A reference ontology for digital scientific journals applied to systematic literature review processes

Ghisi, Fernando Benedet; Fachin, Gleisy Regina Bóries; Santos, Marcos Henrique dos; Sell, Denilson; Rados, Gregório Jean Varvakis

Abstracts

This paper presents possible approaches to the use of a reference ontology for digital journals, supporting bibliographic processes in systematic literature reviews. The benefits are highlighted of using specialized services through "batch" or "on-the-fly" processing of information from different repositories, such as recognized and indexed databases and portals or specific websites. It is concluded that the use of reference ontology enables the creation of services that ensure greater interoperability between different repositories, allowing a more inclusive and accurate retrieval of information, as it standardizes the concepts related to the access points of scientific journals.

Information retrieval; Journal; Reference ontology; Systematic review of the literature

O presente artigo apresenta possíveis abordagens para o uso de uma ontologia de referência para periódicos científicos digitais, apoiando os processos de levantamento bibliográfico em revisão sistemática da literatura. Destacam-se os benefícios da utilização de serviços especializados por meio de processamentos em "batch" ou "on-the-fly" de informações provenientes de diferentes repositórios, como bases de dados reconhecidas e indexadas e portais ou sítios específicos. Conclui-se que a utilização de ontologia de referência possibilita a criação de serviços que asseguram maior interoperabilidade entre diferentes repositórios, permitindo a recuperação da informação de forma mais abrangente e precisa, através da padronização dos conceitos relacionados aos pontos de acesso de periódicos científicos.

Recuperação de informação; Periódicos; Ontologia de referência; Revisão sistemática da literatura

BAEZA-YATES, R.; RIBEIRO-NETO, B. Retrieval evaluation. In: BAEZA-YATES, R.; RIBEIRO-NETO, B. Modern information retrieval. New York: Addison-Wesley, 1999. p.73-98.
BELKIN, N.J. Intelligent information retrieval: whose intelligence?. 1996. Available from: <http://mariner.rutgers.edu/tipster3/iirs.html>. Cited: Apr. 2008.
BERWANGER, O.; GUIMARÃES, H.P.; AVEZUM, A. Revisões sistemáticas em cardiologia 2005. Disponível em: <http://www.moreirajr.com.br/revistas.asp?id_ materia=3254&fase= imprime>. Acesso em: abr. 2011.
BRÄSCHER, M.; CARLAN, E. Sistemas de organização do conhe-cimento: antigas e novas linguagens. In: ROBREDO, J.; BRÄSCHER, M. (Org.). Passeios no bosque da informação: estu-dos sobre representação e organização da informação e do conhecimento. Brasília: Ibict, 2010. cap. 8.
CAMPOS, M.L.A. Aspectos semânticos da compatibilização terminológica entre ontologias no campo da bioinformática. In: ENCONTRO NACIONAL DE PESQUISA EM CIÊNCIA DA INFORMAÇÃO, 10., 2009, João Pessoa. Anais eletrônicos.. João Pessoa: ANCIB, 2009. Disponível em: <http://hdl.handle.net/123456789/477>. Acesso em: nov. 2009.
CENTRE FOR REVIEWS AND DISSEMINATION. Systematic reviews: CRD's guidance for undertaking reviews in health care. York: University of York, 2009. Available from: <http://www.york.ac.uk/inst/crd/pdf/Systematic_Reviews.pdf>. Cited: May 2011.
CRESWELL, J.W. Projeto de pesquisa: métodos qualitativo, quantitativo e misto. 3.ed. Porto Alegre: Artmed, 2010.
FACHIN, G.R.B. Ontologia de referência para periódico científico digital 2011. Tese (Doutorado em Engenharia e Gestão do Conhecimento) - Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis, 2011.
FACHIN, G.R.B. et al Periódicos científicos digitais e ontologia: uma pesquisa. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA EM ONTOLOGIA NO BRASIL, 3., 2010, Florianópolis. Anais.. Florianópolis: UFSC, 2010. p.339-349.
FERNÁNDEZ-LÓPEZ, M.; GÓMEZ-PÉREZ, A.; JURISTO, N. Methontology: from ontological art towards ontological engineering. In: SPRING SYMPOSIUM ON ONTOLOGICAL ENGINEERING, 1997, Stanford. Proceedings.. Stanford: AAAI, 1997. Available from: <http://oa.upm.es/5484/1/METHONTOLOGY_.pdf>. Cited: May 2012.
FONSECA, F. The double role of ontologies in information science research. Journal of the American Society for Information Science and Technology, v.58, n.6, p.786-793, 2007.
FREITAS, L.A.; VIEIRA, R. Revisão sistemática sobre métricas para ontologias. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA EM ONTOLOGIA NO BRASIL, 3., 2010, Florianópolis. Anais.. Florianópolis: UFSC, 2010. p.331-338.
Grossman, D.A.; Frieder, O. Information retrieval: algorithms and heuristics. 2nd.ed. Dordrecht: Springer, 2004.
GRUBER, T. What is an ontology? 1996. Available from: <http://www-ksl.stanford.edu/kst/what-is-an-ontology.html>. Cited: 21 June 2010.
GUARINO, N. Formal ontology and information systems 1998. Available from: <http://www.loa-cnr.it/Papers/FOIS98.pdf>. Cited: Nov. 2010.
GUARINO, N. The basic tools of ontological analysis. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA EM ONTOLOGIA NO BRASIL, 2008, Niterói. Anais eletrônicos.. Niterói: UFF, 2008. 108p. Disponível em: <http://www.uff.br/ontologia>. Acesso em: nov. 2010.
GUÉDON, J.C. Acesso aberto e divisão entre ciência predo-minante e ciência periférica. In: FERREIRA, S.M.S.P.; TARGINO, M.G. (Org.). Acessibilidade e visibilidade de revistas científicas eletrônicas São Paulo: Senac, 2010. p.21-78.
HIGGINS, J.P.T.; GREEN, S. (Ed.). Cochrane handbook for systematic reviews of interventions: version 5.1.0. 2011. Available from: <http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/cochrane/handbook/>. Cited: May 2011.
HOESCHL, H.C. Ontoweb: a nova era das ferramentas de busca. Consultor Jurídico, 2006. Disponível em: <http://www.conjur.com.br/2006-fev-01/ontoweb_ferramentas_busca>. Acesso em: maio 2011.
KITCHENHAM, B. Procedures performing systematic review 2004. Available from: <citeseerx.ist.psu.edu/>. Cited: May 2011.
MIRANDA, A. Verbivocovisualidade das revistas no século XXI. In: FERREIRA, S.M.S.P.; TARGINO, M.G. (Org.). Acessibilidade e visibilidade de revistas científicas eletrônicas São Paulo: Senac, 2010. p.9-12.
NOY, N.F.; MCGUINNESS, D.L. Ontology development 101: a guide to creating your first ontology. 2005. Available from: <http://protege.stanford.edu/publications/ontology_development/ontology101.pdf>. Cited: May 2012.
SAMPAIO, R.F.; MANCINI, M.C. Estudos de revisão sistemática: um guia para síntese criteriosa da evidência científica. Revista Brasileira de Fisioterapia, v.11, n.1, p.83-89, 2007. Disponível em: <http://www.scielo.br>. Acesso em: maio 2011.
ZENG, M.L.; QIN, J. Metadata New York: Neal-Schuman Publishers, 2008.

