NESTE TRABALHO nós usamos o instrumental da genética molecular e da genética de populações para estimar quantitativamente a contribuição africana para a formação do povo brasileiro. Examinamos dois compartimentos genômicos: o DNA mitocondrial, de herança matrilínea, e o DNA nuclear, de herança bi-parental. Os estudos mitocondriais revelaram que aproximadamente 30% dos brasileiros autoclassificados como brancos e 80% dos negros apresentam linhagens maternas características da áfrica subsaariana. A partir destes dados, estimamos que pelo menos 89 milhões de brasileiros são afro-descendentes, um número bem superior aos 76 milhões de pessoas que se declararam negros (pretos e pardos) no censo de 2000 do IBGE. As análises de polimorfismos nucleares com marcadores "informativos de ancestralidade" mostraram resultados mais expressivos ainda. Usando estudos de brasileiros autoclassificados como brancos de várias regiões do Brasil, estimamos que aproximadamente 146 milhões de brasileiros (86% da população) apresentam mais de 10% de contribuição africana em seu genoma. Estes números devem ser levados em conta nas discussões sobre ações afirmativas no Brasil, mas em um sentido descritivo e não prescritivo.

IN THIS ARTICLE we used tools of molecular and population genetics to estimate quantitatively the African contribution for the formation of the Brazilian population. We examined two genomic compartments: mitochondrial DNA (mtDNA), maternally inherited, and nuclear DNA, inherited from both parents. The studies using mtDNA showed that about 30% of Brazilians self-classified as White and 80% of Brazilian Negroes carry maternal lineages typical of Sub-Saharan Africa. Using these data we could estimate that at least 89 million Brazilians are afrodescendants, a number considerably larger than the 76 million individuals self-classified as Negro in the 2000 census. The analyses on nuclear polymorphisms employed "ancestry informative" markers and showed even more striking results. On the basis of studies in individuals self-classified as White from several Brazilian regions, we estimated that approximately 146 million Brazilians (86% of the population) had more than 10% African contribution to their genome. These numbers should be taken into account in discussing affirmative action programs in Brazil, but in a descriptive rather than a prescriptive sense.

A observação de que indivíduos homozigotos para uma deleção de 32 pares de base no gene que codifica para o receptor 5 de cc-quimiocinas apresentam um menor risco de contrair a infecção por HIV-1 levou à investigação da freqüência deste polimorfismo em várias populações mundiais. É importante investigar se o CCR5delta32 é um fator a ser considerado na epidemiologia do HIV em populações individuais. Com estes pressupostos em mente nós estabelecemos a freqüência do CCR5delta32 em uma grande amostra (907 indivíduos não-relacionados) da população urbana do sudeste brasileiro, estratificada da seguinte maneira: 322 indivíduos sadios, 354 pacientes com câncer colorretal e 229 doadores de sangue. Os três grupos apresentaram essencialmente a mesma freqüência alélica de CCR5delta32 e a comparação par-a-par não revelou diferenças significativas. Assim, os nossos resultados podem ser agrupados para fornecer uma estimativa confiável de 0,053 ± 0,005 da freqüência alélica de CCR5delta32. Os doadores de sangue compreendiam 50 indivíduos soronegativos para HTLV-I, 115 indivíduos assintomáticos por ELISA mas com resultados indeterminados em Western blot, 49 indivíduos soropositivos para HTLV-I mas assintomáticos e 15 indivíduos soropositivos para HTLV-I sintomáticos com mielopatia. Foi observado um sugestivo gradiente decrescente da freqüência alélica de CCR5delta32 nestas categorias. Entretanto, quando aplicamos o teste exato de Fisher, não emergiram diferenças significativas. Para uma melhor avaliação da influência do alelo CCR5delta32 na probabilidade de infectar-se com HTLV-I ou de desenvolver doença clínica serão necessários estudos com um maior número de doadores de sangue.

The identification of a 32-bp deletion in the cc-chemokine receptor-5 gene (CCR5delta32 allele) that renders homozygous individuals highly resistant to HIV infection has prompted worldwide investigations of the frequency of the CCR5delta32 allele in regional populations. It is important to ascertain if CCR5delta32 is a factor to be considered in the overall epidemiology of HIV in individual populations. With this in mind we determined the CCR5delta32 allele frequency in a large sample (907 individuals) of the southeastern Brazilian urban population, stratified as follows: 322 healthy unrelated individuals, 354 unselected colorectal cancer patients, and 229 blood donors. The three groups displayed essentially identical allelic frequencies of CCR5delta32 and pairwise comparisons did not show significant differences. Thus, our results can be pooled to provide a reliable estimate of the CCR5delta32 allele frequency in the southeastern Brazil of 0.053 ± 0.005. The blood donors comprised 50 HTLV-I serologically negative individuals, 115 non-symptomatic individuals HTLV-I positive by ELISA but with indeterminate Western blot results, 49 healthy blood donors HTLV-I positive both at ELISA and Western blot and 15 patients with clinical spinal cord disease (HAM). A suggestive trend was observed, with the CCR5delta32 frequencies decreasing progressively in these four categories. However, when we applied Fischer's exact test no significant differences emerged. We believe that further studies in larger cohorts should be performed to ascertain whether the CCR5delta32 allele influences the chance of becoming infected or developing clinical symptoms of HTLV-I infection.

