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Brazilian Journal of Microbiology, Volume: 40, Número: 1, Publicado: 2009
  • Princípios e aplicações da reação em cadeia de Polimerase em áreas médicas diagnósticas: uma revisão Review

    Valones, Marcela Agne Alves; Guimarães, Rafael Lima; Brandão, Lucas André Cavalcanti; Souza, Paulo Roberto Eleutério de; Carvalho, Alessandra de Albuquerque Tavares; Crovela, Sergio

    Resumo em Português:

    O advento dos métodos moleculares tem, nos últimos anos, revolucionado a detecção e caracterização dos microorganismos em diversas áreas médicas diagnósticas, tais como virologia, micologia, parasitologia, microbiologia e odontologia. Dentre as técnicas baseadas em biologia molecular, a PCR (Polymerase Chain Reaction) trouxe enormes benefícios e desenvolvimentos científicos, se mostrando como um excelente caminho para a rápida detecção de patógenos, até mesmo aqueles de difícil cultivo. Derivada da PCR convencional, a PCR em Tempo Real se mostra como uma inovação tecnológica e vem conquistando espaço nos diagnósticos clínicos e nos laboratórios de pesquisa por apresentar a capacidade de gerar, além de resultados qualitativos, resultados quantitativos, se mostrando de forma mais rápida e precisa. Este trabalho de revisão tem por objetivo explorar a utilidade clínica da técnica de PCR convencional e em Tempo real nas diversas áreas médicas supracitadas, abrangendo seus principais usos e avanços, direcionando para o cotidiano profissional.

    Resumo em Inglês:

    Recent developments in molecular methods have revolutionized the detection and characterization of microorganisms in a broad range of medical diagnostic fields, including virology, mycology, parasitology, microbiology and dentistry. Among these methods, Polymerase Chain Reaction (PCR) has generated great benefits and allowed scientific advancements. PCR is an excellent technique for the rapid detection of pathogens, including those difficult to culture. Along with conventional PCR techniques, Real-Time PCR has emerged as a technological innovation and is playing an ever-increasing role in clinical diagnostics and research laboratories. Due to its capacity to generate both qualitative and quantitative results, Real-Time PCR is considered a fast and accurate platform. The aim of the present literature review is to explore the clinical usefulness and potential of both conventional PCR and Real-Time PCR assays in diverse medical fields, addressing its main uses and advances.
  • Purification and characterization of an extreme halothermophilic protease from a halophilic bacterium Chromohalobacter sp. TVSP101 Industrial Microbiology

    Vidyasagar, Malashetty; Prakash, S.; Mahajan, Vineet; Shouche, Yogesh S.; Sreeramulu, K.

    Resumo em Inglês:

    An extreme halophilic bacterium was isolated from solar saltern samples and identified based on biochemical tests and 16S r RNA sequencing as Chromohalobacter sp. strain TVSP101. The halophilic protease was purified using ultrafiltration, ethanol precipitation, hydrophobic interaction column chromatography and gel permeation chromatography to 180 fold with 22% yield. The molecular mass of the protease determined by SDS PAGE was 66 kDa. The purified enzyme was salt dependent for its activity and stability with an optimum of 4.5 M NaCl. The optimum temperature for maximum protease activity was 75°C. The protease was optimally active at pH 8 and retained more than 80% of its activity in the range of pH 7-10. Sucrose and glycine at 10% (w/v) were the most effective osmolytes, retained 100% activity in the absence of NaCl. The activity was completely inhibited by ZnCl2 (2 mM), 0.1% SDS and PMSF (1mM). The enzyme was not inhibited by 1mM of pepstatin, EDTA and PCMB. The protease was active and retained 100% it activity in 10% (v/v) DMSO, DMF, ethanol and acetone.
  • Produção de quitosana fungica em cultivo liquido utilisando bagaço de maçã como substrato Industrial Microbiology

    Streit, Fernanda; Koch, Fernanda; Laranjeira, Mauro C.M.; Ninow, Jorge L.

    Resumo em Português:

    Este trabalho propõe o reuso do bagaço de maçã como substrato para a produção de quitosana fúngica em cultivo liquido do fungo Gongronella butleri CCT4274. Diferentes concentrações de açúcares redutores e nitrato de sódio foram adicionadas ao extrato aquoso do bagaço de maçã. O melhor resultado foi obtido para concentrações de 40 g/L e 2,5 g/L de açúcares redutores e nitrato de sódio, respectivamente. Os resultados indicam a possibilidade de produzir 1,19 g/L de quitosana após 72,5 horas de cultivo, representando 21% da composição da biomassa.

    Resumo em Inglês:

    In this work, we propose the reuse of apple pomace as a substrate for fungal chitosan production by liquid cultivation of Gongronella butleri CCT4274. Different concentrations of reducing sugars and sodium nitrate were added to the aqueous extract of apple pomace and the best result was obtained with 40 g/L of reducing sugars and 2.5 g/L of sodium nitrate. The results indicate the possibility of producing 1.19 g/L of chitosan per liter of culture medium after 72.5 hours of cultivation, representing around 21% of the biomass content.
  • Xenobióticos aumentam a atividade de lacase em γ-Proteobacterium JB alcali-tolerante Industrial Microbiology

    Singh, Gursharan; Batish, Mona; Sharma, Prince; Capalash, Neena

    Resumo em Português:

    Vários corantes têxteis genotóxicos, xenobióticos, substratos (10 mM) e agroquímicos (100 mM/mL) foram testados quanto ao aumento da atividade de lacase em γ-Proteobacterium JB. Os corantes Neutral Red, Indigo Carmine, Naphtol Base Bordears e Sulphast Ruby aumentaram a atividade em 3,7, 2,7, 2,6 e 2,3 vezes, respectivamente. Xenobióticos/substratos como p-toluidina, 8-hidroxiquinolina e antracina aumentaram a atividade em 3,4, 2,8 e 2,3 vezes, respectivamente. Atrazina e pesticidas triciclozol aumentaram a atividade em 1,95 e 1,5 vezes, respectivamente.

    Resumo em Inglês:

    Various genotoxic textile dyes, xenobiotics, substrates (10 µM) and agrochemicals (100 µg/ml) were tested for enhancement of alkalophilic laccase activity inγ-proteobacterium JB. Neutral Red, Indigo Carmine, Naphthol Base Bordears and Sulphast Ruby dyes increased the activity by 3.7, 2.7, 2.6 and 2.3 fold respectively. Xenobiotics/substrates like p-toluidine, 8-hydroxyquinoline and anthracine increased it by 3.4, 2.8 and 2.3 fold respectively. Atrazine and trycyclozole pesticides enhanced the activityby 1.95 and 1.5 fold respectively.
  • Produção de ligninases por linhagens de fungos Basidiomicetos usando resíduos agrícolas lignocelulósicos e aplicação das enzimas na descoloração de corantes sintéticos Industrial Microbiology

    Gomes, Eleni; Aguiar, Ana Paula; Carvalho, Caio César; Bonfá, Maricy Raquel B.; Silva, Roberto da; Boscolo, Mauricio

    Resumo em Português:

    Fungos decompositores de madeira, do grupo Basidiomicetes, coletados na "Estação Ecológica do Noroeste Paulista", São José do Rio Preto, São Paulo, Brasil, pertencentes a ordem Aphyllophorales e identificados como Coriolopsis byrsina SXS16, Lentinus strigellus SXS355, Lentinus sp. SXS48, Picnoporus sanguineus SXS 43 e Phellinus rimosus SXS47 foram estudados para a produção de ligninases por FES (fermentação em estado sólido) usando farelo de trigo ou palha de arroz como meio de cultura. A espécie C. byrsina produziu a maior quantidade de lacase (200 U mL-1) enquanto que Lentinus sp. foi o melhor produtor de manganês peroxidase (MnP) e lignina peroxidase (LiP) (7 e 8 U mL-1, respectivamente), quando cultivados em meio composto por farelo de trigo. A avaliação do efeito da suplementação de nitrogênio do substrato sólido lignocelulósico (palha de arroz) indicou um aumento de 3 a 4 vezes na produção de lacase. A caracterização das enzimas mostrou que as lacases apresentaram atividade ótima em pH 3,0-3,5 e foram estáveis em pH de neutro a alcalino. O pH ótimo para atividade de MnP e LiP foi de 3,5 e entre 4,5 e 6,0, respectivamente. Todas as linhagens produziram lacase com atividade ótima a 55-60°C, enquanto as peroxidases apresentaram atividades máximas entre temperaturas de 30 e 55°C. A aplicação das soluções enzimáticas brutas, obtidas pelo cultivo das linhagens em meio de farelo de trigo, em testes de descoloração de corantes sintéticos de diferentes grupos químicos levou a mais 70% de perda de cor dos corantes RBBR e de cybacron blue 3GA, em 6h de tratamento. Os dados obtidos indicaram que as soluções enzimáticas contendo ligninases produzidas pelas linhagens de basidiomicetos estudadas promoveram a descoloração de corantes sintéticos.

