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Genetics and Molecular Biology, Volume: 23, Número: 1, Publicado: 2000
  • Mapping oligogenes for atopy and asthma by meta-analysis Human And Medical Genetics

    Collins, A.; Ennis, S.; Tapper, W.; Morton, N.E.

    Resumo em Português:

    Apresenta-se uma meta-análise de estudos publicados sobre associação alélica ou de ligação que têm em comum apenas os níveis de significância relatados. Os relatos são tendenciosos e a não-significância é raramente quantificada. Portanto, a meta-análise não pode identificar oligogenes dentro de uma região candidata nem estabelecer sua significância, mas define bem as regiões candidatas. Aplicando-se a um banco de dados sobre atopia e asma, as regiões candidatas são identificadas nos cromossomos 6, 5, 16, 11, 12, 13, 14, 7, 20 e 10, ordenados partindo-se das evidências mais fortes para as mais fracas. Por outro lado, há pouca evidência para os cromossomos 9, 8, 18, 1 e 15, na mesma ordem. As evidências obtidas em 156 publicações são revistas para cada região. Com erros tipo I e II aceitáveis, vários milhares de pares de irmãos afetados seriam necessários para detectar um loco responsável por 1/10 do efeito genético na asma. A identificação de regiões por uma avaliação geral do genoma visando a associação alélica e de ligação requer estudos colaborativos internacionais para atingir o tamanho necessário da amostra, usando métodos baseados em "lod" que especifiquem uma hipótese alternativa fracamente paramétrica e que possam ser combinados com relação a estudos que diferem em avaliação, fenótipos e marcadores. Este é o problema central em heranças complexas.

    Resumo em Inglês:

    Meta-analysis is presented for published studies on linkage or allelic association that have in common only reported significance levels. Reporting is biassed, and nonsignificance is seldom quantified. Therefore meta-analysis cannot identify oligogenes within a candidate region nor establish their significance, but it defines candidate regions well. Applied to a database on atopy and asthma, candidate regions are identified on chromosomes 6, 5, 16, 11, 12, 13, 14, 7, 20, and 10, in rank order from strongest to weakest evidence. On the other hand, there is little support for chromosomes 9, 8, 18, 1, and 15 in the same rank order. The evidence from 156 publications is reviewed for each region. With reasonable type I and II errors several thousand affected sib pairs would be required to detect a locus accounting for 1/10 of the genetic effect on asthma. Identification of regions by a genome scan for linkage and allelic association requires international collaborative studies to reach the necessary sample size, using lod-based methods that specify a weakly parametric alternative hypothesis and can be combined over studies that differ in ascertainment, phenotypes, and markers. This has become the central problem in complex inheritance.
  • Screening fetal losses for monosomy X with a simple PCR-based procedure Human And Medical Genetics

    Pereira, Rinaldo W.; Sturzeneker, Rosane; Pena, Sérgio D.J.

    Resumo em Português:

    Para a detecção molecular de monossomia X em perdas fetais espontâneas, nós exploramos uma estratégia baseada em perda de heterozigosidade, desenvolvendo um sistema multiplex fluorescente que permite a amplificação simultânea de cinco microssatélites em uma região com baixa recombinação no cromossomo X. A análise foi então feita por densitometria a laser assistida por computador. Nenhum caso de homozigosidade em todos os cinco locos foi encontrado em 30 mulheres normais estudadas, nem em 37 mulheres cuja tipagem foi extraída do banco de dados do CEPH. Além disso, todos os casos de monossomia X previamente diagnosticados por citogenética convencional apresentaram a prevista perda de heterozigosidade. Quando estudamos 19 casos de perdas fetais femininas do primeiro trimestre da gravidez, encontramos quatro amostras uniformemente homozigotas em todos os locos (21%), de acordo com a proporção esperada de casos de monossomia X em perdas fetais do primeiro trimestre. Concluímos que o sistema multiplex que nós desenvolvemos apresenta alta diversidade e alta eficiência de amplificação pela PCR e constitui um método simples e útil de triagem para monossomia X em abortamentos e natimortos.

    Resumo em Inglês:

    To screen for monosomy X in spontaneous fetal losses we explored a simple molecular strategy based on loss of heterozygosity at highly polymorphic X-linked loci. We developed a multiplex fluorescent procedure that allows the simultaneous amplification of five dinucleotide repeat polymorphisms in a large low-recombination region in the long arm of the X chromosome. Analysis was performed by computer-assisted laser densitometry. We did not find any instances of homozygosity at all five loci in 30 normal females tested, nor among 37 women whose typing data were retrieved from the Fondation Jean Dausset - CEPH genotype database. In addition, all cases of monosomy X previously diagnosed by conventional cytogenetics presented the anticipated loss of heterozygosity at all loci. We studied 19 spontaneously aborted female fetuses and we found four samples homozygous for the five loci (21%), in good agreement with the expected rate of monosomy X in first trimester spontaneous abortions. We conclude that the loci have high diversity and high efficiency in PCR-amplification and that our multiplex procedure constitutes a simple and useful molecular screening test for monosomy X in abortions and stillbirths.
  • Perinatal mortality among twins and singletons in a city in southeastern Brazil, 1984-1996 Human And Medical Genetics

    Beiguelman, Bernardo; Franchi-Pinto, Carla

    Resumo em Português:

    Dados a respeito de 116.699 partos (1062 gemelares e 115.637 únicos) ocorridos entre 1984 e 1996 na maior maternidade de Campinas, SP, Brasil, permitiram fazer as seguintes observações: 1) a despeito da baixa porcentagem de nascimentos gemelares (0,9%), os gêmeos foram responsáveis por 10,7% dos óbitos neonatais precoces e 3,5% dos natimortos. Em relação aos recém-nascidos de parto único, a probabilidade de natimortalidade e mortalidade neonatal precoce dos gêmeos foi, respectivamente, 1,9 e 6,5 vezes menor. 2) A proporção de gêmeos entre os óbitos neonatais precoces vem decrescendo, podendo essa tendência ser atribuída à melhoria da assistência pré- e perinatal. 3) Os três primeiros dias após o nascimento constituíram o período crítico de ocorrência dos óbitos neonatais tanto dos gêmeos quanto dos recém-nascidos de parto único. 4) A mortalidade perinatal incidiu mais freqüentemente nos pares MM, que foram seguidos pelos pares FF, e foi menor nos pares MF. 5) A taxa anual de óbitos neonatais precoces tem decrescido nos recém-nascidos de parto único e nos gêmeos, o mesmo ocorrendo com a taxa anual de natimortos de parto único, mas o decréscimo foi mais acentuado nos recém-nascidos do sexo feminino. 6) Durante o período analisado a razão de sexo esteve praticamente estável nos recém-nascidos de parto único vivos, mostrou variação cíclica nos recém-nascidos que foram a óbito na primeira semana e revelou tendência crescente nos natimortos. A razão de sexo dos gêmeos que foram a óbito na primeira semana e daqueles que sobreviveram também mostrou crescimento acentuado no período entre 1984 e 1996. 7) Nos recém-nascidos de parto único a idade gestacional média foi maior naqueles que sobreviveram, os quais foram seguidos pelos natimortos, sendo menor nos que foram a óbito na primeira semana. Nos gêmeos a idade gestacional média dos sobreviventes foi maior do que a dos falecidos na primeira semana, mas não diferiu daquela apresentada pelos natimortos. 8) O peso médio de todos os recém-nascidos foi maior entre os sobreviventes, que foram seguidos pelos natimortos, e menor naqueles que foram a óbito na primeira semana. 9) Os índices de Apgar > ou = 7 obtidos cinco minutos após o nascimento não podem ser considerados como um indicador de boas condições clínicas do recém-nascido, porque quase a metade dos óbitos neonatais precoces mostraram índices de Apgar de cinco minutos variando de 7 a 10.

    Resumo em Inglês:

    Analysis of 116,699 deliveries (1062 twin pairs and 115,637 singletons) which occurred from 1984 to 1996 at the largest obstetric center in Campinas, SP, Brazil, provided the following conclusions: 1) despite the low percentage of twin births (0.9%), 10.7% of all early neonatal deaths and 3.5% of all stillbirths were twins. Compared to singletons, the likelihood of stillbirths and early neonatal deaths among twins was 1.9 and 6.5 times greater, respectively. 2) The proportion of twins among early neonatal deaths tended to decrease, probably because of improvements in prenatal and perinatal care. 3) The critical period for early neonatal deaths in singletons and twins lasted for the three first days after birth. 4) The incidence of perinatal deaths among twins was highest among MM pairs, followed by FF pairs, and lowest among MF pairs. 5) There was a trend towards a decrease in the annual rate of early neonatal deaths among both singletons and twins, and of stillbirths among singletons, the latter being more conspicuous among females. 6) The sex ratio of singletons was practically stable among living newborns, but showed strong cyclic variation among early neonatal deaths, and a tendency to increase among stillbirths. Twins who died in the first week, as well as living twins showed a strong increase in their sex ratio from 1984 to 1996. 7) The mean gestational age of singletons was highest among living newborns followed by stillbirths, and was lowest among early neonatal deaths. The mean gestational age of living twins was higher than that of early neonatal deaths, but not different from that of stillbirths. 8) The mean birth weight of singletons and twins was highest among living newborns, followed by stillbirths, and lowest among early neonatal deaths. 9) Apgar scores > or = 7 obtained five minutes after birth are inadequate as a reliable indicator of the clinical condition of the newborn, since almost half of the early neonatal deaths had 5-min Apgar scores varying from 7 to 10.
  • Genetic hearing loss: a study of 228 Brazilian patients Human And Medical Genetics

    Longhitano, Silvia Bragagnolo; Brunoni, Décio

    Resumo em Português:

    Estudamos 228 pacientes, pertencentes a 188 famílias, com deficiência auditiva genética, suspeita ou confirmada, já excluídas causas ambientais, no sentido de determinar o diagnóstico clínico e genético e a etiologia em cada caso, já que estudos deste tipo são escassos em pacientes brasileiros. A surdez sem anomalias associadas compreendeu 146 pacientes (64%) pertencentes a 112 famílias. Deficiência auditiva sindrômica foi diagnosticada em 82 pacientes (36%) pertencentes a 76 famílias. Em 44,7% deles, não foi possível determinar a etiologia da deficiência auditiva e a origem monogênica foi suposta baseada em dados de freqüência. Com relação ao padrão de herança, 40,8%, entre sindrômicos e não-sindrômicos, foram recessivos, 13,2% foram dominantes e 1,3%, ligados ao X. Algumas variáveis foram analisadas: consangüinidade parental foi encontrada em 22,4% dos casos, surdez neurosensorial profunda bilateral em 47,4%, e o início precoce da perda auditiva (até 2 anos) em 46,5%. O estudo clínico e a história familiar revelaram-se como os principais métodos para a definição diagnóstica. As causas genéticas de surdez em pacientes brasileiros são similares aos estudos referidos na literatura.

    Resumo em Inglês:

    We studied 228 patients, with suspected or confirmed genetic hearing loss, in order to determine the clinical and genetic diagnoses and etiology of each case. Deafness with no associated abnormalities was found in 146 patients (64%) belonging to 112 families. Syndromic deafness was diagnosed in 82 patients (36%) belonging to 76 families. The genetic etiology was as follows: autosomal recessive inheritance in 40.8% of syndromics and non-syndromics, autosomal dominant inheritance in 13.2% and X-linked recessive in 1.3%. In 44.7% of the cases, the etiology of the hearing loss could not be determined. Monogenic causes are the most possible etiology in the latter cases. Parental consanguinity was found in 22.4% of the cases, and deafness was bilateral, profound and neurosensorial in 47.4% of the patients. An early onset of hearing loss (< 2 years of age) occurred in 46.5% of the cases. These results are similar to previous literature reports.
  • The anticancer agent PB-100, selectively active on malignant cells, inhibits multiplication of sixteen malignant cell lines, even multidrug resistant Human And Medical Genetics

    Beljanski, Mirko

    Resumo em Português:

    O agente anticancerígeno de origem vegetal PB-100 destrói seletivamente as células cancerosas, mesmo quando elas são resistentes a múltiplas drogas; no entanto, ele não inibe a multiplicação de células normais (não malignas). O teste do PB-100 em 16 linhagens de células malignas, assim como em 5 linhagens de células normais, confirmou nosso resultados prévios. Flavopereirine e dihidroflavopereirine, os princípios ativos do PB-100, foram sintetizados quimicamente e mostraram a mesma seletividade para as células tumorais que o extrato purificado da planta, sendo ativos em concentrações ainda menores.

