes com sintomas gástricos no distrito de Haripur, Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Este estudo transversal foi realizado de junho de 2018 a junho de 2020 no Departamento de Tecnologia de Laboratórios Médicos da Universidade de Haripur, Paquistão. A presença de HP foi uma variável de pesquisa, enquanto sexo, faixas etárias, escolaridade, superlotação, hábitos alimentares, ingestão de leite, fonte de água potável e contato com animais foram variáveis de agrupamento. A técnica imunocromatográfica (TIC) foi utilizada para a detecção sorológica de anticorpos para HP. Todas as variáveis foram representadas por frequência e percentual com IC 95%. A prevalência de HP e sua distribuição por oito variáveis sociodemográficas foi comprovada pelo teste de ajuste do qui-quadrado, enquanto a associação foi verificada pelo teste de associação do qui-quadrado. Do total de 1.160 casos, 557 (48%) foram positivos para HP. A prevalência populacional foi maior em homens, na faixa etária de 20 a 40 anos, analfabetos, família ≤ 10 pessoas, consumindo comida de restaurante, usando tetra pack, usando água municipal e tendo contato com animais. A prevalência observada de HP foi semelhante à sua prevalência esperada na população. A distribuição observada de HP na amostra foi diferente de sua distribuição esperada na população por oito variáveis sociodemográficas. A presença de HP foi associada a todas as oito variáveis sociodemográficas além das faixas etárias.

Abstract Helicobacter pylori (HP) is a vital element in the etiology of peptic ulcers and gastric cancer. This research aimed to determine the frequency, distribution, and determinants of HP infection in adults and adolescents with gastric symptoms in district Haripur, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan. This cross-sectional study was performed from June 2018 to June 2020 at the Medical Laboratory Technology Department, The University of Haripur, Pakistan. Presence of HP was a research variable, while sex, age groups, education status, overcrowding, dining habits, milk intake, drinking water source and animal contact were grouping variables. Immuno-chromatographic technique (ICT) was used to for serological detection of HP antibodies. All variables were represented by frequency and percentage with 95%CI. Prevalence of HP and its distribution by eight socio-demographic variables was testified by the chi-square goodness-of-fit test while association was testified by chi-square test of association. Out of total 1160 cases, 557 (48%) were positive for HP. Population prevalence was higher in men, in the age group 20-40 years, illiterate, family size ≤ 10 persons, taking restaurant food, using tetra pack, using municipal water, and having animal contact. The observed prevalence of HP was similar to its expected prevalence in the population. The observed distribution of HP in the sample was different from its expected distribution in population by eight socio-demographic variables. Presence of HP was associated with all eight socio-demographic variables besides age groups.

Resumo O peixe é considerado o mais adequado para indicação de toxicidade na água. Assim, o objetivo do presente estudo foi determinar as concentrações de alguns metais (Na, K, Ca, Mg, Fe, Cd, Pb e Zn) em relação ao tamanho corporal e fator de condição em Scomberoides commersonnianus. Foi coletado um total de 73 amostras de peixes marinhos, S. commersonnianus, com tamanhos que variaram de 93,4 a 1.180 g de peso corporal e comprimento total de 20,5 a 56,9 cm, aleatoriamente do Mar Arábico de Karachi, Paquistão, para exame de composição elementar. A concentração de Ca foi máxima, enquanto a de Cd foi mínima em S. commersonnianus. As concentrações de Zn mostraram-se altamente significativas negativas (P < 0,001), enquanto Na e Ca apresentaram forte correlação positiva com o tamanho dos peixes. As correlações de Pb, K e Mg foram menos significativas (P < 0,05) com o peso úmido e o comprimento total de S. commersonnianus. Já o Fe e o Cd permaneceram pouco correlacionados (P > 0,05) com o tamanho dos peixes. O fator de condição apresentou correlação altamente significativa (P < 0,001) com todos os metais estudados, exceto Cd e Pb, que foram encontrados correlacionados insignificantemente (P > 0,05) com o fator de condição de S. commersonnianus.

