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Inferência robusta e heterocedástica em componentes de variância, parâmetros e valores genéticos multirraciais

Robust and heteroskedastic inference in multibreed variance components, genetic parameters and breeding values

Resumos

Os objetivos neste estudo foram avaliar um modelo animal multirracial (MAMR) heterocedástico para estimar a heterogeneidade de variância residual devida à raça, à heterozigosidade, ao sexo e ao grupo de contemporâneos (GC) e a robustez a dados extremos. Foram avaliadas diferenças nas estimativas de componentes de variância, herdabilidades e valores genéticos. Foram utilizados 4.016 registros de ganho de peso pós-desmame (GPD) do rebanho de formação da raça Brangus-Ibagé da Embrapa Pecuária Sul. Os dados foram analisados por um MAMR com quatro especificações diferentes da distribuição dos resíduos, definidas pela natureza da variância residual homocedástica (HO) ou heterocedástica (HE) e pela distribuição marginal dos resíduos Gaussiana (G) ou t de Student (T). O melhor ajuste aos dados foi pelo MAMR-T-HE e foi observada heterocedasticidade devida ao sexo e à heterozigosidade dos animais e entre grupos de contemporâneos. Houve diferenças substanciais nas variâncias genéticas de grupos raciais estimadas utilizando-se diferentes modelos e nos heterocedásticos, MAMR-G-HE e MAMR-T-HE. As maiores diferenças nas estimativas de herdabilidade ocorreram entre grupos raciais diferentes. Também foram observados reordenamentos na classificação de animais superiores quanto ao mérito genético quando variâncias residuais heterogêneas e robustez a dados extremos foram consideradas. Avaliações genéticas multirraciais utilizando o modelo t de Student para descrever resíduos e assumindo variâncias residuais heterogêneas são mais apropriadas para realizar interferência no mérito genético de animais produtos de cruzamento entre as raças Angus e Nelore.

Angus; avaliação genética; bovinos de corte; cruzamento; inferência bayesiana; Nelore


The objectives of this study were to evaluate a multibreed heteroskedastic animal model (MAMR) to estimate residual variance heterogeneity due to breed, heterozigosity, sex and contemporary groups (CG) and robustness to outliers. Differences on variance components, heritability and genetic values estimates were evaluated. It was used 4,016 records of post weaning weight gain (PWG) from Brangus foundation herd of Embrapa Pecuária Sul. Data were analyzed by MAMR with four different residual distribution specifications, which were defined by the nature of residual variance, homoskedastic (HO) or Heteroskedastic (HE) and by the Gaussian (G) or Student t marginal residual distribution. The best data fit was achived by using MAMR-T-HE and it was observed heteroscedasticity due to sex and animal heterozigosity and among contemporary groups. There were substantial differences in genetic variances of breed groups estimated by using different models and in the heteroskedastic, MAMR-G-HE and MAMR-T-HE. The greatest differences on heritability estimates occured among different breed groups. It was also noted a reordering in the ranking of superior animals regarded to genetic merit when heterogenous residual variances and robustness to outliers were considered. Multibreed genetic evaluations by using the Student t distribution model to describe residuals and assuming heterogenous residual variances are more appropriate to perform inference on genetic merit of animals from crossbreeding progenies of Angus and Nelore purebred animals.

Angus; Bayesian inference; beef cattle; crossbreeding; genetic evaluation; Nelore


MELHORAMENTO, GENÉTICA E REPRODUÇÃO

Inferência robusta e heterocedástica em componentes de variância, parâmetros e valores genéticos multirraciais1 1 Pesquisa financiada pelo CNPq.