    Resumo em Inglês:

    The plant-derived anticancer agent PB-100 selectively destroys cancer cells, even when multidrug resistant; yet, it does not inhibit normal (non-malignant) cell multiplication. Testing of PB-100 on sixteen malignant cell lines, several multidrug resistant, as well as on five normal cell lines, confirmed our previous results. Flavopereirine and dihydroflavopereirine, the active principles of PB-100, were chemically synthesized and displayed the same selectivity for tumor cells as the purified plant extract, being active at even lower concentrations.
  • Mitochondrial DNA-like sequence in the nuclear genome of Saguinus (Callitrichinae, Primates): transfer estimation Population Genetics And Evolution

    Vallinoto, Marcelo; Sena, Leonardo; Sampaio, Iracilda; Schneider, Horacio; Schneider, Maria Paula

    Resumo em Português:

    Seqüências tipo mitocondriais têm comumente sido encontradas no genoma nuclear de diversos organismos. Quando acidentalmente incluídas em estudos de seqüências mitocondriais, diversas conclusões errôneas podem ser obtidas. No entanto, estes pseudogenes nucleares tipo mitocondriais podem ser usados para a estimativa da taxa relativa de evolução de genes mitocondriais e também como grupo externo em análises filogenéticas. No presente trabalho, seqüências mitocondriais com características do tipo de pseudogene, tais como deleções e/ou inserções e códons de parada, foram encontradas em tamarins (Saguinus spp., Callitrichinae, Primates). A análise filogenética permitiu a estimativa do tempo da migração da seqüência mitocondrial para o genoma nuclear e algumas inferências filogenéticas. A escolha de um grupo externo não adequado (Aotus infulatus) não permitiu uma reconstrução filogenética confiável da subfamília Callitrichinae. A divergência bastante antiga de Cebidae (Callitrichinae, Aotinae e Cebinae) pode ter favorecido o aparecimento de homoplasias, obscurecendo a análise.

    Resumo em Inglês:

    Mitochondrial DNA-like sequences have been found in the nuclei of a variety of organisms. These nuclear pseudogenes can be used to estimate relative evolutionary rates of mitochondrial genes, and can be used as outgroups in phylogenetic analyses. In this study, mitochondrial sequences with pseudogene-like characteristics, including deletions and/or insertions and stop codons, were found in tamarins (Saguinus spp., Callitrichinae, Primates). Phylogenetic analysis allowed estimation of the timing of the migration of these sequences to the nuclear genome, and also permitted inferences on the phylogeny of the genus. The choice of an inadequate outgroup (Aotus infulatus) prevented a good phylogenetic resolution of the subfamily Callitrichinae. The relatively ancient divergence of the Cebidae (Callitrichinae, Aotinae and Cebinae) may have favored confounding homoplasies.
  • Population genetics of the Chilean frog Batrachyla Leptopus (Leptodactylidae) Population Genetics And Evolution

    Formas, J.R.; Brieva, L.M.

    Resumo em Português:

    A variação eletroforética de proteínas codificadas por 14 loci foi analisada em oito populações (5 continentais e 3 insulares) da rã leptodactilídea chilena Batrachyla leptopus. A proporção geral de loci polimórficos foi estimada como sendo de 18,7% e o número médio de alelos por loco, 1,2, enquanto que as heterozigosidades observada e esperada foram 1,7 e 5,1%, respectivamente. O coeficiente esperado de identidade genética foi 0,940; o número correspondente para a distância genética foi 0,063. A análise estatística F mostrou um coeficiente de endogamia total (Fit) de 0,855 e altos níveis de subdivisão genética (Fst = 0,596), assim como de endogamia dentro das populações (Fis = 0,640). Contudo, houve apenas um nível moderado de diferenciação genética (Fst = 0,181) entre o grupo insular de populações e o grupo continental.

    Resumo em Inglês:

    Electrophoretic variation of proteins encoded by 14 loci was analyzed in eight (five continental and three insular) populations of the Chilean leptodactylid frog Batrachyla leptopus. The overall proportion of polymorphic loci was estimated to be 18.7% and the average number of alleles per locus, 1.2, while observed and expected heterozygosities were 1.7 and 5.1%, respectively. The estimated coefficient of genetic identity was 0.940; the corresponding figure for genetic distance was 0.063. F-statistics analysis showed a total inbreeding coefficient (Fit) of 0.855 and high levels of genetic subdivision (Fst = 0.596) as well as of inbreeding within populations (Fis = 0.640). However, there was only a moderate level of genetic differentiation (Fst = 0.181) between the insular group of populations and the continental group.
  • A new concept of relatedness and its significance to the theory of social evolution Population Genetics And Evolution

    Drummond, M.S.

    Resumo em Português:

    Dados de campo de espécies de Hymenoptera primitivamente sociais têm se mostrado contraditórios quanto ao papel do reconhecimento de parentes e do grau de parentesco na evolução social. Nesse trabalho um novo conceito de "coeficiente de parentesco" foi desenvolvido. Esta nova hipótese foi chamada de "parentesco agregado". Nesse conceito, genes compartilhados por dois indivíduos quaisquer têm importância significativa na formação das unidades familiares, dependendo de suas freqüências e da forma como estão distribuídos na população circunvizinha a esta unidade familiar.

    Resumo em Inglês:

    Data on primitively social groups of Hymenoptera have been somewhat contradictory with respect to kin recognition, degree of relatedness and social evolution. This study presents a new concept of "relatedness coefficient". Called "aggregated relatedness", the hypothesis here introduced proposes that genes shared by any two individuals affect formation of family units to an extent dependent on their frequency and manner of dispersion in neighboring populations.
  • A program for representing and simulating population genetic phenomena Population Genetics And Evolution

    Nuin, Paulo A.S.; Otto, P.A.

    Resumo em Português:

    O artigo descreve o funcionamento de um programa capaz de representar e simular vários fenômenos de pertinência em genética de populações, como a distribuição de freqüências gênicas e genotípicas sob regime de diversos tipos de sistemas de cruzamentos, como pan-mixia, endogamia e cruzamentos preferenciais e sob influência de fatores evolutivos como mutação, seleção, fluxo gênico e deriva genética. O programa foi desenvolvido em Visual Basic (Microsoft, Inc.) e pode ser executado em qualquer computador IBM-PC compatível, em ambiente Windows 3.1 ou versões posteriores.

    Resumo em Inglês:

    The paper describes a computer program for representing and simulating population genetic phenomena, such as the distribution of gene and genotype frequencies under different mating systems (panmixia, inbreeding and assortative mating systems) and under influence of evolution factors (mutation, selection, gene flow and genetic drift). The program was written in Visual Basic (Microsoft, Inc.) and is able to run in any IBM-PC compatible computer running Windows 3.1 or later versions.
  • Effects of double-stranded RNA on virulence of Paecilomyces fumosoroseus (Deuteromycotina: Hyphomycetes) against the silverleaf whitefly, Bemisia tabaci strain B (Homoptera: Aleyrodidae) Genetics Of Microorganisms

    Azevedo, Andréia Cristiane Souza; Sosa-Gómez, Daniel Ricardo; Faria, Marcos Rodrigues; Fungaro, Maria Helena Pelegrinelli

    Resumo em Português:

    Bandas de dsRNA foram detectadas em três dos doze isolados de Paecilomyces fumosoroseus. A identidade destas bandas foi provada através de tratamentos com RNAse, DNAse e S1 nuclease. A cura do dsRNA para um dos isolados (P92) foi obtida através do isolamento de colônias monospóricas. Linhagens isogênicas, com e sem dsRNA, foram submetidas ao teste de virulência contra a mosca branca Bemisia tabaci biotipo B. Ao contrário do que ocorre para vários fungos fitopatogênicos, os fragmentos de dsRNA não causaram hipovirulência em P. fumosoroseus.

    Resumo em Inglês:

    Bands of double-stranded RNA (dsRNA) were detected in three out of twelve isolates of Paecilomyces fumosoroseus. Identity of these bands was confirmed by RNAse, DNAse and S1 nuclease treatments. The cure of dsRNA for one isolate (P92) was successfully carried out for a single conidium subculture. Isogenic strains, with or without dsRNA, were submitted to virulence tests against the whitefly Bemisia tabaci strain B. In contrast to findings for some phytopathogenic fungi, these dsRNA fragments did not cause hypovirulence in P. fumosoroseus.
  • A simplified CsCL protocol for lambda DNA purification: no enzymatic treatment/one phenol extraction Genetics Of Microorganisms

    Santelli, Roberto V.; Navarro-Cattapan, Luci Deise

    Resumo em Português:

    É proposta uma modificação para o tradicional protocolo de purificação de DNA de fago que utiliza gradiente de cloreto de césio. Este método evita etapas enzimáticas assim como a necessidade de uma titulação prévia, um processo que consome tempo e é proposto na maioria dos métodos em uso. A qualidade do DNA obtido permite manipulações adicionais, tais como digestões, ligações, marcações, subclonagens, etc.

    Resumo em Inglês:

    A modification of the CsCl gradient centrifugation method for DNA phage purification is presented. It avoids the enzymatic steps as well the need for a preliminary phage titration, a tedious process proposed in the majority of the protocols in use. The quality of the DNA obtained makes it amenable for additional manipulations like digestions, ligations, labelling, subcloning, etc.
  • Heterochromatin variation in chromosomes of Anopheles (Nyssorhynchus) darlingi Root and A.(N.) nuneztovari Gabaldón (Diptera: Culicidae) Insect Genetics

    Rafael, Míriam Silva; Tadei, Wanderli Pedro

    Resumo em Português:

    Pela técnica do bandamento C detectou-se variação de marcação dos blocos heterocromáticos dos cromossomos de A. darlingi e A. nuneztovari de Manaus, Amazonas, e de Macapá, Amapá, Brasil. Os cromossomos sexuais de ambas as espécies mostraram duas formas de cromossomos X e o Y foi totalmente heterocromático. No cromossomo X1 de A. darlingi a marcação atingiu 1/3 e no cromossomo X2 foi apenas na região centromérica. Nos autossomos de ambas as espécies as marcações foram constantes nas regiões centroméricas, e o cromossomo II de A. darlingi mostrou um bloco heterocromático em um dos braços. A. nuneztovari mostrou polimorfismo de tamanho para o cromossomo X, tendo o X maior (X1) três blocos e o menor (X2) dois blocos heterocromáticos. Fêmeas homozigotas (X2X2) não foram detectadas nas duas localidades. Em machos de A. darlingi foram encontrados os cromossomos X1 e X2, enquanto que em machos de A. nuneztovari somente o cromossomo X1 foi detectado. Apenas variação intraespecífica de blocos heterocromáticos nos cromossomos X e nos autossomos foi registrada nas duas populações de ambas as espécies estudadas em cada localidade.

