Lipopolissacarídeos são os principais constituintes da membrana externa de bactérias Gram-negativas. Esta classe de compostos desempenha um papel fundamental em processos químicos mediados por estas bactérias como o reconhecimento e ligação de metais, adesão a superfícies e reações de óxido-redução. Lipopolissacarídeos são também os mais comuns agentes causadores de doenças nosocomiais que levam a infecções crônicas e agudas em pacientes de queimaduras, deficiência imunológica e fibrose cística. Variação fenotípica na expressão de bandas A e B em membranas lipopolissacarídicas de P. aeruginosa resultam em mudanças de propriedades químicas da superfície bacteriana que afetam a adesão bacteriana a superfícies celulares e favorecem a sobrevivência do organismo. Simulações de dinâmica molecular clássica em solvente explícito foram realizadas para a membrana lipopolissacarídica lisa (A-B+ LPS) de Pseudomonas aeruginosa por um período de 12 ns. A banda B exibe uma grande flexibilidade e permanece solvatada durante o período de simulação. Interações de longo alcance entre a banda B e as moléculas de carboidratos na superfície da membrana não foram observadas corroborando resultados postulados anteriormente através de experimentos de microscopia de forca atômica. Comparações com simulações da membrana lipopolissacarídica rugosa (A-B- LPS) de P. aeruginosa indicam que a presença da banda B induz uma expansão da membrana e modifica drasticamente tanto o potencial eletrostático através da membrana como a distribuição de cargas na superfície da mesma. Estes resultados oferecem uma explicação para o fato de que apenas as cepas de P. aeruginosa que contem a banda B são capazes de se aderirem a superfícies celulares, e para a necessidade de perda da banda B para que então estes organismos possam iniciar uma infecção aguda em adição à infecção crônica do paciente.