Publication Dates

Publication in this collection
04 Apr 2013
Date of issue
Aug 2012

History

Received
19 Dec 2011
Accepted
23 May 2012
Reviewed
04 May 2012

This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

[1] BAEZA-YATES, R.; RIBEIRO-NETO, B. Retrieval evaluation. In: BAEZA-YATES, R.; RIBEIRO-NETO, B. Modern information retrieval. New York: Addison-Wesley, 1999. p.73-98.

[2] BELKIN, N.J. Intelligent information retrieval: whose intelligence?. 1996. Available from: <http://mariner.rutgers.edu/tipster3/iirs.html>. Cited: Apr. 2008.

[3] BERWANGER, O.; GUIMARÃES, H.P.; AVEZUM, A. Revisões sistemáticas em cardiologia 2005. Disponível em: <http://www.moreirajr.com.br/revistas.asp?id_ materia=3254&fase= imprime>. Acesso em: abr. 2011.

[4] BRÄSCHER, M.; CARLAN, E. Sistemas de organização do conhe-cimento: antigas e novas linguagens. In: ROBREDO, J.; BRÄSCHER, M. (Org.). Passeios no bosque da informação: estu-dos sobre representação e organização da informação e do conhecimento. Brasília: Ibict, 2010. cap. 8.

[5] CAMPOS, M.L.A. Aspectos semânticos da compatibilização terminológica entre ontologias no campo da bioinformática. In: ENCONTRO NACIONAL DE PESQUISA EM CIÊNCIA DA INFORMAÇÃO, 10., 2009, João Pessoa. Anais eletrônicos.. João Pessoa: ANCIB, 2009. Disponível em: <http://hdl.handle.net/123456789/477>. Acesso em: nov. 2009.

