Investigamos longitudinalmente la asociación entre la infestación por Triatoma dimidiata, su infección con Trypanosoma cruzi y las características ambientales de los domicilios/peridomicilios en 101 viviendas de Molas, Yucatán, México entre Noviembre de 2009 (temporada lluviosa) y Mayo de 2010 (temporada seca). Mediante modelos de regresión logística se probaron asociaciones entre la infestación/infección de T. dimidiatay factores de riesgo potenciales a nivel de las viviendas. Se colectó un total de 200 individuos de T. dimidiata en el 35.6% de las viviendas, mayormente del peridomicilio (73%). De todos los triatominos colectados el 48% se encontraron infectados con T. cruzi. Los triatomas infectados fueron colectados en el 31.6% de las viviendas (54.1% y 45.9% en intra y peridomicilio respectivamente). Aproximadamente el 30% de todos los triatominos colectados, fueron encontrados en gallineros. La presencia de un gallinero en el peridomicilio de una vivienda se asoció significativamante tanto con las posibilidades de encontrar T. dimidiata (OR = 4.10, CI 95% = 1.61-10.43, p = 0.003) como con la presencia de triatominos infectados con T. cruzi (OR = 3.37, CI 95% = 1.36-8.33, p = 0.006). Los resultados de este estudio enfatizan la relevancia de los gallineros como fuente putativa de poblaciones de T. dimidiata y como una fuente potencial de riesgo de transmisión de T. cruzi.