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Ciência e Agrotecnologia

versão impressa ISSN 1413-7054

Resumo

GARCIA, Suzana Antunes Lourençoni; PANIS, Bart; SWENNEN, Rony  e  CARPENTIER, Sebastien Christian. Avaliação de quatro estratégias diferentes para caracterizar proteínas da membrana plasmática de raízes de banana. Ciênc. agrotec. [online]. 2014, vol.38, n.5, pp.424-434. ISSN 1413-7054.  https://doi.org/10.1590/S1413-70542014000500002.

Proteínas da membrana plasmática constituem uma importante classe de proteínas. Elas estão envolvidas na transmissão de sinais externos para o interior da célula e no transporte seletivo de nutrientes/ions, através da membrana plasmática. Porém, o estudo dessas proteinas é difícil, porque elas são poucoabundantes e apresentam baixa solubilidade em tampões aquosos. Neste trabalho, nós avaliamos quatro estratégias diferentes para extrair proteínas da membrana plasmática de raízes de banana: (i) a técnica de sistema aquoso de duas fases, constituída porpolímeros(ATPS) combinada com eletroforese em gel e (ii) ATPS sem gel usandoLC-MS/MS, (iii) uma fração microssomal e (iv) uma fração, contendo o proteoma total celular, ambas as frações avaliadas via LC-MS/MS. Nossos resultados mostram que a estratégia baseada em eletroforese em gel é útil para a visualização de proteínas, mas apresenta limitações em termos de reproducibilidade e eficiência. Dentre as estratégias sem o uso de gel, a fração microssomal permitiu a identificação do maior número de proteínas de membrana plasmática, seguida pela fração de proteoma total e pela técnica de sistema aquoso de duasfases. O alto rendimento de proteínas de membrana plasmática proporcionado pela fração microssomal pode ser explicado pelo enriquecimento de proteínas de membrana nessa fração e pela eficiência do espectrômetro de massa na identificação de proteínas.

Palavras-chave : Sistema aquoso de duas fases; frações microssomal e de proteoma total; identificação de proteínas.

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