O cerrado pode ser dividido em dois principais setores fitogeográficos: um caracterizado por Piptocarpha rotundifolia, em que o Parque Nacional das Emas (PNE) está localizado, e outro caracterizado por Curatella americana. Realizamos um levantamento florístico no PNE, que nos permitiu determinar a composição taxonômica de sua flora vascular e sua similaridade com outros sítios. Comparamos a flora do PNE com sítios disjuntos de cerrado, também no setor Piptocarpha, e com padrões florísticos gerais do cerrado. A distribuição de espécies por família foi significativamente diferente daquela obtida para cada componente da flora do cerrado. O componente herbáceo-subarbustivo se caracterizou pela super-representação de Myrtaceae e pela sub-representação de Orchidaceae e Lythraceae; e o componente arbustivo-arbóreo, pela super-representação de Myrtaceae e Nyctaginaceae. Quando comparado aos sítios disjuntos, o PNE se mostrou distinto, não só em nível específico, mas também em nível de famílias.
