Anticorpos para Enterovírus 71 (EV71) foram avaliados no Estado de São Paulo durante 1999-2005. O título de anticorpos neutralizantes contra EV71 foi determinado pelo ensaio microneutralização, e um título de > 1:8 foi definido como indicador de imunidade protetora. Anticorpos neutralizantes para EV71 foram observados em 12,4% (55/442) das amostras de soro, uma baixa taxa de proteção, sugerindo que a infecção pelo EV71 é incomum nesta região e que existe alta susceptibilidade a doenças relacionadas ao EV71, o que é preocupante considerando os recentes surtos asiáticos. Ainda, foi observada diferença significativa na soropositividade em relação à localização, onde 8,7% (21/241) e 16,9% (34/201) das amostras provenientes da região metropolitana de São Paulo, e demais municípios, respectivamente, apresentaram anticorpos neutralizantes para EV71. Um grande número de brasileiros vive em áreas rurais e à beira-mar, sem acesso adequado à água encanada ou saneamento. Essa situação pode contribuir para a disseminação de EV71 nessas regiões. A análise de amostras ambientais poderia gerar contribuição valiosa para estudos sobre a epidemiologia da EV71.