Validation of molecular markers associated with pungency in hot
                  pepper

The pungency in hot pepper fruits of the genus Capsicum, due to the presence of capsaicinoids, is one of the most attractive and highly valued characteristics in the world cuisine. This work aimed to validate and evaluate the efficiency of prediction of molecular markers pun1¹ , pun1³ and SNP identified by tetra-primer ARMS-PCR method for the determination of pungency in Capsicum spp. Thirty six accessions of the Germplasm Bank of the Universidade Federal de São Carlos were evaluated by sensory (ripe fruits) and molecular (at seedling stage by DNA extraction from leaves) analyses for pungency. The SNP ARMS-PCR, pun1¹ and pun1³ markers were used for molecular evaluation. The results show the efficiency of using these markers for molecular characterization of Capsicum spp. accessions for pungency character.

Capsicum spp.; SNP; crop breeding; selection.

Authorship

Ítalo S Pereira

UFSCar,Depto. Biotecnologia,Prod. Vegetal e Animal,C. Postal 153, 13600-970Araras-SP;italo_sudre@hotmail.com;fernandazbarreto@gmail.com;fcsala@cca.ufscar.br;thiagobalsalobre@gmail.com;monalisa@cca.ufscar.brUFSCarBrazilAraras, SP, BrazilUFSCar,Depto. Biotecnologia,Prod. Vegetal e Animal,C. Postal 153, 13600-970Araras-SP;italo_sudre@hotmail.com;fernandazbarreto@gmail.com;fcsala@cca.ufscar.br;thiagobalsalobre@gmail.com;monalisa@cca.ufscar.br

Fernanda Z Barreto

Thiago WA Balsalobre

Fernando C Sala

Cyro P Costa

Monalisa S Carneiro

SCIMAGO INSTITUTIONS RANKINGS

Tables

Tables (3)

Thumbnail

Tabela 1.
Avaliação de trinta e seis acessos de Capsicum e três representantes da família Solanaceae pertencentes ao Banco de Germoplasma da Universidade Federal de São Carlos para reação a pungência através do método sensorial e de marcadores moleculares pun1¹ e SNP (tetra-primer ARMS-PCR) (assessment of thirty-six Capsicum accessions and three Solanaceae family representatives belonging to Germplasm Bank of Universidade Federal de São Carlos for reaction to pungency through the sensory method and molecular markers pun1¹ and SNP (tetra-primer ARMS-PCR). Araras, UFSCar, 2014.

Thumbnail

Tabela 2.
Primers dos marcadores moleculares pun1¹, pun1³ e o SNP (tetra-primer ARMS-PCR) utilizados para a determinação de pungência em Capsicum ssp. {primers of molecular markers pun1¹, pun1³ and SNP (tetra-primer ARMS-PCR) used for the determination of pungency in Capsicum spp.}. Araras, UFSCar, 2014.

Thumbnail

Tabela 3.
Associação entre análises sensoriais e de marcadores moleculares para a determinação da pungência em 36 acessos de Capsicum ssp. (association between sensory analysis and molecular markers for determining the pungency in 36 Capsicum spp accessions). Araras, UFSCar, 2014.

Tabela 1. Avaliação de trinta e seis acessos de Capsicum e três representantes da família Solanaceae pertencentes ao Banco de Germoplasma da Universidade Federal de São Carlos para reação a pungência através do método sensorial e de marcadores moleculares pun1¹ e SNP (tetra-primer ARMS-PCR) (assessment of thirty-six Capsicum accessions and three Solanaceae family representatives belonging to Germplasm Bank of Universidade Federal de São Carlos for reaction to pungency through the sensory method and molecular markers pun1¹ and SNP (tetra-primer ARMS-PCR). Araras, UFSCar, 2014.