Abstract Fish is thought to be the most appropriate for indication of toxicity in water. So, purpose of present study was to determine the concentrations of few metals (Na, K, Ca, Mg, Fe, Cd, Pb and Zn) in relation to the body size and condition factor in Scomberoides commersonnianus. A total of 73 samples of marine fish, S. commersonnianus with various sizes that ranged from 93.4-1180 g of body weight and total length 20.5-56.9cm were randomly collected from the Arabian Sea of Karachi Pakistan, for examination of elemental composition. The concentration of Calcium found maximum while Cadmium found minimum in S. commersonnianus. Concentrations of Zn showed highly significant (P<0.001) negative, while Na and Ca exhibited strong positive correlation with the fish size. Correlations of Pb, K and Mg were found least significant (P<0.05) with the wet weight and total length of S. commersonnianus. Whereas, Fe and Cd were remained insignificantly correlated (P>0.05) with the fish size. Condition factor showed highly significant correlation (P<0.001) with all studied metals except cadmium and lead which were found insignificantly correlated (P>0.05) with condition factor of S. commersonnianus.

Abstract: Sickle cell disease is a group of health disorders that affect hemoglobin in red blood cells. Sickle cell disease causes multiple manifestations and complications, including infections, delayed growth, pain crisis, and multi-organs damage. These complications can disturb the patients' vital signs, including body temperature, heart rate, and oxygen saturation. The decline in hemoglobin level is another indication of sickle cell disease due to abnormal hemoglobin that distorts red blood cells resulting in sickle cell anemia. RBCs, also called erythrocytes, are found in the blood and responsible for carrying oxygen to the body tissues attached to the hemoglobin. Optical microscopy can detect and monitor sickle cell disease, but it requires a blood sample and offline analysis, which is a time-consuming process. There is currently no known technology available to provide non-invasive monitoring solutions for sickle cell disease patients' health. Therefore, a need arises for a non-invasive and continuous monitoring solution to continuously check on sickle cell disease patients, which can be transformed into a wearable monitoring device. The proposed optical wristband consists of optical sensors that provide non-invasive and continuous health status monitoring of sickle cell disease patients using key vital signs and hemoglobin levels. A comparative study was performed among 21 participants and equally divided into three groups (non-anemic, anemic, and sickle cell disease patients). The data was collected from optical sensors, Arduino used as a processor, and continuously monitors the patient's vital signs and hemoglobin levels. Abnormal reading of any parameter alerts the user of any unhealthy status, and the parameter's trend assists the clinician in patient assessment. The body temperature and oxygen saturation levels of the anemic patients were found in the normal ranges, but the heart rate of three patients and hemoglobin of all the participants were found in aberrant ranges. The vital signs and hemoglobin levels of all sickle cell disease patients were beyond the normal ranges and significantly different (p>0.001) than non-anemic and anemic groups. Therefore, these physiological parameters monitoring has clinical importance for sickle cell disease management and early treatment.

Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.

Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.

