Mudanças no uso e ocupação do solo representam um importante impacto antrópico sobre a qualidade de habitats e a diversidade biológica. Os efeitos do uso do solo sobre a qualidade de habitats e a granulometria do sedimento em um rio tropical impactado por urbanização e agricultura fora m investigados. Foram selecionados 15 trechos de amostragem representativos da bacia do Rio das Mortes, sendo 12 localizados no leito principal, desde a cabeceira até a foz, e os restantes em três dos principais tributários. Um levantamento de habitat foi realizado nestes trechos durante a estação seca de 2010 e amostras de sedimento foram coletadas para análise granulométrica. A cobertura da bacia nos trechos estudados foi dominada por vegetação natural (41.6 a 60.2%), seguida por agricultura (38.4 a 56.9%) e urbanização (1.4 a 5.6%). Os sedimentos foram dominados por silte e areia, pouco favoráveis à diversidade biológica. De acordo com o levantamento de habitat, todos os trechos apresentaram integridade moderada ou totalmente perturbada, devido a diversos impactos frequentes, tais como remoção de mata ciliar, captação de água, extração de areia e cascalho e erosão. Apenas um dos trechos estudados apresentou largura de corredor ripário em concordância com o exigido pelo Código Florestal Brasileiro. Os resultados indicam que a integridade de habitat e a qualidade do sedimento riverinos dependem principalmente das condições presentes na vizinhança imediata dos trechos estudados. Assim, a restauração custo-efetiva dos habitats aquáticos poderia ser alcançada por medidas simples de restauração do canal e a proteção da vegetação ripária neste rio tropical.
Rios neotropicais; urbanização; agricultura; integridade estrutural