Os objetivos foram avaliar a distribuição espaço-temporal, estrutura de assembléias e associações de ninfas de Ephemeroptera com substratos em 5 ecossistemas lóticos nas nascentes das bacias dos rios Doce e São Francisco, Brasil. As amostragens foram realizadas em 24 estações, nos períodos de chuvas e seca de 1998. No total, 7,066 organismos foram coletados, pertencentes a 27 gêneros e 6 famílias. Os taxa dominantes foram Americabaetis, Paracloeodes, Leptohyphes e Hagenulus. No período de chuvas foram observados maiores valores dos indices de riqueza taxonômica, diversidade e equitabilidade na bacia do rio São Francisco, enquanto que no período de seca, a riqueza taxonômica foi maior na bacia do rio Doce. Não foram encontradas diferenças significativas dos valores dos indices de riqueza, equitabilidade, diversidade e densidade de ninfas de Ephemeroptera entre os dois períodos estudados. Os resultados obtidos sugerem que a diversidade das assembléias de Ephemeroptera nas cabeceiras da Serra do Cipó são provavelmente devido a características ecológicas dos ecossistemas aquáticos e bacias hidrográficas estudadas.
