No presente trabalho foram descritos os cariótipos de Mycteria americana (Ciconiidae) e Platalea ajaja (Threskiornithidae). Embora ambas as espécies tenham apresentado o número diplóide 2n = 72, foram observadas diferenças na morfologia cariotípica resultantes de processos evolutivos distintos que parecem ocorrer entre as duas famílias. Além de contribuir para um melhor entendimento da evolução cromossômica dentro da ordem Ciconiiformes, a caracterização cariotípica de M. americana e P. ajaja vem representar uma importante ferramenta para a realização de planos de manejo e conservação destas espécies.