Examinou-se a variação genética de 102 cavalos Pantaneiros da região do Pantanal, Brasil, usando sete locos de grupos sanguíneos e 10 locos genéticos bioquímicos. As medidas de variação genética individual e diversidade genética populacional dentro da população de cavalos Pantaneiros foram próximas da média encontrada para as raças de cavalos domésticos. Do ponto de vista de conservação genética, não há preocupação imediata com relação à perda de variação dentro da raça. Análises das relações genéticas mostraram claramente que o cavalo Pantaneiro descende de cavalos da península Ibérica e que ele é estreitamente relacionado com as demais raças brasileiras.
