RESUMO A co-infecção por dengue vírus pode ocorrer em áreas com circulação endêmica, nas quais diferentes sorotipos vêm circulando durante muitos anos. Neste trabalho relatamos um caso de co-infecção por DENV-1/DENV-4 em soro humano, detectado por testes moleculares. Análises filogenéticas das sequências obtidas indicaram a presença do genótipo V e II de DENV-1 e DENV-4, respectivamente.
Case Reports • Rev. Inst. Med. Trop. Sao Paulo 55
(4)
• Jul-Aug 2013 • https://doi.org/10.1590/S0036-46652013000400009 linkcopiar
Co-infecção por vírus dengue, sorotipos 1 e 4, em paciente de cidade de porte médio no Brasil
Autoria
person Tatiana Elias Colombo
schoolFaculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto, SP, BrazilFaculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP)BrazilSão José do Rio Preto, SP, BrazilFaculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP), São José do Rio Preto, SP, BrazilschoolUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (IBILCE/UNESP), São José do Rio Preto, SP, BrazilUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (IBILCE/UNESP)BrazilSão José do Rio Preto, SP, BrazilUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (IBILCE/UNESP), São José do Rio Preto, SP, Brazil
person Danila Vedovello
person Adriano Mondini
person Andrea Francesli Negri Reis
schoolPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em SaúdeBrazilSão José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, Brazil
person Amena Alcântara Ferras Cury
schoolPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em SaúdeBrazilSão José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, Brazil
person Frank Hulder de Oliveira
schoolPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em SaúdeBrazilSão José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, Brazil
person Lilian Elisa Arão Antonio Cruz
schoolPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em SaúdeBrazilSão José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, Brazil
person Roberta Vieira de Morais Bronzoni
person Maurício Lacerda Nogueira
Financial Support: This work is supported by INCT-Dengue/CNPq and FAPESP (grant # 2012/11733-6 and 2011/10458-9 to MLN)
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Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (IBILCE/UNESP), São José do Rio Preto, SP, BrazilUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (IBILCE/UNESP)BrazilSão José do Rio Preto, SP, BrazilUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (IBILCE/UNESP), São José do Rio Preto, SP, Brazil
Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (FCFAR/UNESP), Araraquara, SP, BrazilUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (FCFAR/UNESP)BrazilAraraquara, SP, BrazilUniversidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” (FCFAR/UNESP), Araraquara, SP, Brazil
Prefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em SaúdeBrazilSão José do Rio Preto, SP, BrazilPrefeitura de São José do Rio Preto, Departamento de Vigilância em Saúde, São José do Rio Preto, SP, Brazil
Figuras | Tabelas
imageFig. 1 Electrophoresis in agarose gel showing the amplified products on two methodologies. PM = DNA ladder = 100 bp and 1 = Co-infection Sample RP/BR/507/2012, dengue 1 and 4 strains. (A) Lanciotti (1992) PCR assay showing the amplicon of 482 bp and 392 bp DENV-1 of DENV-4; (B) Bronzoni (2005) PCR assay showing the amplicon of 472 bp and 222 bp DENV-1 of DENV-4. open_in_new
imageFig. 2 (A) Alignment of thirty-one amino acid sequences of Capsid Protein (C) of samples obtained at Genbank and the DENV-1 sequence isolated in this work. The strain RP/BR/2012/507a is shown in yellow and amino acid substitutions identified are marked in green. Only amino acids are shown as distinct from the reference sample (AB074760.1). (B) Alignment of thirty-three amino acid sequences of Capsid Protein (C) of samples obtained at Genbank and the DENV-4 sequence isolated in this work. The strain RP/BR/2012/507b is shown in yellow and amino acid substitutions identified are marked in green. The amino acid substitution F49L is marked in blue. Only amino acids are shown as distinct from the reference sample (JQ513335.1). open_in_new
