Este estudo foi desenvolvido com o objetivo de avaliar as freqüências gênicas em diferentes gerações de bovinos da raça sintética Canchim (5/8 Charolês, 3/8 Zebu). Uma amostra de 154 animais, representando três classes de gerações de um rebanho das raça Canchim, foi analisada para sete marcadores moleculares. Uma amostra da raça Charolesa (N = 36) foi incluída nas análises para permitir comparações. Observou-se um aumento linear, altamente significativo (P < 0,01), na freqüência do alelo que codifica o aminoácido valina na posição 127 do hormônio de crescimento, ao longo das gerações de Canchim. Este alelo foi observado na amostra da raça Charolesa e não é encontrado em raças zebuínas nacionais. Quatro alelos foram observados para o microssatélite localizado na região 5' não transcrita do gene do fator de crescimento semelhante à insulina do tipo I (IGF-I), com tamanhos variando de 231 a 225 pb. A freqüência do alelo de 225 pb apresentou um aumento significativo (P < 0,05) não linear ao longo das gerações. Este alelo não foi observado na raça Charolesa e é predominante nas raças zebuínas. Para o microssatélite CSFM50, seis alelos foram observados na raça Canchim, tendo sido verificada uma redução linear (P < 0,05) na freqüência do alelo de 168 bp. A hipótese de acasalamento preferencial com relação ao polimorfismo do hormônio de crescimento foi reforçada pelos resultados da análise de estatística F de Wright. O valor estimado de FIS para este loco foi 0,59 (P < 0,01). O aumento simultâneo de um alelo do hormônio de crescimento característico de Bos taurus e de um alelo de IGF-I característico de Bos indicus sugere que a seleção fenotípica tenha favorecido regiões diferentes de ambos os genomas que entraram na formação dessa raça.
