Em um levantamento de macrófitas aquáticas realizado no reservatório de Itaipu foram identificados 62 táxons pertencentes a 25 famílias e 42 gêneros. O maior número de táxons foi representado pelas macrófitas emergentes (40 táxons). O surgimento de uma rica comunidade de espécies submersas (23% dos táxons identificados) parece ter sido favorecido pelas alterações decorrentes da formação dor reservatório, tais como redução da flutuação dos níveis de água, aumento da penetração de luz e enriquecimento do sedimento em nutrientes e matéria orgânica. As macrófitas aquáticas foram registradas principalmente próximo à foz dos tributários do reservatório, em áreas rasas (profundidade inferior a 2 metros). Além da reduzida profundidade, o maior aporte de nutrientes associado à proteção do vento explicam essa distribuição. Entre as espécies registradas, Egeria najas merece destaque por ocorrer em todas as localidades visitadas com valores de biomassa entre 98 e 168 gPS/m². Algumas espécies potencialmente daninhas como Eichhornia crassipes, Salvinia auriculata e Pistia straiotes também merecem atenção, pois foram encontradas cobrindo amplas áreas de alguns braços do reservatório.