    Resumo em Inglês:

    Wood rotting Basidiomycetes collected in the "Estação Ecológica do Noroeste Paulista", São José do Rio Preto, São Paulo State, Brazil, concerning Aphyllophorales order and identified as Coriolopsis byrsina SXS16, Lentinus strigellus SXS355, Lentinus sp SXS48, Picnoporus sanguineus SXS 43 and Phellinus rimosus SXS47 were tested for ligninases production by solid state fermentation (SSF) using wheat bran or rice straw as culture media. C. byrsina produced the highest laccase (200 U mL-1) and Lentinus sp produced the highest activities of manganese peroxidase (MnP) and lignin peroxidase (LiP) (7 and 8 U mL-1, respectively), when cultivated on wheat bran. The effect of N addition on enzyme production was studied in medium containing rice straw and the data showed an increase of 3 up to 4-fold in the laccase production compared to that obtained in SSF on wheat bran. The laccases presented optimum pH at 3.0-3.5 and were stable at neutral pH values. Optimum pH for MnP and LiP activities was at 3.5 and between 4.5 and 6.0, respectively. All the strains produced laccase with optimum activities between 55-60°C while the peroxidases presented maximum activity at temperatures of 30 to 55°C. The crude enzymes promoted decolorization of chemically different dyes with around 70% of decolorization of RBBR and cybacron blue 3GA in 6h of treatment. The data indicated that enzymes from these basidiomycetes strains are able to decolorize synthetic dyes.
  • Enzimas pectinolíticas constitutivas e indutíveis de Aspergillus flavipes FP-500 e sua modulação pelo pH e fonte de carbono Industrial Microbiology

    Martínez-Trujillo, Aurora; Aranda, Juan S.; Gómez-Sánchez, Carlos; Trejo-Aguilar, Blanca; Aguilar-Osorio, Guillermo

    Resumo em Português:

    Avaliou-se o crescimento e a produção de enzimas por Aspergillus flavipes FP-500 em pectina, ácido poligalacturônico, ácido galacturônico, arabinose, ramnose, xilose, glicerol e glicose, em diferentes valores de pH inicial. Verificamos que a cepa produziu exopectinases, endopectinases e pectina liases. Exopectinases e pectina liases foram produzidas em níveis basais como enzimas constitutivas e sua produção foi modulada pela fonte de carbono disponível e pelo pH do meio de cultura e estimulada pela presença de indutores no meio de cultura. Endopectinase foi indutível e produzida somente quando pectina foi utilizada como fonte de carbono. Nossos resultados sugerem que as pectinases de A. flavipes FP-500 são produzidas de forma planejada. A primeira enzima a ser produzida foi expopectinase, seguida por pectina liase e endopectinase.

    Resumo em Inglês:

    Growth and enzymes production by Aspergillus flavipes FP-500 were evaluated on pectin, polygalacturonic acid, galacturonic acid, arabinose, rhamnose, xylose, glycerol and glucose at different initial pH values. We found that the strain produced exopectinases, endopectinases and pectin lyases. Exopectinases and pectin lyase were found to be produced at basal levels as constitutive enzymes and their production was modulated by the available carbon source and pH of culture medium and stimulated by the presence of inducer in the culture medium. Endo-pectinase was basically inducible and was only produced when pectin was used as carbon source. Our results suggest that pectinases in A. flavipes FP-500 are produced in a concerted way. The first enzyme to be produced was exopectinase followed by Pectin Lyase and Endo-pectinase.
  • Desempenho de um Reator Anaeróbio Compartimentado (RAC) no tratamento da manipueira Industrial Microbiology

    Ferraz, Fernanda M.; Bruni, Aline T.; Del Bianchi, Vanildo L.

    Resumo em Português:

    O desempenho de um reator anaeróbio compartimentado (RAC) foi avaliado para o tratamento da manipueira, resíduo tóxico. Um RAC dividido em quatro compartimentos de mesmo volume (volume total 4L) e operado a 35°C foi utilizado no tratamento da manipueira. A demanda química de oxigênio (DQO) do tanque de alimentação variou de 2000 a 7000 mg L-1 e avaliou-se o tempo de residência hidráulica (TRH) mais apropriado ao melhor desempenho do reator. O RAC foi avaliado pelas análises de DQO (método colorimétrico), pH, turbidez, sólidos totais e voláteis, alcalinidade e acidez. A Análise das Componentes Principais (PCA) foi conduzida para melhor compreensão dos dados obtidos. O sistema apresentou capacidade tamponante conforme a acidez decresceu ao longo dos compartimentos ao passo que a alcalinidade e o pH aumentaram. Houve retenção do material particulado e a remoção da DQO variou de 83 a 92% para TRH de 3,5 dias.

    Resumo em Inglês:

    The performance of an anaerobic baffled reactor (ABR) was evaluated in the treatment of cassava wastewater, a pollutant residue. An ABR divided in four equal volume compartments (total volume 4L) and operated at 35°C was used in cassava wastewater treatment. Feed tank chemical oxygen demand (COD) was varied from 2000 to 7000 mg L-1 and it was evaluated the most appropriated hydraulic retention time (HRT) for the best performance on COD removal. The ABR was evaluated by analysis of COD (colorimetric method), pH, turbidity, total and volatile solids, alkalinity and acidity. Principal component analysis (PCA) was carried to better understand data obtained. The system showed buffering ability as acidity decreased along compartments while alkalinity and pH values were increased. There was particulate material retention and COD removal varied from 83 to 92% for HRT of 3.5 days.
  • Produção de protease alcalina porCellulosimicrobium cellulans Industrial Microbiology

    Ferracini-Santos, Luciana; Sato, Hélia H.

    Resumo em Português:

    Cellulosimicrobium cellulans é um microrganismo que produz uma variedade de enzimas que hidrolisam a parede celular de leveduras: β-1,3-glucanase, protease e quitinase. Células desidratadas de Saccharomyces cerevisiae foram usadas como fonte de carbono e nitrogênio para o crescimento celular e produção de protease. Os componentes do meio de cultura: KH2PO4, KOH e células de levedura desidratadas mostraram efeitos significativos (p<0,05) no planejamento experimental fracionário. Um segundo planejamento foi preparado usando dois fatores: pH e porcentagem de células de levedura desidratadas. Os resultados mostraram que o meio de cultura para a produção máxima de protease foi 0,2 g/L de MgSO4.7H2O; 2,0 g/L de (NH4)2SO4 e 8% de células de levedura desidratadas em tampão fosfato 0,15M e pH 8,0. A produção máxima de protease alcalina foi 7,0 ± 0,27 U/mL no ponto central. A protease bruta apresentou atividade ótima a 50 °C e pH 7,0-8,0; e foi estável a 50°C.

    Resumo em Inglês:

    Cellulosimicrobium cellulans is one of the microorganisms that produces a wide variety of yeast cell wall-degrading enzymes, β-1,3-glucanase, protease and chitinase. Dried cells of Saccharomyces cerevisiae were used as carbon and nitrogen source for cell growth and protease production. The medium components KH2PO4, KOH and dried yeast cells showed a significant effect (p<0.05) on the factorial fractional design. A second design was prepared using two factors: pH and percentage of dried yeast cells. The results showed that the culture medium for the maximum production of protease was 0.2 g/l of MgSO4.7H2O, 2.0 g/l of (NH4)2SO4 and 8% of dried yeast cells in 0.15M phosphate buffer at pH 8.0. The maximum alkaline protease production was 7.0 ± 0.27 U/ml over the center point. Crude protease showed best activity at 50°C and pH 7.0-8.0, and was stable at 50°C.
  • Triagem de fungos para descoloramento de melaço Industrial Microbiology

    Seyis, Isil; Subasioglu, Tugba

    Resumo em Português:

    Este estudo avaliou o descoloramento do melaço por 17 fungos em dois meios. Trichoderma viride apresentou o melhor rendimento de descoloramento (53,5%) quando cultivado a 30°C por 7 dias no meio 1, composto de melaço diluído a 40 g/L em água destilada. As outras espécies de Trichoderma e Penicillium sp apresentaram rendimento da ordem de 40-45%. O rendimento de descoloramento aumentou com a adição de peptona e extrato de levedura ao meio de produção, com exceção de Penicillium sp. A taxa de crescimento não teve relação com o descoloramento, mas o pH sim. Quando o pH diminuiu para abaixo de 5,0 depois da incubação, o rendimento de descoloramento foi maior. Embora os açúcares redutores no meio de cultura tenham diminuído com a diminuição da intensidade de cor, não houve relação entre utilização de proteína e atividade descolorizante.

    Resumo em Inglês:

    The decolorization of molasses by 17 different fungi in 2 media was studied. Trichoderma viride showed the highest decolorization yield (53.5%) when cultivated at 30°C for 7 days in Medium 1 which contained the molasses which was diluted to 40 g/L in distilled water. The other Trichoderma species and Penicillium sp. also gave similar results of 40-45%. Decolorization yield was increased by adding peptone and yeast extract to the production medium except Penicillium sp. Growth rate was not related to decolorization yet pH value was. When the pH decreased below 5.0 after the incubation, the decolorization yield increased. Although reducing sugar in culture broth decreased with decreasing color intensity, there was no connection between protein utilization and decolorizing activity.
  • Produção de glicosiltransferase por Klebsiella sp. K18 e conversão de sacarose em palatinose utilizando células imobilizadas Industrial Microbiology

    Orsi, Daniela C.; Kawaguti, Haroldo Y.; Sato, Hélia H.