Robust and heteroskedastic inference in multibreed variance components, genetic parameters and breeding values

Mauricio Morgado de OliveiraI; Fernando Flores CardosoI, II; José Carlos da Silveira OsórioI

IDepartamento de Zootecnia/FAEM, UFPEL, Pelotas, RS. Bolsista do CNPq

IIEmbrapa Pecuária Sul, Bagé, RS

RESUMO

Os objetivos neste estudo foram avaliar um modelo animal multirracial (MAMR) heterocedástico para estimar a heterogeneidade de variância residual devida à raça, à heterozigosidade, ao sexo e ao grupo de contemporâneos (GC) e a robustez a dados extremos. Foram avaliadas diferenças nas estimativas de componentes de variância, herdabilidades e valores genéticos. Foram utilizados 4.016 registros de ganho de peso pós-desmame (GPD) do rebanho de formação da raça Brangus-Ibagé da Embrapa Pecuária Sul. Os dados foram analisados por um MAMR com quatro especificações diferentes da distribuição dos resíduos, definidas pela natureza da variância residual homocedástica (HO) ou heterocedástica (HE) e pela distribuição marginal dos resíduos Gaussiana (G) ou t de Student (T). O melhor ajuste aos dados foi pelo MAMR-T-HE e foi observada heterocedasticidade devida ao sexo e à heterozigosidade dos animais e entre grupos de contemporâneos. Houve diferenças substanciais nas variâncias genéticas de grupos raciais estimadas utilizando-se diferentes modelos e nos heterocedásticos, MAMR-G-HE e MAMR-T-HE. As maiores diferenças nas estimativas de herdabilidade ocorreram entre grupos raciais diferentes. Também foram observados reordenamentos na classificação de animais superiores quanto ao mérito genético quando variâncias residuais heterogêneas e robustez a dados extremos foram consideradas. Avaliações genéticas multirraciais utilizando o modelo t de Student para descrever resíduos e assumindo variâncias residuais heterogêneas são mais apropriadas para realizar interferência no mérito genético de animais produtos de cruzamento entre as raças Angus e Nelore.

Palavras-chave: Angus, avaliação genética, bovinos de corte, cruzamento, inferência bayesiana, Nelore

ABSTRACT

The objectives of this study were to evaluate a multibreed heteroskedastic animal model (MAMR) to estimate residual variance heterogeneity due to breed, heterozigosity, sex and contemporary groups (CG) and robustness to outliers. Differences on variance components, heritability and genetic values estimates were evaluated. It was used 4,016 records of post weaning weight gain (PWG) from Brangus foundation herd of Embrapa Pecuária Sul. Data were analyzed by MAMR with four different residual distribution specifications, which were defined by the nature of residual variance, homoskedastic (HO) or Heteroskedastic (HE) and by the Gaussian (G) or Student t marginal residual distribution. The best data fit was achived by using MAMR-T-HE and it was observed heteroscedasticity due to sex and animal heterozigosity and among contemporary groups. There were substantial differences in genetic variances of breed groups estimated by using different models and in the heteroskedastic, MAMR-G-HE and MAMR-T-HE. The greatest differences on heritability estimates occured among different breed groups. It was also noted a reordering in the ranking of superior animals regarded to genetic merit when heterogenous residual variances and robustness to outliers were considered. Multibreed genetic evaluations by using the Student t distribution model to describe residuals and assuming heterogenous residual variances are more appropriate to perform inference on genetic merit of animals from crossbreeding progenies of Angus and Nelore purebred animals.

Key Words: Angus, Bayesian inference, beef cattle, crossbreeding, genetic evaluation, Nelore

Introdução

Os ambientes de criação onde o desempenho de bovinos de corte é registrado para as avaliações genéticas têm geralmente ampla diversidade climática e de sistemas de produção. A qualidade dos dados pode ser comprometida por ocorrência de erros de registro, de tratamento preferencial e de potencial efeito de lesões ou doenças (Cardoso et al., 2005).

A utilização de modelos hierárquicos bayesianos é uma alternativa para as avaliações genéticas de populações com registros de dados caracterizados por diferentes tipos de heterogeneidade em múltiplos níveis (Sorensen & Gianola, 2002). No melhoramento animal esses modelos foram utilizados para ajustar variâncias residuais heterogêneas (Foulley et al., 1992; Gianola et al., 1992; Sancristobal et al., 1993) e avaliar robustez a dados extremos em virtude de tratamento preferencial (Stranden & Gianola, 1998; 1999). Heterocedasticidade e robustez geralmente são avaliadas isoladamente, entretanto, não há dificuldade em considerá-las concomitantemente (Kizilkaya & Tempelman, 2003; Sorensen & Waagepetersen, 2003; Kizilkaya & Tempelman, 2005), o que é especial-mente relevante uma vez que esses fatores podem estar correlacionados (Cardoso et al., 2005).

