RESUMO Considerado fonte de proteína mais acessível à população, o feijão-comum é consumido diariamente, principalmente nos países em desenvolvimento, das regiões tropicais e subtropicais do planeta. Estudos que utilizam tanto descritores morfológicos quanto marcadores moleculares, vêm sendo utilizados em programas de melhoramento vegetal do feijoeiro. O presente artigo tem por objetivo reportar o estudo da diversidade de linhagens endogâmicas recombinantes e seus genitores utilizando descritores morfológicos e marcadores SSR. Foram avaliadas 22 linhagens recombinantes derivadas dos genitores BRS Agreste e a linhagem preto-01. Para a caracterização foram utilizados 18 marcadores microssatélites e os seguintes descritores morfológicos: presença de antocianina, número de dias após a germinação, dias para floração, cor da asa, cor do estandarte, cor da semente, cor do tegumento, brilho da semente, grupo comercial. Para caracterização molecular foram usados sete marcadores que apresentaram polimorfismo. Os valores de dissimilaridade, utilizando-se os dados morfológicos, variaram de 0 a 8.5; organizando as linhagens em três grupos distintos. Nas análises moleculares, dos 18 primers testados, 11 foram monomórficos e 7 apresentaram-se polimorfismo. Os valores de dissimilaridade para análise molecular variarando de 0 a 0.8; com média de 0.57. Além de informativos, esses marcadores estão associados a características importantes para o feijoeiro. A análise conjunta dos dados apresentou valores de dissimilaridade variando de 0.0 a 12.5, com média de 6.89, formando três grupos. A análise conjunta dos dados morfológicos e moleculares foi eficiente em caracterizar e distinguir as linhagens endogâmicas. Os marcadores moleculares utilizados mostraram-se adequados para o estudo realizado neste trabalho. As linhagens 18 e 19 podem ser consideradas duplicadas, pois na análise de diversidade obteve dissimilaridade zero.

ABSTRACT Considred a more accessible protein source for the population, common beans are consumed daily, mainly in developing countries, in the tropical and subtropical regions of the planet. Studies that use both morphological descriptors and molecular markers have been used in plant breeding programs for common beans. This article aims to report the study of the diversity of recombinant inbred lines and their parents using morphologial descriptors and SSR markers. 22 recombinant inbreeding lines were evaluated derived from the BRS Agreste parents and the black-01 line.For the characterization, 18 microsatellite markers and the following morphological descriptors were used: presence of anthocyanin, number of days after germination, days for flowering, wing color, standard color, seed color, tegument color, seed brightness, commercial group. For molecular characterization, seven markers were used that presented polymorphism The dissimilarity values, using morphological data, ranged from 0 to 8.5; organizing the lineages into three distinct groups. In the molecular analyzes, of the 18 primers tested, 11 were monomorphic and 7 presented polymorphism. The dissimilarity values for molecular analysis ranged from 0 to 0.8; with an average of 0.57. In addition to being informative, these markers are associated with important characteristics for common beans. Joint analysis of the data presented dissimilarity values ranging from 0.0 to 12.5, with an average of 6.89, forming three groups. The joint analysis of morphological and molecular data was efficient to characterize and distinguish inbred lines. The molecular markers used were suitable to the present study. The lines 18 and 19 can be considered duplicate because in all analyzes they remained together.

Resumo Espécies de plantas que mostram padrão gregário de distribuição e endemismo na Floresta Atlântica, como Dorstenia elata, são particularmente sensíveis aos efeitos da perda da diversidade genética. Considerando isso, objetivou-se com este trabalho quantificar a diversidade genética em populações nativas dessa espécie em um remanescente da Mata Atlântica. A amostra incluiu três subpopulações de indivíduos e a caracterização molecular foi realizada com doze primers ISSR. As análises intrapopulacionais foram baseadas no cálculo do índice de Shannon; a heterozigosidade total esperada e a matriz de distâncias entre pares de indivíduos também foram calculadas. O dendrograma de agrupamento obtido evidenciou a formação de dois grupos. As investigações interpopulacionais foram baseadas na análise de variância molecular e na estimativa do fluxo gênico. Os resultados demonstram que um grupo compreendeu os genótipos de duas subpopulações, e o outro continha exclusivamente os genótipos de uma terceira subpopulação. A maior variabilidade genética foi observada dentro e não entre populações, indicando que a distância geográfica e a estrada que divide as populações estudadas não estão causando perda de diversidade genética.

