Eucariontes unicelulares são abundantes na maioria dos ambientes aquáticos, contribuindo de várias maneiras nos ecossistemas, tais como produtores, consumidores primários e secundários, exercendo um importante papel no declínio e controle de comunidades bacterianas e ciclagem de nutrientes. O objetivo desse estudo foi descrever a riqueza e distribuição de eucariontes unicelulares no córrego Ponta Porã e seus principais afluentes, buscando possíveis relações com a qualidade de suas águas nos locais amostrados. Foram selecionados seis locais de coleta, considerando: nascentes (L1 e L2), jusante (L5 e L6) e a principal fonte poluidora (L3). Foram utilizadas análises de similaridade e correspondência canônica para avaliar as relações entre riqueza e distribuição dos organismos para as variáveis abióticas (oxigênio dissolvido, pH, temperatura, turbidez e condutividade). A riqueza foi relacionada com o aumento de sedimento orgânico e inorgânico, oriundos da decomposição e erosão. Foi verificada uma variação na distribuição dos gêneros, com predominância discreta de organismos ciliados, sendo alguns gêneros indicadores de ambientes eutrofizados. As presenças de Vorticella, Saprodinium, Paramecium, Metopus e Chilodonella sugerem um ambiente que varia de polissapróbio a oligossapróbio. Gêneros como Urostyla, que tem sido usado como indicador de qualidade da água, o flagelado Cercomonas, que possui uma ampla dispersão em ambientes aquáticos, Didinium, um ciliado predador amplamente disperso, Synura, uma crisófita sensível a pH básico e altas temperaturas, e Amoeba, mais frequentemente encontrados em águas limpas ou em processo de depuração, podem ser pressupostos de recuperação ambiental, visto que são gêneros também registrados nos locais menos impactados.
Centro-oeste brasileiro; ciliados; erosão; eutrofização; impactos ambientais