    Resumo em Português:

    A linhagem Klebsiella sp. K18 produz a enzima glicosiltransferase que catalisa a conversão de sacarose em palatinose, um açúcar alternativo que apresenta baixa cariogenicidade. Metodologia de Superfície de Resposta foi empregada com sucesso para determinar a concentração ótima dos componentes do meio de cultivo. A máxima produção de glicosiltransferase (21,78 U mL-1) foi obtida utilizando o meio de cultivo otimizado composto por melaço de cana de açúcar (80 g L-1), peptona bacteriológica (7 g L-1) e extrato de levedura (20 g L-1), após 8 horas de fermentação a 28°C. A conversão de sacarose em palatinose foi estudada utilizando células imobilizadas em alginato de cálcio. Os efeitos da concentração de alginato (2-4%), concentração de massa celular (20-40%) e concentração de substrato (25-45%) foram avaliados e a porcentagem de palatinose foi de aproximadamente 62,5%.

    Resumo em Inglês:

    The strain Klebsiella sp. K18 produces the enzyme glucosyltransferase and catalyses the conversion of sucrose to palatinose, an alternative sugar that presents low cariogenicity. Response Surface Methodology was successfully employed to determine the optimal concentration of culture medium components. Maximum glucosyltransferase production (21.78 U mL-1) was achieved using the optimized medium composed by sugar cane molasses (80 g L-1), bacteriological peptone (7 g L-1) and yeast extract (20 g L-1), after 8 hours of fermentation at 28°C. The conversion of sucrose to palatinose was studied utilizing immobilized cells in calcium alginate. The effects of the alginate concentration (2-4%), cell mass concentration (20-40%) and substrate concentration (25-45%) were evaluated and the yield of palatinose was approximately 62.5%.
  • Seleção de fungos endofíticos de confrei (Symphytum officinale L.), buscando controle biológico in vitro do fitopatógeno Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) Environmental Microbiology

    Rocha, Rafaeli; Luz, Daniela Eleutério da; Engels, Cibelle; Pileggi, Sônia Alvim Veiga; Jaccoud Filho, David de Souza; Matiello, Rodrigo Rodrigues; Pileggi, Marcos

    Resumo em Português:

    O controle biológico consiste no uso de organismos que atacam outros que causam danos a culturas de plantas. Esta é uma estratégia muito utilizada no Controle Integrado de Pragas (CIP). O mofo branco, causado por Sclerotiniasclerotiorum (Lib.), causa danos em culturas de feijão. Este fungo é encontrado no solo e seus sintomas são caracterizados por lesões úmidas cobertas por micélios algodonosos, crescidos a partir do solo e/ou da planta hospedeira. Há relatos de pesquisas buscando agentes potenciais de controle biológico isolados de plantas para controlar fungos fitopatogênicos. Entre estes agentes encontram-se os microrganismos endofíticos, habitantes de espaços intercelulares de tecidos vegetais, muitas vezes responsáveis pela produção de substâncias antimicrobianas. Este trabalho teve por objetivo selecionar linhagens endofíticas isoladas de folhas de confrei (Symphytumofficinale L.), com potencial de antagonismo in vitro contra a linhagem fitopatogênica S. sclerotiorum. Doze linhagens de fungos endofíticos foram utilizadas na técnica de desafio em placa contra um isolado patogênico de S. sclerotiorum. Com o auxílio desta técnica, quatro linhagens com melhor atividade antagonística contra S. sclerotiorum foram selecionadas. Zonas de inibição no crescimento da linhagem patogênica foram consideradas como indicativo de antibiose. Foram efetuadas análises da porcentagem de elongação micelial com e sem antagonismo, mostrando resultados de 46,7% a 50,0% de redução no crescimento micelial do fitopatógeno. Estas análises consistiram de avaliações das medidas do crescimento em mm/dia das linhagens endofíticas/patogênica em testes de antagonismo.

    Resumo em Inglês:

    Biological control consists of using one organism to attack another that may cause economic damage to crops. Integrated Pest Management (IPM) is a very common strategy. The white mold produced by Sclerotiniasclerotiorum (Lib.) causes considerable damage to bean crops. This fungus is a soil inhabitant, the symptoms of which are characterized by water-soaked lesions covered by a white cottony fungal growth on the soil surface and/or the host plant. Possible biological control agents taken from plants are being investigated as phytopathogen inhibitors. These are endophytic microorganisms that inhabit the intercellular spaces of vegetal tissues and are often responsible for antimicrobial production. The objective of the present study was to select endophytic fungi isolated from comfrey (Symphytumofficinale L.) leaves with in vitro antagonist potential against the phytopathogenic fungus S. sclerotiorum. Twelve isolates of endophytic fungi and a pathogenic strain of S. sclerotiorum were used in the challenge method. With the aid of this method, four endophytes with the best antagonistic activity against S. sclerotiorum were selected. Pathogen growth inhibition zones were considered indicative of antibiosis. The percentages of pathogenic mycelia growth were measured both with and without the antagonist, resulting in growth reductions of 46.7% to 50.0% for S. sclerotiorum. These analyses were performed by evaluating the endophytic/pathogenic mycelia growth in mm/day over an eight-day period of antagonistic tests.
  • Calidion bombacis, uma nova combinação para Uredo bombacis e o relato de Bombacopsisglabra (Bombacaceae), como um novo hospedeiro no Brasil Environmental Microbiology

    Silva, Meiriele da; Soares, Dartanhã José; Barreto, Robert Weingart

    Resumo em Português:

    A combinação nova Calidion bombacis é proposta para a ferrugem anteriormente conhecida como Uredo bombacis. Esta modificação nomenclatural é proposta baseada no exame de material deste fungo coletado em um novo hospedeiro, Bombacopsisglabra (Bombacaceae) no Brasil e reexame do isotipo. Até então este fungo tinha sido relatado apenas na Ásia (China, Índia e Sri Lanka). Portanto, este é o primeiro relato deste fungo nos Neotrópicos.

    Resumo em Inglês:

    The new combination Calidion bombacis is proposed for the rust species formerly known as Uredobombacis. This nomenclatural change is based on the examination of newly collected material of this fungus from a new host, Bombacopsisglabra from Brazil, and reexamination of the isotype. Until now this fungus was only known to occur in Asia (China, India and Sri Lanka). Therefore, this is also the first record of this fungus from the Neotropics.
  • Disseminação de Metalo-β-Lactamases: triagem revela a presença do gene BLA SPM-1 em efluente hospitalar no Sul do Brasil Environmental Microbiology

    Fuentefria, Daiane Bopp; Ferreira, Alessandra Einsfeld; Gräf, Tiago; Corção, Gertrudes

    Resumo em Português:

    Ao todo, 396 isolados de Pseudomonas aeruginosa foram estudados. O gene blaSPM-1 foi encontrado em nove isolados de efluente hospitalar. Este estudo é o primeiro relato de isolados ambientais de P. aeruginosa com o gene blaSPM-1no Brasil. A resistência aos carbapenêmicos, amplamente disseminada entre isolados clínicos, já é detectada em isolados ambientais.

    Resumo em Inglês:

    Of 396 Pseudomonas aeruginosa strains isolated from hospital sewage, the blaSPM-1 gene was confirmed in nine. This is the first report of environmental P. aeruginosa strains carrying the blaSPM-1 gene in Brazil. The carbapenem resistance, already disseminated among clinical isolates, has been detected among environmental isolates.
  • Microalgas com deficiência de nitrogênio são enriquecidas com manose na superfície celular: potenciais implicações para reconhecimento de presas por protozoários fagotróficos Environmental Microbiology

    Martel, Claire M.

    Resumo em Português:

    Citometria de fluxo foi usada para quantificar a abundância de glicoconjugados com manose em precultivos de microalgas usando meios com baixo e alto teor de nitrato. Microalgas com deficiências de nitrogênio tinham mais manose na superfície celular do que as com nitrogênio suficiente. Resultados são discutidos com base nas pesquisas recentes que revelam receptores específicos para manose que auxiliam no reconhecimento da presa por protozoários fagotróficos que ingerem microalgas.

    Resumo em Inglês:

    Flow cytometry was used to quantify the abundance of mannose-linked glycoconjugates on microalgae precultured using low- or high-nitrate media. Nitrogen-deficient microalgae were richer in cell-surface mannose than nitrogen-sufficient. Findings are discussed in view of recent research which reveals mannose-specific 'feeding receptors' assist prey biorecognition by phagotrophic protozoa that ingest microalgae.
  • Comunidades de leveduras em dois fragmentos de Mata Atlântica no sudeste do Brasil Environmental Microbiology

    Pimenta, Raphael S.; Alves, Priscila D. D.; Almeida, Gabriel M. F.; Silva, Juliana F.M; Morais, Paula B.; Corrêa Jr., Ary; Rosa, Carlos A.

    Resumo em Português:

    O objetivo deste trabalho foi estudar as comunidades de leveduras associadas a frutos, cogumelos, exudatos de árvores e moscas do gênero Drosophila, em dois fragmentos de Mata Atlântica no Estado de Minas Gerais, Brasil. Foram coletadas 456 amostras no Parque Estadual do Rio Doce e 142 na Estação Ecológica da Universidade Federal de Minas Gerais. Destas amostras foram obtidas 608 isolados de levedura, distribuídas em 71 espécies. Entre os isolados obtidos a partir do Parque Estadual do Rio Doce, 17 foram provenientes de frutos, 12 de cogumelos, 13 de exudatos de árvores e 299 de Drosophila spp. A Estação Ecológica da Universidade Federal de Minas Gerais possibilitou a obtenção de 24 isolados de frutos e 243 de Drosophila spp. Foram observadas comunidades distintas de leveduras associadas a Drosophila, frutos, cogumelos e exudatos de árvores. O maior número de espécies foi obtido em drosófilas, sugerindo que estas moscas são vetores naturais destes microrganismos.