    Resumo em Inglês:

    C-banding was used to study the variations in heterochromatic block markings in chromosomes of Anopheles darlingi and A. nuneztovari from Manaus, State of Amazonas, and Macapá, State of Amapá, Brazil. Both species had two differently shaped X chromosomes and a Y chromosome that was entirely heterochromatic. The X1 chromosome of A. darlingi had markings that extended 1/3 of the total length whereas in the X2 chromosome the markings were located around the centromeric region. The markings on autosomal chromosomes were concentrated in the centromeric region in both species, with a heterochromatic block in one arm of chromosome II of A. darlingi. A. nuneztovari had three heterochromatic blocks in chromosome X1 (longer) and two blocks in X2 (shorter). X2X2 females were not detected in either species. The X1 and X2 chromosomes of males were found in A. darlingi, whereas in A. nuneztovari only the X1 chromosome was detected. Only intraspecific variation was found in heterochromatic block markings in the sex chromosomes and autosomes in the two populations of both species at each location.
  • Genetic divergence in mitochondrial DNA of Anopheles nuneztovari (Diptera: Culicidae) from Brazil and Colombia Insect Genetics

    Scarpassa, Vera Margarete; Geurgas, Silvia; Azeredo-Espin, Ana Maria L.; Tadei, Wanderli Pedro

    Resumo em Português:

    Neste estudo, apresentamos a variabilidade no DNA mitocondrial de três populações da Amazônia brasileira e uma do oeste da Colômbia (Sitronela) de A. nuneztovari, utilizando-se quatro endonucleases de restrição (BclI, ClaI, HindIII, SstI). A diversidade haplotípica (h) foi ligeiramente elevada em todas as populações (0.5000 a 0.6765), enquanto que a diversidade de nucleotídeo (pi) foi menor na população de Sitronela (0.0029) e maior nas populações da Amazônia brasileira (0.0056 a 0.0098). O grau de divergência de seqüência (delta) estimado entre as populações da Amazônia brasileira e Sitronela (0.0329 a 0.0371) sugere que estas populações geográficas de A. nuneztovari podem eventualmente representar espécies distintas. Os valores baixos de divergência de seqüência entre as três populações da Amazônia brasileira (0.0012 a 0.0031) indicam que estas populações são geneticamente semelhantes. Estes resultados são consistentes com os reportados recentemente para aloenzimas nestas mesmas populações.

    Resumo em Inglês:

    In the present study, we have examined the variability in Anopheles nuneztovari mitochondrial DNA of three populations from the Brazilian Amazon and one from western Colombia (Sitronela), using four restriction endonucleases (BclI, ClaI, HindIII, SstI). The haplotype diversity (h) was slightly elevated in all populations (0.5000 to 0.6765), whereas the nucleotide diversity (pi) was lower in the Sitronela population (0.0029) and higher in populations from the Brazilian Amazon (0.0056 to 0.0098). The degree of sequence divergence (delta) estimated within the Brazilian Amazon and that in Sitronela (0.0329 to 0.0371) suggests that these geographic populations of A. nuneztovari may eventually constitute separate species. The low sequence divergence values among the three Brazilian Amazon populations (0.0012 to 0.0031) indicate that these populations are genetically similar. These results are consistent with those recently reported for allozymes of these same populations.
  • Evidence of hybridization between two species of Melipona bees Insect Genetics

    Nascimento, Vania Alves; Matusita, Syomara Hakiko; Kerr, Warwick Estevam

    Resumo em Português:

    Este trabalho descreve um caso de hibridação entre duas espécies de meliponínios (Melipona scutellaris originária da Chapada Diamantina, Bahia, e Melipona capixaba oriunda da região de Domingos Martins, ES). Para demonstrar a hibridação, perfis eletroforéticos de esterases das três colônias foram estudados. Dez operárias adultas de colônias de M. scutellaris, M. capixaba e da colônia híbrida foram coletadas e processadas individualmente. O padrão de atividade esterásica foi constante para cada espécie, mas diferente entre elas, enquanto que os indivíduos da colônia híbrida apresentaram um padrão de atividade esterásica derivado de ambas as espécies. O fato de duas espécies de abelhas ecologicamente diferentes, separadas por mais de 300 km, ainda poderem se cruzar quando colocadas em mesma área sugere que houve uma separação geográfica abrupta, sem ocorrência de pressão para desenvolvimento de isolamento reprodutivo.

    Resumo em Inglês:

    This report describes a case of hybridization between two species of Meliponinae bees (Melipona scutellaris from the Diamantina plateau in the State of Bahia, and Melipona capixaba from around Domingos Martins, in the State of Espírito Santo, Brazil). To demonstrate hybridization, electrophoretic profiles of esterase activity from three colonies were studied. Ten adult workers of M. scutellaris, M. capixaba and the hybrid colony were collected and processed individually. The pattern of esterase activity was constant for each species but differed between them, whereas hybrid bees had a pattern derived from both species. The fact that two ecologically different species of stingless bees separated by more than 300 km could still cross when placed in the same area suggests that there has not been any pressure to develop reproductive isolation.
  • Ovarian development in Meliponine bees (Hymenoptera: Apidae): the effect of queen presence and food on worker ovary development and egg production Insect Genetics

    Cruz-Landim, Carminda da

    Resumo em Português:

    Aspectos morfológicos indicativos do grau de desenvolvimento dos ovários de meliponíneos indicaram um possível efeito estimulador da rainha sobre o desenvolvimento do ovário e a produção de ovos tróficos em algumas espécies. Há também indicações de que a rainha inibe a produção de ovos férteis pelas operárias. Esta inibição pode caracterizar-se por um retardamento na postura de ovos férteis, até que a operária esteja fora do contacto direto com a rainha, ou por um não desenvolvimento dos ovários na sua presença, como visto em Leutrotrigona muelleri. A tendência evolutiva, para uma total inabilidade para a produção de ovos férteis pelas operárias, tem sua representação extrema na reabsorção do ovário na pupa, como ocorre em Frieseomelitta silvestri. Por outro lado, a presença, em algumas espécies com determinação trófica das castas, de rainhas anãs com o número básico (quatro) de ovaríolos nos ovários, ao lado de rainhas normais, determinadas troficamente, com números maiores de ovaríolos em seus ovários demonstra a influência do alimento sobre este caráter, como em Apis mellifera.

    Resumo em Inglês:

    Morphological studies of Meliponine worker ovaries in five species indicated a possible stimulatory effect of the queen on ovary development and on the production of trophic eggs in some of them. There are also indications that the queen inhibits the production of fertile eggs by the workers. This inhibition may involve a delay in the development of fertile eggs by the worker, until she is out of direct contact with the queen, or a lack of ovary development in the queen's presence, as seen in Leurotrigona muelleri. The evolutionary tendency toward inability to produce fertile eggs has its extreme representation in the pupal worker ovary reabsorption found in Frieseomelitta silvestri. On the other hand, the finding, in some species, of dwarf queens with the basic number of ovarioles (four) in the ovaries, along with normal, trophically determined queens with larger numbers of ovarioles in the ovaries demonstrate the influence of food on this character, as in Apis mellifera.
  • Africanized honey bees (Apis mellifera L.) are more efficient at removing worker brood artificially infested with the parasitic mite Varroa jacobsoni Oudemans than are Italian bees or Italian/Africanized hybrids Insect Genetics

    Guerra Jr., José Carlos Vieira; Gonçalves, Lionel Segui; Jong, David De

    Resumo em Português:

    Abelhas africanizadas são mais tolerantes à infestação com o ácaro Varroa jacobsoni do que abelhas de origem européia. A capacidade destas abelhas de detectar e reagir à cria infestada com este ácaro pode ser um dos fatores chaves que determina esta tolerância. Células de cria de operária foram infestadas artificialmente, abrindo o opérculo, inserindo ácaros fêmeas adultas vivas e selando as células. A habilidade das abelhas africanizadas de reconhecer e remover esta cria infestada artificialmente foi comparada com a de abelhas híbridas italianas/africanizadas e com dois grupos de abelhas italianas "puras", em três experimentos distintos. Rainhas italianas já fecundadas foram importadas dos EUA ou foram obtidas da ilha de Fernando de Noronha, Brasil, onde abelhas italianas são mantidas desde 1984. Colmeias africanizadas removeram em media 51% da cria infestada, enquanto colmeias híbridas italianas/africanizadas removeram 25%. Colmeias africanizadas também removeram uma proporção significativamente maior de cria infestada do que colmeias "puras" italianas com rainhas dos EUA (59 vs. 31%, respectivamente). Da mesma maneira, quando colmeias africanizadas foram comparadas com colmeias de abelhas italianas da ilha de Fernando de Noronha, as africanizadas foram significativamente mais eficientes na remoção de cria infestada (61 vs. 35%, respectivamente), apesar de que a população de abelhas italianas desta ilha foi exposta a varroa e elas sobreviveram sem tratamento durante mais de 12 anos. Somente as abelhas africanizadas removeram uma proporção significante da cria infestada com V. jacobsoni, quando os dados foram corrigidos pela taxa de remoção da cria das células controles.

    Resumo em Inglês:

    Africanized honey bees are more tolerant of infestations with the mite Varroa jacobsoni than are honey bees of European origin. The capacity of these bees to detect and react to brood infested with this mite could be one of the factors determining this tolerance. We tested colonies of Africanized bees headed by queens from swarms collected in Ribeirão Preto, São Paulo State. The Italian colonies had queens imported directly from the USA, or from the Brazilian Island of Fernando de Noronha, where varroa-infested Italian colonies have been maintained, untreated, since 1984. Recently sealed worker brood cells were artificially infested by opening the cell capping, inserting live adult female mites and resealing the cells. Control cells were treated in the same way, but without introducing mites. The ability of the Africanized honey bees to recognize and remove this artificially infested brood was compared with that of first generation Italian/Africanized hybrid bees, and with the two groups of "pure" Italian bees, in three separate experiments. Africanized colonies removed a mean of 51% of the infested brood, while Italian/Africanized hybrid colonies removed 25%. Africanized colonies also removed a significantly greater proportion of infested brood than did Italian colonies, headed by queens from the USA (59 vs. 31%, respectively). Similarly, when Africanized colonies were compared with colonies of Italian bees from Fernando de Noronha, the former were found to be significantly more efficient at removing infested brood (61 vs. 35%, respectively), even though the population of Italian bees on this island has been exposed to and survived varroa infestations (without treatment) for more than 12 years. Only the Africanized honey bees removed a significant proportion of varroa-infested brood, when the data was corrected for brood removal from control cells.
  • Changes in the structure and pigmentation of the eyes of honeybee (Apis mellifera L.) queens with the "limão" mutation Insect Genetics

    Chaud-Netto, José; Cruz-Landim, Carminda da

    Resumo em Português:

    Este estudo descreve as diferenças ultra-estruturais entre os olhos compostos de rainhas de abelhas de genótipo ch li/ch li e Ch/ch li. Foram registradas diferenças na organização do omatídeo e na pigmentação geral dos dois tipos de olhos. As abelhas heterozigotas apresentaram organização ultra-estrutural dos omatídeos praticamente normal. Contudo, foram observadas algumas alterações nos cones cristalinos, particularmente a presença de pequenos vacúolos nas células dos cones e perda de pigmento pelas células pigmentares primárias. Nas abelhas homozigotas foram encontrados vários omatídeos com cones cristalinos muito deformados e alguns omatídeos com rabdoma bipartido. A quantidade de pigmento nas células pigmentares primárias e secundárias, bem como nas células receptoras (retinulares) do olho mutante, foi menor. Contudo, os olhos das rainhas heterozigotas e homozigotas apresentaram o mesmo tipo de grânulos de pigmento. Estruturas limitadas por membranas contendo grânulos de pigmento e material eletro-denso, aparentemente de natureza lisossomal, também foram observadas. Como elas foram vistas nas células retinulares dos olhos mutantes, foram interpretadas como corpos multivesiculares responsáveis pela redução do rabdoma, sob a presença de luz. A redução de pigmento nas células pigmentares e retinulares e as alterações morfológicas observadas no rabdoma dos omatídeos podem dar origem a deficiências visuais, que poderiam explicar as modificações comportamentais relatadas para rainhas de Apis mellifera mutantes para a cor dos olhos.

