A Família Annonaceae inclui espécies cultivadas de interesse econômico e representa uma importante fonte de informação para uma melhor compreensão da evolução das florestas tropicais. Em análises filogenéticas de dados de sequências de DNA que são utilizados para tratar de questões evolutivas, é imperativo usar modelos estatísticos apropriados. As Anonáceas são casos em questão: Dois clados irmãos, as subfamílias Annonoideae e Malmeoideae, contêm a maioria da diversidade da espécie anonáceas. As Annonoideae geralmente apresentam um maior grau de divergência de seqüência em relação às Malmeoideae, resultando em diferenças acentuadas nos comprimentos dos ramos em árvores filogenéticas. Incerteza sobre como interpretar e analisar essas diferenças levou a resultados inconsistentes ao estimar as idades de clados em Anonáceas utilizando-se técnicas de datação molecular. Foi perguntado se estas diferenças podem ser atribuídas a hipóteses de modelagem inadequadas nas análises filogenéticas. Especificamente, foi testado para (clado específico) diferenças nas taxas de substituições não sinônimas e sinônimas. Uma elevada proporção de substituições não-sinônimas para sinônimas pode levar à semelhança das seqüências de DNA, devido à convergência em vez de um ancestral comum, e, como resultado confundir a análise filogenética. Foi utilizado um conjunto de dados de três genes de cloroplasto (rbcL, matK, ndhF) para 129 espécies representantes da família. Verificou-se que as diferenças em comprimentos dos ramos entre os principais clados não são atribuíveis a diferentes taxas de substituições não-sinônimas e sinônimas. As diferenças na taxa evolutiva entre os principais clados de anonáceas representam um desafio para as atuais técnicas de datação molecular que deve ser visto como um alerta para a interpretação de tais resultados em outros organismos.
Annonaceae; comprimentos dos ramos; modelo códon; substituições não-sinônimas; filogenética; substituições sinônimas