    Resumo em Inglês:

    We studied the yeast communities associated with fruits, mushrooms, tree exudates, and flies of the genus Drosophila, in two Atlantic Rain Forest fragments in state of Minas Gerais, Brazil. A total of 456 samples were collected from Rio Doce State Park and 142 from Ecological Station of Universidade Federal de Minas Gerais. From these samples, 608 yeast isolates were obtained, belonging to 71 different species. Among the yeasts isolated from Rio Doce State Park, 17 isolates were recovered from fruits, 12 from mushrooms, 13 from tree exudates, and 299 from Drosophila spp. In the Ecological Station of Universidade Federal de Minas Gerais, 24 isolates were recovered from fruits and 243 from Drosophila spp. Distinct communities of yeast were observed in Drosophila flies, fruits, mushrooms and tree exudates. The highest number of yeast species was recovered from Drosophila flies suggesting that flies are the natural vectors of these microorganisms.
  • Predomínio da morfologia tipo-Paris em talo de Lunularia cruciata colonizado por Glomus proliferum Environmental Microbiology

    Fonseca, Henrique M.A.C.; Ferreira, Joana I.L.; Berbara, Ricardo L.L.; Zatorre, Natalia P.

    Resumo em Português:

    Observações de microscopia ótica confirmam que L. cruciata colonizada por G. proliferum apresenta caracteres anatomicos (arbúsculos, hifas novelas, arbúsculos enovelados e vesículas) geralmente associadas a raízes micorrízicas arbusculares em que o micélio intra-tálico apresenta uma anatomia predominantemente do tipo Paris. L. cruciata colonizada apresentou redução de biomassa quando comparada com plantas axenicas, sugerindo dreno de recursos para o fungo e consequente redução de nutrientes necessários para o ótimo crescimento da planta. O comportamento do talo-colonizado em relação à disponibilidade de KH2PO4 no meio indica que o limiar de stress nutricional para fósforo se encontra acima do somatório das quantidades residuais deste elemento presentes no PhytagelTM e no inóculo. Os resultados aqui discutidos sugerem a possibilidade de, em certas circunstâncias, a relação entre L. cruciata e G. proliferum ter características de parasitismo e não de simbiose, abrindo novas perspectivas para futuros estudos na determinação da natureza da relação hepática-fungo arbuscular.

    Resumo em Inglês:

    Microscopic evidence confirms that L. cruciata hosting G. proliferum shows major anatomical traits (arbuscules, coils, arbusculate coils and vesicles) generally associated arbuscular mycorrhizal roots and the anatomical morphology of intra-thalli mycelium is predominantly of the Paris-type. Colonised L. cruciata showed a reduction of biomass when compared with axenic plants suggesting a drain of resources towards the fungus and depletion of nutrients required for optimum plant growth. The behaviour of mycothalli regarding available KH2PO4 indicates that the nutritional stress threshold for phosphorus (P) is above the residual amount of P already present in PhytagelTM and in plant inoculum. These raise the possibility that in certain circumstances the relationship between L. cruciata and G. proliferum be parasitic rather than symbiotic and open the door for future studies to ascertain the nature of liverwort-AM fungi relationships.
  • Estudo longitudinal da ocorrência de adenovírus e vírus da hepatite A em esgoto doméstico na cidade de Limeira, SP Environmental Microbiology

    Barrella, Karina Medici; Garrafa, Patrícia; Monezi, Telma Alves; Hársi, Charlotte Marianna; Salvi, Cleber; Violante, Paula Alessandra B. Costa; Mehnert, Dolores Ursula

    Resumo em Português:

    O objetivo do estudo foi verificar a ocorrência e a distribuição anual de adenovírus humanos e vírus da Hepatite A (VHA) no efluente doméstico da cidade de Limeira, São Paulo, ao longo do período de Dezembro de 2004 e Dezembro de 2005, com vistas à futura implementação de sistemas de tratmento de água de esgoto. Cinquenta amostras de efluente bruto com volume de 8L cada foram colhidas semanalmente e os vírus concentrados por filtração em membrana eletropositiva ZP60S, seguida de ultracentrifugação. Adenovírus foram detectados por PCR e nested-PCR. Adenovírus da espécie F foram distinguidos das demais por restrição do produto da PCR com endonuclease TaqI. Ensaios de infectividade viral foram realizados em culturas de células HEp-2. A presença do vírus da hepatite A também foi pesquisada nas mesmas amostras, fazendo-se uso de método de RT-PCR. Adenovírus foram detectados em todas as amostras, sendo a espécie F identificada em 82% destas. Sessenta e quatro por cento dos adenovírus detectados ainda estavam infecciosos. O vírus da Hepatite A foi detectado em 48% das amostras examinadas. Estes resultados evidenciam a presença e a circulação de Adenovírus humano e VHA nas águas de esgoto doméstico de Limeira ao longo do período de estudo, demonstrando a importância de um tratamento adequado desse material antes da disposição no meio ambiente.

    Resumo em Inglês:

    The aim of this study was to verify the presence and annual distribution of adenoviruses and hepatitis A virus in domestic sewage in the city of Limeira, São Paulo. Fifty samples with a volume of 8 liters each were collected weekly from December 2004 to December 2005. The viruses were concentrated by filtration through positively charged ZP60S filter membranes, followed by ultracentrifugation. Human adenoviruses (HAdV) were detected by PCR followed by nested-PCR and screening for species F was done by restriction of the PCR product with TaqI endonuclease. Virus infectivity assays were performed by inoculation of concentrates onto HEp-2 cell monolayers. RT-PCR was used for the detection of hepatitis A virus. HAdV were detected in all samples, and 64% of samples were positive for infectious virus. Species F was present in 82% of the samples. Hepatitis A virus was detected in 48% of the samples. These results demonstrate that HAdV and HAV were present in the domestic sewage of Limeira throughout the period of study, demonstrating the importance of an adequate treatment before the disposal in the environment.
  • Leveduras micocinogênicas inibem o crescimento do fitopatógeno Moniliophthora perniciosa, o agente causador da doença Vassoura-de-bruxa Environmental Microbiology

    Cabral, Anderson de Souza; Carvalho, Patricia Maria Barroso de; Pinotti, Tatiana; Hagler, Allen Norton; Mendonça-Hagler, Leda Cristina Santana; Macrae, Andrew

    Resumo em Português:

    Leveduras de frutas e de solo isoladas da Floresta Amazônica, Mata Atlântica e de uma fazenda orgânica foram selecionadas em uma triagem para atividade micocinogênica. As estirpes micocinogênicas foram posteriormente testadas frente a Moniliophthora perniciosa (syn. Crinipellis perniciosa). Uma estirpe de Dipodascus capitatus e outra de Candida sp.inibiram o crescimento deste fitopatógeno.

    Resumo em Inglês:

    Fruit and soil yeasts isolated from the Amazon, Atlantic Rainforests and an organic farm were screened for killer activity against yeasts. Killer yeasts were then tested against the phytopathogen Moniliophthora perniciosa (syn. Crinipellis perniciosa) and a Dipodascus capitatus strain and a Candida sp strain inhibited its growth.
  • Ocorrência e diversidade de fungos micorrízicos arbuculares em culturas armadilhas de solos sob diferentes sistema de uso na Amazônia, Brasil Environmental Microbiology

    Leal, Patrícia Lopes; Stürmer, Sidney Luiz; Siqueira, José Oswaldo

    Resumo em Português:

    O objetivo deste trabalho foi avaliar a ocorrência de espécies de fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) em amostras de solos da região Amazônica sob diferentes sistemas de uso da terra (Floresta, Capoeira Velha, Capoeira Nova, Sistema Agroflorestal, Culturas e Pastagens) usando dois métodos de culturas armadilhas. Culturas armadilhas estabelecidas com Sorghum sudanense e Vigna unguiculata (na Universidade Regional de Blumenau - FURB) e Brachiaria decumbens e Neonotonia wightii (na Universidade Federal de Lavras - UFLA) foram cultivadas por 150 dias em condições de casa-de-vegetação e avaliadas para o número de esporos e identificação das espécies. Uma grande variação na riqueza de espécies foi detectada em várias amostras, independente do sistema de uso da terra de onde as amostras foram obtidas. Um total de 24 espécies de FMAs foram recuperadas usando ambas metodologias de culturas armadilhas e as culturas estabelecidas na FURB produziram um número maior de espécies. Acaulospora delicata, A. foveata, Entrophospora colombiana e duas espécies não descritas de Glomus foram as espécies mais abundantes e freqüentes recuperadas das culturas armadilhas. O número de espécies diminui em cada gênero na seguinte ordem: Acaulospora, Glomus, Entrophospora, Gigaspora, Archaeospora, Scutellospora e Paraglomus. Número de esporos foi maior na Capoeira jovem e Pastagens. Nosso estudo demonstrou que os FMAs possuem uma ampla dispersão em todos os sistemas de uso na Amazônia e que eles esporulam mais abundantemente em culturas armadilhas estabelecidas de solos sob interferência antrópica do que em solos de Floresta nativa.