Na presença de heterocedasticidade residual, os valores genéticos de animais criados em ambientes com maior variância seriam superestimados (Carvalheiro et al., 2002), visto que os dados ajustados para os efeitos de ambiente têm menor contribuição genética do que a ponderação que lhes estaria sendo aplicada (Martins, 2002).

Os objetivos neste estudo foram aplicar um modelo animal multirracial considerando heterogeneidade de variância residual devido à raça, heterozigose, sexo e grupo de contemporâneos, e avaliar possíveis diferenças nas estimativas de componentes de variância, herdabilidade e valores genéticos de bovinos produtos do cruzamento entre as raças Angus e Nelore quando variâncias residuais heterogêneas são consideradas.

Material e Métodos

Registros de ganho de peso pós-desmame (GPD) padronizados para um período de teste de 345 dias do rebanho de formação da raça Brangus-Ibagé (3/8 Nelore - 5/8 Angus) da EMBRAPA Pecuária Sul foram analisados. A formação desse rebanho foi iniciada em 1940, mas dados de peso corporal foram registrados somente a partir de 1956, quando nasceu a primeira geração de animais 3/8 Nelore.

Foram controlados 6.499 nascimentos e realizados 110.250 registros de peso corporal ao nascer, ao desmame e mensalmente até os dois anos de idade, entre 1956 e 1979. Foram excluídos animais sem registro de peso ao desmame e, para obter o GPD dentre as múltiplas pesagens disponíveis, foram formados grupos de contemporâneos (GC) conside-rando ano e estação de nascimento, sexo e data da pesagem. Foram mantidas aquelas avaliações em que a idade média do GC estava mais próxima de 550 dias, e GC em que a idade média na data da pesagem era menor que 490 dias ou maior que 610 dias ou GC com menos de quatro animais foram eliminados. Foram ainda eliminados registro de GPD com 3,5 desvios-padrão acima da média do GC ao qual o animal pertencia, restando um subconjunto de 4.060 registros.

A conectabilidade entre grupos contemporâneos foi avaliada em função do número total de laços genéticos (mínimo 10), utilizando o programa AMC (Roso & Schenkel, 2006). Foram eliminados registros de 44 animais pertencentes a nove grupos contemporâneos. Portanto, foram utilizados para as análises 4.016 registros, havendo 4.819 animais no arquivo de pedigree. Os animais avaliados apresentaram composições raciais que variavam de Angus puro a ¼ Angus × ¾ Nelore. Todos os animais foram criados em pastejo sob condições extensivas.

Os dados foram analisados utilizando um modelo animal multirracial (MAMR):

em que: yijkl = registro de GPD do l-ésimo animal, pertencente ao i-ésimo grupo de contemporâneos, j-ésimo sexo e filho da k-ésima vaca; μ = média geral da população; gci = efeito do i-ésimo GC (i = 1, 2,..., 268), sendo gci ~ N (0, σ2gc);sexoj = efeito do j-ésimo sexo (j=1, j=2 e j=3, para macho, macho castrado e fêmea, respectivamente); βIDV e βIDV2 = respectivamente, coeficientes de regressão linear e quadrático da idade da vaca, mãe do animal l, em meses(23 d" IDVk d" 192); βA = coeficiente do efeito aditivo (A) da raça Angus, βD do efeito de dominância Nelore-Angus (D) e βAA do efeito epistático Nelore-Angus (AA); fl =proporção esperada de alelos oriundos da raça Angus no animal l; δl = coeficiente de heterozigosidade, que representa a probabilidade que um dos alelos de um locus aleatoriamente escolhido seja derivado da raça Nelore e o outro alelo seja derivado da raça Angus; 2[1-fl]fl = coeficiente epistático para o animal l baseado na definição de perdas por recombinação de Kinghorn (1980); ul = efeito genético aditivo do animal l, assumindo que em que G é a matriz de (co)variância genética multirracial (Lo et al., 1993), que é uma função do parentesco aditivo entre os animais e das variâncias genéticas aditivas específicas por raça, para Angus σ2g(1) e Nelore σ2g(2); representa os resíduos, para a qual a pressuposição sobre sua variância (σ2eijl) e sua distribuição caracteriza os distintos modelos avaliados. Assumiu-se que a variância de segregação entre as duas raças era igual a zero, σ2s(12) = 0, nesta população (Oliveira et al., 2010).

