Variabilidade genética de acessos de pitaya com diferentes níveis de produção por meio de marcadores RAPD

Pitaya accesses genetic variability with different pruduction levels through RAPD markers

ARTIGOS

GENÉTICA E MELHORAMENTO

Variabilidade genética de acessos de pitaya com diferentes níveis de produção por meio de marcadores RAPD¹

Pitaya accesses genetic variability with different pruduction levels through RAPD markers

Keize Pereira Junqueira^I; Fábio Gelape Faleiro^II; Graciele Bellon^II; Nilton Tadeu Vilela Junqueira^II; Kênia Gracielle da Fonseca^II; Cristiane Andréa de Lima^II; Erivanda Carvalho dos Santos^II

^IEng. Agr. Doutoranda em Fitopatologia/Universidade Brasília, Brasília-DF. E-mail: [e-mail]

^IIEmbrapa Cerrados, BR 020, Km 18, C. P. 08223, 73010-970 Planaltina-DF. E- mail: [e-mail], [e-mail]

RESUMO

A espécie de pitaya mais cultivada atualmente é Hylocereus undatus, a pitaya-vermelha-de-polpa-branca. Colômbia e México são os principais produtores mundiais e, devido à sua rusticidade, a pitaya é considerada uma alternativa potencialmente viável também para o aproveitamento de solos pedregosos, arenosos e maciços rochosos. Apesar da crescente demanda, ainda não há uma cultivar lançada no mercado que atenda às necessidades climáticas de produção e às exigências do consumidor brasileiro. O presente trabalho é parte do programa de seleção e melhoramento da pitaya CPAC PY-01 da Embrapa Cerrados. Objetivou-se realizar o estudo da variabilidade genética de 16 acessos de pitayas mantidos na coleção de germoplasma da Embrapa Cerrados, apresentando diferentes características fenotípicas relacionadas especialmente à produção, por meio de marcadores moleculares RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). O DNA genômico de cada acesso foi extraído, e onze iniciadores decâmeros foram utilizados para a obtenção de marcadores moleculares RAPD, que foram convertidos em matriz de dados binários, a partir da qual foram estimadas as distâncias genéticas entre os acessos e realizadas análises de agrupamento e de dispersão gráfica. Foram obtidos 111 marcadores RAPD, perfazendo uma média de 10,1 marcadores por primer, dos quais 45 (40,54%) foram polimórficos. As distâncias genéticas entre os 16 acessos variaram entre 0,006 e 0,148. As maiores distâncias genéticas foram obtidas entre os acessos "52" e "61", sendo que, em 2007, o primeiro produziu mais de 25 frutos, e o segundo, nenhum. Assim, deduz-se que, nesse caso, a próvável causa da variação seja genotípica. As menores distâncias genéticas foram constatadas entre os acessos "63"e "55" e entre "19"e "59". Os dois grupos apresentaram valores de produção próximos. Os marcadores moleculares RAPD mostraram que, mesmo dentro da mesma espécie, há variabilidade genética entre plantas com produções diferentes, ressaltando a importância das técnicas moleculares para subsidiar e auxiliar nos trabalhos de seleção, em programas de melhoramento genético.

Termos para indexação: marcadores moleculares, características agronômicas, Hylocereus undatus, melhoramento genético.

ABSTRACT

The most cultivated pitaya species nowadays is Hylocereus undatus, red pitaya with white pulp. Colombia and Mexico are the major world producers and, due to its rusticity, pitaya is considered a potentially viable alternative to make good use of gravel, sandy and compact rocky soils. Although the great demand, there is not yet a variety released on the market that attends production climatic needs and brazilian consumer exigencies. The present work is a part of Embrapa Cerrados pitaya CPAC PY-01 selection and improvement program. We have had the objective to realize genetic variability study of 16 pitaya accesses maintained at Embrapa Cerrados germoplasm collection, showing different phenotypic characteristics with special relation to production, through molecular markers RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Each access genomic DNA was extracted and eleven decamer primers indicators were used to obtain molecular markers RAPD, that were converted in a binarium data matrix, from where it was estimated genetic distances between accesses and realized grouping analysis and graphic dispersion. One hundred and eleven RAPD markers were obtained, making a 10,1 markers medium per primer, in witch 45 (40,54%) were polymorphic. Genetic distances between 16 accesses varied within 0,006 and 0,148. The biggest genetic distances were obtained between accesses "52" and "61"; in 2007, the first one produced more than 25 fruits and the second one, none. The smallest genetic distances were verified between accesses "63" and "55" and between 19" and "59". Both groups showed close production values. RAPD molecular markers showed that, even inside the same species, there is genetic variability between plants with different productions, standing out molecular techniques importance as auxiliary instruments selection breeding programs.

