O estudo das Pinnulariaceae do rio Guaraguaçu baseou-se em 29 amostras planctônicas e perifíticas coletadas em seis estações de coleta ao longo do leito do rio. A análise qualitativa das amostras permitiu a identificação de 36 espécies, 14 variedades e uma forma taxonômica: Caloneis bacillum, C. hyalina, C. formosa, C. westii, Pinnularia acoricola, P. acrosphaeria, P. acrosphaeria f. minor, P. acuminata var. acuminata, P. acuminata var. novazealandica, P. borealis var. rectangularis, P. brauniana, P. butantanum, P. decrescens var. ignorata, P. divergens var. biconstricta, P. divergens var. divergens, P. divergens var. malayensis, P. divergens var. media, P. divergens var. mesoleptiformis, P. diversarea, P. dornii, P. gibba, P. graciloides var. latecapitata, P. grunowii, P. hartleyana var. curta, P. huckiae, P. hudsonii, P. hyalina, P. inconstans, P. latevittata, P. maculata, P. meriadiana var. parallela, P. michelcostei, P. microstauron, P. neomajor, P. nobilis var. regularis, P. oominensis, P. rhombarea, P. rostratissima var. parva, P. rumrichae, P. stidolphii, P. stoermeri, P. subcapitata, P. subgibba var. subgibba, P. subgibba var. undulata, P. sudetica, P. tabellaria, P. viridiformis, P. viridis, Pinnularia sp.1 e Pinnularia sp.2; sendo 32 destas novos registros para o estado do Paraná.
ambiente lótico; Caloneis; estuário; Pinnularia; taxonomia