Quatro especificações diferentes da distribuição e variância dos resíduos foram consideradas em um arranjo fatorial 2 × 2, no qual o primeiro fator foi definido pela variâncias residual, homocedástica ou heterocedástica, e o segundo fator pela distribuição marginal dos resíduos, Gaussiana (G) ou t de Student (T). Os quatro modelos resultantes são apresentados em detalhes a seguir.

MAMR-T-HE: os erros foram considerados heterocedásticos e distribuídos de acordo com uma distribuição t de Student. Assumiu-se que a variância residual específica para o registro do animal l era determinada por uma função multiplicativa da variância residual global (σ2e) e fatores escalares multiplicativos específicos para GC (τGCi), sexo (τSj), proporção da raça Angus (γA) e heterozigosidade A contribuição do grupo de contemporâneos sobre a variância residual (τGCi) foi considerada uma variável aleatória com distribuição a priori τGCi~ Gama-1 (η, η_1), sendo η > 1, em que η é o parâmetro desconhecido que define a heterocedasticidade da variância residual em função do grupo contemporâneo a que pertence o animal l, uma vez que a influência do efeitoaleatório de GC na heterocedasticidade residual desaparece quando (Cardoso et al., 2005; Kizilkaya & Tempelman, 2005). A variável wl representa a ponderação específica para o registro do animal l e sua distribuição a priori foi definida como ν representa um hiperparâmetro de robustez desconhecido. Com essa especificação, a distribuição marginal dos resíduos a priori é t de Student com ν graus de liberdade (Lange & Sinsheimer, 1993; Rosa et al., 2003).

MAMR-G-HE: neste modelo o erro também foi considerado heterocedástico, entretanto, a distribuição marginal dos resíduos foi considerada Gaussiana. Assumiu-se wl = 1 para todo l, isto é, todos os registros tiveram a mesma ponderação. Por exemplo, a variância residual para um animal macho inteiro F1 do grupo de contemporâneos 2 (isto é, i = 2, j = 1, fl = 0,5, δl = 0,5 e wl = 1) foi estimada como:

MAMR-T-HO: neste modelo os erros foram considerados homocedásticos e distribuídos de acordo com uma distribuição t de Student. Neste modelo, impõe-se que e, portanto, a variância residual para o registro do animal l é homocedástica e definida por . Assim como no primeiro modelo, a variável de ponderação específica para o registro do animal l foi considerada aleatória e distribuída de acordo com

MAMR-G-HO: neste modelo assumiram-se erros Gaussianos homocedásticos, sendo e wl = 1. Assim, é a variância residual homocedástica para todo l.

Distribuições a priori uniformes finitas foram adotadas para os efeitos ambientais μ, sexoj e todos os coeficientes β*'s, bem como para os efeitos τsj, γA e γD sobre a variância residual. Para os efeitos aleatórios de gcj e u foram presumidas distribuições a priori normais com médias e variâncias conforme definidas acima na descrição do modelo. Especificações conjugadas foram adotadas como distribuições a priori para os compo-nentes de variância. As seguintes distribuições qui-quadrado invertidas escalonadas foram empregadas: para a variância devida ao efeito de grupo contemporâneo e variância aditiva, respectivamente, em que r=1 para Angus e r=2 para Nelore. Os hiperparâmetros representados por vgc, e vg(r) indicam o grau de confiança nos valores a priori dos componentes de variâncias σ2gc e σ2g(r), dados respectivamente pelos hiperparâmetros s2gc e s2g(r). Os valores adotados para os hiperparâmetros foram Como distribuição a priori da variância residual assumiu-se com ve = 1 e s2e = 350 kg2 e foi especificada uma distribuição gama a priori para o parâmetro de heterocedasticidade η com hiperparâmetros αη = 0,03 e βη = 0,01, resultando numa média a priori de Eη = 3, com variância var(η) = 300. Similarmente, foram especificadas distribuições gama a priori para o parâmetro de robustez ν, com hiperparâmetros αv = 0,04 e βv = 0,01 para os modelos em que o erro era distribuído como t de Student (MAMR-T-HO e MAMR-T-HE), tal que a média a priori foi E(v) = 4.

