Cryptococcus neoformans, pertencente à classe dos basidiomicetos, é um importante patógeno, principalmente em pacientes imunocomprometidos. Neste estudo, 47 isolados clínicos de C. neoformans de várias regiões do Estado de São Paulo foram avaliados quanto aos sorotipos e ao mating-type por PCR. A diversidade genética foi analisada por PCR-fingerprinting com a seqüência iniciadora específica para regiões microssatélite (GACA)4, RAPD com o iniciador 6 (Amersham Pharmacia Biotech) e por RFLP do gene PLB1 digerido com AvaI. Todos os isolados foram obtidos de pacientes HIV positivos e identificados como sorotipo A e MATalfa. A maioria dos isolados pertencia ao tipo molecular VNI (45/47) e apenas dois foram VNII quando analisados por PCR-fingerprinting e PCR-RFLP. Homogeneidade alta foi obtida com o iniciador (GACA)4, com a maioria dos isolados apresentando correlação alta (> 0.9). Os resultados do RAPD, por sua vez, revelaram maior heterogeneidade com número maior de perfis moleculares. Por PCR-RFLP, nenhum tipo molecular novo foi encontrado, realçando a idéia de que em genes conservados como PLB1, as diferenças podem ser resultantes de divergências evolutivas dentro do complexo C. neoformans, separando os isolados nos oito subtipos moleculares já estabelecidos. Nossos resultados fornecem novas informações sobre a epidemiologia molecular de C. neoformans na região sudeste do Brasil.