    Resumo em Inglês:

    The aim of this work was to evaluate the occurrence of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) species diversity in soil samples from the Amazon region under distinct land use systems (Forest, Old Secondary Forest, Young Secondary Forest, Agroforestry systems, Crops and Pasture) using two distinct trap cultures. Traps established using Sorghum sudanense and Vigna unguiculata (at Universidade Regional de Blumenau - FURB) and Brachiaria decumbens and Neonotonia wightii (at Universidade Federal de Lavras - UFLA) were grown for 150 days in greenhouse conditions, when spore density and species identification were evaluated. A great variation on species richness was detected in several samples, regardless of the land use systems from where samples were obtained. A total number of 24 AMF species were recovered using both methods of trap cultures, with FURB';s traps yielding higher number of species. Acaulospora delicata, A. foveata, Entrophospora colombiana and two undescribed Glomus species were the most abundant and frequent species recovered from the traps. Number of species decreased in each genus according to this order: Acaulospora, Glomus, Entrophospora, Gigaspora, Archaeospora, Scutellospora and Paraglomus. Spore numbers were higher in Young Secondary Forest and Pastures. Our study demonstrated that AMF have a widespread occurrence in all land use systems in Amazon and they sporulate more abundantly in trap cultures from land uses under interference than in the pristine Forest ecosystem.
  • Nova metodologia de armazenamento do latex de mamão sem degradação viral Food Microbiology

    Rodrigues, Silas P.; Andrade, Josemar S.; Ventura, José A.; Fernandes, Patricia M. B.

    Resumo em Português:

    Papaya meleira virus (PMeV) é o agente etiológico da meleira do mamoeiro (Carica papaya L.), cujo diagnóstico é feito através da detecção do RNA dupla-fita (dsRNA) viral a partir do látex das plantas. Neste trabalho é demonstrado que o dsRNA do PMeV é protegido durante 25 dias quando diluído em tampão citrato pH 5.0 (1:1 v/v) seguido de armazenamento à -20°C. Nesta mesma temperatura, o dsRNA foi parcialmente protegido quando o látex foi diluído em água ultra-pura ou mantido puro. Ao contrário, quando as amostras foram mantidas à 25°C, observou-se uma degradação progressiva do dsRNA, com ausência de bandas após 25 dias, indicando a necessidade do congelamento do látex. Os procedimentos de coleta e armazenamento do látex descritos neste trabalho contribuem para a eficiência e uso em larga escala do diagnóstico molecular do PMeV.

    Resumo em Inglês:

    Papaya meleira virus (PMeV) is the causal agent of papaya (Carica papaya L.) sticky disease, which has been detected through analysis of its double-stranded RNA (dsRNA) genome from plant latex. In this work we demonstrate that PMeV dsRNA is protected during 25 days when latex is diluted in citrate buffer pH 5.0 (1:1 v/v) and maintained at -20°C. At the same temperature, some protection was observed for pure latex or latex diluted in ultra-pure water. Conversely, the dsRNA was almost completely degraded after 25 days when maintained at 25°C, indicating the need for freezing. The proper procedures to collect and store papaya latex described here will contribute to efficient and large scale use of molecular diagnosis of PMeV.
  • Perfil de resistência antimicrobiana de Enterococcusspp isolados de alimentos no Sul do Brasil Food Microbiology

    Riboldi, Gustavo Pelicioli; Frazzon, Jeverson; d'Azevedo, Pedro Alves; Frazzon, Ana Paula Guedes

    Resumo em Português:

    Cinqüenta e seis cepas de Enterococcus spp. foram isoladas de alimentos no Sul do Brasil, confirmados por PCR e classificadas como Enterococcus faecalis (27), Enterococcus faecium (23) e Enterococcus spp. (6). Testes de susceptibilidade aos antimicrobianos demonstraram fenótipos de resistência a uma gama de antibióticos administrados em humanos, como gentamicina, estreptomicina, ampicilina e vancomicina.

    Resumo em Inglês:

    Fifty-six Enterococcus spp. strains were isolated from foods in Southern Brazil, confirmed by PCR and classified as Enterococcus faecalis (27), Enterococcus faecium (23) and Enterococcus spp(6). Antimicrobial susceptibility tests showed resistance phenotypes to a range of antibiotics widely administrated in humans such as gentamycin, streptomycin, ampicillin and vancomycin.
  • Viabilidade de Staphylococcus xylosus isoladas de embutidos artesanais para aplicação como cultivos iniciadores em produtos cárneos Food Microbiology

    Fiorentini, Ângela Maria; Sawitzki, Maristela Cortez; Bertol, Teresinha Marisa; Sant'Anna, Ernani S.

    Resumo em Português:

    Investigamos a viabilidade de cepas de Staphylococcus xylosus (AD1 e U5) isoladas de embutidos com fermentação natural, para aplicação como cultivos iniciadores em embutidos fermentados produzidos na Região Sul do Brasil. O estudo demonstrou que cepas de Staphylococcus xylosus (AD1 e U5) apresentaram crescimento significativo durante a fermentação, estabilidade no processo de liofilização e conservação, ausência de produção de enterotoxinas e viabilidade para aplicação como cultivo iniciador simples ou associado com bactérias lácticas na elaboração de embutidos fermentados.

    Resumo em Inglês:

    Viability of Staphylococcus xylosus isolated from artisanal sausages for application as starter cultures in meat products Viability of Staphylococcus xylosus strains AD1 and U5isolated from natural fermented sausages was investigated as starter cultures in fermented sausages produced in the South Region of Brazil. The study demonstrated that the Staphylococcus xylosus strains AD1 and U5showed significant growth during fermentation, stability over freeze-dried process, negative reaction for staphylococcal enterotoxins and viability for using as a single-strain culture or associated with lactic acid bacteria for production of fermented sausages.
  • Detecção de Fusarium verticillioides produtor de fumonisina em arroz empregando reação de polimerase em cadeia Food Microbiology

    Maheshwar, P.K.; Moharram, S. Ahmed; Janardhana, G.R.

    Resumo em Português:

    O estudo relata a ocorrência de Fusarium verticillioides produtor de fumonisina em 90 amostras de arroz armazenado, coletado de diferentes regiões geográficas de Karnataka, Índia. F. verticillioides produtor de fumonisina foi identificado baseado em características micromorfológicas e PCR empregando dois sets de primers. Um dos sets era F. verticillioides especie-específico, que amplificava seletivamente a região do espaço intergênico do rDNA. O outro set de primers era especifico para F. verticillioides produtor de fumonisina. Oito amostras de arroz foram positivas para F. verticillioides. Onze isolados obtidos dessas amostras foram produtores de fumonisina.

    Resumo em Inglês:

    The study reports the occurrence of fumonisin producing Fusarium verticillioides in 90 samples of stored paddy (Oryza sativa L.)collected from different geographical regions ofKarnataka, India. Fumonisin producing F. verticillioides was identified based on micromorphological characteristics and PCR using two sets of primers. One set of primers was F. verticillioides species specific, which selectively amplified the intergenic space region of rDNA. The other set of primers was specific to fumonisin producing F. verticillioides. Eight paddy samples were positive for F. verticillioides. Eleven isolates obtained from these samples were capable of producing fumonisin.
  • Alterações nutricionais em pimenta vermelha em pó após infecção in vitro com Aspergillus flavus Food Microbiology

    Tripathi, Smita; Mishra, H.N.

    Resumo em Português:

    Foram avaliadas as perdas de vários constituintes bioquímicos como capsaicina, carotenos, acido ascórbico, polifenóis, matéria orgânica, açucares (solúveis e insolúveis), proteína e gordura em pimenta vermelha em pó após a multiplicação de Aspergillus flavus por 30 dias. A biomassa fúngica foi mensurada pelo conteúdo de ergosterol e aflatoxina por HPLC. Entre os vários constituintes avaliados, a maior perda foi a de carotenóides totais (88,55%), seguido de açucares totais (85,5%). O conteúdo protéico da amostra infectada aumentou de 18,01% para 23%. O perfil nutricional da pimenta em pó (Capsicum annum var. sannam L.) indica alto teor de açucares totais (32,89%) e fibras (21,05%), seguido de proteína (18,01%) e gordura (13,32%), tornando-a um substrato ideal para crescimento de fungos. Ao final dos 30 dias, a biomassa fúngica foi 192,25 mg/100g, a contagem total em placas foi 17,5 x 10(4) CFU/g e o conteúdo de aflatoxina B1 foi 30,06 µg/kg.