A variância genética de um grupo racial g2g) foi obtida pela média das variâncias raciais ponderadas pela composição racial do grupo, em que fir é a fração da raça r observada no grupo racial g.

A variância residual marginal específica para um grupo racial g2e(g)) foi estimada de acordo com as pressuposições de cada modelo, seguindo Cardoso et al. (2005). Para MAMR-G-HO tem-se σ2e(g)=σ2e; para MAMR-T-HO, para MAMR-G-HE, sendo EGCi) = 1 em todo grupo contemporâneo i e que 0,146 e 0,241 são, respectivamente, a proporção amostral de animais do sexo 1 (macho inteiro) e sexo 2 (macho castrado); para MAMR-T-HE A herdabilidade para o grupo g pode ser obtida por: .

Os valores da variância residual de referência σ2e são afetados pela parametrização do modelo estrutural e não são diretamente comparáveis entre modelos com distintas distribuições marginais dos resíduos (Cardoso et al., 2005), como os empregados no presente estudo. Portanto, calculou-se a variância residual marginal global σ2E, que representa uma estimativa do valor médio para dispersão residual adotada para todas as observações. Para os dois modelos de erro homocedástico (MAMR-G-HO e MAMR-T-HO), σ2E é idêntica para todos os grupos raciais e obtida por respectivamente. Para os modelos heterocedásticos (MAMR-G-HE e MAMR-T-HE), σ2E foi ponderada pela proporção observada de sexo do terneiro (0,146 e 0,241, respectivamente, para macho inteiro e macho castrado), pela proporção de média de genes da raça Angus esperada na população (f _ = 0,631) e pelo coeficiente médio de heterozigosidade (δ_=0,473), sendo obtida por respectivamente, para MAMR-G-HE e MAMR-T-HE.

A inferência foi baseada no método Monte Carlo via Cadeias de Markov (MCMC) de 110.000 ciclos, após 10.000 ciclos do período de descarte e as amostras foram retiradas a cada dez ciclos. Utilizou-se o programa INTERGEN (Cardoso, 2008). Médias, modas, percentis (0,025 e 0,975) e os desvios-padrão das densidades marginais a posteriori dos parâmetros foram calculados. Estimativas de correlações de Spearman entre as médias a posteriori dos efeitos genéticos aditivos de ganho de peso pós-desmame, obtidas utilizando todos os animais e somente para touros (reprodutores) em cada classe ou somente aqueles classificados nos 10% superiores de cada classe.

Para verificar o ajuste dos modelos foram utilizados o critério de informação de desvio (DIC) (Spiegelhalter et al., 2002) e ordenadas preditivas condicionais (Gelfand, 1996).

O valor de critério de informação de desvio é composto por uma medida de ajuste global, a média a posteriori do desvio e uma penalização para a complexidade do modelo. O desvio do modelo Mr, segundo Spiegelhalter et al. (2002), pode ser estimado por em que θ(c) inclui o valor amostrado para todos os parâmetros do modelo Mr no ciclo c de C ciclos totais. A complexidade do modelo Mr é determinada pelo numero efetivo de parâmetros sendo θ_a média a posteriori de θ, isto é, pD(r) representa a diferença entre a média a posteriori do desvio e o desvio calculado com a média a posteriori dos parâmetros do modelo Mr. O critério de informação de desvio para o modelo Mr é determinado por:

Menores valores do critério de informação de desvio são indicativos de melhor ajuste do modelo.

Para observação yijkl, a ordenada preditiva condicional é destinada ser a densidade de validação cruzada, que sugere quais valores de yijkl são prováveis quando o modelo Mr é ajustado a todas as outras observações y(-ijkl), exceto yijkl. Para um dado modelo Mr, as ordenadas preditivas condicionais foram obtidos pela média harmônica de C ciclos de MCMC, pela seguinte aproximação (Gelfand, 1996):

Finalmente, um estimador do desvio do modelo r baseado nas ordenadas preditivas condicionais de todas as observações foi obtido por isto é, multiplicando-se por -2 a soma dos logaritmos de todos os registros. De mesma forma que para DIC, menores valores do desvio baseado em ordenadas preditivas condicionais indicam melhor ajuste.

