O microambiente adequado do Paracoccidioides brasiliensis não foi ainda bem esclarecido, talvez porque os métodos utilizados não sejam suficientemente sensíveis. Aplicamos com este propósito, a reação em cadeia da polimerase (PCR) usando três jogos de primers específicos do P. brasiliensis, correspondendo a dois dos genes do P. brasiliensis. Este fungo, assim como outros fungos, foram cultivados e seus DNAs obtidos por ruptura mecânica e purificados com mistura de fenol-clorofórmio com álcool isoamílico. Os DNAs serviram para a reação de PCR utilizando-se primers específicos para dois dos genes do P. brasiliensis que codificam para as proteínas antigênicas, denominadas, 27 kDa e 43 kDa. O limite mínimo de detecção para o gene 27 kDa foi de 3 pg. A amplificação para os dois genes foi positiva só com o DNA do P. brasiliensis; além disso, o mRNA para o gene de 27kDa estava presente apenas no material do P. brasiliensis, como mostrado pela análise por Northern-blot. A padronização da técnica do PCR permitiu a amplificação do DNA do P. brasiliensis em solos contaminados artificialmente com o fungo e em tecidos de tatus infectados na natureza. Estes resultados indicam que a técnica do PCR podería ter um papel muito importante na pesquisa do habitat do P. brasiliensis e, além disso, podería ser utilizada em outros estudos ecológicos.