Abstract Plant species that show gregarious spatial distribution and endemism to the Atlantic Forest, such as Dorstenia elata, are particularly sensitive to the effects of genetic diversity loss. In the present study, we aimed to quantify the genetic diversity in native populations of this species in an Atlantic Forest remnant. The sample included three aggregates of individuals, and molecular characterization was performed with twelve ISSR primers. Intrapopulation analyses were based on the calculation of the Shannon index; total expected heterozygosity and the matrix of distances between pairs of individuals were also calculated. The obtained grouping dendrogram evinced the formation of two groups. Interpopulation investigations were based on the analysis of molecular variance and the estimate of historical gene flow. The results demonstrate that one group comprised the genotypes from two subpopulations, and the other contained exclusively the genotypes of a third subpopulation. The greatest genetic variability was observed within rather than among populations, indicating that the geographical distance and the road that divides the studied populations are not causing loss of genetic diversity.

The molecular characterization of ten genotypes of the Coffea arabica plants and of seven genotypes of C. canephora having interesting features for coffee breeding programs was carried to select the parents for breeding. A total of 40 SSR and 29 ISSR primers were used. The primers generated a total of 331 (307 polymorphic and 24 monomorphic) bands. Analysis of genetic diversity presented dissimilarity intervals ranging from 0.22 to 0.44 between the Conilon genotypes, from 0.02 to 0.28 between the Arabica genotypes, and from 0.49 to 0.60 between the genotypes of the two species in the joint analysis. Four groups were formed: I = genotypes of C. arabica, II = four progenies of C. canephora, Conilon group, and one non defined C. canephora (Conilon or Robusta), III = one progeny of un-defined C. canephora (Conilon or Robusta) and IV = one progeny of C. canephora of Robusta group. The grouping formed was consistent with the origins of each group. High stabilities of the bifurcations were found by bootstrap analysis. The use of molecular markers of the SSR and ISSR types in the diversity study was efficient in distinguishing genotypes between and within C. arabica and C. canephora.

O biribazeiro é uma planta frutífera nativa das matas Atlântica e Amazônica. Seus frutos têm grande aceitação popular para consumo in natura. Objetivou-se com este estudo a avaliação da diversidade genética de acessos de biribazeiro (Rollinia mucosa [Jacq.] Baill) com a utilização de marcadores moleculares ISSR. Foram analisados 16 acessos com 20 primers ISSR, os quais produziram um total de 118 bandas, sendo 96 polimórficas e 22 monomórficas. Os valores de dissimilaridade genética, calculados de acordo com o complemento do índice de Jaccard, variaram de 0,0909 a 0,5147. O método UPGMA (Unweighted Pair Group Method Average) agrupou os acessos em seis grupos. Os acessos 1 e 5 foram mais dissimilares e 11 e 12 os menos dissimilares. Os marcadores ISSR utilizados neste estudo demonstraram eficiência na detecção de polimorfismos moleculares, revelando variabilidade genética entre os 16 acessos. Diante dos resultados obtidos neste trabalho, é possível inferir que existe considerável variabilidade genética entre os acessos de biribazeiro, demonstrando a importância dos marcadores na análise de variabilidade de espécies pouco estudadas, como Rollinia mucosa [Jacq.]Baill.