    Resumo em Inglês:

    This study describes the ultrastructural differences between the compound eyes of ch li/ch li and Ch/ch li honeybee queens. Heterozygous "limão" bees had an almost normal ultrastructural organization of the ommatidia, but there were some alterations, including small vacuoles in the crystalline cones and a loss of pigment by primary pigmentary cells. In homozygous bees many ommatidia had very deformed crystalline cones and there were some bipartite rhabdoma. There was a reduction in the amount of pigment in the primary and secondary pigmentary cells and receptor cells (retinulae) of mutant eyes. However, the eyes of both heterozygous and homozygous queens had the same type of pigment granules. Certain membrane-limited structures containing pigment granules and electron-dense material appeared to be of lysosomal nature. Since these structures occurred in the retinular cells of mutant eyes, they were considered to be multivesicular bodies responsible for the reduction in rhabdom volume in the presence of light, as a type of adaptation to brightness. The reduction of pigment in the pigmentary and retinular cells and the morphological changes seen in the rhabdom of the ommatidia may originate visual deficiencies, which could explain the behavioral modifications reported for Apis mellifera queens with mutant eye color.
  • Analysis of the sex ratio in Bradysia matogrossensis (Diptera, Sciaridae) Insect Genetics

    Rocha, Lincoln S.; Perondini, André Luiz P.

    Resumo em Português:

    Nas espécies de sciarídeos, o controle da determinação do sexo dos indivíduos, assim como da proporção sexual das progênies, é feito pelas fêmeas parentais e baseia-se em um mecanismo diferencial de eliminação de cromossomo X nas primeiras fases do desenvolvimento embrionário. Existem espécies cujas fêmeas produzem progênies de um único sexo (fêmeas monogênicas) e outras cujas proles incluem machos e fêmeas (fêmeas digênicas). A proporção sexual nas proles bissexuais é variável, desviando-se significativamente de 1:1. Bradysia matogrossensis apresenta características dos dois modos de reprodução. Em uma população recém-introduzida no laboratório, existem 15% de fêmeas digênicas, 10% de fêmeas produtoras de fêmeas, 13% de fêmeas produtoras de machos e 62% de fêmeas em cujas proles um sexo foi predominante sobre o outro (33% de progênies de fêmeas com raros machos e 29% de proles de machos com raras fêmeas). Foi mostrado que estas condições se mantêm sem alterações significativas por gerações sucessivas. Fêmeas derivadas de progênies com predominância de fêmeas produzem sempre filhas produtoras de fêmeas e produtoras de machos, na proporção de 1:1. Ao contrário, fêmeas derivadas de progênies bissexuais (com predominância de machos) produzem filhas que dão origem a proles apenas de machos ou, então, com predominância de machos. O cromossomo X de B. matogrossensis não apresenta inversão ou outra aberração visível citologicamente. Os resultados sugerem que no controle da eliminação do cromossomo X deve existir mais que um loco ou, então, mais que um simples par de alelos. Sugerem, também, que os dois modos de reprodução dos sciarídeos, monogenia e digenia, devem ter mecanismos de controle similares, uma hipótese nem sempre considerada em estudos anteriores.

    Resumo em Inglês:

    In sciarid flies, the control of sex determination and of the progeny sex ratio is exercised by the parental females, and is based on differential X-chromosome elimination in the initial stages of embryogenesis. In some species, the females produce unisexual progenies (monogenic females) while in others, the progenies consist of males and females (digenic females). The sex ratio of bisexual progenies is variable, and departs considerably from 1:1. Bradysia matogrossensis shows both monogenic and digenic reproduction. In a recently established laboratory strain of this species, 15% of the females were digenic, 10% produced only females, 13% produced only males, and 62% produced progenies with one predominant sex (33% predominantly of female and 29% predominantly male progenies). These progeny sex ratios were maintained in successive generations. Females from female-skewed progenies yielded female- and male-producing daughters in a 1:1 ratio. In contrast, daughters of females from male-skewed progenies produce bisexual or male-skewed progenies. The X-chromosome of B. matogrossensis shows no inversion or other gross aberration. These results suggest that the control of the progeny sex ratio (or differential X-chromosome elimination) involves more than one locus or, at least, more than one pair of alleles. The data also suggest that, in sciarid flies, monogeny and digeny may share a common control mechanism.
  • Effect of stannous chloride combined with caffeine on fecundity of Drosophila prosaltans Insect Genetics

    Itoyama, Mary Massumi; Bicudo, Hermione Elly Melara de Campos

    Resumo em Português:

    A fecundidade de Drosophila prosaltans foi analisada em indivíduos tratados com íon estanoso, cafeína ou íon estanoso, em duas concentrações, combinado com cafeína. Em todos os casos, a fecundidade foi significativamente menor quando comparada com o controle, exceto na menor concentração de íon estanoso. Nas combinações das duas substâncias, a redução não foi significativamente maior que a causada pela cafeína sozinha, podendo indicar que o efeito das duas substâncias juntas corresponde ao próprio efeito da cafeína separada. Mas a redução da fecundidade foi 15% maior no tratamento que utilizou íon estanoso em maior concentração, sugerindo que seu efeito tóxico nesse parâmetro, mesmo em combinação com a cafeína, não deve ser desconsiderado.

    Resumo em Inglês:

    The present study analyzed the number of progeny of stannous chloride- and/or caffeine-treated Drosophila prosaltans. A significant decreasing effect was observed in every case when compared to the control, except for the smallest stannous chloride dose used. Combinations of both substances using two different stannous chloride doses did not differ significantly from each other but number of progeny decreased 15% with the higher concentration combination when compared with caffeine-treated flies. The present results and data in the literature indicate that the effects of continuous ingestion of stannous chloride should be studied.
  • Image analysis of DNA fragmentation and loss in V79 cells under apoptosis Animal Genetics

    Maria, Silvya Stuchi; Vidal, Benedicto de Campos; Mello, Maria Luiza S.

    Resumo em Português:

    Análise de imagem de núcleos de fibroblastos V79 após três dias em cultura foi realizada em preparados submetidos à reação de Feulgen para discriminar células suspeitas de estarem em fases precoces da apoptose daquelas comprovadamente apoptóticas. Parâmetros tais como conteúdo de Feulgen-DNA, grau de condensação cromatínica e área nuclear foram estudados em associação com a morfologia estabelecida em termos visuais. Os fibroblastos foram inicialmente plaqueados numa densidade de 10(5) células/ml e encubados sob condições ótimas de cultura sem subcultura. Com a confluência, as células sofreram apoptose pela inibição por contato. A análise de imagem revelou três fenótipos nucleares definidos quanto a características morfológicas e níveis de condensação cromatínica. Foi detectado decréscimo no conteúdo de Feulgen-DNA das células apoptóticas mas também nas células suspeitas de apoptose. Admite-se que este decréscimo indique perda de DNA. A análise de imagem pode ser, portanto, uma ferramenta útil na discriminação de células mesmo em fases precoces da apoptose.

    Resumo em Inglês:

    Nuclear image analysis of Feulgen-stained V79 fibroblasts after three days in culture was used to discriminate apoptotic cells and cells suspected to be undergoing apoptosis from control cells based on parameters such as the Feulgen-DNA content, degree of chromatin condensation and nuclear areas, in association with visual morphology. The fibroblasts were initially plated at a density of 10(5) cells/ml and incubated under optimal culture conditions without subculturing. Following confluency, the cells underwent contact inhibition apoptosis. Image analysis revealed three nuclear phenotypes which were defined in terms of their morphological characteristics and levels of chromatin condensation. A decrease in the amount of Feulgen-DNA was detected in apoptotic cells and in cells suspected of undergoing apoptosis. This decrease was assumed to indicate DNA loss. Image analysis procedures may therefore provide a useful tool for discriminating cells in the early stages of apoptosis.
  • Estimates of repeatability and heritability of productive and reproductive traits in a herd of Jersey cattle Animal Genetics

    Roman, R.M.; Wilcox, C.J.; Martin, F.G.

    Resumo em Português:

    Estimativas da repetibilidade e da herdabilidade de 19 medidas de desempenho de vacas da raça Jersey foram obtidas usando-se um modelo animal com uma matriz de relação e um algoritmo de máxima verossimilhança. Os dados consistiram em 935 registros de 374 vacas e 69 touros no período de 1969 a 1987. As estimativas foram semelhantes às obtidas pelo método de quadrados mínimos relatadas para o mesmo conjunto de dados e em outros estudos, mas tiveram menores erros de variação. Um teste de verossimilhança mostrou concordância entre estas estimativas de herdabilidade e as da literatura. As estimativas de herdabilidade de produção de leite, gordura, proteína, lactose-mineral, sólidos não-gordura e sólidos totais foram de cerca de 0,25; para as porcentagens correspondentes e para as relações proteína/gordura e sólidos não-gordura/gordura, as estimativas foram de 0,50. As estimativas de herdabilidade foram 0,10 ou menos para o período desde o parto até a primeira cria e para três medidas de contagem de células somáticas. Estas estimativas de herdabilidade em uma população de gado leiteiro num ambiente subtropical não foram diferentes das de populações em clima temperado.

    Resumo em Inglês:

    Estimates of the repeatability and heritability of 19 measures of performance in Jersey cows were obtained using an animal model with a relationship matrix and a derivative-free restricted maximum likelihood algorithm. The data consisted of 935 records for 374 cows by 69 sires over the period 1969-1987. The estimates were similar to those obtained by ordinary least squares methods reported for the same data set and in other studies, but had smaller error variances. A likelihood ratio test showed agreement between these heritability estimates and those in the literature. The heritability estimates of milk, fat, protein, lactose-mineral, solids-not-fat, and total solids yields were about 0.25; for the corresponding percentages, and for the protein to fat and solids-not-fat to fat ratios, the estimates were 0.50. Heritability estimates were 0.10 or less for the time from parturition to first breeding and for three measures of somatic cell counts. These estimates of heritability in a dairy cattle population in a subtropical environment were not different from those of populations in temperate climates.
  • Genetic distances and taxonomic trees between goats of Ceará State (Brazil) and goats of the Mediterranean region (Europe and Africa) Animal Genetics

    Machado, Théa M.M.; Chakir, Mohamed; Lauvergne, Jean Jacques

    Resumo em Português:

    Foram comparadas cabras do tipo Sem Raça Definida ou UDB do Ceará (N = 447), nordeste do Brasil, cabras mediterrâneas européias (N = 3847) e mediterrâneas africanas (N = 325) visando o estabelecimento de distâncias genéticas e de árvores taxonômicas. Foram utilizadas as freqüências alélicas em cada população para a presença ou ausência dos caracteres cornos, orelhas reduzidas, pêlos longos, brincos, barba, pelagem ruão, eumelanina de coloração castanha e padrão pigmentar eumelânico. As distâncias genéticas segundo o método de Nei (1972) são: as menores entre as cabras de diferentes mesorregiões do Ceará (0,0008 a 0,0120); pequenas entre o conjunto das UDB do Ceará e as cabras francesas do Rove e do Alto Roya (0,0236 e 0,0459); grande entre o conjunto das cabras UDB do Ceará e as cabras do norte da Espanha (0,1166); as maiores entre o conjunto das cabras UDB do Ceará e as cabras norte-africanas (marroquinas do Drâa, Rhâali e Zagora), balcânicas (Sakhar da Bulgária e Macedônia da Grécia) e algumas populações insulares (Córsega, Sicília, Sardenha) mediterrâneas (0,1237 a 0,2714). As cabras brasileiras UDB estão mais aparentadas com as populações européias do oeste do continente do que com as populações caprinas norte-africanas, balcânicas ou mediterrâneas insulares.