Resumo Um grupo de defeitos sanguíneos hereditários é conhecido como talassemia e está entre as hemoglobinopatias mais prevalentes do mundo. As talassemias são de dois tipos, como talassemia alfa e beta. As causas desses defeitos são as mutações genéticas que levam a níveis baixos e/ou proteínas de globina com mau funcionamento, respectivamente. Em alguns casos, uma dessas proteínas pode estar completamente ausente. As cadeias de globina α e β formam uma dobra ou bolsa de globina para a fixação de heme (Fe ++) para transportar oxigênio. Os genes das proteínas alfa e beta globina estão presentes na forma de um cluster nos cromossomos 16 e 11, respectivamente. Diferentes genes de globina são usados em diferentes estágios do curso de vida. Durante os estágios de desenvolvimento embrionário e fetal, as proteínas γ globina se associam à α globina e, posteriormente, são substituídas pela proteína β globina. Os desequilíbrios da cadeia de globina resultam em hemólise e impedem a eritropoiese. Indivíduos que apresentam sintomas leves incluem portadores de talassemia alfa ou as pessoas com traços de talassemia alfa ou beta. A talassemia alfa causa condições como anemia hemolítica ou hidropsia fetal fatal, dependendo da gravidade da doença. A beta talassemia principal resulta em anemia hemolítica, retardo de crescimento e aberrações esqueléticas na primeira infância. As crianças afetadas por esse distúrbio precisam de transfusões de sangue regulares ao longo da vida. Os pacientes que dependem de transfusão de sangue geralmente desenvolvem sobrecarga de ferro que causa outras complicações nos sistemas do corpo, como insuficiência renal ou hepática, portanto as talassemias agora são classificadas como uma síndrome. A única cura para as talassemias seria um transplante de medula óssea ou terapia genética sem atualmente uma taxa de sucesso significativa. Uma compreensão completa da base molecular dessa síndrome pode fornecer novos insights e ideias para seu tratamento, já que os cientistas ainda não conseguiram encontrar uma cura permanente para essa doença mortal depois de mais de 87 anos desde que foi descrita pela primeira vez em 1925.

Abstract A group of inherited blood defects is known as Thalassemia is among the world’s most prevalent hemoglobinopathies. Thalassemias are of two types such as Alpha and Beta Thalassemia. The cause of these defects is gene mutations leading to low levels and/or malfunctioning α and β globin proteins, respectively. In some cases, one of these proteins may be completely absent. α and β globin chains form a globin fold or pocket for heme (Fe++) attachment to carry oxygen. Genes for alpha and beta-globin proteins are present in the form of a cluster on chromosome 16 and 11, respectively. Different globin genes are used at different stages in the life course. During embryonic and fetal developmental stages, γ globin proteins partner with α globin and are later replaced by β globin protein. Globin chain imbalances result in hemolysis and impede erythropoiesis. Individuals showing mild symptoms include carriers of alpha thalassemia or the people bearing alpha or beta-thalassemia trait. Alpha thalassemia causes conditions like hemolytic anemia or fatal hydrops fetalis depending upon the severity of the disease. Beta thalassemia major results in hemolytic anemia, growth retardation, and skeletal aberrations in early childhood. Children affected by this disorder need regular blood transfusions throughout their lives. Patients that depend on blood transfusion usually develop iron overload that causes other complications in the body systems like renal or hepatic impairment therefore, thalassemias are now categorized as a syndrome. The only cure for Thalassemias would be a bone marrow transplant, or gene therapy with currently no significant success rate. A thorough understanding of the molecular basis of this syndrome may provide novel insights and ideas for its treatment, as scientists have still been unable to find a permanent cure for this deadly disease after more than 87 years since it is first described in 1925.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente “SARS-CoV-2”, foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o “SARS-CoV-2”, embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre “SARS-CoV-2” e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que “SARS-CoV-2” tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely “SARS-CoV-2” is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the “SARS-CoV-2” although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among “SARS-CoV-2” and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that “SARS-CoV-2” has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

RESUMO Para investigar o papel do esterco de vaca na recuperação do solo e bioassimilação, juntamente com a bioacumulação de metais pesados em minhocas (P. posthuma) (N = 900), minhocas foram usadas e grupos de tratamento de mistura CD-solo de diferentes proporções de esterco de vaca foram projetados. Doses não letais de acetato de chumbo e cloreto de cádmio foram adicionadas aos grupos de tratamento. P. posthuma maduros foram liberados em cada vaso experimental, mantendo as condições favoráveis. Foram avaliados o pH, carbono, nitrogênio, fósforo, cátions trocáveis e nível de metais pesados de cada mistura. Os resultados indicaram que a bioassimilação de Pb e Cd por P. posthuma foi significativamente (P ˂ 0,01) maior em diferentes tratamentos de solo-CD em relação ao controle. A maior bioassimilação de ambos os metais foi observada em T1 de ambos os grupos (Pb = 563,8 mg / kg e Cd = 42,95 mg / kg). O conteúdo de ambos os metais foi significativamente (P ˂ 0,05) reduzido na fundição. A concentração de nutrientes nas fundições finais de todos os tratamentos de solo-CD também foi igualmente transformada de menos ou insolúvel para mais solúvel e disponível para as plantas, exceto o nível de carbono que aumenta com a proporção de CD. Conclui-se que o esterco de vaca como matéria orgânica tem um efeito positivo na recuperação do solo e na bioassimilação de metais por P. posthuma.