The biribazeiro is a fruit plant native from Amazonian and Atlantic forests, in Brazil. Their fruits have great popular acceptance for fresh consumption. The objective of this study was to measure the genetic divergence of biriba genotypes (Rollinia mucosa [Jacq.]Baill) using ISSR molecular markers. Sixteen genotypes of biriba were screened with 20 ISSR primers, which produced a total of 118 bands, with 96 polymorphic and 22 monomorphic fragments. The genetic dissimilarity values ranged from 0.0909 to 0.5147, based on the complement of the Jaccard index. The UPGMA (Unweighted Pair Group Average Method) grouped the accessions into six groups. The genotypes 1 and 5 were most dissimilar and 11 and 12 the most similar. The ISSR markers used in this study demonstrated the efficiency of molecular polymorphisms detection, revealing high genetic variability among the 16 accessions. So, it can be inferred that there is a considerable genetic variation among accessions of the biribazeiro, showing the importance of molecular markers in the analysis of variability of species poorly studied, as Rollinia mucosa [Jacq.]Baill.

Marcadores microssatélites originalmente desenvolvidos para Pitcairnia albiflos Herb. e Pitcairnia geysksii L.B.Sm. foram testados para amplificação heteróloga do genoma de cinco outras espécies de Bromeliacea. Dos treze pares de primers avaliados, dez (76,9%) geraram resultados positivos para algumas das espécies em estudo. O número de alelos polimórficos por loco variou entre dois e quatro para a maioria das espécies. Os valores de Ho variaram entre zero em Pitcairnia flammea Lindl. (PaA05), Aechmea ramosa Mart ex Schult & Schult e Billbergia horrida Regel (PaC05) e um para Billbergia euphemiae E. Morren (PaA05, PaA10, PaC05 e PaD07). Este estudo demonstrou que marcadores microssatélites desenvolvidos para P. albiflos e P. geysksii mostraram-se eficientes para amplificação heteróloga de amostras de DNA de Pitcairnia flammea, Aechmea nudicaulis (L.) Griseb., Aechmea ramosa, Billbergia horrida e Billbergia euphemiae, validando a transferibilidade destes marcadores para espécies das subfamílias Pitcairnioideae e Bromelioideae.

Microsatellite markers previously developed for Pitcairnia albiflos Herb. and Pitcairnia geysksii L.B.Sm. were used in cross-amplification tests of five other Bromeliaceae species. Ten (76.9%) out of the 13 evaluated pair of primers had positive results for some of the species tested. The number of polymorphic alleles ranged between two and four in most species. Ho values ranged between zero, in Pitcairnia flammea Lindl. (PaA05), Aechmea ramosa Mart ex Schult & Schult and Billbergia horrida Regel (PaC05), and one in Billbergia euphemiae E. Morren (PaA05, PaA10, PaC05 and PaD07). This study showed that microsatellite markers developed for P. albiflos and P. geysksii effectively amplified the DNA samples of Pitcairnia flammea, Aechmea nudicaulis (L.) Griseb., Aechmea ramosa, Billbergia horrida and Billbergia euphemiae, validating the transferability of these markers to species of the Pitcairnioideae and Bromelioideae subfamilies.

Este experimento teve como objetivo avaliar a divergência genética entre 57 acessos de feijão comum, sendo 31 genótipos locais do sul do Espírito Santo, 20 da EMBRAPA e seis cultivares comerciais. Foram realizados três experimentos no município de Alegre, ES nos anos agrícolas de 2008/2009 e de 2009/2010. O delineamento utilizado foi o de blocos casualizados com três repetições. Os dados foram submetidos à análise de variância pelo teste F. Foi utilizada análise multivariada para avaliar a divergência genética entre os acessos utilizando o método de agrupamento UPGMA e variáveis canônicas com base na distância generalizada de Mahalanobis. As variáveis que mais contribuíram para a separação dos acessos foram: peso de cem sementes (P100) com 24,01%, período vegetativo (PV) com 20,39%, período reprodutivo (PR) com 17,16% e comprimento da semente (CS) com 14,87%. Os acessos menos divergentes foram o F15 e o F18 (9,18) e os mais divergentes foram F10 e F08 (1308,62). Verificou-se baixa dissimilaridade genética entre as cultivares comerciais e também entre os acessos provenientes da EMBRAPA e entre ambas. Os acessos locais demonstraram uma diversidade genética significativa. Tanto a análise de agrupamento quanto a de variáveis canônicas foram capazes de separar os acessos de acordo com os centros de origem.