    Resumo em Inglês:

    Goats of an undefined breed (called UDB) from the State of Ceará, northeastern Brazil (N = 447), European Mediterranean goats (N = 3,847) and African Mediterranean goats (N = 325) were compared to establish genetic distances and taxonomic trees. Allelic frequencies in each population for presence or absence of the following traits were used: horns, reduced ears, long hair, wattles, beard, roan color, brown eumelanin and eumelanic standard pigmentation. The genetic distance, applying the method developed by Nei (1972), was: least between goats from different meso-regions of the State of Ceará (0.0008 to 0.0120); small between all UDB of Ceará and French goats of Rove and Haute Roya (0.0236 and 0.0459); greater between all UDB of Ceará and northern Spanish goats (0.1166), and greatest between all UDB of Ceará and northern African goats (Moroccan of Drâa, Rhâali and Zagora), Balkan goats (Sakhar from Bulgaria and Macedonia from Greece) and some insular Mediterranean populations (Corsica, Sicily and Sardinia), which ranged from 0.1237 to 0.2714. Brazilian UDB goats are more closely related to Continental and Western European populations than to North African, Balkan or Insular Mediterranean populations.
  • Loss of genetic variability at the transferrin locus in five hatchery stocks of tambaqui (Colossoma macropomum) Animal Genetics

    Calcagnotto, Daniela; Toledo-Filho, Silvio de Almeida

    Resumo em Português:

    O conhecimento e a conservação da variabilidade genética mantida nos estoques de peixe são prioridades atuais da piscicultura brasileira. A utilização de marcadores genético-bioquímicos como a transferrina constitui uma eficiente ferramenta para a caracterização de estoques cultivados de peixes. O objetivo do presente trabalho foi analisar a diversidade alélica no loco da transferrina em tambaquis provenientes de cinco estações de piscicultura. Foram analisados 437 tambaquis através de eletroforese em gel de poliacrilamida. No estoque de Pentecoste, que é o mais antigo cultivado no Brasil, foram detectados três alelos enquanto que em outros quatro estoques, derivados de Pentecoste, só foi detectada a presença de um alelo fixado para a transferrina. O número insuficiente de fundadores e a deriva genética parecem ser os principais fatores envolvidos na perda de variabilidade genética nos estoques cultivados de tambaqui no Brasil. Estratégias de manejo apropriadas se fazem necessárias para tentar aumentar o potencial genético dos estoques de tambaqui utilizados na piscicultura nacional.

    Resumo em Inglês:

    Knowledge and conservation of the genetic variability in stocks maintained as live gene banks have become a high priority task for Brazilian fish culture. The aim of the present survey was to assess the transferrin allelic diversity of five hatchery stocks of tambaqui (Colossoma macropomum). The tambaqui stock from Pentecoste, the oldest maintained in Brazilian hatchery stations, retained three of the six alleles detected in wild populations of tambaqui from the Amazon River. Other hatchery stocks, directly or indirectly derived from the Pentecoste stock, did not show transferrin allelic variability. Insufficient number of founders and genetic drift due to sampling errors seem to be the main causes leading to loss of genetic diversity in tambaqui hatchery stocks. Appropriate management strategies are required in order to improve the genetic potential of tambaqui stocks in Brazil.
  • A second case of multivalent meiotic configurations in diploid species of Anura Animal Genetics

    Lourenço, Luciana Bolsoni; Recco-Pimentel, Shirlei M.; Cardoso, Adão José

    Resumo em Português:

    Nós analisamos os cromossomos meióticos de espécimes dos dois grupos cariotípicos de Physalaemus petersi (Jiménez de la Espada, 1872) descritos na literatura. Configurações multivalentes (anéis e cadeias) foram descritas em ambos os grupos. Essa organização meiótica resultou da associação terminal de cromossomos não-homólogos e a análise de preparações meióticas submetidas ao bandamento C não indicou o envolvimento de regiões heterocromáticas nessas associações. Uma possível explicação para tais configurações meióticas consiste na presença de translocações heterozigotas. Nesse caso, os multivalentes observados evidenciariam o envolvimento de eventos de translocação na evolução cariotípica em P. petersi.

    Resumo em Inglês:

    We analyzed the meiotic chromosomes of specimens from the two karyological groups of Physalaemus petersi (Jiménez de la Espada, 1872) described in the literature. Multivalent configurations (rings or chains) were observed in both groups. This meiotic organization resulted from the terminal association of non-homologous chromosomes, and an analysis of C-banded multivalents indicated no involvement of heterochromatic regions in these associations. A possible explanation for such meiotic configurations is the occurrence of heterozygous translocations. Thus, multivalents may indicate the involvement of translocation events in the karyotypic evolution of P. petersi.
  • Mapping 18S ribosomal genes in fish of the genus Brycon (Characidae) by fluorescence in situ hybridization (FISH) Animal Genetics

    Wasko, Adriane Pinto; Galetti Jr., Pedro Manoel

    Resumo em Português:

    O presente estudo fornece dados sobre as regiões organizadoras de nucléolos (NORs) de sete espécies do gênero Brycon, obtidos através da localização dos genes RNAr 18S por hibridação in situ fluorescente (FISH). Sinais fluorescentes foram observados no telômero do braço longo de dois cromossomos submetacêntricos grandes e confirmaram o número e a localização das regiões organizadoras de nucléolos anteriormente detectadas através de outras técnicas citogenéticas clássicas. Embora não tenham sido detectadas variações inter ou intra-individuais no número e localização dos loci 18S, um polimorfismo de tamanho na região organizadora de nucléolo foi observado entre os dois homólogos. O alto nível de estabilidade das NORs observado no gênero Brycon é caracterizado pela presença destes sítios agrupados e conservados em um único par de cromossomos nestes peixes.

    Resumo em Inglês:

    The present study provides data on the nucleolar organizer regions (NORs) of seven Brycon species based on mapping of the 18S rRNA genes by fluorescence in situ hybridization (FISH). Fluorescent signals were observed on the telomere of the long arm of two large submetacentric chromosomes, thus confirming the number and location of NORs previously revealed by other classical cytogenetic techniques. Although there were no inter- or intra-individual variations in the number and location of the 18S loci, NOR size polymorphism was observed between homologous chromosomes. The clustering and conservation of NORs in a single chromosome pair indicates a high level of NOR stability among species of the genus Brycon.
  • Lactate dehydrogenase of Mugil sp. (Mugilidae, Perciformes). Lack of electrokinetic, thermostability and kinetic differences among individuals with different number of scales Animal Genetics

    Santos, Marcelo dos; Schwantes, Maria Luiza B.; Schwantes, Arno Rudi

    Resumo em Português:

    O número de escamas em séries laterais (SNS) de exemplares de Mugil sp. (Mugilidae, Perciformes) coletados na região estuarino-lagunar de Cananéia, Estado de São Paulo, varia de 33 a 39. A fim de tentar determinar se exemplares com diferentes SNS corresponderiam a diferentes espécies ou populações de tainhas, foram analisadas as propriedades eletrocinéticas, cinéticas e de termoestabilidade da sua lactato desidrogenase (LDH). A exemplo de muitos teleósteos, a LDH de Mugil sp. mostrou-se codificada por 3 locos gênicos: LDH-A*, LDH-B* e LDH-C*. Método de diluições seriadas aplicado a 10 diferentes tecidos dessa espécie sugeriu um padrão bidirecionalmente divergente de expressão desses locos da LDH. Não foi observada nenhuma associação entre padrão eletroforético, inativação térmica, respostas cinéticas e diferentes SNS. Os valores de Km (pyr) aparente aqui obtidos mostraram-se similares aos obtidos por outros autores para músculo e coração, bem como aos de suas isoformas purificadas. O efeito do NaCl nos valores de Km e Vmax de Mugil sp. (SNS de 35 e 39) indica que esse sal se comporta como um inibidor competitivo, já que decresce a afinidade enzima-substrato. Assim, os comportamentos eletrocinéticos e de termoestabilidade, valores de Km e Vmax e os efeitos do NaCl sobre esses não nos permitem caracterizar as tainhas capturadas na região estuarino-lagunar de Cananéia, com amplitudes de SNS de 33 a 39, como diferentes espécies ou populações.

    Resumo em Inglês:

    The scale number in lateral sets (SNS) of Mugil sp. (Mugilidae, Perciformes) collected in the lagoon-estuarine region of Cananéia, State of São Paulo ranges from 33 to 39. Electrokinetic, kinetic and thermostability properties of lactate dehydrogenase (LDH) were tested to determine if individuals with different SNS correspond to different species or populations of mullet. As in many other teleosts, LDH-A*, LDH-B*, and LDH-C* loci were detected. Through a two-fold serial dilution method applied to 10 different tissues of Mugil sp., a bidirectionally divergent expression of these loci was suggested. No association among LDH electrophoretic pattern, thermal inactivation, kinetic responses and different SNS was observed. The apparent Km (pyr) values obtained here were similar to Km values obtained by other authors for muscle and heart LDH or their purified isoforms. The effect of NaCl on Km and Vmax values of Mugil sp. (35 and 39 SNS individuals) indicates that this salt behaves as a competitive inhibitor, since it decreases enzyme-substrate affinity. Thus, electrokinetic and thermostability behavior, Km and Vmax values and the effect of NaCl do not permit us to consider these mullets, with SNS ranging from 33 to 39, as belonging to different populations or species.
  • In situ detection of transcripts of the myogenic factor MyoD in whole chicken embryos Animal Genetics

    Gabriel, Jane E.; Alves, Helena J.; Alvares, Lucia E.; Schmidt, Gilberto S.; Coutinho, Luiz L.

    Resumo em Português:

    A detecção in situ de diferentes fatores regulatórios músculo-específicos vem sendo uma prática muito empregada para o entendimento das bases moleculares envolvidas no processo de formação do tecido muscular esquelético durante o desenvolvimento embrionário em diferentes organismos. O objetivo deste estudo foi investigar o padrão de expressão dos transcritos do fator miogênico MyoD em embriões inteiros de galinha por análises de hibridização in situ, usando uma sonda obtida a partir de ensaios de transcrição reversa e reação em cadeia da polimerase (RT-PCR). Nos somitos recém-formados (embriões no estádio 12), os transcritos de MyoD foram detectados na porção mediana dos somitos posicionados imediatamente adjacentes ao tubo neural, enquanto nos somitos maduros (embriões no estádio 24), a expressão do gene do MyoD foi observada em toda a região dos somitos. Tais resultados indicam que a expressão do MyoD é importante no processo de determinação e manutenção da miogênese nas aves.

    Resumo em Inglês:

    In situ hybridization has provided insights into the molecular basis of skeletal myogenesis during embryonic development. In situ detection of different muscle-specific regulatory factors in whole embryos has been described. Spatial and temporal expression patterns of these factors differed among species. The expression pattern of MyoD in whole chicken embryos was studied via in situ hybridization using a probe obtained by the reverse transcription - polymerase chain reaction (RT-PCR) technique. In newly formed somites (embryos of stage 12), MyoD mRNA transcripts were detected along the anterior to posterior axis of somites immediately adjacent to the neural tube, whereas in mature somites (embryos of stage 24), MyoD transcripts were detected throughout the entire somite. These results indicate that MyoD expression is important for initiating and maintaining the avian myogenic system.
  • Identification of proliferating cells in chicken embryos using 5-bromo- 2'-deoxyuridine immunohistochemical detection Animal Genetics

    Lopes, Mário Lúcio; Schmidt, Gilberto Silber; Coutinho, Luiz Lehmann

    Resumo em Português:

    Embriões de frango foram incubados na presença de BrdU e montados em resina plástica. A detecção de células em proliferação nos somitos e tubo neural foi feita através de anticorpos contra BrdU. Um ponto essencial para a otimização do método foi a fixação dos embriões por apenas uma hora em paraformaldeído a 4%. Análise de cortes transversais revelou que no tubo neural os núcleos marcados se posicionavam na região central. Cortes transversais em somitos diferenciados revelaram a presença de células em proliferação no dermátomo e esclerótomo, no entanto não foi observado nenhum sinal no miótomo. A metodologia aqui apresentada permitiu identificar com clareza e boa resolução as células em proliferação presentes em tecidos embrionários.

