Avaliam-se três técnicas do tipo bootstrap para a análise estatística de um modelo não-paramétrico de produção em que uma medida de eficiência DEA é afetada potencialmente por um conjunto de fatores exógenos. A aplicação de interesse diz respeito a avaliação da significância das variáveis contextuais receita própria, melhoria de processos, intensidade de parcerias, tipo e tamanho nas eficiências técnicas de produção dos centros de pesquisa da Embrapa. Conclui-se que o bootstrap associado ao estimador de máxima verossimilhança produz o melhor ajuste do ponto de vista da correlação de Pearson entre valores observados e preditos e é o mais informativo relativamente a significância das variáveis consideradas. Com exceção de tamanho todas as variáveis contextuais são estatisticamente significantes. Receita própria, melhoria de processos e intensidade de parcerias são todas positivamente associadas com a eficiência técnica.
DEA; bootstrap; estimação em dois estágios