This research aimed to evaluate the genetic divergence among 57 accessions of common bean genotypes being 31 genotypes from southern Espírito Santo, Brazil, 20 cultivars from EMBRAPA and 6 commercial cultivars. Three experiments were conducted in the agricultural years 2008/2009 and 2009/2010, two in the experimental area and a CCA-UFES at IFES, both sites in the municipality of Alegre, ES, Brazil. The desing was a randomized block with tree replications. Data were subjected to analysis of variance test by F. By multivariate analysis assessed the genetic diversity among accessions using the UPGMA clustering method and canonical variables based on the Mahalanobis distance. The variables that contributed most to the separation of the accessions were one hundred seed weight (P100) with 24.01%, growing season (PV) with 20.39%, reproductive period (PR) with 17.16% and seed length (CS) with 14.87%. The accessions were less divergent the F15 and F18 (9.18) and the most divergent F10 and F08 (1308.62). Multivariate analysis showed a low genetic similarity between cultivars and also between accessions from EMBRAPA and between them. Site accesses demonstrated significant genetic diversity. Both the cluster analysis and the canonical variables were able to separate the access according to the centers of origin.

Cinqüenta e oito genótipos de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.), sendo 32 genótipos locais, 20 genótipos provenientes da EMBRAPA e seis cultivares comerciais, foram avaliados em Alegre/ES, através da influência de oito caracteres de importância agronômica sobre a produção de grãos por unidade de área. O experimento, em blocos casualizados com três repetições, foi conduzido no período das "águas" no ano agrícola de 2008/09. O objetivo deste trabalho foi estimar os coeficientes de trilha entre os caracteres primários e secundários sobre a produtividade de grãos. Os caracteres primários foram constituídos pelo número de sementes por vagem (NSV), peso de cem grãos (P100), número de vagem por planta (NVP) e número de sementes por planta (NSP), os caracteres secundários foram: número de dias da germinação até à floração (FL), número de dias entre a emergência e a maturação de colheita (MC), estatura da planta (EP) e altura da inserção da primeira vagem (PIV). A análise do coeficiente de trilha demonstrou que o caráter primário com maior efeito direto sobre produtividade (PROD) foi NVP (1,0011), associado à alta correlação (0,754). As variáveis P100 e NSV apresentaram altos efeitos indiretos sobre NVP de 0,8848 e 0,6369, respectivamente. Observou-se um incremento em P100 e NVP em plantas de ciclo e período vegetativo curtos e uma maior altura de inserção da primeira vagem, sendo que o ponto de inserção da primeira vagem não influenciou significativamente a produtividade.