Resultados e Discussão

Os critérios adotados para comparar o ajuste dos modelos, o critério de informação de desvio e o desvio baseado em ordenada preditiva condicional favoreceram os modelos multirraciais heterocedásticos em detrimento aos modelos multirraciais homocedástico (Tabela 1). Com relação à avaliação da distribuição marginal dos resíduos (Gaussiana ou t de Student), os modelos com resíduos t de Student foram melhores. Dessa forma, o MAMR-T-HE foi o modelo mais adequado por ambos os critérios. Isto implica que esse modelo não somente ajusta melhor os dados conforme indicado pelo seu menor critério de informação de desvio, mas também seu menor desvio baseado em ordenadas preditivas condicionais aponta para uma melhor habilidade preditiva de dados que não fazem parte das observações. Esta última característica é particularmente relevante ao se avaliarem modelos utilizados em avaliações genéticas, uma vez que o principal objetivo é predizer fenótipos não observados, ou seja, o desempenho das futuras gerações. Esses resultados concordam com os obtidos por Cardoso et al. (2005), que aplicaram os mesmos modelos deste estudo na análise do ganho pós desmama de bovinos, produto de cruzamentos entre as raças Nelore e Hereford e concluíram que o modelo t de Student heterocedástico era o que melhor ajustava os dados.

Nos modelos robustos t de Student, os graus de liberdade ou parâmetros de robustez (v) indicam o grau de curtose da distribuição dos resíduos e quanto menores os seus valores mais leptocúrtica e de caudas mais longas são essas distribuições, ou seja, com mais valores que se afastam da média em vários múltiplos do desvio-padrão. Quando considerados desconhecidos, como no presente estudo, os graus de liberdade podem convergir para um valor infinito se a distribuição dos resíduos é normal sem dados extremos (Lange & Sinsheimer, 1993). A média a posteriori de v para o MAMR-T-HO e o MAMR-T-HE estão entre quatro e oito (Tabela 2), o que indica a presença de dados extremos com respeito à pressuposição de distribuição normal dos resíduos (Stranden & Gianola, 1998). Isso indica que modelos com distribuição residual t devem propiciar melhor ajuste aos dados.

A média ± desvio-padrão a posteriori deν neste estudo foi bastante similar aos resultados obtidos por Cardoso et al. (2005) para o modelo t de Student homocedástico de 4,79 ± 0,21 e para o modelo t de Student heterocedástico de 7,33 ± 0,48, indicando estrutura residual similar nestes dois conjuntos de dados de ganho pós-desmama. Os maiores valores de v associados aos modelos heterocedásticos em relação aos homocedásticos em ambos os estudos era esperado, pois alguns resíduos que aparecem como extremos sob especificações de erro homocedástico e contribuem para menores estimativas de v, ou seja, caudas mais longas, podem pertencer a grupo contemporâneo com maiores variâncias residuais no modelo heterocedástico. Neste caso, essas variâncias aumentadas permitem maior amplitude nos valores dos resíduos e, consequentemente, que resíduos moderadamente extremos sejam contemplados dentro da pressuposição de normalidade pela maior dispersão da distribuição (Cardoso et al., 2005).

A heterocedasticidade residual entre os grupos de contemporâneos foi ajustada no modelo pela especificação dos correspondentes efeitos escalares aleatórios τGCi e pelo parâmetro de heterocedasticidade η. Os valores observados de η apresentam evidência de heterocedasticidade entre os grupos de contemporâneos (Tabela 2), o que pode ser verificado também pelo desvio-padrão dos τGCi, que foram de 0,71 e 0,63 para MAMR-G-HE e MAMR-T-HE, respectivamente. Esses resultados são muito similares àqueles de Kizilkaya & Tempelman (2005), que estimaram a média a posteriori de desvio-padrão (τGCi) para pesos ao nascer e de escores da facilidade de parto na raça italiana Piedmontês de 0,74 ± 0,14 e 0,60 ± 0,09 para esses respectivos modelos. Resultados similares, embora com maior magnitude, também foram observados por Cardoso et al. (2005), respectivamente de 0,84 ± 0,07 e 0,72 ± 0,06. Nesses três estudos as médias a posteriori de desvio-padrão (τGCi) sob o modelo de erros gaussianos heterocedásticos foram sempre ligeiramente maiores do que aquelas estimadas pelo modelo de erros t de Student heterocedásticos. Esses resultados podem ser atribuídos à especificação de erros t de Student que atenua os efeitos residuais extremos, enquanto que a distribuição gaussiana pode resultar em estimativas da variância específica de grupo de contemporâneos inflacionadas e consequentemente maiores estimativas de desvio-padrão (τGCi) (Cardoso et al., 2005).

