Este estudo determinou a prevalência de protozoários intestinais em Instituições de Longa Permanência para Idosos (ILPI), enfermeiros, manipuladores de alimentos identificando fatores de risco associados às infecções. Amostras de fezes de idosos (n = 293), enfermeiros (63), manipuladores de alimentos (19) foram estudadas. Foram aplicados questionários relacionados a variáveis sociodemográficas, de higiene, comportamento e características de saúde. As amostras de fezes foram examinadas pelas técnicas de Faust e Ziehl Neelsen e a prevalência de G. duodenalis, Cryptosporidium spp., E.histolytica/dispar nos idosos foi de 4,0%, 1,0% e 0,3%, respectivamente. Enfermeiros e manipuladores de alimentos apresentaram 4,8% e 5,2% de positividade apenas para G. duodenalis, respectivamente. A origem dos indivíduos, o contato com animais domésticos foram associados à infecção por G. duodenalis nos idosos, sendo que o contato com animais domésticos foi considerado um fator de risco para a infecção, o tempo do último exame coproparasitológico foi relacionado a Cryptosporidium spp.. Nenhuma das variáveis apresentaram associação com E. histolytica/dispar. A frequência da lavagem das mãos foi associada significativamente com G. duodenalis entre enfermeiros. As frequências de amostras positivas para G. duodenalis, Cryptosporidium spp., E. histolytica/dispar demonstram que ILPIs são ambientes propícios para esta ocorrência devido ao contato entre idosos, enfermeiros, manipuladores de alimentos, que muitas vezes são mal treinados em procedimentos de higiene e manipulação de alimentos.