Index terms: molecular markers, agronomic characteristics, Hylocereus undatus, breeding program.

INTRODUÇÃO

Pertencentes à família Cactacea, as pitayas vêm destacando-se no mercado de frutas exóticas. Há várias espécies denominadas "pitayas", dentre as quais podem ser citadas Hylocereus undatus (pitaya-vermelha-de-polpa-branca), Hylocereus costaricensis (pitaya-vermelha-de-polpa-vermelha), Selenicereus megalanthus (pitaya-amarela) e Selenicereus setaceus (pitaya-do-cerrado). Há também outras espécies de ocorrência em áreas de Cerrado (Junqueira et al., 2007) e acredita-se que o Brasil seja um dos centros de origens das pitayas.

A espécie mais cultivada atualmente é a pitaya-vermelha-de-polpa-branca. Os frutos são bastante atrativos, de coloração vermelha e polpa esbranquiçada, com numerosas sementes pretas. Segundo Ortiz e Liveira (1995), a pitaya-vermelha possui alto potencial agronômico e econômico. De acordo com Junqueira et al. (2002), devido à sua rusticidade, a pitaya é considerada uma opção também para o cultivo em solos pedregosos, arenosos e maciços rochosos.

Os preços atualmente cotados nos mercados regional, nacional ou internacional têm estimulado a extensão e a intensificação do cultivo da pitaya em diferentes sistemas de plantio, no México, Nicarágua, Malásia, Vietnã e Israel (HESEN;TELLEZ, 1995; NERD;MIZRAHI, 1997; RODRÍGUEZ, 2000, citados por ANDRADE et al., 2007). No Brasil, existem pequenas áreas de produção de pitaya, situadas principalmente no Estado de São Paulo, localizadas na região de Catanduva. Na região Sudeste, a produção dos frutos ocorre durante os meses de dezembro a maio. A produtividade média anual é de 14 toneladas de fruto/ha (BASTOS et al., 2006).

Entretanto, ainda não há uma cultivar lançada que, além de atender às necessidades climáticas de produção, satisfaça também às exigências do consumidor. As mudas comercializadas atualmente não são provenientes de sementes selecionadas e observa-se, num mesmo plantio, grande variação na produção, tamanho e formato de frutos, bem como em suas características físico-químicas, refletindo a desuniformidade das mudas e necessidade de existência de uma cultivar indicada para a região.

O presente trabalho é parte do programa de seleção e melhoramento da pitaya CPAC PY-01 da Embrapa Cerrados. Neste programa, acessos têm sido avaliados e selecionados com base, principalmente, em características físicas e químicas de frutos e produtividade. Para o sucesso do trabalho de seleção na obtenção de ganhos genéticos, é essencial que exista variabilidade genética entre os diferentes acessos. Neste sentido, objetivou-se realizar o estudo da variabilidade genética de 16 acessos de pitayas mantidos na coleção de germoplasma da Embrapa Cerrados, apresentando diferentes características fenotípicas relacionadas especialmente à produção, por meio de marcadores moleculares RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA).

MATERIAL E MÉTODOS

O trabalho foi realizado no Laboratório de Genética e Biologia Molecular da Embrapa Cerrados. Foram analisados 16 acessos de pitaya-vermelha-de-polpa-branca (Hylocereus undatus), com dois anos de idade, pertencentes à Coleção de Germoplasma da Embrapa Cerrados (Tabela 1). Cladódios em estágio inicial de maturação foram coletados, e o DNA genômico extraído, utilizando-se do método do CTAB, com algumas modificações (FALEIRO et al., 2003).