    Resumo em Inglês:

    Chicken embryos were incubated with BrdU, embedded in plastic resin, sectioned and screened immunohistochemically to identify proliferating cells in the neural tube and somites. Fixation in 4% paraformaldehyde for 1 h was essential for detecting specific colorimetric signals of BrdU incorporation into cells during the S phase of the cell cycle. Transverse sections of the neural tube showed that the nuclei of proliferating cells (BrdU positive) had a uniform and centralized distribution, whereas unstained nuclei were found only along the extremities of the neural tube. Transverse sections of differentiated somites showed proliferating cells in the scleratome and dermatome. However, no incorporation of BrdU was observed in myotomic cells, which give rise to axial skeletal muscle. In spite of their proximity, the dermatome and myotome showed marked differences in cell proliferation. The excellent preservation of morphological characteristics in the embryonic tissues facilitated identification of variations in BrdU incorporation.
  • Effects of Phaseolus vulgaris QTL in controlling host-bacteria interactions under two levels of nitrogen fertilization Plant Genetics

    Souza, Alessandra A.; Boscariol, Raquel L.; Moon, David H.; Camargo, Luis E.A.; Tsai, Siu M.

    Resumo em Português:

    Marcadores moleculares foram utilizados para estudar os efeitos do nitrogênio mineral na expressão fenotípica de QTLs associados ao número de nódulos (NN) e à resistência a Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em feijoeiro. Linhagens recombinantes obtidas do cruzamento BAT-93 x Jalo EEP558 foram avaliadas em casa-de-vegetação, sob dois níveis de adubação nitrogenada (0 e 5 mM de NH4NO3). A resistência ao patógeno foi avaliada pela medição da área foliar lesionada (DLA) e o NN por meio de contagem direta. Análises de variância foram empregadas para detectar associações significativas entre características quantitativas e genótipos das linhagens em 85 loci marcadores distribuídos em 12 grupos de ligação (LG). Sob a condição de ausência de N mineral, foram encontradas associações significativas entre 15 marcadores distribuídos em 7 LG para NN e 11 marcadores em 5 LG para DLA, explicando 34 e 42% da variação fenotípica destas características, respectivamente. Na presença de N, foram detectadas somente cinco associações significativas para NN e oito para DLA, explicando 28 e 26% da variação fenotípica de cada respectiva característica. Alguns QTLs foram detectados somente na ausência de N, evidenciando o efeito deste elemento na expressão destes QTLs. Entretanto, em alguns QTLs associados a NN, a contribuição dos alelos parentais foi dependente da concentração de N utilizada. Quatro QTLs foram encontrados associados tanto a número de nódulos como resistência a Xanthomonas, sugerindo um controle genético comum do feijoeiro à infecções bacterianas. Por outro lado, a expressão fenotípica de alguns QTLs não foi significativamente afetada pelo nível de nitrogênio utilizado. A estabilidade destes QTLs é interessante do ponto de vista de um programa de melhoramento voltado para o desenvolvimento de cultivares adaptadas a condições variáveis de fertilidade de solo.

    Resumo em Inglês:

    Molecular markers were used to estimate the effect of mineral nitrogen on the phenotypic expression of quantitative trait loci (QTL) controlling the number of Rhizobium nodules (NN) and resistance to Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli in the common bean. Recombinant inbred lines derived from a BAT-93 x Jalo EEP558 cross were grown in a greenhouse in the absence or presence (5 mM NH4NO3) of nitrogen. Resistance to Xanthomonas was assessed as diseased leaf area (DLA) and the number of nodules was obtained by direct counting. Analyses of variance were used to detect significant associations between 85 marker loci from 12 linkage groups (LG) and quantitative traits. In the absence of nitrogen, 15 and 11 markers, distributed over 7 and 5 LG, showed a significant association with NN and DLA, respectively. The combined percentage of phenotypic variance explained by the marker-loci and QTL associations was 34% for NN and 42% for DLA. In the presence of nitrogen, there were only five significant associations for NN and eight for DLA, which explained 28 and 26% of the total phenotypic variance, respectively. The effects of some QTL were detected only at a certain level of nitrogen. The contribution of parental alleles at two NN QTL was dependent on the level of nitrogen. Four QTL were associated with both the number of Rhizobium nodules and resistance to Xanthomonas, suggesting a common genetic control of responses to bacterial infections in the common bean. Despite the dramatic environmental interactions noted with some QTL, in other cases the phenotypic effects were not affected by the amount of nitrogen. The stability of the latter QTL may be relevant when breeding cultivars adapted to variable soil fertility.
  • Isoenzymatic polymorphism in Citrus spp. and Poncirus trifoliata (L.) Raf. (Rutaceae) Plant Genetics

    Novelli, Valdenice Moreira; Machado, Marcos Antonio; Lopes, Catalina Romero

    Resumo em Português:

    A análise do polimorfismo isoenzimático foi usada para determinar a variabilidade genética entre espécies e híbridos de Citrus spp. e um acesso da espécie Poncirus trifoliata (L.) Raf. Dez diferentes sistemas enzimáticos foram analisados, incluindo aspartato aminotransferase (AAT), fosfatase ácida (ACP), leucina aminopeptidase (LAP), 6-fosfogluconato desidrogenase (6-PGD), isocitrato desidrogenase (IDH), fosfoglucose isomerase (PGI), fosfoglucomutase (PGM), diaforase (DIA), shiquimato desidrogenase (SKD) e peroxidase (PRX). Um total de 20 locos e 48 alelos foram identificados. Os cultivares de laranja doce (C. sinensis (L.) Osbeck) apresentaram um grande número de locos heterozigotos, mas similares entre eles, com exceção dos cultivares Westin e Lima graúda. Os cultivares de mandarim (C. reticulata Blanco) apresentaram diferentes padrões entre eles, enquanto que Poncirus trifoliata (L.) Raf. apresentou elevada diferenciação em relação a todas as espécies de Citrus e híbridos. Fenótipos exclusivos foram observados em alguns sistemas enzimáticos, sendo encontrados padrões similares entre os híbridos interespecíficos e seus possíveis parentais.

    Resumo em Inglês:

    Isoenzymatic polymorphism analysis was used to determine genetic variability among species and hybrids of Citrus spp. and one accession of Poncirus trifoliata (L.) Raf. Ten enzymatic systems aspartate aminotransferase (AAT), acid phosphatase (ACP), leucine aminopeptidase (LAP), 6-phosphogluconate dehydrogenase (6-PGD), isocitrate dehydrogenase (IDH), phosphoglucoisomerase (PGI), phosphoglucomutase (PGM), diaphorase (DIA), shikimate dehydrogenase (SKD) and peroxidase (PRX) were analyzed. Twenty loci and 48 alleles were identified. Sweet orange cultivars (C. sinensis (L). Osbeck) showed the highest polymorphism with the largest number of heterozygous loci, although the alleles of those loci were the same in all cultivars, with the exception of Westin and Lima graúda. Mandarins (C. reticulata Blanco) exhibited diverse patterns, whereas Poncirus trifoliata (L.) Raf. showed high variability with all Citrus species and hybrids. Exclusive phenotypes were observed in some enzymatic systems, and similar patterns were found among interspecific hybrids and their putative parents.
  • The use of random amplified polymorphic DNA to evaluate the genetic variability of Ponkan mandarin (Citrus reticulata Blanco) accessions Plant Genetics

    Coletta Filho, Helvécio Della; Machado, Marcos Antonio; Targon, M. Luiza P.N.; Pompeu Jr., Jorgino

    Resumo em Português:

    Amplificações RAPD foram desenvolvidas utilizando-se 25 "primers" de seqüência aleatória e 19 acessos de tangerinas pertencentes ao grupo das Ponkan. Dos 112 produtos de amplificação selecionados somente 32 foram polimórficos, sendo este polimorfismo restrito somente a 5 acessos. Nos 14 acessos restantes não pôde ser detectada qualquer variabilidade genética, sugerindo que estes podem ser propagação clonal da tangerina `Ponkan', tendo os mesmos adquirido diferentes nomes regionais ao longo do tempo. Ou, por outro lado, a técnica RAPD utilizada pode não ter detectado qualquer mutação de ponto que tenha ocorrido nestes materiais ao longo do tempo.

    Resumo em Inglês:

    RAPD analysis of 19 Ponkan mandarin accessions was performed using 25 random primers. Of 112 amplification products selected, only 32 were polymorphic across five accessions. The absence of genetic variability among the other 14 accessions suggested that they were either clonal propagations with different local names, or that they had undetectable genetic variability, such as point mutations which cannot be detected by RAPD.
  • Chromosome numbers in Bromeliaceae Plant Genetics

    Cotias-de-Oliveira, Ana Lúcia Pires; Assis, José Geraldo Aquino de; Bellintani, Moema Cortizo; Andrade, Jorge Clarêncio Souza; Guedes, Maria Lenise Silva

    Resumo em Português:

    Este trabalho apresenta o número de cromossomos de 17 espécies de Bromeliaceae, pertencentes aos gêneros Encholirium, Bromelia, Orthophytum, Hohenbergia, Billbergia, Neoglaziovia, Aechmea, Cryptanthus e Ananas. A maioria tem cariótipo 2n = 50, mas Bromelia laciniosa, Orthophytum burle-marxii e O. maracasense são poliplóides com 2n = 150, 100 e 150, respectivamente, enquanto Cryptanthus bahianus tem 2n = 34 + 1-4B. Cromossomos B foram observados também em Bromelia plumieri e Hohenbergia aff. utriculosa. O número de cromossomos de todas as espécies foi determinado pela primeira vez, exceto para Billbergia chlorosticta e Cryptanthus bahianus. Os dados obtidos reforçam a hipótese de um número básico x = 25 para a família Bromeliaceae e aneuploidia decrescente no gênero Cryptanthus.

    Resumo em Inglês:

    The present study reports chromosome numbers of 17 species of Bromeliaceae, belonging to the genera Encholirium, Bromelia, Orthophytum, Hohenbergia, Billbergia, Neoglaziovia, Aechmea, Cryptanthus and Ananas. Most species present 2n = 50, however, Bromelia laciniosa, Orthophytum burle-marxii and O. maracasense are polyploids with 2n = 150, 2n = 100 and 2n = 150, respectively, while for Cryptanthus bahianus, 2n = 34 + 1-4B. B chromosomes were observed in Bromelia plumieri and Hohenbergia aff. utriculosa. The chromosome number of all species was determined for the first time, except for Billbergia chlorosticta and Cryptanthus bahianus. Our data supports the hypothesis of a basic number of x = 25 for the Bromeliaceae family and decreasing aneuploidy in the genus Cryptanthus.
  • Genotype-environment interaction and the number of test sites for the genetic improvement of rubber trees (Hevea) in São Paulo State, Brazil Plant Genetics

    Costa, Reginaldo Brito da; Resende, Marcos Deon Vilela de; Araujo, Antonio José de; Gonçalves, Paulo de Souza; Martins, Antonio Lúcio Mello

    Resumo em Português:

    O presente estudo objetivou quantificar possíveis interações de progênie x local, bem como determinar o número ideal de locais de experimentação com base em estimativas de correlação genética entre progênies nos diferentes locais e estimativa de ganhos genéticos com seleção indireta em seringueira [Hevea brasiliensis (Willd ex Adr. de Juss.) Müell. Arg.]. Vinte e duas progênies de meio-irmãos foram plantadas nas Estações Experimentais de Jaú, Pindorama e Votuporanga, todas em SP, no delineamento de blocos ao acaso, com cinco repetições e dez plantas por parcela. Aos três anos de idade foram avaliados os caracteres: número total de anéis de vasos laticíferos, produção de borracha seca, espessura da casca e perímetro do caule. Os resultados demonstraram haver variabilidade genética significativa entre progênies para os caracteres produção, perímetro do caule e espessura da casca, evidenciados em Pindorama e Votuporanga. O efeito da interação genótipo x locais significativos, especialmente para os caracteres produção de borracha e perímetro do caule, não é um fator complicador para o melhorista devido às altas correlações genéticas detectadas. Considerando ser vantajoso o uso de um local a mais apenas quando o ganho em eficiência for superior a 10%, no presente caso a utilização de dois locais de experimentação é a mais adequada. O uso dos locais Pindorama e Votuporanga atenderá satisfatoriamente a região de abrangência do estudo.

