Open-access Desenvolvimento de marcadores SSR e avaliação da diversidade genética em Nepenthes spp. nativas do sul da Tailândia

Resumo

Nepenthes spp. (Nepenthaceae) é um dos gêneros populares de plantas carnívoras, que apresenta uma modificação especial da folha, com formas, tamanhos e tonalidades de cor variados. Essas plantas exibem alta variação dentro das espécies e populações, tornando difícil sua classificação apenas por características morfológicas. Como resultado, técnicas moleculares são necessárias para identificar a diversidade genética. Portanto, este estudo teve como objetivo desenvolver marcadores de repetições de sequência simples (SSR) e avaliar a diversidade genética de nove espécies nativas de Nepenthes no sul da Tailândia. No presente estudo, foram identificados 20 pares de primers SSR contendo motivos de dinucleotídeos ou trinucleotídeos a partir de 2.138 nucleotídeos e 41 ESTs da família Nepenthaceae, além de 950 nucleotídeos de plantas carnívoras recuperados do banco de dados GenBank. Apenas 10 marcadores foram polimórficos, apresentando de 2 a 7 alelos, com uma média de 3,7 alelos por loco. Com base nos marcadores SSR, as nove espécies de Nepenthes foram agrupadas em dois grupos principais por meio da análise de agrupamento UPGMA, com coeficiente de correlação cofenética de 0,76. Este é o primeiro relato que identifica N. mirabilis var. globosa como distinta de N. mirabilis por meio de marcadores SSR. Os resultados indicam que os marcadores SSR são eficazes na detecção da variabilidade entre as espécies de Nepenthes. Eles podem ser úteis em estudos de diversidade genética, fornecer informações práticas para a seleção parental, auxiliar em programas de melhoramento e contribuir para ações de conservação de espécies ameaçadas de extinção.

Palavras-chave:
plantas carnívoras; identificação genética; Nepenthes spp.; planta jarro; repetições de sequência simples

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