Um total de 119 índios Waiãpi e 348 habitantes de Manaus, Amazonas, foram testados usando nove sistemas genéticos enzimáticos na primeira população e dois na segunda. Os Waiãpi mostraram algumas diferenças marcantes quanto às médias dos indígenas sul-americanos em ACP*A (1% vs. 14 ± 9%), GLO1*1 (9% vs. 30 ± 14%) e ESD*1 (99,6% vs. 70 ± 17%), enquanto as prevalências de ESD*1 e CA2*1 na população de Manaus mostraram-se dentro do intervalo encontrado previamente na região norte do Brasil (ESD*1: 85% vs. 80-94%; CA2*1: 98% vs. 89-99.8%). As freqüências quase idênticas obtidas para esses dois marcadores nesta população, quando a amostra foi subdividida de acordo com a cor da pele, sugerem que tais classificações morfológicas têm pouco valor nesta região. Distâncias genéticas entre os Waiãpi e outras tribos, obtidas usando esses e outros marcadores genéticos, mostraram bom paralelismo com as distâncias geográficas que separam esses índios dos outros grupos considerados.
