COMPARAÇÃO DE MÉTODOS PARA EXTRAÇÃO DE RNA DE FOLHAS DE Passiflora edulis SIMS

RESUMO

Para análises de genômica funcional, é indispensável que o RNA esteja íntegro. Folhas de Passiflora edulis são ricas em metabólitos secundários que dificultam o processo de extração de RNA, principalmente por desencadearem processos oxidativos e precipitarem juntamente os ácidos nucleicos. Este estudo objetivou analisar três métodos de extração de RNA: Concert™ Plant RNA Reagent (Invitrogen), TRIzol® Reagent (Invitrogen) e TRIzol® Reagent (Invitrogen)/gelo- produtos comerciais específicos para extração de RNA, e indicar qual é o mais eficaz para uso em folhas de maracujazeiro. O RNA extraído com o método TRIzol® Reagent (Invitrogen) não apresentou razões A260/A280 e A260/A230 satisfatórias, tampouco concentrações ideais, ao contrário dos outros 2 métodos. A eletroforese em gel de agarose mostrou, pelo método Concert, banda nítida de DNA em todos os extratos obtidos, o que não ocorreu com os métodos TRIzol e TRIzol/gelo. Com o método TRIzol, as amostras apresentaram arraste durante a eletroforese. Devido à menor contaminação com DNA, às razões A260/A280 e A260/A230 ideais e maior integridade das amostras, o RNA proveniente do método TRIzol/gelo foi utilizado para a RT-PCR. Os amplicons obtidos apresentaram alta similaridade. Considerou-se o TRIzol/gelo como método preferencial para extração de RNA em folhas de P. edulis.

Termos para indexação
Passiflora edulis; extração de RNA; Concert™; TRIzol®; baixa temperatura