imageFig. 3 (A) Neighbor-Joining phylogenetic tree of 31 sequences of DENV-1 and the sequence RP/BR/2012/507a, inferred from Capsid gene (365 bp). RP/BR/2012/507a is highlighted in gray, the five DENV-1 genotypes are indicated with “}” and DENV serotypes 2, 3 and 4 are used as outgroups. “D” stands for “Dengue” and “1” represents the serotype. Genotype “G” is represented after the serotype, with the number of the genotype. Bootstrap values are shown for key nodes and the scale bar represents 0.05 nt changes per site. (B) - Neighbor-Joining phylogenetic tree of 33 sequences of DENV-4 and the sequence RP/BR/2012/507b, inferred from Capsid gene (257 bp). RP/BR/2012/507b is highlighted in gray, the three DENV-4 genotypes are indicated with “}” and DENV serotypes 1, 2 and 3 are used as outgroups. “D” stands for “Dengue” and “4” represents the serotype. Genotype “G” is represented after the serotype, with the number of the genotype. Bootstrap values are shown for key nodes and the scale bar represents 0.05 nt changes per site. open_in_new
table_chartTable 1
DENV-1 and DENV-4 sequences used for phylogenetic analysis, including serotype and genotype, isolation sites, isolation year, strain and GenBank accession numbers
| Serotype and Genotype | Genbank Accession | Isolation site | Strains | Isolation Year |
|---|---|---|---|---|
| Serotype 1 | ||||
| D1G1 | AB074760.1 | Japan | Mochizuki | 2001 |
| D1G1 | AF180817.1 | USA | 16007 | 1999 |
| D1G1 | JN054255.1 | Sri Lanka | DV1_SL_2010b | 2010 |
| D1G1 | GQ398255.1 | Singapore | SG/07K3640DK1/2008 | 2008 |
| D1G1 | DQ193572.1 | Fujian/China | Fj231/04 | 2004 |
| D1G2 | FJ196841.1 | Guangzhou/China | GD54/03 | 2003 |
| D1G2 | FJ196842.1 | Guangzhou/China | GD66/03 | 2003 |
| D1G2 | EF440432.1 | Australia | ET243 | 2000 |
| D1G2 | EF025110.1 | China | 71/02GZ | 2006 |
| D1G3 | AB074761.1 | Japan | A88 | 2002 |
| D1G3 | DQ285561.1 | Seychelles/ France | 1480/04 | 2004 |
| D1G4 | U88535.1 | Nauru Island | Clone WestPac | 1997 |
| D1G4 | M23027.1 | Nauru Island | Nauru Island | 1994 |
| D1G5 | FJ850087.1 | Northern Brazil | BR/BID-V2395/2006 | 2006 |
| D1G5 | AF226685.2 | Rio de Janeiro/Brazil | Den1BR/90 | 2000 |
| D1G5 | AF513110.1 | Curitiba/Brazil | BR/01-MR | 2002 |
| D1G5 | FJ850075.1 | Northern Brazil | BR/BID-V2381/2002 | 2002 |
| D1G5 | FJ850090.1 | Northern Brazil | BR/BID-V2398/2007 | 2007 |
| D1G5 | FJ850084.1 | Northern Brazil | BR/BID-V2392/2005 | 2005 |
| D1G5 | JX502769.1 | Brazil | RR_DENV1_09007 | 2009 |
| D1G5 | FJ850070.1 | Northern Brazil | BR/BID-V2374/2000 | 2000 |
| D1G5 | FJ850071.1 | Northern Brazil | BR/BID-V2375/2000 | 2000 |
| D1G5 | AB519681.1 | Brasilia/Brazil | SB 01057805 (DF02) | 2002 |
| D1G5 | FJ850081.1 | Northern Brazil | BR/BID-V2389/2004 | 2004 |
| D1G5 | HM043709.1 | Brazil | 55/2009ES | 2009 |
| D1G5 | JN086990.1 | Brazil | A | 2010 |
| D1G5 | JN086991.1 | Brazil | B | 2010 |
| Serotype 4 | ||||
| D4G1 | FJ196850.1 | Guangzhou/China | GD09/1990 | 1990 |
| D4G1 | AF289029.1 | Guangzhou/China | Guangzhou B5 | 2000 |
| D4G1 | AF177542.1 | Mindanao/Philippines | Mindanao/BDJ/1995 | 1995 |
| D4G1 | GQ868594.1 | Philippines | PH/BID-V3361/1956/1956 | 1956 |
| D4G2 | EU854295.1 | Puerto Rico | US/BID-V1083/1986 | 1986 |
| D4G2 | GQ868582.1 | Santander/Colombia | CO/BID-V3409/2001 | 2001 |
| D4G2 | AH011968.1 | Costa Rica | D4.108_1996CR | 1996 |
| D4G2 | JN559741.2 | Boa Vista/Brazil | ROR7365 | 2010 |
| D4G2 | JN983813.1 | Boa Vista/Brazil | Br246RR/2010 | 2010 |
| D4G2 | HQ822126.1 | Roraima/Brazil | Br347RR | 2010 |
| D4G2 | HQ822125.1 | Roraima/Brazil | Br272RR | 2010 |
| D4G2 | JN092557.1 | Brazil | SPH318527 | 2011 |
| D4G2 | JN712226.1 | São José do Rio Preto/Brazil | RP/BR/2011/131 | 2011 |
| D4G2 | JN712225.1 | São José do Rio Preto/Brazil | SJRP/BR/2011/167 | 2011 |
| D4G2 | JQ513335.1 | Belém/Brazil | BeH778494 | 2011 |
| D4G2 | JN092556.1 | Brazil | SPH319325 | 2011 |
| D4G2 | JN092555.1 | Brazil | SPH319268 | 2011 |
| D4G2 | JN092556.1 | Brazil | SPH319325 | 2011 |
| D4G2 | JQ513333.1 | Boa Vista/ Brazil | ROR7542 | 2010 |
| D4G2 | JQ513340.1 | Boa Vista/ Brazil | ROR7591 | 2010 |
| D4G2 | AY152252.1 | San Juan/ Puerto Rico | D4.69_1987 | 1987 |
| D4G2 | AY152084.1 | San Juan/ Puerto Rico | D4.84_1994 | 1994 |
| D4G2 | AY152056.1 | San Juan/ Puerto Rico | D4.17_1998 | 1998 |
| D4G2 | AY152196.1 | San Juan/ Puerto Rico | D4.28_1992 | 1992 |
| D4G2 | AY152336.1 | San Juan/ Puerto Rico | D4M.5_1982 | 1982 |
| D4G2 | AY152360.1 | Dominica | D4M.44_1981DM | 1981 |
| D4G3 | HQ875339.1 | Singapura | SG(EHI)D4/2641Y08 | 2008 |
| D4G3 | GQ398256.1 | Singapura | SG/06K2270DK1/2005 | 2005 |
| D4G3 | AY618993.1 | Bangkok /Thailand | ThD4_0734_00 | 2000 |
| Serotypes 1 to 4 using as outgroups | ||||
| DENV-1 | AB074760.1 | Japan | 2001 | |
| DENV-3 | AF317645.1 | Guangxi/China | 2000 | |
| DENV-2 | HM181971.1 | São Paulo/Brazil | 2008 | |
| DENV-4 | AF326573.1 | Dominica | 2000 | |
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