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Identificação e caracterização de um análogo de gene de resistência (AGR) da família de Caricaceae Dumort

A maioria dos genes de resistência (R) clonados e caracterizados até o momento contém domínios NBS (nucleotide binding site) e LRR (leucine-rich repeat). Dentro destes domínios, encontram-se "motifs" altamente conservados. Análogos de genes de resistência (RGAs) são marcadores genéticos obtidos por uma estratégia, baseada em PCR, que usa primers degenerados desenhados a partir desses "motifs" altamente conservados dos genes R. Esta estratégia possui a vantagem do elevado grau de conservação da estrutura e seqüência dos aminoácidos observados nos genes R. O objetivo do presente estudo foi realizar uma busca por RGAs em Carica papaya L. e Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. De três combinações de primers avaliadas, somente uma obteve sucesso na amplificação. O produto da amplificação foi então clonado em pCR2.1TOPO e seqüenciado utilizando os primers universais M13 forward e reverse. Quarenta e oito clones foram seqüenciados de cada espécie vegetal. Das 96 seqüências geradas para cada espécie, retiraram-se as seqüências do vetor e, em seguida, as mesmas foram agrupadas utilizando o programa "CAP3 assembler". A partir do GENEBANK, foi identificado um RGA em C. papaya apresentando um BlastX e-value de 2x10-61 com o "gb|AAP45165.1| putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum)". Na extensão do nosso conhecimento, este é o primeiro relato de um RGA na família Caricaceae Dumort. Estudos preliminares de estrutura foram realizados visando à maior caracterização deste potencial "NBS-LRR type protein". Esforços para encontrar novos análogos de genes de resistência devem continuar, principalmente para fornecer bases para o desenvolvimento de plantas de mamão transgênicas com resistência a doenças.

Caricaceae; sítios de ligação de nucleotídeos (SLN); V. cauliflora; C. papaya; mamão


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