Os isolados de Giardia duodenalis de indivíduos assintomáticos, de pacientes e de animais apresentam diferenças e semelhanças em sua composição protéica, expressão de antígenos, proteases e isoenzimas, assim como na constituição dos ácidos nucléicos. A presente revisão analisa estas diferenças com ênfase na interação parasita e hospedeiro, e nos possíveis mecanismos de virulência do protozoário.