Fifty-eight genotypes of common bean (Phaseolus vulgaris L.), being 32 local genotypes, 20 genotypes from EMBRAPA and six commercial cultivars were evaluated in Alegre/ES, through the influence of eight characters of agronomic importance to grain production by unit area. The experiment was conducted in a randomized block design with three replications in the wet period of 2008/09 crop year. This study aimed to estimate the path coefficients between the primary and secondary characters on grain yield. The primary characters were set up by the number of seeds per pod (NSV), weight of one hundred grains (P100), number of pods per plant (NVP) and number of seeds per plant (NSP) and the secondary traits were number of days from germination to flowering (FL), number of days between emergence and harvest maturity (MC), plant height (EP), height of the first pod (PIV). The analysis of the path coefficient showed that the primary character with more direct effect on yield (PROD) was NVP (1.0011), associated with high correlation (0.754). Variables P100 and NSV showed high indirect effect on NVP of 0.8848 and 0.6369, respectively. It was observed an increase in P100 and NVP in plants with short cycle and growing season and first pod height taller, and that the height of the first pod did not significantly influence productivity.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a divergência de acessos de feijoeiro-comum por suas características agronômicas, morfológicas e moleculares, com base no procedimento Ward-MLM. Uma coleção de 57 acessos do banco de germoplasma da Universidade Federal do Espírito Santo foi utilizada neste estudo, dos quais: 31 acessos locais, pertencentes à comunidade Fortaleza, no Município de Muqui, ES; 20 acessos fornecidos pela Embrapa Trigo; e 6 cultivares comerciais. Foram avaliados cinco caracteres agronômicos (ciclo da planta, número de sementes por vagem, número de vagens por planta, peso de 100 grãos e produtividade de grãos), cinco caracteres morfológicos (hábito de crescimento, porte da planta, formato da semente, cor da semente e grupo comercial) e 16 iniciadores microssatélites. Detectou-se ampla variabilidade genética pelos dados morfológicos, agronômicos e moleculares nos 57 acessos de feijão. O procedimento Ward-MLM mostrou que cinco foi o número ideal de grupos, de acordo com os critérios do pseudo F e pseudo t². Os acessos de origem andina tiveram sementes mais pesadas do que os outros e ficaram em um mesmo grupo. O procedimento Ward-MLM é uma técnica útil para detectar divergência genética e agrupar genótipos pelo uso simultâneo de descritores morfológicos, agronômicos e moleculares.

The present work aimed at evaluating the divergence among common bean accessions by their agronomic, morphological and molecular traits, based on the Ward-MLM procedure. A collection of 57 accessions from the gene bank of Universidade Federal do Espírito Santo was used in this study, from which: 31 were landraces belonging to the community Fortaleza, in the municipality of Muqui, ES, Brazil; 20 accessions were provided by Embrapa Trigo; and 6 were commercial cultivars. Five agronomic traits (plant cycle, number of seeds per pod, number of pods per plant, weight of 100 seeds, and grain yield), five morphological traits (growth habit, plant size, seed shape, seed color, and commercial group) and 16 microsatellite primers were evaluated. High genetic variability was detected considering morphological, agronomic and molecular traits in the 57 common bean accessions studied. The Ward-MLM procedure showed that the ideal number of groups was five, according to the pseudo F and pseudo t² criteria. The accessions from Andean origin had heavier seeds than others and formed a cluster. The Ward-MLM statistical procedure is a useful technique to detect genetic divergence and to cluster genotypes by simultaneously using morphological, agronomic and molecular data.

Os objetivos deste trabalho foram detectar QTL relativos ao conteúdo de proteína, em soja cultivada em dois ambientes tropicais divergentes, e construir um mapa genético para o conteúdo de proteína em genótipos adaptados a condições tropicais. Foram usadas 118 linhagens recombinantes endogâmicas de soja, obtidas do cruzamento entre as cultivares BARC 8 e Garimpo. A população de linhagens recombinantes endogâmicas foi cultivada em dois ambientes contrastantes: Cascavel, PR, e Viçosa, MG (24º57'S, 53º27'W; e 20º45'S, 42º52'W, respectivamente). Sessenta e seis pares de iniciadores SSR e 65 iniciadores RAPD apresentaram fragmentos polimórficos que segregaram à proporção de 1:1. Foram obtidos 30 grupos de ligação pouco saturados, com 90 marcadores, além de 41 marcas não ligadas. Para as famílias cultivadas em Cascavel, três QTL foram mapeados nos grupos de ligação C2, E, e N, que explicaram 14,37, 10,31 e 7,34% da variação fenotípica do conteúdo de proteína, respectivamente. Para as famílias cultivadas em Viçosa, dois QTL foram mapeados nos grupos de ligação G e #1, que explicaram 9,51 e 7,34% da variação fenotípica do conteúdo de proteína. Com base na média dos dois ambientes, dois QTL foram identificados: um no grupo de ligação E (9,90%) e outro no grupo L (7,11%). Genótipos com maior estabilidade devem ser uados em trabalhos futuros, para a detecção de QTL com efeitos consistentes, em diferentes ambientes.