    Resumo em Inglês:

    Quantitative losses in various biochemical constituents like capsaicin, carotenes, ascorbic acid, polyphenols, mineral matter, sugars (soluble and insoluble), protein and fat were estimated after the successful growth of Aspergillus flavus for 30 days on powdered red pepper. The fungal biomass was measured by ergosterol content and Aflatoxin B1 by HPLC. Amongst the various nutritional constituents evaluated for nutritional losses and changes the highest nutritional loss was reported in total carotenoids (88.55%) followed by total sugars (85.5%). The protein content of the infected sample increased from 18.01% to 23%. The nutritional profile of chilli powder (Capsicum annum var. sannam L.) shows highest share of total soluble sugars (32.89%) and fiber content (21.05%), followed by protein (18.01%) and fat (13.32%) making it an ideal solid - substrate for mould growth. At the end of incubation the fungal biomass was 192. 25 mg / 100 gram powder, total plate count 17.5 X 10 4 CFU/g and Aflatoxin B1 content was 30.06 µg / kg.
  • Ocorrência de Staphylococcus aureus e detecção por PCR multiplex de genes de enterotoxinas clássicas em queijo e derivados cárneos Food Microbiology

    Pelisser, Marcia Regina; Klein, Cátia Silene; Ascoli, Kelen Regina; Zotti, Thaís Regina; Arisi, Ana Carolina Maisonnave

    Resumo em Português:

    PCR multiplex foi empregado para investigar a presença de genes de enterotoxinas estafilocócicas (sea, seb, sec, sed e see) e do gene femA, específico para S.aureus, em cepas de estafilococos coagulase positiva (ECP) isoladas de queijos e derivados cárneos. De 102 cepas, 91 foram positivas para femA, 10 para sea, 12 para sed e 4 para see.

    Resumo em Inglês:

    Multiplex PCR was used to investigate the presence of enterotoxins genes (sea, seb, sec, sed and see) and femA gene (specific for Staphylococcus aureus) in coagulase-positive staphylococci (CPS) isolated from cheese and meat products. From 102 CPS isolates, 91 were positive for femA, 10 for sea, 12 for sed and four for see.
  • Validação de um modelo preditivo para descrever o crescimento de Salmonella em dietas enterais Food Microbiology

    Silva, Roberta Ribeiro; Moraes, Célia Alencar; Bessan, Josefina; Vanetti, Maria Cristina Dantas

    Resumo em Português:

    O crescimento de Salmonella enterica subs. enterica sorovar Typhimurium a 25°C foi determinado em dietas enterais industrializadas e formuladas em hospital e os resultados obtidos foram usados para validar um modelo matemático de crescimento de Salmonella apresentado no Programa de Modelagem de Patógenos (PMP), versão 7,0 (USDA-EUA). O tempo de geração de Salmonella em dietas enterais variou de 21 a 34,8 min e a velocidade específica máxima de crescimento (µmax) foi de 1,28 a 1,95 h-1, resultando em aumento de 5 a 6 ciclos logarítimos em um período de 14 a 24 h de incubação. O crescimento foi mais rápido na dieta formulada em hospital contendo vegetais e ovos. Os parâmetros cinéticos como fase lag, µmax e densidade populacional máxima (MDP) foram similares aqueles previstos no PMP 7.0, com exceção da fase lag em dietas enteral com pH 6,3. Os resultados deste estudo validaram o modelo do PMP 7,0 para descrever o crescimento de Salmonella em dietas enterais e demonstraram a propriedade desse modelo para determinar o comportamento do patógeno em uma variedade de condições nesse tipo de alimento.

    Resumo em Inglês:

    The growth of Salmonella enterica subs. enterica sorovar Typhimurium at 25°C was monitored in industrialized and hospital formulated enteral feeds and the results were used to validate the mathematical model of Salmonella growth presented by the Pathogen Modeling Program (PMP) 7.0 (USDA-USA). The generation time of Salmonella in enteral feeds ranged from 21 to 34.8 min and, the maximum growth rate (µmax) varied from 1.28 to 1.95 h-1, resulting in a population increase from 5 to 6 log10 cycles within 14 to 24 h incubation. Growth was faster in the hospital formulated feed containing vegetables and eggs. The growth kinetic's parameters as lag phase; µmax and maximum population density (MPD) were similar to those predicted by the PMP 7.0, with exception of lag phase in enteral diet at pH 6.3. The results of this study validated the PMP 7.0 model for describe Salmonella growth in enteral feeds and demonstrates the appropriateness of use such model to determine the pathogen behavior in a wide range of storage conditions in this food.
  • Infecções hospitalares em pacientes infectados com HIV-1 e com AIDS: principais microrganismos e perfil imunológico Medical Microbiology

    Panis, C.; Matsuo, T.; Reiche, E.M.V.

    Resumo em Português:

    Avanços na terapia anti-retroviral têm proporcionado aos pacientes com AIDS um aumento na sobrevida. Ao mesmo tempo, a permanência de pacientes soropositivos no ambiente nosocomial torna-se comum não só pelos efeitos colaterais desta terapia, mas também pelas diversas doenças oportunistas que acometem estes indivíduos dentro e fora do ambiente hospitalar. Durante o período de internação, a fragilidade do sistema imunológico é exposta à virulência da microbiota nosocomial, adquirindo infecções hospitalares graves e muitas vezes fatais. Dentre as diversas síndromes de infecções hospitalares descritas, pouco se sabe sobre estas infecções em pacientes imunocomprometidos e sobre como o estado imunológico é capaz de determinar o curso destas infecções. Este trabalho teve como objetivo determinar os principais microrganismos envolvidos nas infecções hospitalares de pacientes soropositivos para a infecção pelo HIV-1 e descrever a associação com seu perfil imunológico. Realizou-se análise de dados de notificações do Serviço de Controle de Infecção Hospitalar do Hospital Universitário, Londrina, Paraná, na região sul do Brasil, no período de julho de 2003 a julho de 2004. Do total de casos estudados (n=969), 24 pacientes (2,5%) tinham o diagnóstico de AIDS, sendo metade do gênero feminino, com contagem média de células T CD4+ de 158,4/mm³. A principal topografia foi o sítio pulmonar (50,0%), sendo Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa e Escherichia coli os principais microrganismos isolados. Observou-se maior incidência de infecção em pacientes com contagem de células T CD4+ menor que 50/mm³. O estudo da relação entre sistema imunológico e microrganismos causadores de infecções poderá contribuir para melhorias nos cuidados de pacientes com AIDS e avanços nos sistemas de controle de infecção hospitalar.

    Resumo em Inglês:

    Antiretroviral therapy advances have proportioned to AIDS patients a survival increase. At the same time, the permanence of the seropositive people in the nosocomial environment becomes common not only by the adverse reactions caused by this therapy, but also by several opportunistic diseases that take them into and out of hospital environment. During the hospital permanence, the patients expose their impaired immune system to the nosocomial virulent microorganisms, and acquire destructive nosocomial infections that sometimes can be lethal. Among several hospital syndromes described, little is known about infections in immunocompromised patients and how their immune system is able to determine the course of the infection. The objective of this study was to describe the major microorganisms involved in the nosocomial infections of HIV-1 seropositive patients associated with their immunological status. The survey was carried out with the Hospital Infection Control Service records, from University Hospital, Londrina, Paraná, Southern of Brazil, during the period from July 2003 to July 2004. From all the cases studied (n=969), 24 patients (2.5%) had AIDS diagnosis and a half of them was women with the mean of CD4+ T cells counts of 158/mm³. The main topography of the infection was pulmonary (50.0%) and the main isolated microorganisms were Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli. A major incidence of infection was observed in patients with CD4+ T cells counts lower than 50/mm³. The study of the relationship between the impairment of the immune system and infectious agents could provide a better healthcare of people living with HIV/AIDS and advances into the nosocomial infection control systems.
  • Teste de suscetibilidade de Candida albicans isoladas da mucosa orofaringeana de pacientes HIV+, ao fluconazol, anfotericcina B e caspofungina: cinética de morte de caspofungina e anfotericina B contra isolados fluconazol resistentes e suscetíveis Medical Microbiology

    Lemos, Janine de Aquino; Costa, Carolina Rodrigues; Araújo, Crystiane Rodrigues de; Souza, Lúcia Kioko Hasimoto e; Silva, Maria do Rosário Rodrigues

    Resumo em Português:

    Um claro entendimento das propriedades farmacodinâmicas dos agentes antifúngicos é de grande importância para o adequado tratamento das infecções fúngicas como a candidíase. Em alguns casos de escolha do agente antifúngico, a determinação da concentração fungicida minima (CFM) e a curva do tempo de morte podem ser mais clinicamente relevantes do que a concentração inibitória minima (CIM). Nesse estudo, foi avaliado a CIM e a CFM de fluconazol, anfotericina B e caspofungina em Candida albicans e ainda os padrões de morte obtidos com caspofungina e anfotericina B de isolados suscetíveis e resistentes ao fluconazol. Os resultados de CIM mostraram que todos os isolados de Candida albicans foram altamente suscetíveis à anfotericina B, entretanto dois isolados foram fluconazol resistentes. A análise comparativa de CIM e da CFM mostrou que o CFM de fluconazol foi quatro vezes superior à CIM para 41,9% dos isolados de Candida albicans. Valores iguais de CFM e CIM de anfotericina B e caspofungina foram encontrados para 71% dos isolados. Correlação entre a curva do tempo de morte e a CFM de anfotericina B e caspofungina contra quatro isolados testados foi observada. O efeito de morte de caspofungina foi mais evidente na CFM até 6 horas de incubação do que na CIM nesse mesmo tempo, sugerindo a dependência da concentração. A similaridade dos resultados da curva do tempo de morte e os valores de CFM indicam que a determinação da CFM é uma escolha alternativa na detecção da atividade fungicida destes agentes antifúngicos.