*Marcador específico para acessos de Capsicum annuum (specific marker for accessions of Capsicum annuum); **Marcador SNP (tetra-primer ARMS-PCR) indicado para todas as espécies do Gênero Capsicum [SNP marker (tetra-primer ARMS-PCR) suitable for all species of Capsicum genus]; ***Marcador ³, específico para C. frutescens, também caracterizou o acesso CCA 176 como pungente (Marker ³, specific for C. frutescens, also characterized access CCA 176 as pungent); Tomate: Solanum lycopersicon, cv. Santa Clara (tomato: Solanum lycopersicon, cv. Santa Clara); Quiabo: Abelmoschus esculentus, cv. Santa Cruz (okra: Abelmoschus esculentus, cv. Santa Cruz); Berinjela: Solanum melongena cv. F₁ Ciça (eggplant: Solanum melongena, cv. F₁ Ciça); Pungente (P) e não pungente (NP) (pungent (P) and not pungent (NP)].

Tabela 2. Primers dos marcadores moleculares pun1¹, pun1³ e o SNP (tetra-primer ARMS-PCR) utilizados para a determinação de pungência em Capsicum ssp. {primers of molecular markers pun1¹, pun1³ and SNP (tetra-primer ARMS-PCR) used for the determination of pungency in Capsicum spp.}. Araras, UFSCar, 2014.

Tabela 3. Associação entre análises sensoriais e de marcadores moleculares para a determinação da pungência em 36 acessos de Capsicum ssp. (association between sensory analysis and molecular markers for determining the pungency in 36 Capsicum spp accessions). Araras, UFSCar, 2014.

*Porcentagem de associação entre as análises sensoriais e os marcadores moleculares na determinação da pungência. (percentage of association between the sensory analysis and molecular markers in determining pungency); ¹Presença do fragmento de 108 pb referente ao marcador SNP (tetra-primer ARMS-PCR) {presence of the 108 bp fragment related to the SNP marker (tetra-primer ARMS-PCR)}; ²Presença do fragmento de 1063 pb referente ao marcador ¹ (presence of the 1063 bp fragment related to ¹ marker); ³Presença do fragmento de 134 pb referente ao marcador SNP (tetra-primer ARMS-PCR) {presence of the 134 bp fragment related to the SNP marker (tetra-primer ARMS-PCR)}; ⁴Presença do fragmento de 746 pb referente ao marcador ¹ (presence of the fragment of 746 bp related to ¹ marker).

How to cite

copy

Associação Brasileira de Horticultura Embrapa Hortaliças, C. Postal 218, 70275-970 Brasília-DF, Tel. (61) 3385 9099, Tel. (81) 3320 6064, www.abhorticultura.com.br - Vitoria da Conquista - BA - Brazil
E-mail: associacaohorticultura@gmail.com

Acompanhe os números deste periódico no seu leitor de RSS

Versão para download de PDF

PDF

Português

Versões e tradução automática

Versão original do texto

Português

Tradução automática

Google Translator
Microsoft Translator

Como citar

RIS

BIBTEX

Outros formatos de citação e exportação:

SciELO - Scientific Electronic Library Online
Rua Dr. Diogo de Faria, 1087 – 9º andar – Vila Clementino 04037-003 São Paulo/SP - Brasil
E-mail: scielo@scielo.org

Leia a Declaração de Acesso Aberto

Métricas

Validation of molecular markers associated with pungency in hot pepper

PlumX

Mensagem

[TFN1] *Marcador específico para acessos de Capsicum annuum (specific marker for accessions of Capsicum annuum); **Marcador SNP (tetra-primer ARMS-PCR) indicado para todas as espécies do Gênero Capsicum [SNP marker (tetra-primer ARMS-PCR) suitable for all species of Capsicum genus]; ***Marcador ³, específico para C. frutescens, também caracterizou o acesso CCA 176 como pungente (Marker ³, specific for C. frutescens, also characterized access CCA 176 as pungent); Tomate: Solanum lycopersicon, cv. Santa Clara (tomato: Solanum lycopersicon, cv. Santa Clara); Quiabo: Abelmoschus esculentus, cv. Santa Cruz (okra: Abelmoschus esculentus, cv. Santa Cruz); Berinjela: Solanum melongena cv. F₁ Ciça (eggplant: Solanum melongena, cv. F₁ Ciça); Pungente (P) e não pungente (NP) (pungent (P) and not pungent (NP)].