O objetivo do presente estudo foi determinar a prevalência de determinadas espécies de micoplasmas, tais como, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum e Mycoplasma penetrans, em swabs uretrais de pacientes infectados com HIV-1 comparando com um grupo controle. Micoplasmas foram detectados por técnicas padrão de cultivo e pela reação de polimerase em cadeia para a qual foram utilizados "primers" genéricos obtidos da região conservada 16SrRNA e "primers" específicos para Mycoplasma penetrans. A positividade obtida nos dois métodos foi comparável. Contudo, o PCR mostrou ser mais sensível nas condições empregadas enquanto que o cultivo permitiu a quantificação dos isolados. Os resultados demonstraram não haver diferenças significantes (p < 0,05) nas taxas de positividade entre os métodos empregados para a detecção dos micoplasmas.