    Resumo em Inglês:

    A clear understanding of the pharmacodynamic properties of antifungal agents is important for the adequate treatment of fungal infections like candidiasis. For certain antifungal agents, the determination of Minimal Fungicidal Concentration (MFC) and time kill curve could be clinically more relevant than the determination of the Minimal Inhibitory Concentration (MIC). In this study, MIC and MFC to fluconazole, amphotericin B and caspofungin against C. albicans isolates and the killing patterns obtained with caspofungin and amphotericin B against susceptible and resistant strains to fluconazole were determined. The results of MICs showed that all C. albicans isolates were highly susceptible to amphotericin B, but two isolates were fluconazole resistant. The comparative analysis between MIC and MFC showed that MFC of fluconazole was fourfold higher than MIC in 41.9% of the C. albicans isolates. Same values of MFC and MIC of amphotericin B and caspofungin were found for 71% of the isolates. Correlation between time kill curves and MFC of amphotericin B and caspofungin against all 4 isolates tested was observed. The caspofungin killing effect was more evident at MFC in 6 hours of incubation than at MIC in this time, suggesting dependence of concentration. The similarity of results of time-kill curve and MFC values indicate that determination of MFC is an alternative for the detection of the fungicidal activity of these drugs.
  • Investigação de um surto de Salmonella Typhi no distrito de Battalgazi, Malatya, Turquia Medical Microbiology

    Iseri, Latife; Bayraktar, Mehmet Refik; Aktaş, Elif; Durmaz, Riza

    Resumo em Português:

    As infecções por Salmonella Typhi são problemas importantes de saúde pública em países em desenvolvimento. Neste estudo, investigamos a epidemiologia molecular de surto de Salmonella Typhi, supostamente causado por água de poço, ocorrido no distrito de Battalgazi, Malatya, Turquia. Este surto afetou 10 pessoas em dois dias. A tipagem por AP-PCR (arbitrary primed polimerase chain reaction) indicou dois clones, um com sete isolados e outro com três isolados. Com a adição de cloro aos poços pelas autoridades locais, o surto terminou rapidamente (em dez dias).

    Resumo em Inglês:

    Salmonella Typhi infections are important public health problems for the developing countries. In this study we investigated the molecular epidemiology of a suspected well-water borne S. Typhi outbreak occurred in a district of Malatya-Turkey. This outbreak affected 10 patients in two days. Arbitrary primed polymerase chain reaction (AP-PCR) based typing showed two clones, one had seven, and the other had three strains, supporting outbreak speculation. By adding chlorine to wells by local municipal authority, the outbreak ended within a very short time (about ten days).
  • Influência do comprimento do material obturador remanescente no canal radicular e preparo do espaço protético na infiltração coronária do Enterococcus Faecalis Medical Microbiology

    Mozini, Alexandra Conca Alves; Vansan, Luis P.; Sousa Neto, Manoel D.; Pietro, Rosimeire

    Resumo em Português:

    Este estudo avaliou a capacidade de diferentes de remanescentes de material obturador do canal radicular e preparo do espaço protético na infiltração do Enterococcus faecalis. Quarenta e uma raízes de incisivos superiores foram preparadas biomecanicamente, mantendo-se diâmetro padronizado nos terços médio e cervical. As raízes foram autoclavadas e todos os passos subseqüentes foram realizados em capela de fluxo laminar. Os canais de 33 raízes foram obturadors com AH Plus e guta-percha. As obturações foram reduzidas a 3 comprimentos (n=11): G1=6 mm, G2=4 mm e G3=2 mm. As raízes remanescentes serviram de controles positivo e negativo. O dispositivo para testar a microinfiltração bacteriana foi confeccionado com as raízes fixas a Eppendorfs, mantendo-se 2 mm do ápice submergido em vidro contendo BHI. Os dentes receberam o inóculo de 1 x 10(7) UFC/ml de E. faecalis a cada 3 dias, com observação diária por 60 dias. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância, teste de Tukey e Fisher. Foi possível observar que aos 60 dias, o G1 (6 mm) e G2 (4 mm) apresentou resultados estatisticamente semelhantes (p>0,05) (54% dos espécimes com infiltração bacteriana) e ambos os grupos foram diferentes estatisticamente (p<0,01) do G3 (2 mm), o qual apresentou 100% de espécimes com microinfiltração. Concluiu-se que apesar da infiltração do E. faecalis ter ocorrido em todas as condições testadas, aparentemente houve uma correlação positiva entre o comprimento do remanescente radicular e a eficácia do selamento, uma vez que, a menor a obturação remanescente infiltrou consideravelmente mais que os outros comprimentos.

    Resumo em Inglês:

    This study evaluated the sealing ability of different lengths of remaining root canal filling and post space preparation against coronal leakage of Enterococcus faecalis. Forty-one roots of maxillary incisors were biomechanically prepared, maintaining standardized canal diameter at the middle and coronal thirds. The roots were autoclaved and all subsequent steps were undertaken in a laminar flow chamber. The canals of 33 roots were obturated with AH Plus sealer and gutta-percha. The root canal fillings were reduced to 3 predetermined lengths (n=11): G1=6 mm, G2=4 mm and G3=2 mm. The remaining roots served as positive and negative controls. Bacterial leakage test apparatuses were fabricated with the roots attached to Eppendorf tubes keeping 2 mm of apex submerged in BHI in glass flasks. The specimens received an E. faecalis inoculum of 1 x 107 cfu/mL every 3 days and were observed for bacterial leakage daily during 60 days. Data were submitted to ANOVA, Tukey's test and Fisher's test. At 60 days, G1 (6 mm) and G2 (4 mm) presented statistically similar results (p>0.05) (54.4% of specimens with bacterial leakage) and both groups differed significantly (p<0.01) from G3 (2 mm), which presented 100% of specimens with E. faecalis leakage. It may be concluded that the shortest endodontic obturation remnant leaked considerably more than the other lengths, although none of the tested conditions avoids coronal leakage of E. faecalis.
  • Aspergilose invasiva associada ao lúpus eritematoso sistêmico e a complicação cardíaca pós-operatória Medical Microbiology

    Macêdo, Danielle Patrícia Cerqueira; Silva-Júnior, Heraldo Maia; Souza-Motta, Cristina Maria de; Milan, Eveline Pípolo; Neves, Rejane Pereira

    Resumo em Português:

    Aspergillus é um fungo ubíquito que pode causar uma variedade de síndromes clínicas. Este fungo tem emergido como agente de infecções sistêmicas e tem conquistado considerável importância para saúde pública. Este trabalho descreve dois casos de aspergilose invasiva causada por A. fumigatus em pacientes imunossuprimidos e relata a importância da identificação precoce em infecção por Aspergillus associada ao lúpus eritematoso sistêmico e a complicações cardíacas pós-operatórias.

    Resumo em Inglês:

    Aspergillus is a ubiquitous fungus which can cause a variety ofclinical syndromes. This fungus has emerged as agent of systemic infections and has therefore gained considerable public health importance. This paper describes two cases of invasive aspergillosis caused by A. fumigatus in immuno-suppressed patients and underscores the importance of early identification of Aspergillus infection associated with systemic lupus erythematosus and cardiac postoperative complications.
  • Diferenciação molecular entre Salmonella enterica subsp enterica serovar Pullorum e Salmonella enterica subsp enterica serovar Gallinarum Veterinary Microbiology

    Ribeiro, Simone Alves Mendes; Paiva, Jaqueline Boldrin de; Zotesso, Fábio; Lemos, Manoel Victor Franco; Berchieri Júnior, Ângelo

    Resumo em Português:

    A S. Pullorum (SP) é muito semelhante à S. Gallinarum (SG), agentes da Pulorose e Tifo aviário, respectivamente, sendo que as duas enfermidades são responsáveis por perdas econômicas no setor avícola. SP e SG são de difícil diferenciação em procedimento laboratorial rotineiro, mas uma prova bioquímica muito utilizada na distinção das duas refere-se à capacidade de assimilar o aminoácido ornitina: SP descarboxila este aminoácido enquanto SG não. No entanto, o isolamento de cepas com comportamento bioquímico atípico, tem dificultado tal diferenciação. Um dos genes relacionados à assimilação do aminoácido ornitina, denomina-se gene speC, o qual está presente nos dois sorovares. Analisando 21 amostras de SP e 15 de SG com a utilização da PCR não foi possível realizar a diferenciação dos dois sorovares pois os fragmentos gerados eram idênticos. Posteriormente, com o uso da técnica de tratamento enzimático com a enzima de restrição Eco RI, foi possível observar que o padrão de bandas gerado em cada sorovar era diferente, mesmo quando amostras que apresentavam comportamento bioquímico atípico eram analisadas. Tal fato permitiu a padronização da técnica para ser utilizada na diferenciação entre os sorovares Pullorum e Gallinarum de maneira rápida e segura.

