Neste trabalho foi analisada, através de Microscopia Eletrônica de Transmissão, a morfologia de trofozoitos de Giardia muris obtidos de hamsters, ratos peridomiciliares e camundongos, bem como de trofozoitos de Giardia duodenalis obtidos de hamsters e ratos peridomiciliares. Basicamente a ultraestrutura dos trofozoitos estudados foi semelhante. Foram observadas, no entanto, diferenças na morfologia da franja ventro-lateral dos trofozoitos de Giardia muris quando comparados com os de Giardia duodenalis, diferenças estas relacionadas ao tamanho, arranjo das lâminas marginais e presença de lamela osmiofílica.