O objetivo deste estudo foi avaliar o selamento de ápices radiculares tratados com diferentes agentes desmineralizantes e retrobturados com agregado de trióxido mineral (MTA), mediante infiltração marginal por corante. Cinqüenta e seis dentes unirradiculares humanos extraídos foram instrumentados, obturados e seccionados apicalmente. Os preparos cavitários apicais foram confeccionados com pontas ultra-sônicas e os agentes desmineralizantes foram aplicados previamente à retrobturação com Pro Root MTA. Os espécimes foram divididos aleatoriamente em 4 grupos (n=14): grupo 1 (sem agente desmineralizante); grupo 2 (ácido fosfórico 35% durante 15 s); grupo 3 (solução de EDTA 17%, pH 7, durante 3 min); grupo 4 (gel de EDTA 24%, pH 7, durante 4 min). A extensão da infiltração de corante (rodamina B 2% a 37°C, por 24 h) foi avaliada em milímetros utilizando-se um estereomicroscópio. Os resultados foram analisados estatisticamente por meio de análise de variância a um critério e do teste Tukey com nível de significância de 5%. Dentre os grupos experimentais, a menor extensão de infiltração do corante foi verificada no grupo 1 (1,89 mm), seguido pelos grupos 2 (2,18 mm), 4 (2,54 mm) e 3 (2,64 mm). Não houve diferenças estatisticamente significante (p>0.05) na infiltração marginal pelo corante entre os grupos 1, 2 e 4 e os grupos 2, 3 e 4. Com base nos resultados obtidos, pode-se concluir que a aplicação de agentes desmineralizantes não pode ser recomendada quando da utilização do MTA em cirurgias parendodônticas.