    Resumo em Inglês:

    S. Pullorum (SP) and S. Gallinarum (SG) are very similar. They are the agents of pullorum disease and fowl typhoid, respectively, and the two diseases are responsible for economic losses in poultry production. Although SP and SG are difficult to be differentiated in routine laboratory procedures, the ability to metabolize ornithine is a biochemical test that may be used to achieve this aim. While SP is able to decarboxylate this amino acid, SG is not. However, the isolation of strains showing atypical biochemical behavior has made this differentiation difficult. One of the genes associated with the metabolization of the amino acid ornithine is called speC, and is found in both serovars. The analysis of 21 SP and 15 SG strains by means of PCR did not enable the differentiation of the two serovars, because fragments produced were identical. However, after enzymatic treatment with restriction enzyme Eco RI, the band pattern of each serovar showed to be different, even in samples of atypical biochemical behavior. This fact enabled the standardization of the technique for a quick and safe differentiation of serovars Pullorum and Gallinarum.
  • Meio de EMJH com 5-fluorouracil e ácido nalidíxico associado a técnica das diluições seriadas usados para recuperar Leptospira spp do sêmen bovino experimentalmente contaminado Veterinary Microbiology

    Miraglia, Fabiana; Moraes, Zenaide Maria de; Melville, Priscilla Anne; Dias, Ricardo Augusto; Vasconcellos, Silvio Arruda

    Resumo em Português:

    Sêmen bovino experimentalmente contaminado com a estirpe Leptospira santarosai Sorovar Guaricura foi utilizado para verificar a porcentagem de recuperação de leptospiras, utilizando o meio de EMJH com 5-fluorouracil (300 mg/L) e ácido nalidíxico (20 mg/L), denominado "meio seletivo", associado à técnica das diluições seriadas. O meio seletivo EMJH foi encontrado com porcentagem de recuperação mais elevada e com menos perda de amostras devido à contaminação com microorganismos oportunistas quando comparado com o meio EMJH não seletivo, que foram encontrados, respectivamente, com 151/376 (40.0%) de crescimento positivo e 38/376 (10.0%) de contaminação, 58/376 (15%) e 129/376 (34.0%). Estes resultados foram estatíticamente significantes (p<0, 0001; Fisher). Diferenças foram encontradas quando as freqüências de leptospiras recuperadas foram comparadas com a técnica de diluição seriada (10-1 a 10-4) e entre os meios seletivo e não-seletivo, em diferentes níveis de diluição. À diluição de 1/10, as porcentagens encontradas foram (0%, 0/80) e (38%, 30/80); à diluição 1/100, (3%, 2/80) e (49%, 39/80); e à diluição 1/1000, (25%, 20/80) e (50%, 40/80), respectivamente. A porcentagem de recuperação de leptospiras foi diretamente proporcional às diluições empregadas. A metodologia das diluições seriadas (estabelecendo pelo menos três diluições) e o uso de meio EMJH seletivo mostraram ser eficientes no isolamento de leptospiras presentes nas amostras de sêmen bovino.

    Resumo em Inglês:

    Bovine semen experimentally contaminated with Leptospira santarosai serovar Guaricura was submitted to the modified EMJH medium with 5-fluorouracil (300mg/L) and nalidixic acid (20mg/L), named as "selective medium" and using the serial dilution technique, in order to evaluate the percentage of recovery of the added microorganism. The selective EMJH medium was found with higher percentage of recovery of leptospiras and minor losses of samples due to contamination with opportunistic microorganisms than the non-selective EMJH medium: 151/376 (40.0%) of positive growth; and 38/376 (10.0%) contamination and 58/376 (15%) and 129/376 (34.0%), respectively. These results were statistically significant (p<0. 0001; Fisher). Differences were found when the frequencies of positive leptospires recovery have been compared in the serial dilution technique (10-1 to 10-4) between the selective and non-selective media at different dilution factors. At 1/10th dilution the percentages found were (0%, 0/80) and (38%, 30/80), at 1/100th dilution, (3%, 2/80) and (49%, 39/80) and at 1/1,000th dilution, (25%, 20/80) and (50%, 40/80), respectively. The percentage of recovery of leptospires was found to be directly proportional to the dilution used. The methodology of the serial dilution technique (setting at least three dilutions) and the use of selective EMJH medium have been found to be efficient for the isolation of leptospires from the bovine semen samples.
  • Microflora bacteriana aeróbica da cavidade oral e cloaca de jacaré-de-papo-amarelo (Caiman latirostris) procedentes do Zoológico de João Pessoa, PB, Brasil Veterinary Microbiology

    Silva, J.S.A.; Mota, R.A.; Pinheiro Júnior, J.W.; Almeida, M.C.S.; Silva, D.R.; Ferreira, D.R.A.; Azevedo, J.C.N.

    Resumo em Português:

    O presente estudo teve como objetivo isolar e identificar a microflora bacteriana aeróbica presente na mucosa da cavidade oral e da cloaca de exemplares de jacarés-de-papo-amarelo (Caiman latirostris) nascidos e criados em cativeiro no Parque Zoológico Arruda Câmara, localizado na cidade de João Pessoa - PB. As bactérias mais freqüentes foram Staphylococcus sp. (14,74%), Corynebacterium sp.(13,68%), Escherichia coli (13,68%) e Shigella sp. (11,58%), e as menos prevalentes foram Citrobacter sp.(1,05%), Klebsiella pneumoniae (1,05%) e Salmonella sp. (1,05%). Ressalta-se a importância da participação desses microrganismos em processos infecciosos (septicemias) e em feridas provocadas por crocodilianos.

    Resumo em Inglês:

    The objective of this study was to isolate and identify the aerobic bacterial microflora from the oral cavity mucosa and cloaca's samples, collected from Broad-snouted caiman (Caiman latirostris), born and bred in captivity at Parque Zoológico Arruda Câmara, João Pessoa, Paraíba, Brazil. The most common bacteria were Staphylococcus sp. (14.74%), Corynebacterium sp. (13.68%), Escherichia coli (13.68%) and Shigella sp. (11.58%), and the less common were Citrobacter sp. (1.05%), Klebsiella pneumoniae (1.05%) and Salmonella sp. (1.05%).This emphasizes the importance of these microorganisms' participation in infectious processes (sepsis) and injuries caused by crocodilians.
  • Frequência de genes de virulência em Escherichia coli isolada de suínos com diarréia no norte do Estado do Paraná, Brasil Veterinary Microbiology

    Vidotto, Marilda C.; Lima, Natália C.S. de; Fritzen, Juliana T.T.; Freitas, Júlio C. de; Venâncio, Emerson J.; Ono, Mario A.

    Resumo em Português:

    A identificação de amostras de Escherichia coli responsáveis por diarréia pós-desmame em suínos requer conhecimento dos patotipos prevalentes dentro de uma dada região. Cem amostras deEscherichia coli isoladas de leitões com diarréia no Estado do Paraná, Brasil, foram testadas para a presença dos genes que codificam antígenos fimbriais F4, F5, F6, F18, F41 e para a produção de enterotoxinas (STa, STb, LT and STx2e), através de sondas e da técnica da PCR (polymerase chain reaction). Os resultados mostraram que 60% dos isolados foram positivos para um ou mais antígenos fimbriais e 92% foram positivos para pelo menos um dos fatores de virulência examinados. Os genes de virulência detectados foram F4 (44%), F18 (38%), F5 (30%), F41 (32%), F6 (25%), LTp-I (71%), STa (40%), STb (47%) e STx2e (3%). Vinte e quatro padrões de virulência, de acordo com as diferentes combinações dos genes de virulência, foram encontrados e o mais prevalente foi F4, F18, F41, STa, STb e LT. A maioria das amostras que carreiam genes para adesinas também transportam genes para produção de toxinas.

    Resumo em Inglês:

    Identification of Escherichia coli causing porcine postweaning diarrhea requires knowledge regarding the prevalent pathotypes within a given region. A total of 100Escherichia coli isolates from piglets with diarrhea in Londrina city, Parana State, South Brazil, were screened for the presence of genes for F4, F5, F6, F18, F41 fimbrial antigens by specific probes and for enterotoxins (STa, STb, LT and STx2e) by polymerase chain reaction (PCR). The results showed that 60% of the isolates were positive for one or more of the fimbrial antigens and 92% were positive at least for one of the virulence factors examined. Virulence factor genes detected were F4 (44%), F18 (38%), F5 (30%), F41 (32%), F6 (25%), LTp-I (71%), STa (40%), STb (47%) and STx2e (3%). Twenty four patterns of virulence factor according to the different virulence genes form were found and the most frequent virulence gene pattern was F4, F18, F41, STa, STb and LT. Most of the isolates that carried genes for adhesins also harboured genes for toxins.
  • Sequenciamento e análise filogenética de isolados do vírus da doença infecciosa bursal de surtos ocorridos em lotes de poedeiras no estado de Minas Gerais Veterinary Microbiology

    Dias, Camila Cristina Almeida; Souza, Fernanda de Oliveira; Silva, Elisa Monteiro Sant'Anna da; Eller, Monique Renon; Barrios, Priscilla Rochele; Santos, Bernadete Miranda dos; Moraes, Mauro Pires; Almeida, Márcia Rogéria de

    Resumo em Português:

    O sequenciamento e a análise filogenética a partir da seqüência nucleotídica do gene que codifica a proteína VP2 foram realizados com o intuito de caracterizar os agentes causadores de dois surtos da doença infecciosa bursal em lotes de poedeiras do estado Minas Gerais, em 2004. Os resultados indicam que os surtos analisados podem estar relacionados com o vírus de origem vacinal.

    Resumo em Inglês:

    Sequencing and phylogenetic analysis based on the nucleotide sequence of the gene encoding VP2 protein was carried out in order to characterize the agent of two outbreaks of infectious bursal disease in layer flocks in the state of Minas Gerais in 2004. The results indicate the outbreaks could be related to the vaccinal virus.
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