    Resumo em Inglês:

    The present study quantifies the possible genotype-environment interactions and determines the ideal number of test sites for rubber trees [Hevea brasiliensis (Willd ex Adr. de Juss.) Muell Arg] in the plateau region of São Paulo State. The study was based on the genetic correlation among progenies at three different sites and on estimates of genetic gains with indirect selection of rubber trees. Twenty-two half-sib progenies were planted at the Jaú, Pindorama and Votuporanga experimental stations using random blocks with five replications and 10 plants per plot. At three years of age, the plants were evaluated for their total number of latex ring vessels (NR), rubber production (RP), bark thickness (BT) and girth (SG). There was significant genetic variability in the characters RP, SG and BT, mainly among progenies from Pindorama and Votuporanga. The effects of genotype-site interactions were significant for RP and SG. The finding of significant interactions was not a complicating factor because of the large genetic correlation detected. These results indicate that the use of two sites is more profitable when the gains in efficiency of selection are greater than 10%. Thus, Pindorama and Votuporanga will satisfactorily attend the studied region.
  • Diversity within American cassava germ plasm based on RAPD markers Plant Genetics

    Colombo, Carlos; Second, Gérard; Charrier, André

    Resumo em Português:

    Este trabalho enfoca a diversidade genética de mandiocas americanas através de marcadores moleculares do tipo RAPD. Os 126 genótipos estudados estão distribuídos em quatro escalas geográficas, indo do local ao continental, ou seja, etnocultivares de uma comunidade chamada Santa Isabel, na Amazônia brasileira, cultivares locais coletados no Estado de São Paulo, um grupo representado por acessos oriundos das mais diversas regiões brasileiras e acessos representantes da "core collection" do CIAT. Oitenta e oito bandas RAPD polimórficas foram retidas para as análises. A estrutura genética das mandiocas deste estudo revelou-se fraca. O plano formado pelos dois primeiros eixos da análise de coordenadas principais (PCoA) revelou sobreposição dos genótipos do Estado de São Paulo, do grupo Brasil e dos acessos da "core collection". Por outro lado, os etnocultivares de Santa Isabel mostraram-se estruturados num grupo a parte com relação aos demais genótipos. Além disso, os etnocultivares de Santa Isabel apresentaram importante diversidade genética em relação aos genótipo dos outros três grupos. A fraca estrutura genética das mandiocas cassava pode ser explicada pelas trocas de material botânico entre pequenos produtores, prática normalmente empregada, assim como recombinação entre genótipos, visto que a mistura de diferentes cultivares em uma mesma parcela de cultura é também uma prática usada por pequenos produtores. Entretanto, quando os genótipos foram analisados em função de dados climáticos das localidades de origem dos mesmos, pudemos evidenciar uma estruturação em função da temperatura e da precipitação destes locais. Os marcadores RAPD mostraram-se informativos para o estudo da diversidade genética de mandiocas, oferecendo indicações importantes para a coleta de germoplasma de mandioca, assim como para o seu melhoramento genético. Com relação à importante diversidade genética encontrada na comunidade de Santa Isabel, outros estudos, através de outros marcadores e com genótipos de outras localidades, precisariam ser realizados para se tirarem conclusões mais diretas a respeito desta variabilidade.

    Resumo em Inglês:

    This work focuses on the genetic diversity of American cassava through RAPD molecular markers. The 126 genotypes studied were distributed on four geographical levels ranging from local to continental. Samples included ethnocultivars from the Santa Isabel community in the Brazilian Amazon, local cultivars collected in the State of São Paulo, native accessions from very diverse Brazilian regions, and representative accessions from the Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT) core collection. Eighty-eight polymorphic bands were analyzed. Results revealed the weak genetic structure of the cassava analyzed. The pattern formed by the first two axes of the principal coordinates analysis (PCoA) revealed an overlapping of the São Paulo State genotype, the Brazilian group and the core collection accessions. The Santa Isabel ethnocultures formed a separate group. The weak genetic structure of cassava can be explained by the common practice of exchanging botanical material among small producers as well as by recombinations among genotypes. When the genotypes were analyzed using climatic data, the sample sites were found to be structured according to temperature and precipitation. RAPD markers proved very useful in the genetic diversity study, resulting in important implications for cassava germ plasm collections and genetic breeding.
  • Wild cassava, Manihot spp.: Biology and potentialities for genetic improvement Plant Genetics

    Nassar, Nagib M.A.

    Resumo em Português:

    Espécies selvagens de Manihot dão origem à mandioca. Elas constituem valioso reservatório genético, com genes mostrando novos caracteres. O exame cuidadoso dessas espécies mostrou que algumas delas têm uma percentagem notavelmente alta de proteína combinada com uma porcentagem baixa de ácido cianídrico. O estudo dos habitats naturais revelou resistência à seca e à toxicidade por alumínio em excesso no solo, assim como adaptação a baixas temperaturas. Alguns dos híbridos obtidos mostraram alta produtividade da raiz e resistência a brocas do caule. A apomixia foi descoberta nas espécies selvagens e transferida com sucesso para as espécies cultivadas.

    Resumo em Inglês:

    Wild species of Manihot are progenitors of cassava. They constitute valuable genetic reservoirs presenting genes that show new characters. Screening of these species showed some of them to have a notably high percentage of protein combined with a low percentage of hydrocyanic acid. Study of natural habitats revealed resistance to drought and excessive soil aluminum toxicity as well as adaptation to low temperature. Some of the hybrids obtained showed high root productivity and resistance to stem borers. Apomixis was discovered in the wild and transferred successfully to the cultivate species.
  • Caffeine content of Ethiopian Coffea arabica beans Plant Genetics

    Silvarolla, Maria Bernadete; Mazzafera, Paulo; Lima, Marinez Muraro Alves de

    Resumo em Português:

    O banco de germoplasma de café do Instituto Agronômico de Campinas contém grande número de introduções de Coffea arabica provenientes da Etiópia, considerada centro de diversidade genética desta espécie. A avaliação dos teores de cafeína nas sementes de 99 progênies revelou a presença de variabilidade entre e dentro das progênies, de acordo com a região de origem das introduções. Entre as 68 progênies da região de Kaffa encontraram-se valores de cafeína entre 0.46 e 2.82% (média 1.18%) e entre as 22 progênies de Illubabor obtiveram-se plantas cujos teores de cafeína variaram de 0.42 a 2.90% (média 1.10%). A variabilidade aqui relatada poderá ser explorada na produção de uma variedade de café com baixos teores de cafeína nas sementes.

    Resumo em Inglês:

    The coffee germplasm bank of the Instituto Agronômico de Campinas has many Coffea arabica accessions from Ethiopia, which is considered the primary center of genetic diversity in coffee plants. An evaluation of the caffeine content of beans from 99 progenies revealed intra- and inter-progeny variability. In 68 progenies from the Kaffa region we found caffeine values in the range 0.46-2.82% (mean 1.18%), and in 22 progenies from Illubabor region these values ranged from 0.42 to 2.90% (mean 1.10%). This variability could be exploited in a breeding program aimed at producing beans with low-caffeine content.
  • Interactions in the Agrobacterium-soybean system and capability of some Brazilian soybean cultivars to produce somatic embryos Plant Genetics

    Mauro, Antonio Orlando Di; Nóbrega, José Carlos Martins de; Mauro, Sonia Marli Z. Di; Collins, Glenn Burton

    Resumo em Português:

    Vinte e cinco cultivares brasileiros de soja foram estudados quanto à suscetibilidade a quatro linhagens de Agrobacterium tumefaciens (C58, Ach5, Bo542 e A281) e quanto à capacidade de produzir embriões somáticos. Doze plantas de cada cultivar foram inoculadas, na casa de vegetação, 4-6 semanas após a semeadura, sendo efetuadas 12 inoculações por planta. O número de galhas derivadas dessas inoculações foi contado 8-10 semanas após as inoculações. Para avaliar a capacidade de produção de embriões somáticos, cotilédones imaturos com 4-6 mm de comprimento foram cultivados em meio N10 para indução de calos embriogênicos, sendo empregadas, para cada cultivar, quatro placas de Petri contendo 20 cotilédones cada. Os tecidos embriogênicos foram transferidos 6 vezes, a cada 15 dias de intervalo, para novo meio N10, sendo contado o número de embriões somáticos por cultivar. Foi observada uma interação significativa entre cultivares de soja e linhagens de A. tumefaciens e a linhagem mais virulenta foi a A281. O tipo de opina aparentemente não teve efeito sobre a virulência das linhagens e os cultivares mais embriogênicos foram IAS-5, Cristalina, FT-Cometa, IAC-7 e OC-3.

    Resumo em Inglês:

    Twenty-five Brazilian soybean cultivars were studied for susceptibility to four strains of Agrobacterium tumefaciens (C58, Ach5, Bo542 and A281) and for their ability to produce somatic embryos. Twelve plants of each cultivar were inoculated in a greenhouse at 4-6 weeks of age, using 12 inoculation sites per plant. The number of galls formed on plants were counted 8-10 weeks after inoculation. To study ability to produce somatic embryos, immature cotyledons, 4-6 mm in length, were plated onto N10 medium for induction of somatic embryogenesis, using four Petri dishes with 20 cotyledons for each cultivar. The embryogenic tissues were transferred onto new N10 medium six times at 15-day intervals and the number of somatic embryos per cultivar determined. Significant interaction between soybean cultivars and A. tumefaciens strains was observed; the most virulent strain was A281. The opine type apparently had no effect on strain virulence, and the most embryogenic cultivars were IAS-5, Cristalina, FT-Cometa, IAC-7 and OC-3.
  • Genetic analisys of a cross of gaillon (Brassica oleracea var. alboglabra) with cauliflower (B.oleracea var. botrytis) Plant Genetics

    Spini, Vanessa B.M.G.; Kerr, Warwick Estevam

    Resumo em Português:

    A couve-flor (Brassica oleracea var. botrytis) é um vegetal anual e tem seu cultivo no Brasil limitado às regiões Sul e Sudeste, com pequena produção no Nordeste e Centro-Oeste. Uma variedade de couve da China, "kaai laan" ou "gaillon" (Brassica oleracea var. alboglabra), produz sementes em altas temperaturas e, portanto, é apta a produzir sementes no Norte e Nordeste do Brasil. Gaillon e couve-flor foram cruzados. Foram feitos 55 cruzamentos usando 10 plantas de gaillon como mãe e 4 plantas de couve-flor como doadores de pólen. Desses cruzamentos, na geração F2, 612 plantas com inflorescência tipo gaillon e 48 plantas com inflorescência tipo couve-flor foram obtidas, em proporção similar a 15:1, demonstrando que 2 pares de genes estão envolvidos na formação da inflorescência em couve-flor. Com o objetivo de estudar a cor das flores, 339 plantas foram analisadas: 274 apresentaram flores brancas e 65 flores amarelas, demonstrando que este caráter é determinado por 1 par de genes, sendo branco dominante sobre amarelo; as flores brancas têm um valor adaptativo levemente maior em nossa população. O caráter cerosidade da folha mostrou uma proporção de 3 plantas cerosas para 1 planta não cerosa, que mostra a ação de 1 par de genes.