Abstract To investigate the role of cow dung in soil reclamation and bio assimilation along with bio accumulation of heavy metals in earthworm (P. posthuma) (N=900) earthworms were used and treatment groups of CD-soil mixture of different proportion of cow dung were designed. Nonlethal doses of lead acetate and cadmium chloride were added in treatment groups. Mature P. posthuma were released in each experimental pot maintaining the favorable conditions. The pH, carbon, nitrogen, phosphorus, exchangeable cations, and heavy metal level of each mixture was evaluated. The results indicated that bio-assimilation of Pb and Cd by P. posthuma were significantly (P ˂ 0.01) higher in different soil-CD treatments compared to control. Highest bio-assimilation of both metals was observed in T1 of both groups (Pb = 563.8 mg/kg and Cd = 42.95 mg/kg). The contents of both metals were significantly (P ˂ 0.05) lowered in casting. The nutrient concentration in the final castings of all soil-CD treatments were also equally transformed from less or insoluble to more soluble and available for plants, except for carbon level which increased with CD proportion. It is concluded that cow dung as organic matter has a positive effect on soil reclamation and bio-assimilation of metals by P. posthuma.

Resumo Os protozoários incluem muitos patógenos humanos intracelulares. A detecção acurada desses patógenos é necessária para tratar as doenças. Na epidemiologia clínica, a identificação molecular de protozoários é considerada o método de identificação mais confiável e rápido do que a microscopia. Entre esses protozoários, o Cryptosporidium é considerado um dos importantes patógenos zoonóticos transmitidos pela água e uma das principais causas de uma doença diarreica denominada criptosporidiose em humanos, animais domésticos e selvagens. Este estudo teve como objetivo identificar Cryptosporidium em zoofelídeos (N = 56) pertencentes a diferentes zoológicos da China, mas acidentalmente Colpodella foi encontrada na amostra de zoofelídeos e os dados filogenéticos confirmaram essa amplificação inesperada de amostras fecais usando nested-PCR em duas etapas. A análise filogenética revelou o fato sobre os primers específicos usados anteriormente por muitos pesquisadores e a amplificação entre gêneros. Ficamos sabendo que o amplicon sequenciado geneticamente fornece uma identificação mais acurada das espécies. Este estudo sugere mais investigação sobre Colpodella, que foi negligenciada anteriormente, mas ganha a atenção dos pesquisadores depois de identificada em humanos e animais e é conhecida por se correlacionar com sintomas neurológicos em pacientes.

Abstract The protozoans include many intracellular human pathogens. Accurate detection of these pathogens is necessary to treat the diseases. In clinical epidemiology, molecular identification of protozoan is considered a more reliable and rapid method for identification than microscopy. Among these protozoans, Cryptosporidium considered being one of the important water-borne zoonotic pathogens and a major cause of a diarrheal disease named cryptosporidiosis in humans, domestic animals, and wild animals. This study was aimed to identify Cryptosporidium in zoo felids (N= 56) belonging to different zoo of China, but accidentlly Colpodella was encountered in the zoo felids sample and phylogenetic data confirmed this unexpected amplification from fecal samples using two-step nested-PCR. Phylogenetic analysis revealed the fact about the specific primers used previously by many researchers and cross-genera amplification. We came to know that genetically sequenced amplicon gives more accurate identification of species. This study suggests more investigation on Colpodella which has been neglected previously but gains the attention of researchers after identified from humans and animals and has been known to correlate with neurological symptoms in patients.

Resumo Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos d’água do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.

Abstract Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.

