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Estimation of the proportion of genetic variance explained by molecular markers

A estimação da proporção da variância genética explicada por marcadores moleculares (p) desempenha um importante papel em estudos básicos de características quantitativas, bem como na seleção assistida por marcadores (SAM), se o índice de seleção proposto por Lande e Thompson (Genetics 124: 743-756, 1990) é utilizado. Freqüentemente, o coeficiente de determinação (R2) é usado para quantificar esta proporção. Neste trabalho, um estimador simples de p é apresentado, o qual é aplicável quando um modelo de regressão múltipla é utilizado e progênies são avaliadas em delineamentos experimentais. A sua distribuição de amostragem foi obtida e comparada com aquela do R2. Simulações de Monte Carlo sugeriram que, quando o número de progênies avaliadas é pequeno, ambas as estatísticas são insatisfatórias, devido a tendenciosidades e/ou baixa precisão. O coeficiente R2 mostrou-se adequado apenas quando p é alta. Se o número de progênies avaliadas é elevado (algumas centenas), então o estimador proposto <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> mostrou-se superior, com tendenciosidade consideravelmente menor que a do R2, e com precisão aceitável. Uma aproximação normal da distribuição de amostragem de <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> foi obtida, utilizando a expansão de Taylor da esperança e da variância dessa estatística. Intervalos de confiança aproximados para p, baseados na distribuição normal, mostraram-se satisfatórios, se o número de progênies for elevado. O uso de <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> na SAM é ilustrado para a estimativa do coeficiente dado ao escore molecular, se um índice de seleção é utilizado.


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