[6] CENTRE FOR REVIEWS AND DISSEMINATION. Systematic reviews: CRD's guidance for undertaking reviews in health care. York: University of York, 2009. Available from: <http://www.york.ac.uk/inst/crd/pdf/Systematic_Reviews.pdf>. Cited: May 2011.

[7] CRESWELL, J.W. Projeto de pesquisa: métodos qualitativo, quantitativo e misto. 3.ed. Porto Alegre: Artmed, 2010.

[8] FACHIN, G.R.B. Ontologia de referência para periódico científico digital 2011. Tese (Doutorado em Engenharia e Gestão do Conhecimento) - Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis, 2011.

[9] FACHIN, G.R.B. et al Periódicos científicos digitais e ontologia: uma pesquisa. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA EM ONTOLOGIA NO BRASIL, 3., 2010, Florianópolis. Anais.. Florianópolis: UFSC, 2010. p.339-349.

[10] FERNÁNDEZ-LÓPEZ, M.; GÓMEZ-PÉREZ, A.; JURISTO, N. Methontology: from ontological art towards ontological engineering. In: SPRING SYMPOSIUM ON ONTOLOGICAL ENGINEERING, 1997, Stanford. Proceedings.. Stanford: AAAI, 1997. Available from: <http://oa.upm.es/5484/1/METHONTOLOGY_.pdf>. Cited: May 2012.

[11] FONSECA, F. The double role of ontologies in information science research. Journal of the American Society for Information Science and Technology, v.58, n.6, p.786-793, 2007.

[12] FREITAS, L.A.; VIEIRA, R. Revisão sistemática sobre métricas para ontologias. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA EM ONTOLOGIA NO BRASIL, 3., 2010, Florianópolis. Anais.. Florianópolis: UFSC, 2010. p.331-338.

[13] Grossman, D.A.; Frieder, O. Information retrieval: algorithms and heuristics. 2nd.ed. Dordrecht: Springer, 2004.

[14] GRUBER, T. What is an ontology? 1996. Available from: <http://www-ksl.stanford.edu/kst/what-is-an-ontology.html>. Cited: 21 June 2010.

[15] GUARINO, N. Formal ontology and information systems 1998. Available from: <http://www.loa-cnr.it/Papers/FOIS98.pdf>. Cited: Nov. 2010.

[16] GUARINO, N. The basic tools of ontological analysis. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA EM ONTOLOGIA NO BRASIL, 2008, Niterói. Anais eletrônicos.. Niterói: UFF, 2008. 108p. Disponível em: <http://www.uff.br/ontologia>. Acesso em: nov. 2010.

[17] GUÉDON, J.C. Acesso aberto e divisão entre ciência predo-minante e ciência periférica. In: FERREIRA, S.M.S.P.; TARGINO, M.G. (Org.). Acessibilidade e visibilidade de revistas científicas eletrônicas São Paulo: Senac, 2010. p.21-78.

[18] HIGGINS, J.P.T.; GREEN, S. (Ed.). Cochrane handbook for systematic reviews of interventions: version 5.1.0. 2011. Available from: <http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/cochrane/handbook/>. Cited: May 2011.

[19] HOESCHL, H.C. Ontoweb: a nova era das ferramentas de busca. Consultor Jurídico, 2006. Disponível em: <http://www.conjur.com.br/2006-fev-01/ontoweb_ferramentas_busca>. Acesso em: maio 2011.

[20] KITCHENHAM, B. Procedures performing systematic review 2004. Available from: <citeseerx.ist.psu.edu/>. Cited: May 2011.

[21] MIRANDA, A. Verbivocovisualidade das revistas no século XXI. In: FERREIRA, S.M.S.P.; TARGINO, M.G. (Org.). Acessibilidade e visibilidade de revistas científicas eletrônicas São Paulo: Senac, 2010. p.9-12.

[22] NOY, N.F.; MCGUINNESS, D.L. Ontology development 101: a guide to creating your first ontology. 2005. Available from: <http://protege.stanford.edu/publications/ontology_development/ontology101.pdf>. Cited: May 2012.

[23] SAMPAIO, R.F.; MANCINI, M.C. Estudos de revisão sistemática: um guia para síntese criteriosa da evidência científica. Revista Brasileira de Fisioterapia, v.11, n.1, p.83-89, 2007. Disponível em: <http://www.scielo.br>. Acesso em: maio 2011.

[24] ZENG, M.L.; QIN, J. Metadata New York: Neal-Schuman Publishers, 2008.

Brasil

Brasil

A reference ontology for digital scientific journals applied to systematic literature review processes

Uma ontologia de referência para periódicos científicos digitais aplicada em processos de revisão sistemática da literatura

Abstracts

Publication Dates

History