Resumo Os físidos pertencem à classe Gastropoda; o filo Mollusca possui importante posição na teia alimentar e atua como bioindicador, praga e hospedeiro intermediário. Por serem resistentes, são chamadas baratas de malacologia. Os caramujos físidos foram coletados em diferentes corpos d’água de Faisalabad (Punjab) e identificados até as espécies por meio de marcadores morfológicos. A morfometria dos corpos de prova foi realizada com auxílio de paquímetro digital Vernier em milímetros (mm) por meio de medida linear dos caracteres da casca. A análise de regressão linear da razão AL / SW vs. AL e razão SL / SW vs. AL indicou que o crescimento alométrico existe apenas em Physa acuta quando comparado com P. gyrina e P. fontinalis. Este estudo levará a avaliar a situação das espécies de físido no Punjab Central. A análise do componente principal mostra que o componente 1 (comprimento da casca) e o componente 2 (largura da casca) são os componentes mais prolíficos e quase 80% da identificação. A distância entre P. acuta e P. fontinalis é 5,4699, P. acuta e P. gyrina é 7,6411, P. fontinalis e P. gyrina é 16,6080, mostrando que P. acuta se assemelha a P. fontinalis, e ambos os espécimes não se parecem com P. gyrina. P. acuta é uma espécie invasora e apresenta bioatividade, tornando-se uma candidata potente para substâncias bioativas.

Abstract Physids belong to Class Gastropoda; Phylum Mollusca have important position in food web and act as bio indicators, pests and intermediate host. Being resistant these are called cockroaches of malacology. Physid snails were collected from different water bodies of Faisalabad (Punjab) and were identified up to species using morphological markers. The morphometry of the specimens was carried out with the help of a digital Vernier caliper in millimeters (mm) using linear measurement of shell characters. Linear regression analysis of the AL/SW ratio vs AL and SL/SW ratio vs AL indicated that allometric growth exists only in Physa acuta when compared with P.gyrina and P. fontinalis. This study will lead to assess the status of the Physid species in Central Punjab. The Principal component analysis shows that the Component 1 (Shell Length) and component 2 (Shell Width) are the most prolific components and nearly 80 percent of the identification. The distance between P. acuta and P. fontinalis is 5.4699, P. acuta and P. gyrina is 7.6411, P. fontinalis and P. gyrina is 16.6080 showing that P. acuta resembles with P. fontinalis, and both these specimens donot resemble with P. gyrina. P.acuta is an invasive species and shows bioactivity making it a potent candidate for bioactive substances.

RESUMO Fatores climáticos desempenham papel essencial no crescimento da largura dos anéis das árvores. Neste estudo, objetivou-se avaliar a correlação entre variáveis climáticas e características de crescimento de anéis de árvores de Pinus sibirica nas montanhas de Altai, noroeste da China. Este estudo é o primeiro desse tipo na análise do crescimento climático de Pinus sibirica no noroeste da China. O estudo mostrou grande potencial para entender as espécies que crescem sob as condições climáticas específicas. Total de 70 testemunhos coletados em três locais na área de amostragem, dos quais 63 testemunhos considerados para este estudo. O efeito das variáveis climáticas estudadas incluem precipitação, temperatura e PDSI. Nossos resultados mostraram que a cronologia da Largura do Anel da Árvore tem uma correlação significativamente positiva com a temperatura do final do inverno (março) e uma correlação negativa significativa com as temperaturas de julho. Uma correlação significativa foi observada com a precipitação do final do verão, enquanto nenhuma relação significativa foi encontrada com o Índice de Severidade de Seca de Palmer. Essas correlações significativas com a temperatura e precipitação sugeriram que esta espécie de árvore tinha o potencial para a reconstrução do clima passado na área.