Para a detecção molecular de monossomia X em perdas fetais espontâneas, nós exploramos uma estratégia baseada em perda de heterozigosidade, desenvolvendo um sistema multiplex fluorescente que permite a amplificação simultânea de cinco microssatélites em uma região com baixa recombinação no cromossomo X. A análise foi então feita por densitometria a laser assistida por computador. Nenhum caso de homozigosidade em todos os cinco locos foi encontrado em 30 mulheres normais estudadas, nem em 37 mulheres cuja tipagem foi extraída do banco de dados do CEPH. Além disso, todos os casos de monossomia X previamente diagnosticados por citogenética convencional apresentaram a prevista perda de heterozigosidade. Quando estudamos 19 casos de perdas fetais femininas do primeiro trimestre da gravidez, encontramos quatro amostras uniformemente homozigotas em todos os locos (21%), de acordo com a proporção esperada de casos de monossomia X em perdas fetais do primeiro trimestre. Concluímos que o sistema multiplex que nós desenvolvemos apresenta alta diversidade e alta eficiência de amplificação pela PCR e constitui um método simples e útil de triagem para monossomia X em abortamentos e natimortos.

To screen for monosomy X in spontaneous fetal losses we explored a simple molecular strategy based on loss of heterozygosity at highly polymorphic X-linked loci. We developed a multiplex fluorescent procedure that allows the simultaneous amplification of five dinucleotide repeat polymorphisms in a large low-recombination region in the long arm of the X chromosome. Analysis was performed by computer-assisted laser densitometry. We did not find any instances of homozygosity at all five loci in 30 normal females tested, nor among 37 women whose typing data were retrieved from the Fondation Jean Dausset - CEPH genotype database. In addition, all cases of monosomy X previously diagnosed by conventional cytogenetics presented the anticipated loss of heterozygosity at all loci. We studied 19 spontaneously aborted female fetuses and we found four samples homozygous for the five loci (21%), in good agreement with the expected rate of monosomy X in first trimester spontaneous abortions. We conclude that the loci have high diversity and high efficiency in PCR-amplification and that our multiplex procedure constitutes a simple and useful molecular screening test for monosomy X in abortions and stillbirths.

Nós desenvolvemos uma técnica não-isotópica baseada na PCR para a identificação de mutações completas da síndrome do X-frágil em homens. O método é baseado na PCR específica para metilação do promotor do gene FMR1. Amostras de DNA são tratadas com bissulfito de sódio para converter citosinas não-metiladas para uracilo, seguindo-se amplificação por PCR com oligonucleotídeos iniciadores específicos para DNA metilado versus não-metilado. Desenhamos dois iniciadores: um produz um fragmento de 142 pb da ilha CpG metilada tratada com bissulfito de sódio, enquanto o outro gera um produto de 84 pb do promotor tratado não-metilado. Em homens normais apenas o fragmento de 84 pb é visto, enquanto o diagnóstico da síndrome do X-frágil é indicado duplamente pela aparição do produto de 142 pb e pelo desaparecimento ou visualização muito fraca da banda de 84 pb. Como um controle interno indispensável para avaliação da eficiência do tratamento com bissulfito de sódio, nós usamos iniciadores específicos para a versão materna metilada da ilha CpG do gene SNRPN no cromossomo 15 humano. Com a PCR específica para metilação nós identificamos com sensibilidade e acerto de 100% oito pacientes previamente diagnosticados como tendo a síndrome do X-frágil misturados com 42 controles normais. Dada a sua simplicidade e alta eficiência, a PCR específica para metilação pode tornar-se o método de escolha para o diagnóstico da síndrome do X-frágil em homens com retardo mental.

We have developed a non-isotopic technique based on methylation-specific PCR (MSP) of the FMR1 promoter for the identification of fragile X full mutations among men. DNA samples were first treated with sodium bisulfite to convert unmethylated, but not methylated, cytosines to uracil, followed by PCR amplification with oligonucleotide primers specific for methylated versus unmethylated DNA. We designed two primer pairs: one produced a 142-bp fragment from the bisulfite-treated methylated CpG island, while the other generated an 84-bp product from the treated non-methylated promoter. In normal males only the 84-bp fragment was seen, while the diagnosis of FRAXA was doubly indicated by the appearance of a 142-bp product together with absence or weak visualization of the 84-bp band. As an indispensable internal control for the efficiency of the sodium bisulfite treatment, we used a primer pair specific for the imprinted maternal methylated version of the CpG island of the SNRPN gene on human chromosome 15. Using the methylation-specific PCR we identified with 100% sensitivity and accuracy eight previously diagnosed FRAXA male patients mixed with 42 normal controls. Because of its simplicity and high efficiency, methylation-specific PCR may become the method of choice for the diagnosis of the fragile X syndrome in mentally retarded males.