Amostras de DNA de cada material genético foram amplificadas para a obtenção de marcadores RAPD. As reações de amplificação foram feitas em um volume total de 13 µL, contendo Tris-HCl 10 mM (pH 8,3), KCl 50 mM, MgCl² 3 mM, 100 µM de cada um dos desoxirribonucleotídios (dATP, dTTP, dGTP e dCTP), 0,4 µM de um iniciador (Operon Technologies Inc., Alameda, CA, EUA), uma unidade da enzima Taq polimerase e, aproximadamente, 15 ng de DNA. Foram utilizados 11 iniciadores decâmeros: OPD (01; 02; 05 e 11), OPE (11), OPF (08 e 14), OPG (18) e OPH (04; 13 e 15) (Tabela 2).

As amplificações foram efetuadas em termociclador programado para 40 ciclos, cada um constituído pela seguinte sequência: 15 segundos a 94ºC, 30 segundos a 35ºC e 90 segundos a 72ºC. Após os 40 ciclos, foi feita uma etapa de extensão final de seis minutos a 72ºC e, finalmente, a temperatura foi reduzida para 4 ºC. Após a amplificação, foram adicionados, a cada amostra, 3 µl de uma mistura de azul de bromofenol (0,25%) e glicerol (60%), em água. Essas amostras foram aplicadas em gel de agarose (1,2%), corado com brometo de etídio, submerso em tampão TBE (Tris-Borato 90 mM, EDTA 1 mM). A separação eletroforética foi de, aproximadamente, quatro horas, a 90 volts. Ao término da corrida, os géis foram fotografados sob luz ultravioleta.

Os marcadores RAPD gerados foram convertidos em matriz de dados binários, a partir da qual foram estimadas as distâncias genéticas entre os diferentes acessos, com base no complemento do coeficiente de similaridade de Nei e Li (1979), utilizando-se do Programa Genes (CRUZ, 1997). A matriz de distâncias genéticas foi utilizada para realizar análises de agrupamento por meio de dendrograma, utilizando-se do método do UPGMA (Unweighted pair-group arithmetic average) como critério de agrupamento, e a dispersão gráfica, baseada em escalas multidimensionais, usando o método das coordenadas principais, com auxílio do Programa SAS (SAS INSTITUTE INC., 1989) e Statistica (STATSOFT INC., 1999).

RESULTADOS E DISCUSSÃO

Os marcadores RAPD mostraram-se excelentes ferramentas para detectar a variabilidade genética em pitayas, fato já observado por Junqueira et al. (2007), em trabalhos com acessos de pitayas nativos. Os 11 primers decâmeros geraram um total de 111 marcadores RAPD, perfazendo uma média de 10,1 marcadores por primer. Dos 111 marcadores, 45 (40,54%) foram polimórficos (Tabela 2). A baixa porcentagem de marcadores polimórficos evidencia a baixa variabilidade genética dos acessos analisados. Tal resultado já era esperado, tendo em vista que se trata da mesma espécie e que os acessos já se encontram em fase avançada de seleção, estreitando-se a base genética da população analisada.

As distâncias genéticas entre os 16 acessos de pitaya variaram entre 0,006 e 0,148 (Tabela 3). As maiores distâncias genéticas foram obtidas entre os acessos "52" e "61". Considerando que, em 2007, o primeiro produziu mais de 25 frutos, e o segundo, nenhum, deduz-se que, neste caso, a próvável causa da variação seja genotípica. As menores distâncias genéticas foram constatadas entre os acessos "63"e "55" e entre "19"e "59". Nos dois casos, observaram-se valores de produção próximos. Junqueira et al. (2007), estudando acessos nativos de pitaya, de diferentes espécies, obtiveram distâncias variando entre 0,088 e 0,848, comprovando a larga base genética das pitayas de modo geral e concluíndo ser o Brasil um dos maiores centros de diversidade dessas frutas.

