A influência do aumento em caracteres quantitativos contínuos devido ao crescimento indeterminado sobre a análise de diferenciação entre populações foi investigado utilizando como exemplo um conjunto de dados de variáveis craniométricas em 10 populações de uma espécie de roedor. Dois conjuntos de dados, um não corrigido para o efeito alométrico do tamanho e um outro corrigido para o efeito alométrico do tamanho utilizando um método de projeção ortogonal, foram analisados por um procedimento "bootstrap" de reamostragem aplicado à análise de variáveis canônicas. O componente de variância devido ao crescimento indeterminado dentro das populações foi significativo para a maioria das medidas de distâncias, o que não influenciou a ordenação das populações, conforme evidenciado pela posição relativa dos centróides. O padrão de covariância entre as variáveis de distância que foi utilizado para inferir a natureza das diferenças morfológicas foi, no entanto, fortemente influenciado pela variação nas medidas de distâncias dentro das populações. O conjunto de dados não corrigido resultou em uma interpretação errônea sobre a natureza da diferenciação morfológica, sugerindo que as populações diferiram somente em tamanho. O conjunto de dados corrigido para o efeito alométrico, por sua vez, demonstrou claramente que as populações diferiram, não somente no tamanho, mas também na forma. Os resultados são discutidos em termos da diferenciação das populações em forma e tamanho no contexto da definição das unidades geográficas infraspecíficas.