A variabilidade residual diminui com o aumento da proporção da raça Angus (Tabela 2), já que a média a posteriori de gA é menor que 1. Entretanto, grandes desvios-padrão foram observados. Os efeitos da heterozigosidade (gD) na heterocedasticidade residual foram mais evidentes. Determinou-se que para o modelo de erro t de Student heterocedástico, indicando que enquanto a heterozigosidade aumenta (e também a heterose), a variabilidade residual diminui. Este resultado é consistente com a teoria que a heterozigosidade pode minimizar a variação ambiental (Lerner, 1954), como relatado por outros autores (Cardoso et al., 2005).

A média a posteriori do efeito de sexo na variabilidade residual foi muito similar nos dois modelos de erro heterocedástico (Tabela 2). Os machos inteiros (τS1) apresentaram variabilidade residual quase 40% maior a que os machos castrados (τS2) e fêmeas (τS3). Esses resultados estão de acordo com os obtidos por outros pesquisadores, que concluíram que sexo é uma fonte significativa de heterocedasticidade residual para características de crescimento em gado de corte (Garrick et al., 1989; Rodriguez-Almeida et al., 1995). As diferenças entre sexos observadas neste estudo não podem ser atribuídas exclusivamente a um efeito de escala, pois os animais foram criados em condições ambientais relativamente pobres e os ganhos médios diários observados foram de 0,35 ± 0,12 kg para machos inteiros, de 0,31 ± 0,11 kg para machos castrados e 0,21 ± 0,12 kg para fêmeas. A média de ganho dos machos castrados foi mais próxima dos machos inteiros, enquanto sua variabilidade residual foi mais similar à das fêmeas (Tabela 2), contrariando a expectativa que seria um aumento da variância proporcional ao aumento da média da característica se houvesse efeito de escala.

As estimativas das médias (Tabela 3) e distribuições a posteriori (Figura 1) das variâncias genéticas de ganho de peso diário obtidas para as raças Nelore e Angus diferiram substancialmente entre os diferentes modelos. A raça Angus apresentou variância genética em média duas vezes maior que a obtida para a raça Nelore no MAMR-G-HO (Tabela 3), entretanto, para os modelos MAMR-T-HO, MAMR-G-HE e MAMR-T-HE, houve ampla sobreposição dos valores no 95% IPP (Figura 1).


O mesmo padrão de variação das estimativas das variâncias genéticas entre modelos considerando ou não robustez e heterocedasticidade também foi observado por Cardoso et al. (2005) em uma população produto do cruzamento entre as raças Nelore e Hereford. Esses autores observaram que nos modelos homocedásticos Gaussiano e t de Student a raça Hereford apresentou maior variabilidade genética, enquanto o inverso foi observado nos modelos heterocedásticos Gaussiano e t de Student, com a raça Nelore tendo maior variância genética.

As estimativas de variância residual marginal obtidas com diferentes modelos considerados apresentaram sobreposição de todos os 95% IPP e grandes diferenças entre as estimativas de variância residual dos diferentes modelos não foram observadas.