    Resumo em Inglês:

    The cauliflower (Brassica oleracea var. botrytis) is an annual vegetable cultivated in Southern and Southwestern Brazil with limited production in the Northeast and Centralwest. A variety of Chinese kale, "kaai laan" or "gaillon" (Brassica oleracea var. alboglabra), produces seeds at high temperatures and therefore can do so in North and Northeastern Brazil. Gaillon and cauliflower were crossed 55 times using 10 gaillon plants as mothers and 4 cauliflower plants as pollen donors. From these crosses, in the F2 generation, 612 plants with inflorescence like gaillon and 48 plants with inflorescence like cauliflower were obtained, in a proportion similar to 15:1, implying that 2 pairs of genes entered into formation of the cauliflower inflorescence type. In order to study flower color, 339 plants were analyzed: 274 presented white flowers and 65, yellow flowers, denoting that this caracter is determined by 1 pair of genes, white being dominant over yellow; white flowers had a slighly higher adaptive value in our population. The characteristic waxy leaf showed a proportion of 3 waxy plants for 1 not waxy, indicating the action of one pair of genes.
  • Proportional odds model applied to mapping of disease resistance genes in plants Plant Genetics

    Spyrides-Cunha, Maria Helena; Demétrio, Clarice G.B.; Camargo, Luis E.A.

    Resumo em Português:

    Marcadores moleculares têm sido extensivamente usados para o mapeamento de loci de características quantitativas (QTL) que controlam a resistência às doenças em plantas. O mapeamento é usualmente feito estabelecendo uma associação estatística entre os genótipos dos marcadores moleculares e as variações quantitativas na resistência à doença. No entanto, a maioria dos métodos estatísticos requer uma distribuição contínua da variável resposta, um pressuposto nem sempre encontrado, já que a avaliação da resistência às doenças é freqüentemente feita visualmente através da atribuição de escores numa escala ordinal ao grau de severidade da doença. Este artigo apresenta a aplicação do modelo de chances proporcionais no mapeamento de genes de resistência à doença em plantas, adequado aos casos de dados ordinais. O modelo foi utilizado para mapear dois QTL de resistência a Puccinia sorghi em milho. Os marcadores moleculares bngl166 e bngl669, localizados nos cromossomos 2 e 8, respectivamente, foram usados para a genotipagem de indivíduos F2 de uma população segregante. Os genótipos em cada locus foram, então, comparados com relação ao grau de severidade da doença, avaliada em plantas F3 geradas através da auto-polinização das plantas F2, usando uma escala ordinal do grau de severidade. A "deviance" residual indicou uma boa qualidade de ajuste do modelo aos dados, assim como o teste escore confirmou a suposição de proporcionalidade constante das chances a cada ponto de corte. A análise individual dos marcadores detectou diferenças significativas entre os genótipos para ambos os loci, indicando que estes marcadores estão associados aos QTL de resistência à doença. Além disso, a inclusão do termo de interação indicou uma forte evidência de epistase entre os dois QTL. Os resultados indicaram que o modelo de chances proporcionais pode ser usado como uma alternativa aos métodos tradicionais, em casos onde a variável resposta segue uma escala ordinal, eliminando, assim, os problemas de falta de homogeneidade das variâncias, de linearidade e de normalidade dos resíduos, comuns neste tipo de dados.

    Resumo em Inglês:

    Molecular markers have been used extensively to map quantitative trait loci (QTL) controlling disease resistance in plants. Mapping is usually done by establishing a statistical association between molecular marker genotypes and quantitative variations in disease resistance. However, most statistical approaches require a continuous distribution of the response variable, a requirement not always met since evaluation of disease resistance is often done using visual ratings based on an ordinal scale of disease severity. This paper discusses the application of the proportional odds model to the mapping of disease resistance genes in plants amenable to expression as ordinal data. The model was used to map two resistance QTL of maize to Puccinia sorghi. The microsatellite markers bngl166 and bngl669, located on chromosomes 2 and 8, respectively, were used to genotype F2 individuals from a segregating population. Genotypes at each marker locus were then compared by assessing disease severity in F3 plants derived from the selfing of each genotyped F2 plant based on an ordinal scale severity. The residual deviance and the chi-square score statistic indicated a good fit of the model to the data and the odds had a constant proportionality at each threshold. Single-marker analyses detected significant differences among marker genotypes at both marker loci, indicating that these markers were linked to disease resistance QTL. The inclusion of the interaction term after single-marker analysis provided strong evidence of an epistatic interaction between the two QTL. These results indicate that the proportional odds model can be used as an alternative to traditional methods in cases where the response variable consists of an ordinal scale, thus eliminating the problems of heterocedasticity, non-linearity, and the non-normality of residuals often associated with this type of data.
  • Analysis of variance of partial diallel tables Plant Genetics

    Viana, José Marcelo Soriano; Cruz, Cosme Damião; Cardoso, Antonio Américo; Regazzi, Adair José

    Resumo em Português:

    Com base no trabalho de Hayman de 1954, este artigo discute a análise de variância de tabelas de dialelos parciais. Em razão de muitos dos testes proporcionarem as mesmas inferências, os principais objetivos da análise apresentada são a avaliação da variabilidade genética nos dois grupos de pais e o estudo das heteroses específica, varietal e média. Testar a nulidade das heteroses específicas é testar a hipótese de ausência de dominância. O teste de igualdade das heteroses varietais em relação aos pais de um grupo é o teste de igualdade das freqüências alélicas no outro grupo. A rejeição da hipótese de nulidade da heterose média indica que há dominância. As informações geradas complementam as resultantes da análise dialélica, envolvendo os genitores e seus híbridos F1 ou suas gerações F2. Um exemplo com feijoeiro comum é incluído.

    Resumo em Inglês:

    The theory of variance analysis of partial diallel tables, following Hayman's proposal of 1954, is presented. As several statistical tests yield similar inferences, the present analysis mainly proposes to assess genetic variability in two groups of parents and to study specific, varietal and mean heteroses. Testing the nullity of specific heteroses equals testing absence of dominance. Testing equality of varietal heteroses of the parents of a group is equivalent to testing the hypothesis that in the other group allelic genes have the same frequency. Rejection of the hypothesis that the mean heterosis is null indicates dominance. The information obtained complements that provided by diallel analysis involving parents and their F1 hybrids or F2 generations. An example with the common bean is included.
  • Variability in micronucleus induction with different mutagens applied to several species of fish Mutation And Mutagenesis

    Grisolia, Cesar Koppe; Cordeiro, Célia Maria Torres

    Resumo em Português:

    Este estudo fez uma avaliação da indução de micronúcleos em eritrócitos de sangue periférico de peixes Tilapia rendalli, Oreochromis niloticus e Cyprinus carpio após o tratamento com mitomicina C, ciclofosfamida, 5-fluorouracil e bleomicina. Foram colhidas amostras periódicas de sangue com 2, 7, 14 e 30 dias após o tratamento único. Os tratamentos com citocalasina B tiveram como objetivo analisar as proporções entre células binucleadas/mononucleadas nos diferentes períodos de tratamento, para a comparação com os picos de micronúcleos entre as diferentes espécies, uma vez que o orgão hematopoiético nos peixes é o rim cefálico e o sangue analisado é de origem periférica, o que nos dá uma noção do tempo do ciclo celular dos eritrócitos. A análise das taxas de aumento das freqüências de micronúcleos ao longo do tempo demonstrou que do 2° ao 7°dias elas foram crescentes, decresceram ao 14° dia e mantiveram-se estáveis até ao 30°. Os 4 compostos químicos aumentaram significativamente as freqüências de micronúcleos ao longo de todo o período de tratamento, sendo que a ciclofosfamida e a mitomicina C foram as mais efetivas. A T. rendalli foi a espécie mais sensível a todos os tratamentos, enquanto que C. carpio foi a mais resistente. Entre 2 e 7 dias pós-tratamento observaram-se as maiores induções de micronúcleos. A partir do 14° dia de tratamento as freqüências de micronúcleos tenderam a diminuir e as diferenças entre as espécies não foram significativas.

    Resumo em Inglês:

    Fish are often used for screening genotoxicity of water. For such programs, a knowledge of the sensitivity to clastogens, spontaneous micronucleus frequency and cell cycle kinetics of the target tissue is necessary. To investigate the pattern of inter-specific sensitivity to micronucleus induction three species of fish, Tilapia rendalli, Oreochromis niloticus and Cyprinus carpio, were exposed to the clastogens bleomycin (BLM), cyclophosphamide (CP), 5-fluorouracil (5-FU), and mitomycin C (MMC). The binucleate/mononucleate ratio in peripheral erythrocytes exposed to cytochalasin B was also used to evaluate the time-dependent response of micronucleus formation during hematopoesis in the kidney and the micronucleus peak in peripheral erythrocytes. Micronucleus frequencies induced by CP were significantly greater than their respective controls for the three fish species throughout all treatment periods. During the whole evaluation period (30 days) CP was also the most effective clastogen. In general, until the 14th day of evaluation period T. rendalii was the most sensitive species to clastogens. No difference in micronucleus frequencies among species was observed in the 4th evaluation (at the 30th day). A micronucleus peak was observed at the 7th day after treatment. After the 14th day the frequencies were stabilized. The cytochalasin B experiment was carried out to demonstrate that micronuclei induced in the young kidney erythrocyte cells were detected in the circulating blood 2-4 days later.
  • An alkaline single-cell gel electrophoresis (comet) assay for environmental biomonitoring with native rodents Mutation And Mutagenesis

    Silva, Juliana da; Freitas, Thales R.O. de; Marinho, Jorge R.; Speit, Günter; Erdtmann, Bernardo

    Resumo em Português:

    A mais importante vantagem do Ensaio Cometa é a possibilidade do seu uso em qualquer organismo e tipo celular. Além de ser barato e rápido, se obtem resultados em poucas horas. Devido a isto é que ele vem sendo recomendado como teste inicial para monitoramento genotóxico ambiental. Neste trabalho investigaram-se adaptações na técnica para trabalhos de campo, com o uso de roedores endêmicos de região de mineração de carvão. O organismo utilizado foi o Ctenomys torquatus, capturado em duas diferentes áreas: Pelotas (região sem mineração de carvão-controle) e Candiota (zona de mineração de carvão). Foi coletado sangue periférico de 18 roedores, que após marcação foram liberados. O sangue foi protegido da luz e mantido sob refrigeração, e processado in loco. As concentrações das agaroses e as condições alcalinas de lise e eletroforese foram modificadas a partir das metodologias sugeridas pelas revisões existentes. As amostras restantes foram mantidas em RPMI 1640 (1:10) (4ºC) e pela nossa experiência podem ser utilizadas por até 4 dias. Foram analisadas 50 células por animal. As células foram classificadas de 0-4, segundo seu grau de lesão, além de serem medidas em unidades arbitrárias. Foi demonstrado aumento significante no nível de dano do DNA no grupo de Candiota (P < 0,05 - teste t), quando comparado com Pelotas. Ainda se demonstrou correlação entre o índice de danos e as medidas celulares. Estes resultados, neste estudo piloto, indicam que o carvão induz efeitos no DNA que são detectáveis através do Ensaio Cometa, o que indica a viabilidade deste teste para o biomonitoramento ambiental.

    Resumo em Inglês:

    The main advantages of single-cell gel electrophoresis (SCG) are its applicability to any eukaryotic organism and cell type, its low cost and the short time required to obtain results. These properties make the SCG assay particularly useful in screening for environmental genotoxicity. The present study describes a modified version of this technique for use in field work with native rodents and examines some factors which influence the outcome of the assay. Wild rodents (Ctenomys torquatus, "tuco-tuco") from a region close to a strip coal mine and from a region with no coal mines were used. Animals from the coal mining region had significantly more DNA damage than those from the control area. The use of this SCG technique for direct sampling in the field should facilitate environmental genotoxicity studies with natural populations, without the need to remove the animals from their habitat or to sacrifice them.
  • Documento sem título Thesis Abstracts

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