A diversidade genética de Passiflora spp. tem sido estudada basicamente através de características morfológicas e agronômicas, levando à uma classificação até espécie. A caracterização intraespecífica por meio destes descritores necessita de um ciclo integral de cultivo, e é pouco discriminante. O objetivo deste estudo foi caracterizar a variação genética de uma coleção de Passiflora através da técnica RAPD. Análises moleculares foram realizadas em 70 acessos, envolvendo 11 espécies do gênero Passiflora. A utlização de apenas cinco primers permitiu a obtenção de 136 fragmentos polimórficos. A classificação hierárquica obtida mostrou alto nível de dissimilaridade entre e dentro das espécies. Nítida separação foi obtida entre acessos de P. edulis e da forma flavicarpa, de alto interesse comercial, fracamente diferenciados pelas características morfológicas e agronômicas. A utilização desses marcadores na avaliação dos recursos genéticos de Passiflora, é atrativa para o melhorista e poderá muito auxiliar na identificação dos acessos, pela facilidade, rapidez e pelo baixo custo na condução das avaliações.