Nos modelos com homocedasticidade residual, MAMR-G-HO e MAMR-T-HO, as diferenças em herdabilidade são exclusivamente devidas à variância genética uma vez que a variância residual marginal é a mesma para todos os grupos e, portanto, as herdabilidades observadas foram crescentes com a proporção de Angus e com maiores diferenças para MAMR-G-HO (Figura 2). Nos modelos heterocedásticos, MAMR-G-HE e MAMR-T-HE, observam-se maiores diferenças de herdabilidade entre os distintos grupos raciais (Figura 2), pois, além de diferenças genéticas, estas incorporam também diferenças na variância residual devido à raça e à heterozigosidade. Assim esses modelos representam alternativas metodológicas para maximizar a eficiência das avaliações genéticas quando fenótipos de animais cruzados são utilizados, especialmente, pelo adequado ajuste da dispersão dos valores genéticos dentro de cada composição racial presente na população.


As correlações de Spearman entre os valores genéticos obtidos pelos modelos MAMR-G-HO, MAMR-T-HO, MAMR-G-HE e MAMR-T-HE foram estimadas considerando todos os animais avaliados, incluindo touros, vacas e produtos, e, separadamente, para touros que aparecem como pais de outros animais com registro de ganho de peso diário, para os animais classificados como 10% superiores de todos os animais e para os touros com progênie 10% superiores (Tabela 4). As estimativas de correlações entre todos os modelos foram altas entre os valores genéticos quando considerados todos os animais e ou todos os touros com progênie (maior ou igual a 0,970). Entretanto, quando foram incluídos nessas estimativas somente indivíduos classificados como 10% superiores, que justamente são os de maior interesse na seleção, a concordância de ordenação entre os modelos decresceu substancialmente, variando entre 0,496 e 0,948, quando incluídos animais de todas as categorias e entre -0,03 e 0,721 quando considerados somente touros com progênie.

As correlações de ordem entre MAMR-G-HE e MAMR-T-HE foram relativamente altas para todas as situações estudadas, indicando concordância entre os ordenamentos desses modelos (Tabela 4). Por outro lado, entre MAMR-G-HO e MAMR-T-HO, quando considerados animais e touros com progênie classificados nos 10% superiores, a correlação de ordem entre valores genéticos para os animais candidatos à seleção diminuiu consideravel-mente (Tabela 4). Esses últimos resultados têm maiores implicações para as avaliações genéticas e as decisões de seleção que as correlações resultantes quando são envolvidos todos os animais. As correlações para os animais superiores podem ser esperadas como mais baixas quando registros discrepantes pela distribuição gaussiana devem conduzir no MAMR-G-HO às predições mais extremas do mérito genético do animal, em relação ao MAMR-T-HO, onde as caudas longas atenuam dados extremos (Cardoso et al., 2007). Correlações relativamente baixas também foram obtidas entre MAMR-G-HO e MAMR-G-HE para os 10% melhores animais e touros com progênie, MAMR-G-HE provavelmente permitiria uma seleção mais equilibrada dos animais através dos ambientes por considerar a heterocedasticidade, visto que, quando as variâncias heterogêneas são ignoradas na modelagem estatística, uma proporção maior dos animais dos ambientes mais variáveis tende a ser classificada no extremo superior da distribuição de valores genéticos (Hill, 1984; Gianola, 1986).

Conclusões

Avaliações genéticas multirraciais assumindo variâncias residuais heterogêneas, e não normalidade de resíduos, podem ser mais apropriadas para realizar inferência quanto ao mérito genético de animais produtos de cruzamento entre as raças Angus e Nelore. A flexibilidade de modelos que consideram resíduos heterocedásticos permite estimar herdabilidades distintas para diferentes grupos raciais. Heterozigozidade e efeitos ambientais podem influenciar a variabilidade residual e consequentemente a predição de valores genéticos para ganho de peso pós desmama de animais cruzados. Assim, esses fatores devem ser considerados na estimação de componentes de variância.

Agradecimentos

À Embrapa Pecuária Sul e ao Dr. Nelson Manzoni de Oliveira, pelo fornecimento dos dados utilizados neste trabalho. Ao CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, pela concessão da bolsa de estudos.

Recebido em 8/12/2008 e aprovado em 22/4/2010.

Correspondências devem ser enviadas para: oliveira.mauricio.morgado@gmail.com

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    Pesquisa financiada pelo CNPq.
  • Datas de Publicação

    • Publicação nesta coleção
      25 Abr 2011
    • Data do Fascículo
      Abr 2011

    Histórico

    • Recebido
      08 Dez 2008
    • Aceito
      22 Abr 2010
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