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Brazilian Journal of Microbiology

versão impressa ISSN 1517-8382versão On-line ISSN 1678-4405

Resumo

RODRIGUES-SUBACIUS, Sandra M  e  PADILLA, Gabriel. A função dos motivos léxicos na organização do 5S rRNAs de Actinomicetes. Braz. J. Microbiol. [online]. 2007, vol.38, n.3, pp.573-579. ISSN 1517-8382.  http://dx.doi.org/10.1590/S1517-83822007000300036.

Neste trabalho são apresentados resultados obtidos empleando o método linguístico para identificar sítios no 5S rRNAs de actinomicetes com significado biológico. A abordagem identificou palavras-tripletes, junto com a sequência de bases do 5S rRNAs, localizados principalmente nos domínios alfa e beta da estrutura secundária. Entre eles, existem palavras-tripletes que representam sítios de ligação de proteínas universais, que incluem importantes assinaturas procarióticas, além de sítios estrategicamente colocados em regiões críticas relacionados com a formação do complexo 5S ribonucleoproteína (RNP). Nestes sítios, onde a pressão GC promove substituições, as alterações não afetaram seu significado biológico. Sítios formados por GGY (ou mais raramente GER), jogam um papel importante como receptores de proteínas ribossomicas rpL18 e rpL5. Os dados também sugerem que ao contrário de aumentar a variabilidade molecular, esperada pela diversidade em espécies e habitats ocupados pelo grupo, GC funciona como um mecanismo para diversidade inter-específica.

Palavras-chave : Actinomicetes; 5S rRNA; pressão GC; análise linguístico; motivos léxicos.

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