The objectives of this study were to detect quantitative trait loci (QTL) for protein content in soybean grown in two distinct tropical environments and to build a genetic map for protein content. One hundred eighteen soybean recombinant inbred lines (RIL), obtained from a cross between cultivars BARC 8 and Garimpo, were used. The RIL were cultivated in two distinct Brazilian tropical environments: Cascavel county, in Paraná, and Viçosa county, in Minas Gerais (24º57'S, 53º27'W and 20º45'S, 42º52'W, respectively). Sixty-six SSR primer pairs and 65 RAPD primers were polymorphic and segregated at a 1:1 proportion. Thirty poorly saturated linkage groups were obtained, with 90 markers and 41 nonlinked markers. For the lines cultivated in Cascavel, three QTL were mapped in C2, E and N linkage groups, which explained 14.37, 10.31 and 7.34% of the phenotypic variation of protein content, respectively. For the lines cultivated in Viçosa, two QTL were mapped in linkage groups G and #1, which explained 9.51 and 7.34% of the phenotypic variation of protein content. Based on the mean of the two environments, two QTL were identified: one in the linkage group E (9.90%) and other in the group L (7.11%). In order for future studies to consistently detect QTL effects of different environments, genotypes with greater stability should be used.

Este trabalho objetivou identificar locos de carateres quantitativos (QTLs) assosciados com fotossíntese, crescimento e produtividade de soja com a finalidade de identificar possíveis associações entre estas características pela análise de coicindência de QTLs nos respectivos grupos de ligação (GL). Para isto, foram usadas populações de linhagens recombinantes endogâmicas (RILs) das gerações F7 e F8 derivadas dos cruzamentos entre as variedades BARC-8 e Garimpo. As características avaliadas foram taxa de assimilação líquida de CO2 sob luz saturante (Asat), taxa de fotossíntese potencial (Pmax), área foliar (A), área foliar específica (SLA), nitrogênio foliar específico (N); número de nódulos (nN), sementes (n s) e vagens (nP); massa fresca de sementes por planta (W S), massa fresca de 100 sementes (W HS) e percentagem de proteína da semente (P%). Foi possível identificar os seguintes QTLs associados com as características: SLA, Asat, N, W R, W ST, W L, W T, W P, W HS, n s e nP, indicando que as populações de RIL apresentam grande potencial para mapeamento de locos associados com caracteres quantitativos em soja. As correlações entre os caracteres analisados foram parcialmente confirmadas pela coincidência de QTL.

This work aimed to identify the quantitative trait loci (QTL) associated with photosynthesis and growth and productivity traits of soybean and to study possible associations between these traits by the analysis of coincidence of QTL in linkage groups (LGs). Thus, populations of recombinant inbred lines (RILs) of the F7 and F8 generations derived from the cross between the varieties BARC-8 and Garimpo were used. The traits evaluated were net assimilation rate of CO2 under saturating light (Asat), potential photosynthesis rate (Pmax), leaf area (A), specific leaf area (SLA), specific leaf nitrogen (N); root (W R), nodule (W N), stem (W ST), leaf (W L), pod (W P) and plant dry mass (W T); nodule (nN), seed (n s), and pod number (nP); seed fresh mass per plant (W S), one-hundred seed fresh mass (W HS) and seed protein percentage (P%). It was possible to identify the following QTL associated with the following soybean traits: SLA, Asat, N, W R, W ST, W L, W T, W P, W HS, n s and nP, indicating that the RIL population has a great potential for mapping loci associated with quantitative traits of the soybean crop. The correlations between the soybean traits were partially confirmed by coincidence of QTL.