Abstract Climatic factors play an essential role in the growth of tree ring width. In this study, we aimed to evaluate the correlation between climatic variables and tree-ring growth characteristics of Pinus sibirica in Altai mountains, northwestern China. This study being is first of its kind on climate growth analysis of Pinus sibirica in northwestern China. The study showed great potential to understand the species growing under the specific climatic conditions. Total of 70 tree cores collected from three sites in the sampling area, out of which 63 tree cores considered for this study. The effect of climatic variables which was studied include precipitation, temperature and PDSI. Our results showed that Tree Ring Width chronology has a significantly positive correlation with the late winter (March) temperature and significant negative correlation with the July temperatures. A significant correlation was observed with the late summer precipitation whereas no significant relation found with the Palmer Drought Severity Index. These significant correlations with temperature and precipitation suggested that this tree species had the potential for the reconstruction of the past climate in the area.

Resumo A indisponibilidade de probióticos em alevinos do sistema digestivo de peixes faz com que ele seja incapaz de digerir e absorver seus alimentos adequadamente. A presente pesquisa foi conduzida para investigar a influência de probióticos adicionados à dieta à base de farelo de linhaça (LMB) na hematologia e na composição da carcaça de juvenis de Labeo rohita. Os parâmetros hematológicos são diagnósticos essenciais usados para estimar o estado de saúde dos peixes. O uso de probióticos para a melhoria da saúde dos peixes está se tornando comum devido à maior demanda por sistemas de cultivo em água que não agridam o meio ambiente. Farinha de linhaça foi usada como ingrediente para preparar seis dietas de teste experimentais adicionando probióticos (0, 1, 2, 3, 4 e 5 g/kg) e 1% de óxido crômico indigestível por 70 dias. De acordo com seu peso úmido vivo, 5% de alimento eram dados aos alevinos duas vezes ao dia. Amostras de sangue e carcaça de peixes (corpo inteiro) foram coletadas para análise hematológica e de carcaça no final do experimento. A maior composição da carcaça (proteína bruta, 18,72%; gordura bruta, 8,80%; e energia bruta, 2,31 kcal/g) foi observada em peixes alimentados com a dieta teste II suplementada com probióticos (2 g/kg). Além disso, os números máximos de RBCs (2,62×106 mm-3), WBCs (7,84×103 mm-3), PCV (24,61), plaquetas (63,85) e hemoglobina (7,87) também foram relatados em alevinos alimentados com 2 g/kg de dieta suplementada com probióticos. Os resultados indicaram que a suplementação de probióticos tem um papel crítico na melhoria da composição corporal dos alevinos e índices hematológicos. As descobertas atuais mostraram que a suplementação de probióticos no nível de 2 g/kg em dieta à base de subproduto de linhaça foi muito útil para melhorar o desempenho geral de alevinos de L. rohita.

Abstract Unavailability of probiotics in fish digestive system fingerlings is unable to digest and absorb their food properly. The current research was conducted to investigate the influence of probiotics added Linseed meal based (LMB) diet on hematology and carcass composition of Labeo rohita juveniles. Hematological parameters are essential diagnostics used to estimate the health status of fish. The usage of probiotics for fish health improvement is becoming common due to the higher demand for environment-friendly culture system in water. Linseed meal was used as a test ingredient to prepare six experimental test diets by adding probiotics (0, 1, 2, 3, 4 and 5 g/kg) and 1% indigestible chromic oxide for seventy days. According to their live wet weight, five percent feed was given to fingerlings twice a day. Fish blood and carcass samples (Whole body) were taken for hematological and carcass analysis at the end of the experiment. The highest carcass composition (crude protein; 18.72%, crude fat; 8.80% and gross energy; 2.31 kcal/g) was observed in fish fed with test diet II supplemented with probiotics (2 g/kg). Moreover, maximum RBCs number (2.62× 106mm-3), WBCs (7.84×103mm-3), PCV (24.61), platelets (63.85) and hemoglobin (7.87) had also been reported in the fish fingerlings fed on 2 g/kg of probiotics supplemented diet. Results indicated that probiotics supplementation has a critical role in improvement of fingerlings’ body composition and hematological indices. Present findings showed that probiotics supplementation at 2 g/kg level in linseed by-product-based diet was very useful for enhancing the overall performance of L. rohita fingerlings.