Este estudo avaliou as condições microbiológicas dos canais radiculares, por meio de esfregaços e culturas de dentes anteriores e pré-molares com necrose pulpar associada à radiolucidezes periapicais, antes e após o preparo biomecânico (PBM). Utilizou-se a técnica de instrumentação biescalonada coadjuvada por soluções de hipoclorito de sódio (NaOCl) a 1, 2,5 ou 5% nos grupos I (n=39), II (n=36) e III (n=36), respectivamente. Antes do PBM havia 100% de culturas positivas e os esfregaços proveram diversificados morfotipos microbiológicos, sendo 20, 20 e 23 nos grupos I, II e III, respectivamente. Após o PBM, o percentual de culturas negativas nos grupos I, II e III foi 74,2%, 86,3 e 93,4% (p>0,05) e a incidência de morfotipos declinou para 14, 15 e 5, respectivamente. Todos os dentes birradiculados e/ou portadores de fístulas apresentaram-se microbiologicamente negativos após o PBM, independentemente do irrigante utilizado. Os morfotipos Gram-negativos foram mais suscetíveis à ação do PBM. Após o PBM persistiram apenas cocos e bacilos Gram-positivos no grupo III. Portanto, o PBM coadjuvado por solução de NaOCl a 5%, proporcionou o melhor desempenho anti-séptico, pois, nas poucas culturas positivas, houve também significativa redução do número de morfotipos microbiológicos (p<0.05).