Com base na análise de agrupamento realizada a partir das distâncias genéticas, subdividiram-se os 16 acessos em, pelo menos, quatro grupos de similaridade genética (Figura 1). O maior grupo foi formado por 10 dos 16 acessos. Dentro deste grupo, pode-se verificar significativo agrupamento das plantas mais produtivas. Os frutos de diferentes formatos não formaram grupos específicos. Outro grupo foi formado apenas pelo acesso "52", que produziu mais de 25 frutos na referida safra. O terceiro grupo foi constituído pelos acessos "19", "59", "26" e "1", sendo que os três últimos não produziram frutos na safra de 2007. O último grupo foi formado pelo acesso "61", que não produziu frutos em 2007, porém apresentou alto vigor.

O perfil de agrupamento também pode ser constatado no gráfico de dipersão (Figura 2), onde se evidencia a diferença do acesso "61" em relação aos demais e a tendência de agrupamento dos acessos com base em sua produtividade verificada, parcialmente, na análise de agrupamento. Considerando que os acessos analisados possuem a mesma base genética, ou seja, foram originados de uma mesma população, possivelmente diferentes grupos de genes estão condicionando maior ou menor produtividade, abrindo boas perspectivas para os trabalhos de seleção e melhoramento genético.

CONCLUSÕES

A partir de marcadores moleculares RAPD, constatou-se que, dentro da mesma espécie, há variabilidade genética entre plantas com produções diferentes, ressaltando a importância das técnicas moleculares para subsidiar e auxiliar os trabalhos de seleção em programas de melhoramento genético de pitaya. Tal fato vai subsidiar futuros trabalhos de avaliação agronômica e seleção desses acessos, principalmente objetivando o lançamento de uma cultivar de pitaya no mercado.

REFERÊNCIAS

ANDRADE, R.A.; MARTINS, A. B.G.; SILVA, M.T.H. Influência da fonte material e do tempo de cura na propagação vegetativa da pitaya-vermelha (Hylocereus undatus Haw). Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v.29, n.1, p.183-186, 2007.

BASTOS, D.C.; PIO, R.; SCARPARE FILHO, J.A.; LIBARDI, M.N.; ALMEIDA, L.F.P.; GALUCHI, T.P.D.; BAKKER, S.T. Propagação da Pitaya-'vermelha' por estaquia. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v.30, n.6, p.1106-1109, 2006.

CRUZ, C.D. Programa Genes: aplicativo computacional em genética e estatística. Viçosa: UFV, 1997. 442p.

FALEIRO, F.G.; FALEIRO, A.S.G.; CORDEIRO, M.C.R., KARIA, C.T. Metodologia para operacionalizar a extração de DNA de espécies nativas do cerrado. Planaltina: Embrapa Cerrados, 2003. 6 p. (Comunicado Técnico, 92).

JUNQUEIRA, K. P. ; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N.T.V.; BELLON, G. ; FONSECA, K.G.; LIMA, C.A.; SANO, S.M . Diversidade genética de Pitayas nativas do cerrado com base em marcadores RAPD. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais. ..

JUNQUEIRA, K.P.; JUNQUEIRA, N.T.V.; RAMOS, J.D.; PEREIRA, A.V. Informações preliminares sobre uma espécie de pitaya do Cerrado. Planaltina-DF: Embrapa Cerrados, 2002. 18p. (Documentos, 62).

NEI, M.; LI, W. H. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America, Washington, v.76, n. 10, p. 5269-5273, 1979.

ORTIZ, H.Y.D.; LIVERA, M.M. La pitahaya (Hylocereus spp): Recurso genético de América. In: CONGRESO NACIONAL, 6 Y INTERNACIONAL SOBRE EL CONOCIMIENTO Y APROVECHAMIENTO DEL NOPAL, 4. 1995. Guadalajara. Memórias... p.191-194.

SAS INSTITUTE. SAS/STAT: user's guide. Version 6, 4^th ed. North Caroline, 1989.

STATSOFT. Statistica for windows: computer program manual. Tulsa, 1999.

Recebido em: 10-08-2009. Aceito para publicação em: 02-03-2010.

1

(Trabalho 186-09). Apoio financeiro: CAPES e Embrapa Cerrados.

Datas de Publicação

• Publicação nesta coleção
  08 Out 2010
• Data do Fascículo
  Set 2010

Histórico

• Aceito
  02 Mar 2010
• Recebido
  10 Ago 2009